MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 plasmid pRHOM17201

Total Repeats: 1665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015970	GAA	2	6	33140	33145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301827
502	NC_015970	ACC	2	6	33212	33217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301827
503	NC_015970	CCGATG	2	12	33258	33269	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345301827
504	NC_015970	CTGC	2	8	33299	33306	0 %	25 %	25 %	50 %	345301827
505	NC_015970	GCG	2	6	33323	33328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301827
506	NC_015970	ACG	3	9	33407	33415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301827
507	NC_015970	TAT	2	6	33714	33719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345301827
508	NC_015970	CGG	2	6	33723	33728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301827
509	NC_015970	GAC	2	6	33769	33774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301827
510	NC_015970	CG	3	6	33789	33794	0 %	0 %	50 %	50 %	345301827
511	NC_015970	AGG	2	6	33819	33824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301827
512	NC_015970	GT	3	6	33912	33917	0 %	50 %	50 %	0 %	345301827
513	NC_015970	TGG	2	6	33972	33977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301827
514	NC_015970	CAA	2	6	33985	33990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345301827
515	NC_015970	GA	3	6	34041	34046	50 %	0 %	50 %	0 %	345301827
516	NC_015970	TCA	2	6	34062	34067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301827
517	NC_015970	GGA	2	6	34150	34155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301827
518	NC_015970	TGG	2	6	34164	34169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301827
519	NC_015970	ATG	2	6	34260	34265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301827
520	NC_015970	GCT	2	6	34276	34281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301827
521	NC_015970	GTG	2	6	34310	34315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301827
522	NC_015970	GGAT	2	8	34398	34405	25 %	25 %	50 %	0 %	345301827
523	NC_015970	AGT	2	6	34429	34434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301827
524	NC_015970	TAC	2	6	34482	34487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301827
525	NC_015970	CGG	2	6	34488	34493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301827
526	NC_015970	CGG	2	6	34533	34538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301827
527	NC_015970	GCA	4	12	36226	36237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301829
528	NC_015970	ATC	2	6	36254	36259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301829
529	NC_015970	CCT	2	6	36283	36288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301829
530	NC_015970	CGGC	2	8	36430	36437	0 %	0 %	50 %	50 %	345301829
531	NC_015970	CGG	2	6	36470	36475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301829
532	NC_015970	TCA	2	6	36602	36607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301829
533	NC_015970	GAT	2	6	36680	36685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301829
534	NC_015970	ACT	2	6	36718	36723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301829
535	NC_015970	TCC	2	6	36852	36857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301830
536	NC_015970	CCA	2	6	36904	36909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301830
537	NC_015970	ACCT	2	8	36923	36930	25 %	25 %	0 %	50 %	345301830
538	NC_015970	CG	3	6	36943	36948	0 %	0 %	50 %	50 %	345301830
539	NC_015970	GAG	2	6	36977	36982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301830
540	NC_015970	GC	3	6	37079	37084	0 %	0 %	50 %	50 %	345301830
541	NC_015970	TCC	2	6	37116	37121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301830
542	NC_015970	TGG	2	6	37250	37255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301831
543	NC_015970	GC	4	8	37323	37330	0 %	0 %	50 %	50 %	345301831
544	NC_015970	GCAG	2	8	37338	37345	25 %	0 %	50 %	25 %	345301831
545	NC_015970	TCC	2	6	37358	37363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301831
546	NC_015970	GAC	2	6	37417	37422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301831
547	NC_015970	TTC	2	6	37456	37461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301831
548	NC_015970	GTT	2	6	38202	38207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345301832
549	NC_015970	CG	3	6	38240	38245	0 %	0 %	50 %	50 %	345301832
550	NC_015970	GTC	2	6	38273	38278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301832
551	NC_015970	AGCGAA	2	12	38318	38329	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	345301832
552	NC_015970	TAC	2	6	38363	38368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301832
553	NC_015970	ACG	2	6	38388	38393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301832
554	NC_015970	GGC	2	6	38423	38428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301832
555	NC_015970	CTGT	2	8	38449	38456	0 %	50 %	25 %	25 %	345301832
556	NC_015970	GGA	2	6	38464	38469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301832
557	NC_015970	TGA	2	6	38475	38480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301832
558	NC_015970	GCT	2	6	40024	40029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301833
559	NC_015970	GC	3	6	40040	40045	0 %	0 %	50 %	50 %	345301833
560	NC_015970	GCC	2	6	40058	40063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301833
561	NC_015970	GTG	2	6	40082	40087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301833
562	NC_015970	CGCC	2	8	40119	40126	0 %	0 %	25 %	75 %	345301833
563	NC_015970	GTG	2	6	40130	40135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301833
564	NC_015970	CTT	2	6	40153	40158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301833
565	NC_015970	ACG	2	6	40166	40171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301833
566	NC_015970	CTTC	2	8	40183	40190	0 %	50 %	0 %	50 %	345301833
567	NC_015970	GGC	2	6	40201	40206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301833
568	NC_015970	GC	4	8	40239	40246	0 %	0 %	50 %	50 %	345301833
569	NC_015970	TCA	2	6	40281	40286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301833
