MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015966	TCG	2	6	67764	67769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301952
1502	NC_015966	GCG	2	6	67787	67792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301953
1503	NC_015966	CAG	2	6	67793	67798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301953
1504	NC_015966	CAGG	2	8	67808	67815	25 %	0 %	50 %	25 %	345301953
1505	NC_015966	CGT	2	6	67856	67861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301953
1506	NC_015966	GCC	2	6	67862	67867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301953
1507	NC_015966	CTT	2	6	68000	68005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301953
1508	NC_015966	GCC	2	6	68030	68035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301953
1509	NC_015966	GC	3	6	68080	68085	0 %	0 %	50 %	50 %	345301953
1510	NC_015966	CGT	2	6	68125	68130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301953
1511	NC_015966	CTG	2	6	68258	68263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301953
1512	NC_015966	GCC	3	9	68274	68282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301953
1513	NC_015966	CTC	2	6	68297	68302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301953
1514	NC_015966	GGC	2	6	68303	68308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301953
1515	NC_015966	CGGC	2	8	68326	68333	0 %	0 %	50 %	50 %	345301953
1516	NC_015966	GGCG	2	8	68419	68426	0 %	0 %	75 %	25 %	345301953
1517	NC_015966	CCA	2	6	68431	68436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301953
1518	NC_015966	CAG	2	6	68492	68497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301953
1519	NC_015966	GCG	2	6	68520	68525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301953
1520	NC_015966	CCGCGC	2	12	68579	68590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301953
1521	NC_015966	CAG	2	6	68600	68605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301953
1522	NC_015966	GGCC	2	8	68659	68666	0 %	0 %	50 %	50 %	345301953
1523	NC_015966	TCG	2	6	68685	68690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301953
1524	NC_015966	CTG	2	6	68726	68731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301953
1525	NC_015966	TGC	2	6	68805	68810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301953
1526	NC_015966	GTCG	2	8	68839	68846	0 %	25 %	50 %	25 %	345301953
1527	NC_015966	CGGC	2	8	68854	68861	0 %	0 %	50 %	50 %	345301953
1528	NC_015966	TCT	2	6	68887	68892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301953
1529	NC_015966	CAG	2	6	68999	69004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301954
1530	NC_015966	GCA	2	6	69042	69047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301954
1531	NC_015966	GCG	2	6	69061	69066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301954
1532	NC_015966	CAG	2	6	69109	69114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301954
1533	NC_015966	GCA	2	6	69159	69164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301954
1534	NC_015966	CGG	2	6	69209	69214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301954
1535	NC_015966	GAA	2	6	69244	69249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301954
1536	NC_015966	GCA	2	6	69255	69260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301954
1537	NC_015966	AGG	2	6	69275	69280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301954
1538	NC_015966	AGC	2	6	69296	69301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301954
1539	NC_015966	GGC	2	6	69306	69311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301954
1540	NC_015966	TGG	2	6	69335	69340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301954
1541	NC_015966	GGC	2	6	69429	69434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301954
1542	NC_015966	GGA	2	6	69567	69572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301954
1543	NC_015966	ACG	2	6	69604	69609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301954
1544	NC_015966	GGC	2	6	69633	69638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301954
1545	NC_015966	GGCC	2	8	69660	69667	0 %	0 %	50 %	50 %	345301954
1546	NC_015966	GGC	2	6	69669	69674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301954
1547	NC_015966	GCA	2	6	69675	69680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301954
1548	NC_015966	GAC	2	6	69696	69701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301954
1549	NC_015966	GCA	2	6	69747	69752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301954
1550	NC_015966	TGG	2	6	69827	69832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301954
1551	NC_015966	GCGCTG	2	12	69886	69897	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345301954
1552	NC_015966	GCC	2	6	69920	69925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301954
1553	NC_015966	CGA	2	6	69945	69950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301954
1554	NC_015966	GAC	2	6	69967	69972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301954
1555	NC_015966	ATC	2	6	70097	70102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301954
1556	NC_015966	CGA	2	6	70107	70112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301954
1557	NC_015966	GCA	2	6	70119	70124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301954
1558	NC_015966	GATG	2	8	70128	70135	25 %	25 %	50 %	0 %	345301954
1559	NC_015966	GAA	2	6	70242	70247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301954
1560	NC_015966	TGG	2	6	70253	70258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301954
1561	NC_015966	TTC	2	6	70279	70284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301954
1562	NC_015966	GTG	2	6	70304	70309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301954
1563	NC_015966	GGTC	2	8	70314	70321	0 %	25 %	50 %	25 %	345301954
1564	NC_015966	CGC	2	6	70329	70334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301954
