MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015966	CG	3	6	181532	181537	0 %	0 %	50 %	50 %	345302051
4002	NC_015966	CGA	2	6	181559	181564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302051
4003	NC_015966	TCT	2	6	181576	181581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302051
4004	NC_015966	GCG	2	6	181632	181637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302051
4005	NC_015966	TGG	2	6	181647	181652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302051
4006	NC_015966	CCG	2	6	181702	181707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302051
4007	NC_015966	CGC	2	6	181768	181773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302051
4008	NC_015966	CCG	2	6	181860	181865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302051
4009	NC_015966	GGC	2	6	181872	181877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302051
4010	NC_015966	GTG	2	6	181884	181889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302051
4011	NC_015966	GAC	2	6	181915	181920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302051
4012	NC_015966	GCC	2	6	181924	181929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302051
4013	NC_015966	GTCG	2	8	182017	182024	0 %	25 %	50 %	25 %	345302052
4014	NC_015966	G	6	6	182065	182070	0 %	0 %	100 %	0 %	345302052
4015	NC_015966	GGA	2	6	182110	182115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302052
4016	NC_015966	GGCT	2	8	182186	182193	0 %	25 %	50 %	25 %	345302052
4017	NC_015966	GGC	2	6	182206	182211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302052
4018	NC_015966	CCA	2	6	182221	182226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302052
4019	NC_015966	GCA	2	6	182278	182283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302052
4020	NC_015966	ACG	2	6	182286	182291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302052
4021	NC_015966	GCG	2	6	182311	182316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302052
4022	NC_015966	AGC	2	6	182418	182423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302052
4023	NC_015966	A	6	6	182426	182431	100 %	0 %	0 %	0 %	345302052
4024	NC_015966	ACGA	2	8	182491	182498	50 %	0 %	25 %	25 %	345302053
4025	NC_015966	ACG	2	6	182507	182512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302053
4026	NC_015966	GATC	2	8	182515	182522	25 %	25 %	25 %	25 %	345302053
4027	NC_015966	GTG	3	9	182561	182569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302053
4028	NC_015966	GCGCC	2	10	182605	182614	0 %	0 %	40 %	60 %	345302053
4029	NC_015966	CCGG	2	8	182685	182692	0 %	0 %	50 %	50 %	345302053
4030	NC_015966	CGCA	2	8	182762	182769	25 %	0 %	25 %	50 %	345302053
4031	NC_015966	ACG	2	6	182781	182786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302053
4032	NC_015966	CGG	2	6	182791	182796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302053
4033	NC_015966	GCC	2	6	182804	182809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302053
4034	NC_015966	TGG	2	6	182816	182821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302053
4035	NC_015966	CTG	2	6	182822	182827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302053
4036	NC_015966	GGCT	2	8	182828	182835	0 %	25 %	50 %	25 %	345302053
4037	NC_015966	ACG	2	6	182841	182846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302053
4038	NC_015966	CGG	2	6	182863	182868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302053
4039	NC_015966	GGGA	2	8	182886	182893	25 %	0 %	75 %	0 %	345302053
4040	NC_015966	CCGG	2	8	182950	182957	0 %	0 %	50 %	50 %	345302053
4041	NC_015966	GGT	2	6	182962	182967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302053
4042	NC_015966	CGA	2	6	182974	182979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302053
4043	NC_015966	TGC	2	6	182982	182987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302053
4044	NC_015966	GGC	2	6	183009	183014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302053
4045	NC_015966	CG	3	6	183034	183039	0 %	0 %	50 %	50 %	345302053
4046	NC_015966	CGAT	2	8	183060	183067	25 %	25 %	25 %	25 %	345302053
4047	NC_015966	GGCC	2	8	183073	183080	0 %	0 %	50 %	50 %	345302053
4048	NC_015966	GTC	2	6	183203	183208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302053
4049	NC_015966	GCC	2	6	183233	183238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302053
4050	NC_015966	CGG	2	6	183323	183328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302053
4051	NC_015966	CGGCG	2	10	183960	183969	0 %	0 %	60 %	40 %	345302054
4052	NC_015966	TGC	2	6	183995	184000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302054
