MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 plasmid pRHOM17201

Total Repeats: 1665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015970	CCA	2	6	93262	93267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301873
1502	NC_015970	TTTC	2	8	93298	93305	0 %	75 %	0 %	25 %	345301873
1503	NC_015970	GACAGC	2	12	93548	93559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301874
1504	NC_015970	CGC	2	6	93623	93628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301874
1505	NC_015970	TCA	2	6	93633	93638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301874
1506	NC_015970	CCT	2	6	93725	93730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301874
1507	NC_015970	GCT	2	6	93731	93736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301874
1508	NC_015970	GAAA	2	8	93739	93746	75 %	0 %	25 %	0 %	345301874
1509	NC_015970	CCTT	2	8	93832	93839	0 %	50 %	0 %	50 %	345301874
1510	NC_015970	GAA	2	6	93923	93928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301874
1511	NC_015970	GTT	2	6	93995	94000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345301874
1512	NC_015970	GCT	2	6	94009	94014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301874
1513	NC_015970	GC	3	6	94024	94029	0 %	0 %	50 %	50 %	345301874
1514	NC_015970	CCT	2	6	94045	94050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301874
1515	NC_015970	GAA	2	6	94064	94069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301874
1516	NC_015970	CGGG	2	8	94265	94272	0 %	0 %	75 %	25 %	345301874
1517	NC_015970	CTT	2	6	94373	94378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301874
1518	NC_015970	AGA	2	6	94408	94413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301874
1519	NC_015970	CGG	2	6	94494	94499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301874
1520	NC_015970	TCA	2	6	94516	94521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301874
1521	NC_015970	GTA	2	6	94556	94561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301874
1522	NC_015970	GCGTC	2	10	94562	94571	0 %	20 %	40 %	40 %	345301874
1523	NC_015970	GGC	2	6	94598	94603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301874
1524	NC_015970	ATC	2	6	95057	95062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301875
1525	NC_015970	GAA	2	6	95099	95104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301875
1526	NC_015970	GATGCA	2	12	95114	95125	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345301875
1527	NC_015970	CGGC	2	8	95136	95143	0 %	0 %	50 %	50 %	345301875
1528	NC_015970	TCC	2	6	95150	95155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301875
1529	NC_015970	AGA	3	9	95160	95168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301875
1530	NC_015970	CGG	2	6	95224	95229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301875
1531	NC_015970	GCC	2	6	95274	95279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301875
1532	NC_015970	TCA	2	6	95965	95970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301876
1533	NC_015970	AAAG	3	12	96043	96054	75 %	0 %	25 %	0 %	345301876
1534	NC_015970	CAT	2	6	96104	96109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301876
1535	NC_015970	ACT	2	6	96160	96165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301876
1536	NC_015970	AAC	2	6	96182	96187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345301876
1537	NC_015970	ACC	2	6	96328	96333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301876
1538	NC_015970	ACT	2	6	96352	96357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301876
1539	NC_015970	CGG	2	6	96381	96386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301876
1540	NC_015970	CGG	2	6	96419	96424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301876
1541	NC_015970	ATGGGA	2	12	96468	96479	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	345301876
1542	NC_015970	CGC	2	6	96507	96512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301876
1543	NC_015970	AAG	2	6	96543	96548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301876
1544	NC_015970	TCA	2	6	96562	96567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301876
1545	NC_015970	CAT	2	6	96584	96589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301876
1546	NC_015970	GATG	2	8	96759	96766	25 %	25 %	50 %	0 %	345301876
1547	NC_015970	GACGCT	2	12	97147	97158	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345301877
1548	NC_015970	CG	3	6	97313	97318	0 %	0 %	50 %	50 %	345301877
1549	NC_015970	CCT	2	6	97392	97397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301877
1550	NC_015970	GCG	2	6	97428	97433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301877
1551	NC_015970	CG	3	6	97455	97460	0 %	0 %	50 %	50 %	345301877
1552	NC_015970	GGC	2	6	97461	97466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301877
1553	NC_015970	ATC	2	6	97494	97499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301877
1554	NC_015970	GC	3	6	97517	97522	0 %	0 %	50 %	50 %	345301877
1555	NC_015970	GCT	2	6	97540	97545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301877
1556	NC_015970	CGAC	2	8	97549	97556	25 %	0 %	25 %	50 %	345301877
1557	NC_015970	GGC	2	6	97603	97608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301877
1558	NC_015970	TCG	2	6	97831	97836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301878
1559	NC_015970	CGT	2	6	97850	97855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301878
1560	NC_015970	CGT	2	6	97880	97885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301878
1561	NC_015970	GGA	2	6	97898	97903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301878
1562	NC_015970	AAG	2	6	97920	97925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301878
1563	NC_015970	GGA	2	6	98012	98017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301878
