MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015966	TCC	2	6	22842	22847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301912
502	NC_015966	ACCG	2	8	22867	22874	25 %	0 %	25 %	50 %	345301912
503	NC_015966	GGT	2	6	22891	22896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301912
504	NC_015966	CAG	2	6	22901	22906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301912
505	NC_015966	CGT	2	6	22918	22923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301912
506	NC_015966	CGCC	2	8	22958	22965	0 %	0 %	25 %	75 %	345301912
507	NC_015966	C	6	6	22976	22981	0 %	0 %	0 %	100 %	345301912
508	NC_015966	CCG	2	6	23065	23070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301912
509	NC_015966	CAG	2	6	23090	23095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301912
510	NC_015966	AGC	2	6	23103	23108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301912
511	NC_015966	GCT	3	9	23264	23272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301913
512	NC_015966	CTG	2	6	23274	23279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301913
513	NC_015966	ACG	2	6	23320	23325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301913
514	NC_015966	CGT	2	6	23435	23440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301913
515	NC_015966	CCGACC	2	12	23461	23472	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	345301913
516	NC_015966	GC	3	6	23577	23582	0 %	0 %	50 %	50 %	345301913
517	NC_015966	GAA	2	6	23586	23591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301913
518	NC_015966	CTG	2	6	23604	23609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301913
519	NC_015966	ATC	2	6	23652	23657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301913
520	NC_015966	ACA	2	6	23710	23715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345301913
521	NC_015966	CGA	2	6	23716	23721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301913
522	NC_015966	GAG	2	6	23847	23852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301913
523	NC_015966	TCG	2	6	23863	23868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301913
524	NC_015966	CAT	2	6	23873	23878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301913
525	NC_015966	CAT	2	6	23882	23887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301913
526	NC_015966	TGG	2	6	23917	23922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301913
527	NC_015966	GACCT	2	10	23943	23952	20 %	20 %	20 %	40 %	345301913
528	NC_015966	GGA	2	6	24032	24037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345301913
529	NC_015966	GC	3	6	24124	24129	0 %	0 %	50 %	50 %	345301913
530	NC_015966	CGA	2	6	24146	24151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301913
531	NC_015966	CAT	2	6	24167	24172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301913
532	NC_015966	AAG	2	6	24186	24191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301913
533	NC_015966	TCA	2	6	24241	24246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301913
534	NC_015966	CAC	2	6	24266	24271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301913
535	NC_015966	GA	3	6	24289	24294	50 %	0 %	50 %	0 %	345301913
536	NC_015966	TGC	2	6	24584	24589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301914
537	NC_015966	CTA	2	6	24708	24713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301914
538	NC_015966	GCT	2	6	24741	24746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301914
539	NC_015966	GCG	2	6	24876	24881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301914
540	NC_015966	CGG	2	6	24932	24937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301914
541	NC_015966	GCTGG	2	10	24945	24954	0 %	20 %	60 %	20 %	345301914
542	NC_015966	CCG	2	6	24987	24992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301914
543	NC_015966	ACG	2	6	25022	25027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301914
544	NC_015966	CGGG	2	8	25057	25064	0 %	0 %	75 %	25 %	345301914
545	NC_015966	CGG	2	6	25068	25073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301914
546	NC_015966	GAT	2	6	25074	25079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301914
547	NC_015966	CAC	2	6	25113	25118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301914
548	NC_015966	ACT	2	6	25148	25153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301914
549	NC_015966	CAC	2	6	25187	25192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301914
550	NC_015966	CGG	2	6	25195	25200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301914
551	NC_015966	TTC	2	6	25201	25206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301914
552	NC_015966	TCA	2	6	25217	25222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345301914
553	NC_015966	ACG	2	6	25290	25295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301915
554	NC_015966	GGC	2	6	25334	25339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301915
555	NC_015966	CGG	2	6	25426	25431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301915
556	NC_015966	CTG	2	6	25433	25438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301915
557	NC_015966	CCG	2	6	25451	25456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301915
558	NC_015966	GC	4	8	25467	25474	0 %	0 %	50 %	50 %	345301915
559	NC_015966	GAA	2	6	25493	25498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301915
560	NC_015966	CAG	2	6	25511	25516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301915
561	NC_015966	GGC	2	6	25523	25528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301915
562	NC_015966	TTC	3	9	25589	25597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301915
563	NC_015966	CAC	2	6	25637	25642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301915