4053	NC_015966	GC	3	6	184007	184012	0 %	0 %	50 %	50 %	345302054
4054	NC_015966	CTA	2	6	184041	184046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302054
4055	NC_015966	CCA	3	9	184077	184085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302054
4056	NC_015966	CAG	2	6	184123	184128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302054
4057	NC_015966	CCAGCA	2	12	184137	184148	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	345302054
4058	NC_015966	GGC	2	6	184165	184170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302054
4059	NC_015966	CG	3	6	184203	184208	0 %	0 %	50 %	50 %	345302054
4060	NC_015966	GCCG	2	8	184284	184291	0 %	0 %	50 %	50 %	345302054
4061	NC_015966	CGA	2	6	184323	184328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302054
4062	NC_015966	TCA	2	6	184356	184361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302054
4063	NC_015966	GCTTC	2	10	184365	184374	0 %	40 %	20 %	40 %	345302054
4064	NC_015966	GGC	2	6	184416	184421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302054
4065	NC_015966	CCG	2	6	184448	184453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302054
4066	NC_015966	GTGCG	2	10	184474	184483	0 %	20 %	60 %	20 %	345302054
4067	NC_015966	TTG	2	6	184488	184493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302054
4068	NC_015966	TGCGGG	2	12	184523	184534	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	345302055
4069	NC_015966	GGC	2	6	184595	184600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302055
4070	NC_015966	CAGC	2	8	184620	184627	25 %	0 %	25 %	50 %	345302055
4071	NC_015966	CGGT	2	8	184707	184714	0 %	25 %	50 %	25 %	345302055
4072	NC_015966	CGG	2	6	184736	184741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302055
4073	NC_015966	AGG	2	6	184756	184761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302055
4074	NC_015966	GCT	2	6	184803	184808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302055
4075	NC_015966	AGCCG	2	10	184813	184822	20 %	0 %	40 %	40 %	345302055
4076	NC_015966	AGCC	2	8	184840	184847	25 %	0 %	25 %	50 %	345302055
4077	NC_015966	GC	4	8	184938	184945	0 %	0 %	50 %	50 %	345302055
4078	NC_015966	CTGGCG	2	12	185010	185021	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302055
4079	NC_015966	GCA	2	6	185027	185032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302055
4080	NC_015966	GCG	2	6	185053	185058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302055
4081	NC_015966	GTA	2	6	185184	185189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302055
4082	NC_015966	CCTC	2	8	185191	185198	0 %	25 %	0 %	75 %	345302055
4083	NC_015966	TCG	2	6	185269	185274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302055
4084	NC_015966	GTC	2	6	185277	185282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302055
4085	NC_015966	TGG	2	6	185315	185320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302055
4086	NC_015966	GCC	2	6	185440	185445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302055
4087	NC_015966	TCT	2	6	185479	185484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302055
4088	NC_015966	CTCG	2	8	185525	185532	0 %	25 %	25 %	50 %	345302055
4089	NC_015966	GT	3	6	185576	185581	0 %	50 %	50 %	0 %	345302055
4090	NC_015966	GAA	2	6	185583	185588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302055
4091	NC_015966	CGT	2	6	185594	185599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302055
4092	NC_015966	GGA	2	6	185609	185614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302055
4093	NC_015966	CGG	2	6	185626	185631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302055
4094	NC_015966	GCAGGT	2	12	185657	185668	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345302055
4095	NC_015966	CAG	2	6	185694	185699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302055
4096	NC_015966	GTG	2	6	185746	185751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302055
4097	NC_015966	GGTA	2	8	185780	185787	25 %	25 %	50 %	0 %	345302055
4098	NC_015966	CAG	2	6	185853	185858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302055
4099	NC_015966	GCA	2	6	185900	185905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302055
4100	NC_015966	GCC	3	9	185907	185915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302055
4101	NC_015966	GCG	2	6	185939	185944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302055
4102	NC_015966	GGT	2	6	186001	186006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302055
4103	NC_015966	C	6	6	186015	186020	0 %	0 %	0 %	100 %	345302055
4104	NC_015966	CCAG	2	8	186065	186072	25 %	0 %	25 %	50 %	345302055
4105	NC_015966	GGCC	2	8	186098	186105	0 %	0 %	50 %	50 %	345302055