1564	NC_015970	ATC	2	6	98019	98024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301878
1565	NC_015970	GAGG	2	8	98033	98040	25 %	0 %	75 %	0 %	345301878
1566	NC_015970	TCG	2	6	98081	98086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301879
1567	NC_015970	TGG	2	6	98093	98098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301879
1568	NC_015970	CGA	2	6	98106	98111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301879
1569	NC_015970	GCTTG	2	10	98137	98146	0 %	40 %	40 %	20 %	345301879
1570	NC_015970	ACC	2	6	98213	98218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301879
1571	NC_015970	AGG	2	6	98234	98239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301879
1572	NC_015970	GCC	2	6	98347	98352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301879
1573	NC_015970	CAT	2	6	100825	100830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301880
1574	NC_015970	TCG	2	6	100845	100850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301880
1575	NC_015970	GC	3	6	100865	100870	0 %	0 %	50 %	50 %	345301880
1576	NC_015970	CAC	2	6	100918	100923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301880
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1579	NC_015970	GGC	2	6	100949	100954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301880
1580	NC_015970	CAT	2	6	100982	100987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301880
1581	NC_015970	ACT	2	6	101085	101090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301880
1582	NC_015970	CAC	2	6	101101	101106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301880
1583	NC_015970	TCT	2	6	101115	101120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301880
1584	NC_015970	TGT	2	6	101144	101149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345301880
1585	NC_015970	TCG	2	6	101164	101169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301880
1586	NC_015970	TCC	2	6	101182	101187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301880
1587	NC_015970	CTA	2	6	101206	101211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301880
1588	NC_015970	CGC	2	6	101234	101239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301880
1589	NC_015970	CGCC	2	8	101304	101311	0 %	0 %	25 %	75 %	345301880
1590	NC_015970	GCT	2	6	101440	101445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301880
1591	NC_015970	GCA	2	6	101500	101505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301880
1592	NC_015970	GCG	2	6	101512	101517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301880
1593	NC_015970	CTG	2	6	101552	101557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301880
1594	NC_015970	TGT	2	6	101607	101612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345301880
1595	NC_015970	CTG	2	6	101615	101620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301880
1596	NC_015970	GAG	2	6	101720	101725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301881
1597	NC_015970	GCG	2	6	101753	101758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301881
1598	NC_015970	CCA	4	12	101785	101796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301881
1599	NC_015970	CG	3	6	101830	101835	0 %	0 %	50 %	50 %	345301881
1600	NC_015970	CCG	2	6	101894	101899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301881
1601	NC_015970	CATC	2	8	101929	101936	25 %	25 %	0 %	50 %	345301881
1602	NC_015970	CT	3	6	102143	102148	0 %	50 %	0 %	50 %	345301882
1603	NC_015970	CAA	2	6	102203	102208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345301882
1604	NC_015970	TCAATT	2	12	102223	102234	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	345301882
1605	NC_015970	TCA	2	6	102253	102258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301882
1606	NC_015970	GTA	2	6	102345	102350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301882
1607	NC_015970	AAAG	2	8	102397	102404	75 %	0 %	25 %	0 %	345301883
1608	NC_015970	AT	3	6	102467	102472	50 %	50 %	0 %	0 %	345301883
1609	NC_015970	TCCAT	2	10	102540	102549	20 %	40 %	0 %	40 %	345301883
1610	NC_015970	CGT	2	6	102595	102600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301883
1611	NC_015970	CGC	2	6	103327	103332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301884
1612	NC_015970	TCG	2	6	103348	103353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301884
1613	NC_015970	GAC	2	6	103358	103363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301884
1614	NC_015970	CG	3	6	103377	103382	0 %	0 %	50 %	50 %	345301884
1615	NC_015970	ATC	2	6	103429	103434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301884
1616	NC_015970	CTGAT	2	10	103447	103456	20 %	40 %	20 %	20 %	345301884
1617	NC_015970	TCG	2	6	103460	103465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301884
1618	NC_015970	GGC	2	6	103545	103550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301884
1619	NC_015970	GGTCT	2	10	103554	103563	0 %	40 %	40 %	20 %	345301884
1620	NC_015970	CTT	2	6	103577	103582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301884
1621	NC_015970	CCT	2	6	103586	103591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301884
1622	NC_015970	TTTC	2	8	103661	103668	0 %	75 %	0 %	25 %	345301884
1623	NC_015970	TCG	2	6	103705	103710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301884
1624	NC_015970	CCA	2	6	103712	103717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301884
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1627	NC_015970	TGA	2	6	103805	103810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301884
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1632	NC_015970	CTG	3	9	104058	104066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301884
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