564	NC_015966	CCTT	2	8	25653	25660	0 %	50 %	0 %	50 %	345301915
565	NC_015966	AGCG	2	8	25770	25777	25 %	0 %	50 %	25 %	345301915
566	NC_015966	GC	3	6	25814	25819	0 %	0 %	50 %	50 %	345301915
567	NC_015966	GCT	2	6	25829	25834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301915
568	NC_015966	CTC	2	6	25868	25873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301915
569	NC_015966	CTT	2	6	25880	25885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301915
570	NC_015966	CGC	2	6	25888	25893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301915
571	NC_015966	GGC	2	6	25898	25903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301915
572	NC_015966	CCGT	2	8	25909	25916	0 %	25 %	25 %	50 %	345301915
573	NC_015966	CAG	3	9	25949	25957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301915
574	NC_015966	GAT	2	6	25967	25972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301915
575	NC_015966	AGC	2	6	26032	26037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301915
576	NC_015966	CCA	2	6	26119	26124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301915
577	NC_015966	TGG	3	9	26149	26157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301915
578	NC_015966	CCGGCA	2	12	26209	26220	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345301915
579	NC_015966	CCGGC	2	10	26274	26283	0 %	0 %	40 %	60 %	345301915
580	NC_015966	CAGCG	2	10	26337	26346	20 %	0 %	40 %	40 %	345301915
581	NC_015966	CTG	3	9	26491	26499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301916
582	NC_015966	CGG	2	6	26513	26518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301916
583	NC_015966	TGC	2	6	26552	26557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301916
584	NC_015966	GCC	2	6	26569	26574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301916
585	NC_015966	T	6	6	26639	26644	0 %	100 %	0 %	0 %	345301916
586	NC_015966	TTCGG	2	10	26704	26713	0 %	40 %	40 %	20 %	345301916
587	NC_015966	CG	3	6	26822	26827	0 %	0 %	50 %	50 %	345301916
588	NC_015966	CAG	2	6	26839	26844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301916
589	NC_015966	T	6	6	26865	26870	0 %	100 %	0 %	0 %	345301916
590	NC_015966	TTC	2	6	26905	26910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301916
591	NC_015966	GGCC	2	8	26916	26923	0 %	0 %	50 %	50 %	345301916
592	NC_015966	ACCG	2	8	26927	26934	25 %	0 %	25 %	50 %	345301916
593	NC_015966	TTC	2	6	26935	26940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301916
594	NC_015966	CGGGC	2	10	26941	26950	0 %	0 %	60 %	40 %	345301916
595	NC_015966	GATCA	2	10	26966	26975	40 %	20 %	20 %	20 %	345301916
596	NC_015966	GGC	2	6	27030	27035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301917
597	NC_015966	ACG	2	6	27125	27130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301917
598	NC_015966	G	6	6	27150	27155	0 %	0 %	100 %	0 %	345301917
599	NC_015966	GCTCCC	2	12	27165	27176	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	345301917
600	NC_015966	CCG	2	6	27242	27247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301917
601	NC_015966	GAA	3	9	27253	27261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345301917
602	NC_015966	TAA	2	6	27275	27280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345301917
603	NC_015966	AGC	2	6	27281	27286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301917
604	NC_015966	CTC	2	6	27310	27315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345301917
605	NC_015966	GTG	2	6	27353	27358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301917
606	NC_015966	CCG	2	6	27362	27367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301917
607	NC_015966	TGA	2	6	27369	27374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301917
608	NC_015966	AGC	2	6	27470	27475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301917
609	NC_015966	GTC	2	6	27538	27543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301917
610	NC_015966	ATG	2	6	27623	27628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345301917
611	NC_015966	CGA	2	6	27640	27645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301918
612	NC_015966	GCA	2	6	27666	27671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301918
613	NC_015966	CTT	2	6	27703	27708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301918
614	NC_015966	CAC	2	6	27736	27741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345301918
615	NC_015966	CTT	2	6	27790	27795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345301918
616	NC_015966	GCA	3	9	27873	27881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301918
617	NC_015966	T	6	6	27917	27922	0 %	100 %	0 %	0 %	345301918
618	NC_015966	GTC	2	6	28009	28014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345301918
619	NC_015966	GCA	2	6	28029	28034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345301918
620	NC_015966	GCC	2	6	28286	28291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345301919
621	NC_015966	CGCAC	2	10	28296	28305	20 %	0 %	20 %	60 %	345301919
622	NC_015966	GGC	2	6	28346	28351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345301919
623	NC_015966	CCGG	2	8	28368	28375	0 %	0 %	50 %	50 %	345301919
624	NC_015966	TGG	2	6	28377	28382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301919
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626	NC_015966	TGG	2	6	28429	28434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345301919
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999	NC_015966	CGTC	2	8	43900	43907	0 %	25 %	25 %	50 %	345301934
1000	NC_015966	CGGG	2	8	43987	43994	0 %	0 %	75 %	25 %	345301934

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