MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_015966	ACG	3	9	90538	90546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301969
2004	NC_015966	CGC	2	6	90571	90576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301969
2005	NC_015966	GTCG	2	8	90585	90592	0 %	25 %	50 %	25 %	345301969
2006	NC_015966	AGA	2	6	90602	90607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301969
2007	NC_015966	CGAG	2	8	90749	90756	25 %	0 %	50 %	25 %	345301969
2008	NC_015966	TCG	2	6	90844	90849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301969
2009	NC_015966	AGC	2	6	90865	90870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301969
2010	NC_015966	GAT	2	6	90882	90887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301969
2011	NC_015966	CTT	2	6	90950	90955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301969
2012	NC_015966	GCGG	2	8	90960	90967	0 %	0 %	75 %	25 %	345301969
2013	NC_015966	CTCG	2	8	90989	90996	0 %	25 %	25 %	50 %	345301969
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2050	NC_015966	GCGG	2	8	92875	92882	0 %	0 %	75 %	25 %	345301971
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2247	NC_015966	GAA	2	6	100662	100667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301979
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2250	NC_015966	CGA	2	6	100733	100738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301979
2251	NC_015966	CTGG	2	8	100745	100752	0 %	25 %	50 %	25 %	345301979
2252	NC_015966	CGA	2	6	100772	100777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301979
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2254	NC_015966	CTG	2	6	100836	100841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301979
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2352	NC_015966	CTG	2	6	105680	105685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301983
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2357	NC_015966	TTGC	2	8	105830	105837	0 %	50 %	25 %	25 %	345301983
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2487	NC_015966	GTC	2	6	111253	111258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301988
2488	NC_015966	GCG	2	6	111268	111273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301988
2489	NC_015966	GCCAGC	2	12	111335	111346	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345301988
2490	NC_015966	ACG	2	6	111419	111424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301988
2491	NC_015966	GCA	2	6	111438	111443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301988
2492	NC_015966	GGT	2	6	111444	111449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301988
2493	NC_015966	CAG	4	12	111466	111477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301988
2494	NC_015966	GCC	2	6	111518	111523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301988
2495	NC_015966	ACGG	2	8	111529	111536	25 %	0 %	50 %	25 %	345301988
2496	NC_015966	TCG	2	6	111554	111559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301988
2497	NC_015966	CGG	2	6	111610	111615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301988
2498	NC_015966	GGC	2	6	111624	111629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301988
2499	NC_015966	GCGCC	2	10	111666	111675	0 %	0 %	40 %	60 %	345301988
2500	NC_015966	CGC	2	6	111695	111700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301988

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