MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 plasmid pRHOM17201

Total Repeats: 1204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015970	CGC	2	6	1194	1199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301800
2	NC_015970	CGT	2	6	1347	1352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301800
3	NC_015970	TGG	2	6	1425	1430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301800
4	NC_015970	GCT	2	6	1459	1464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301800
5	NC_015970	GAA	2	6	1658	1663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301800
6	NC_015970	CGT	2	6	1799	1804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301800
7	NC_015970	ACG	2	6	1809	1814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301800
8	NC_015970	TGC	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301800
9	NC_015970	TGT	2	6	1837	1842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345301800
10	NC_015970	AGA	2	6	1976	1981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301801
11	NC_015970	CGT	2	6	2091	2096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301801
12	NC_015970	GCT	2	6	2136	2141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301801
13	NC_015970	TGG	2	6	2156	2161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301801
14	NC_015970	TTA	2	6	2169	2174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345301801
15	NC_015970	ATC	2	6	2182	2187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301801
16	NC_015970	TTG	2	6	2216	2221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345301801
17	NC_015970	AGT	2	6	2270	2275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301801
18	NC_015970	CAC	2	6	2470	2475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301802
19	NC_015970	AGC	2	6	3976	3981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301803
20	NC_015970	ACA	3	9	4170	4178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345301803
21	NC_015970	GCC	2	6	4217	4222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301803
22	NC_015970	CCG	2	6	4353	4358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301803
23	NC_015970	CGA	2	6	4427	4432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301803
24	NC_015970	GCC	2	6	4550	4555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301803
25	NC_015970	GGT	2	6	4613	4618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301803
26	NC_015970	GCT	2	6	4688	4693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301803
27	NC_015970	CGC	2	6	4786	4791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301803
28	NC_015970	AGC	2	6	4801	4806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301803
29	NC_015970	TCT	2	6	4906	4911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301803
30	NC_015970	AGC	3	9	4918	4926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301803
31	NC_015970	GGC	2	6	4934	4939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301803
32	NC_015970	GAG	2	6	6456	6461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301804
33	NC_015970	GAC	2	6	6493	6498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301804
34	NC_015970	TCG	2	6	6589	6594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301804
35	NC_015970	CAC	2	6	6658	6663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301804
36	NC_015970	GGT	2	6	6667	6672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301804
37	NC_015970	CAG	2	6	6769	6774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301804
38	NC_015970	TGG	2	6	6884	6889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301804
39	NC_015970	TGT	2	6	6915	6920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345301804
40	NC_015970	CGC	2	6	7017	7022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301804
41	NC_015970	CGC	2	6	7242	7247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301804
42	NC_015970	CCT	2	6	7263	7268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301804
43	NC_015970	TGG	2	6	9932	9937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301805
44	NC_015970	GGC	2	6	9999	10004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301805
45	NC_015970	GGC	2	6	10170	10175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301805
46	NC_015970	TGG	2	6	10256	10261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301805
47	NC_015970	TCG	2	6	10272	10277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301805
48	NC_015970	GCT	2	6	10410	10415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301805
49	NC_015970	TAC	2	6	10610	10615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301806
50	NC_015970	TCG	2	6	10625	10630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301806
51	NC_015970	GGT	2	6	10668	10673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301806
52	NC_015970	GCC	2	6	10685	10690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301806
53	NC_015970	TGG	2	6	10794	10799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301806
54	NC_015970	CAG	2	6	10814	10819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301806
55	NC_015970	TCG	2	6	10853	10858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301806
56	NC_015970	GAG	2	6	10875	10880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301806
57	NC_015970	CGA	2	6	11171	11176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301806
58	NC_015970	GCC	2	6	11181	11186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301806
59	NC_015970	CCG	2	6	11208	11213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301806
60	NC_015970	GCC	2	6	11253	11258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301806
61	NC_015970	GCA	2	6	11275	11280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301806
62	NC_015970	TGG	2	6	11305	11310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301806
63	NC_015970	CTA	2	6	11369	11374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301806
64	NC_015970	CCT	2	6	11487	11492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301807
65	NC_015970	GAG	2	6	11509	11514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301807
66	NC_015970	CGA	2	6	11739	11744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301807
67	NC_015970	AGC	2	6	11771	11776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301807
68	NC_015970	AAC	2	6	11827	11832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345301807
69	NC_015970	GAA	2	6	11855	11860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301807
70	NC_015970	GCT	2	6	11911	11916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301807
71	NC_015970	CTG	2	6	11924	11929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301807
72	NC_015970	TTC	2	6	11963	11968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301807
73	NC_015970	TGG	2	6	11998	12003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301807
74	NC_015970	GCC	2	6	12007	12012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301807
75	NC_015970	TGG	2	6	12079	12084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301807
76	NC_015970	ATC	2	6	12110	12115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301807
77	NC_015970	TGG	2	6	12121	12126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301807