570	NC_015970	AGC	2	6	40311	40316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301833
571	NC_015970	GCC	2	6	40336	40341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301833
572	NC_015970	GAT	2	6	40399	40404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301833
573	NC_015970	GC	4	8	40443	40450	0 %	0 %	50 %	50 %	345301833
574	NC_015970	GCG	2	6	40465	40470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301833
575	NC_015970	GC	3	6	40476	40481	0 %	0 %	50 %	50 %	345301833
576	NC_015970	TCT	2	6	40549	40554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301833
577	NC_015970	GGA	2	6	40555	40560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301833
578	NC_015970	CGG	2	6	40603	40608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301833
579	NC_015970	GCG	2	6	40627	40632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301833
580	NC_015970	CG	3	6	40631	40636	0 %	0 %	50 %	50 %	345301833
581	NC_015970	GCC	2	6	40647	40652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301833
582	NC_015970	GTG	2	6	40671	40676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301833
583	NC_015970	GGC	2	6	40719	40724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301833
584	NC_015970	GGC	3	9	40732	40740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301833
585	NC_015970	GGC	2	6	40753	40758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301833
586	NC_015970	GC	3	6	40757	40762	0 %	0 %	50 %	50 %	345301833
587	NC_015970	ACC	2	6	40797	40802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301833
588	NC_015970	TGC	2	6	40827	40832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301833
589	NC_015970	GC	4	8	40845	40852	0 %	0 %	50 %	50 %	345301833
590	NC_015970	GC	3	6	40953	40958	0 %	0 %	50 %	50 %	345301833
591	NC_015970	GAG	2	6	41099	41104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301833
592	NC_015970	TCG	2	6	41124	41129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301833
593	NC_015970	ACG	2	6	41178	41183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301833
594	NC_015970	GGT	2	6	41191	41196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301833
595	NC_015970	GCT	2	6	41304	41309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301834
596	NC_015970	GC	3	6	41406	41411	0 %	0 %	50 %	50 %	345301834
597	NC_015970	GAC	2	6	41494	41499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301834
598	NC_015970	CAGC	2	8	41520	41527	25 %	0 %	25 %	50 %	345301834
599	NC_015970	CCT	2	6	41530	41535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301834
600	NC_015970	GGCCT	2	10	41557	41566	0 %	20 %	40 %	40 %	345301834
601	NC_015970	TGC	2	6	41585	41590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301834
602	NC_015970	CG	3	6	41638	41643	0 %	0 %	50 %	50 %	345301834
603	NC_015970	CG	3	6	41653	41658	0 %	0 %	50 %	50 %	345301834
604	NC_015970	TGC	2	6	41715	41720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301834
605	NC_015970	GCT	2	6	41823	41828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301835
606	NC_015970	GC	4	8	41841	41848	0 %	0 %	50 %	50 %	345301835
607	NC_015970	CTT	2	6	41866	41871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301835
608	NC_015970	CG	3	6	41949	41954	0 %	0 %	50 %	50 %	345301835
609	NC_015970	GCT	2	6	42032	42037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301835
610	NC_015970	TGC	2	6	42068	42073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301835
611	NC_015970	ACA	2	6	42170	42175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345301835
612	NC_015970	CT	3	6	42218	42223	0 %	50 %	0 %	50 %	345301835
613	NC_015970	CGC	2	6	42315	42320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301836
614	NC_015970	CAG	2	6	42342	42347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301836
615	NC_015970	CTG	2	6	42354	42359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301836
616	NC_015970	TGCCG	2	10	42410	42419	0 %	20 %	40 %	40 %	345301836
617	NC_015970	CGC	2	6	42501	42506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301836
618	NC_015970	TGCCT	2	10	42522	42531	0 %	40 %	20 %	40 %	345301836
619	NC_015970	ACG	2	6	42562	42567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301836
620	NC_015970	GCC	2	6	42570	42575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301836
621	NC_015970	CAC	2	6	42579	42584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301836
622	NC_015970	TG	3	6	42590	42595	0 %	50 %	50 %	0 %	345301836
623	NC_015970	AGC	2	6	42661	42666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301836
624	NC_015970	GCT	2	6	42680	42685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301836
625	NC_015970	GGT	2	6	42716	42721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301836
626	NC_015970	GTG	2	6	42724	42729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301836
627	NC_015970	GCT	2	6	42785	42790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301836
628	NC_015970	GCTACC	2	12	42829	42840	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345301836
629	NC_015970	GAC	2	6	42882	42887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301836
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631	NC_015970	TGG	2	6	43009	43014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301836
632	NC_015970	CGC	2	6	43066	43071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301836
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643	NC_015970	GCA	2	6	44922	44927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301837
644	NC_015970	GCA	2	6	44940	44945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301837
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652	NC_015970	CGA	2	6	45400	45405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301837
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756	NC_015970	CAG	2	6	53421	53426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301840
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1000	NC_015970	AGC	2	6	66049	66054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301852

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