1565	NC_015966	GCTGG	2	10	70512	70521	0 %	20 %	60 %	20 %	345301954
1566	NC_015966	GC	3	6	70598	70603	0 %	0 %	50 %	50 %	345301955
1567	NC_015966	GCT	2	6	70610	70615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301955
1568	NC_015966	GC	3	6	70667	70672	0 %	0 %	50 %	50 %	345301955
1569	NC_015966	GCC	2	6	70679	70684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301955
1570	NC_015966	CGA	2	6	70761	70766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301955
1571	NC_015966	GCC	2	6	70768	70773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301955
1572	NC_015966	CGT	2	6	70807	70812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301955
1573	NC_015966	GGC	2	6	70837	70842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301955
1574	NC_015966	GC	4	8	70893	70900	0 %	0 %	50 %	50 %	345301955
1575	NC_015966	GTCG	2	8	70929	70936	0 %	25 %	50 %	25 %	345301955
1576	NC_015966	CTT	2	6	70985	70990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301956
1577	NC_015966	GCA	2	6	71036	71041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301956
1578	NC_015966	GC	3	6	71047	71052	0 %	0 %	50 %	50 %	345301956
1579	NC_015966	GGT	2	6	71060	71065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301956
1580	NC_015966	GAA	2	6	71157	71162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301956
1581	NC_015966	GGCT	2	8	71164	71171	0 %	25 %	50 %	25 %	345301956
1582	NC_015966	CGG	2	6	71188	71193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301956
1583	NC_015966	CAC	2	6	71202	71207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301956
1584	NC_015966	TCT	2	6	71215	71220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301956
1585	NC_015966	GAT	2	6	71250	71255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301956
1586	NC_015966	CCT	2	6	71294	71299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301956
1587	NC_015966	CTC	2	6	71316	71321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301956
1588	NC_015966	GATA	2	8	71378	71385	50 %	25 %	25 %	0 %	345301956
1589	NC_015966	GCG	2	6	71392	71397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301956
1590	NC_015966	CGT	2	6	71415	71420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301956
1591	NC_015966	CGT	2	6	71439	71444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301956
1592	NC_015966	GTC	2	6	71466	71471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301956
1593	NC_015966	TGG	2	6	71516	71521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301956
1594	NC_015966	TGT	2	6	71642	71647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345301956
1595	NC_015966	AGC	2	6	71656	71661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301956
1596	NC_015966	GCC	2	6	71670	71675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301956
1597	NC_015966	CACGGG	2	12	71720	71731	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345301956
1598	NC_015966	CGG	2	6	71736	71741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301956
1599	NC_015966	CTT	2	6	71778	71783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301956
1600	NC_015966	CTC	2	6	71787	71792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301956
1601	NC_015966	GCC	2	6	71817	71822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301956
1602	NC_015966	TGT	2	6	71960	71965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345301956
1603	NC_015966	ATG	2	6	71977	71982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301956
1604	NC_015966	GCC	2	6	72006	72011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301956
1605	NC_015966	CCG	2	6	72028	72033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301956
1606	NC_015966	CTC	2	6	72102	72107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301956
1607	NC_015966	ATGG	2	8	72126	72133	25 %	25 %	50 %	0 %	345301956
1608	NC_015966	GACC	2	8	72179	72186	25 %	0 %	25 %	50 %	345301956
1609	NC_015966	CG	3	6	72263	72268	0 %	0 %	50 %	50 %	345301956
1610	NC_015966	GTCG	2	8	72276	72283	0 %	25 %	50 %	25 %	345301956
1611	NC_015966	TGC	2	6	72322	72327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301956
1612	NC_015966	GCTC	2	8	72344	72351	0 %	25 %	25 %	50 %	345301956
1613	NC_015966	TGA	2	6	72365	72370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301956
1614	NC_015966	CGT	2	6	72377	72382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301956
1615	NC_015966	ACC	2	6	72421	72426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301956
1616	NC_015966	GAT	2	6	72432	72437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301956
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1618	NC_015966	CCG	2	6	72831	72836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301957
1619	NC_015966	CAC	2	6	72855	72860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301957
1620	NC_015966	GTG	2	6	72864	72869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301957
1621	NC_015966	GC	3	6	72888	72893	0 %	0 %	50 %	50 %	345301957
1622	NC_015966	CGC	2	6	72898	72903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301957
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1624	NC_015966	GCT	2	6	72947	72952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301957
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1995	NC_015966	TTC	2	6	90225	90230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301969
1996	NC_015966	GGC	2	6	90243	90248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301969
1997	NC_015966	CGT	2	6	90251	90256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301969
1998	NC_015966	CAG	2	6	90276	90281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301969
1999	NC_015966	GGC	2	6	90311	90316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301969
2000	NC_015966	CAGC	2	8	90408	90415	25 %	0 %	25 %	50 %	345301969

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