78	NC_015970	GAG	2	6	12182	12187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301807
79	NC_015970	CTG	2	6	12307	12312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301807
80	NC_015970	GAG	2	6	12364	12369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301807
81	NC_015970	GGC	2	6	12476	12481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301807
82	NC_015970	CGA	2	6	12507	12512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301807
83	NC_015970	TCA	2	6	12533	12538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301807
84	NC_015970	AGA	2	6	12651	12656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301808
85	NC_015970	TTC	2	6	12687	12692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301808
86	NC_015970	CGG	2	6	12714	12719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301808
87	NC_015970	ACC	2	6	12796	12801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301808
88	NC_015970	GTA	2	6	12903	12908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301808
89	NC_015970	TCG	2	6	12913	12918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301808
90	NC_015970	GCG	2	6	13003	13008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301808
91	NC_015970	GCG	2	6	13038	13043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301808
92	NC_015970	AGC	2	6	13312	13317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301808
93	NC_015970	AGC	2	6	13351	13356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301808
94	NC_015970	GGC	2	6	13359	13364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301808
95	NC_015970	TGG	2	6	13424	13429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301808
96	NC_015970	CAG	2	6	13440	13445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301808
97	NC_015970	TAG	2	6	13456	13461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301808
98	NC_015970	GCA	2	6	13589	13594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301808
99	NC_015970	AGC	2	6	13817	13822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301809
100	NC_015970	CGG	2	6	13847	13852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301809
101	NC_015970	CGT	2	6	13876	13881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301809
102	NC_015970	GAG	2	6	13906	13911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301809
103	NC_015970	GAT	2	6	13927	13932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301809
104	NC_015970	GAG	3	9	13933	13941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301809
105	NC_015970	AGG	2	6	13985	13990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301809
106	NC_015970	GCG	2	6	14037	14042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301809
107	NC_015970	TGC	2	6	14054	14059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301809
108	NC_015970	CGT	2	6	14084	14089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301809
109	NC_015970	GCT	2	6	14127	14132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301809
110	NC_015970	TTC	2	6	14145	14150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301809
111	NC_015970	TGC	2	6	14168	14173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301809
112	NC_015970	TGC	2	6	14180	14185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301809
113	NC_015970	TGG	2	6	14276	14281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301809
114	NC_015970	TGC	2	6	14306	14311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301809
115	NC_015970	GCG	2	6	14396	14401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301809
116	NC_015970	GGC	2	6	14446	14451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301809
117	NC_015970	GAG	2	6	14497	14502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301809
118	NC_015970	TGC	2	6	14633	14638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301809
119	NC_015970	CGG	2	6	14660	14665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301809
120	NC_015970	CGT	2	6	14666	14671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301809
121	NC_015970	GGT	2	6	14684	14689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301809
122	NC_015970	ATG	2	6	14837	14842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301810
123	NC_015970	GGC	2	6	14848	14853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301810
124	NC_015970	GTT	2	6	14856	14861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345301810
125	NC_015970	GGT	2	6	14919	14924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301810
126	NC_015970	GAT	2	6	14926	14931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301810
127	NC_015970	TTG	2	6	15727	15732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345301811
128	NC_015970	TTA	2	6	15760	15765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345301811
129	NC_015970	CTA	2	6	15788	15793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301811
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131	NC_015970	GTT	2	6	15869	15874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345301811
132	NC_015970	CTT	2	6	15890	15895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301811
133	NC_015970	CCG	2	6	15896	15901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301811
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140	NC_015970	GGA	2	6	16286	16291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301811
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142	NC_015970	CAA	2	6	16349	16354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345301811
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144	NC_015970	GCG	2	6	16448	16453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301811
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249	NC_015970	TCT	2	6	23146	23151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301815
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252	NC_015970	TCG	2	6	23479	23484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301815
253	NC_015970	GAC	2	6	23562	23567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301815
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375	NC_015970	TGG	2	6	34164	34169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301827
376	NC_015970	ATG	2	6	34260	34265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301827
377	NC_015970	GCT	2	6	34276	34281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301827
378	NC_015970	GTG	2	6	34310	34315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301827
379	NC_015970	AGT	2	6	34429	34434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301827
380	NC_015970	TAC	2	6	34482	34487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301827
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400	NC_015970	TAC	2	6	38363	38368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301832
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497	NC_015970	CGG	2	6	51248	51253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301839
498	NC_015970	CCT	2	6	51254	51259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301839
499	NC_015970	GTA	2	6	51265	51270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301839
500	NC_015970	GCC	2	6	51271	51276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301839

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