4106	NC_015966	CTG	2	6	186111	186116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302055
4107	NC_015966	GTC	2	6	186205	186210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302055
4108	NC_015966	GCT	2	6	186272	186277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302055
4109	NC_015966	CAG	2	6	186405	186410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302055
4110	NC_015966	AGC	2	6	186430	186435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302055
4111	NC_015966	GGC	2	6	186460	186465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302056
4112	NC_015966	GCC	2	6	186480	186485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302056
4113	NC_015966	CAG	2	6	186486	186491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302056
4114	NC_015966	TGCAGG	2	12	186493	186504	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345302056
4115	NC_015966	CCA	2	6	186596	186601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302056
4116	NC_015966	TCT	2	6	186628	186633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302056
4117	NC_015966	CAC	2	6	186717	186722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302056
4118	NC_015966	ATG	2	6	186769	186774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302056
4119	NC_015966	AAC	2	6	186781	186786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302056
4120	NC_015966	GGA	2	6	186955	186960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302057
4121	NC_015966	ATC	2	6	187066	187071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302057
4122	NC_015966	GAACCT	2	12	187208	187219	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345302057
4123	NC_015966	GC	3	6	187292	187297	0 %	0 %	50 %	50 %	345302057
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4240	NC_015966	T	6	6	192392	192397	0 %	100 %	0 %	0 %	345302064
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4243	NC_015966	GCC	2	6	192630	192635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302065
4244	NC_015966	GCG	2	6	192749	192754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302065
4245	NC_015966	CGA	2	6	192755	192760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302065
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4361	NC_015966	CAG	4	12	197211	197222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302068
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4363	NC_015966	CGC	2	6	197235	197240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302068
4364	NC_015966	CGCC	2	8	197258	197265	0 %	0 %	25 %	75 %	345302068
4365	NC_015966	CAG	3	9	197286	197294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302068
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4481	NC_015966	CTGT	2	8	202659	202666	0 %	50 %	25 %	25 %	345302074
4482	NC_015966	ATC	2	6	202669	202674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302074
4483	NC_015966	CGA	2	6	202790	202795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302075
4484	NC_015966	CTG	2	6	202837	202842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302075
4485	NC_015966	GCA	2	6	202860	202865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302075
4486	NC_015966	GGC	2	6	202890	202895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302075
4487	NC_015966	GC	3	6	202928	202933	0 %	0 %	50 %	50 %	345302075
4488	NC_015966	GGC	2	6	202950	202955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302075
4489	NC_015966	ACG	2	6	203006	203011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302075
4490	NC_015966	CAA	2	6	203112	203117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302075
4491	NC_015966	CGCTGG	2	12	203180	203191	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302075
4492	NC_015966	TGC	2	6	203192	203197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302075
4493	NC_015966	CAT	2	6	203217	203222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302075
4494	NC_015966	ACG	2	6	203307	203312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302076
4495	NC_015966	GGT	2	6	203330	203335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302076
4496	NC_015966	GGC	2	6	203347	203352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302076
4497	NC_015966	G	6	6	203368	203373	0 %	0 %	100 %	0 %	345302076
4498	NC_015966	CGGCG	2	10	203443	203452	0 %	0 %	60 %	40 %	345302076
4499	NC_015966	CAT	2	6	203569	203574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302076
4500	NC_015966	CAA	2	6	203608	203613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302076

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