MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015966	TCT	2	6	248484	248489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302117
5502	NC_015966	GAT	2	6	248494	248499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302117
5503	NC_015966	GAA	2	6	248509	248514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302117
5504	NC_015966	CGG	2	6	248554	248559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302117
5505	NC_015966	CGG	2	6	248563	248568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302117
5506	NC_015966	GATG	2	8	248574	248581	25 %	25 %	50 %	0 %	345302117
5507	NC_015966	AGC	2	6	248591	248596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302117
5508	NC_015966	CAC	2	6	248632	248637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302117
5509	NC_015966	GCA	2	6	248679	248684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302117
5510	NC_015966	TTG	2	6	248714	248719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302117
5511	NC_015966	ATCGGC	2	12	248809	248820	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345302117
5512	NC_015966	CTT	2	6	248872	248877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302117
5513	NC_015966	GA	3	6	248924	248929	50 %	0 %	50 %	0 %	345302117
5514	NC_015966	GTC	2	6	248951	248956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302117
5515	NC_015966	CAG	2	6	248992	248997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302117
5516	NC_015966	TCA	2	6	249003	249008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302117
5517	NC_015966	CGGG	2	8	249066	249073	0 %	0 %	75 %	25 %	345302117
5518	NC_015966	GATC	2	8	249084	249091	25 %	25 %	25 %	25 %	345302117
5519	NC_015966	AGC	2	6	249092	249097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302117
5520	NC_015966	T	6	6	249114	249119	0 %	100 %	0 %	0 %	345302117
5521	NC_015966	CGG	2	6	249175	249180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302118
5522	NC_015966	CCA	2	6	249190	249195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302118
5523	NC_015966	GAT	2	6	249209	249214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302118
5524	NC_015966	CGAT	2	8	249223	249230	25 %	25 %	25 %	25 %	345302118
5525	NC_015966	GCG	3	9	249333	249341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302118
5526	NC_015966	CGGCG	2	10	249358	249367	0 %	0 %	60 %	40 %	345302118
5527	NC_015966	GCC	2	6	249369	249374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302118
5528	NC_015966	CACC	2	8	249424	249431	25 %	0 %	0 %	75 %	345302118
5529	NC_015966	CGA	2	6	249466	249471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302118
5530	NC_015966	CCT	2	6	249517	249522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302118
5531	NC_015966	C	6	6	249554	249559	0 %	0 %	0 %	100 %	345302118
5532	NC_015966	TCC	2	6	249573	249578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302118
5533	NC_015966	ACA	2	6	249620	249625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302118
5534	NC_015966	TGG	2	6	249646	249651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302118
5535	NC_015966	CCT	2	6	249682	249687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302118
5536	NC_015966	CGGT	2	8	249705	249712	0 %	25 %	50 %	25 %	345302118
5537	NC_015966	GCC	2	6	249780	249785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302118
5538	NC_015966	GTC	2	6	250082	250087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302119
5539	NC_015966	GTG	2	6	250123	250128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302119
5540	NC_015966	TACCTG	2	12	250147	250158	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345302119
5541	NC_015966	GCT	2	6	250260	250265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302119
5542	NC_015966	CCG	2	6	250279	250284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302119
5543	NC_015966	TGG	2	6	250298	250303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302119
5544	NC_015966	ATG	2	6	250327	250332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302119
5545	NC_015966	CGC	2	6	250388	250393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302119
5546	NC_015966	CGT	2	6	250413	250418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302119
5547	NC_015966	CTA	2	6	250443	250448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302119
5548	NC_015966	GAC	2	6	250468	250473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302119
5549	NC_015966	CGACTT	2	12	250670	250681	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345302120
5550	NC_015966	CGA	2	6	250772	250777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302120
5551	NC_015966	GCC	2	6	250864	250869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302120
5552	NC_015966	GC	3	6	250968	250973	0 %	0 %	50 %	50 %	345302120
5553	NC_015966	TGC	2	6	250990	250995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302120
5554	NC_015966	CAG	2	6	251031	251036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302120
5555	NC_015966	GCC	2	6	251044	251049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302120
5556	NC_015966	GCG	2	6	251093	251098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302120
5557	NC_015966	GCC	2	6	251123	251128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302120
5558	NC_015966	GTT	2	6	251149	251154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302120
5559	NC_015966	CG	3	6	251311	251316	0 %	0 %	50 %	50 %	345302120
5560	NC_015966	GCT	2	6	251345	251350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302120
5561	NC_015966	TGC	2	6	251368	251373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302120
5562	NC_015966	GTG	2	6	251382	251387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302120
5563	NC_015966	CGG	2	6	251419	251424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302120
5564	NC_015966	CGC	2	6	251509	251514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302121
5565	NC_015966	CAC	2	6	251553	251558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302121
5566	NC_015966	CG	3	6	251567	251572	0 %	0 %	50 %	50 %	345302121
5567	NC_015966	GGAT	2	8	251600	251607	25 %	25 %	50 %	0 %	345302121
5568	NC_015966	GC	3	6	251648	251653	0 %	0 %	50 %	50 %	345302121
5569	NC_015966	GCCGTG	2	12	251680	251691	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302121
5570	NC_015966	TCG	2	6	251696	251701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302121
5571	NC_015966	CG	3	6	251739	251744	0 %	0 %	50 %	50 %	345302121
5572	NC_015966	CCG	2	6	251818	251823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302121
5573	NC_015966	TCG	2	6	252103	252108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302122
5574	NC_015966	T	6	6	252175	252180	0 %	100 %	0 %	0 %	345302122
5575	NC_015966	GGT	2	6	252239	252244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302122
5576	NC_015966	GC	3	6	252279	252284	0 %	0 %	50 %	50 %	345302122
5577	NC_015966	TCG	2	6	252359	252364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302122
5578	NC_015966	TGA	2	6	252394	252399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302122
5579	NC_015966	GAT	2	6	252416	252421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302122
5580	NC_015966	TCG	2	6	252426	252431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302122
5581	NC_015966	G	7	7	252454	252460	0 %	0 %	100 %	0 %	345302122
5582	NC_015966	GCC	3	9	252479	252487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302122
5583	NC_015966	GTT	2	6	252489	252494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345302122
5584	NC_015966	GAA	2	6	252506	252511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302122
5585	NC_015966	GCC	2	6	252768	252773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302123
5586	NC_015966	GAG	2	6	252861	252866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302123
5587	NC_015966	GTCG	2	8	253046	253053	0 %	25 %	50 %	25 %	345302123
5588	NC_015966	GGC	2	6	253088	253093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302123
5589	NC_015966	GAG	2	6	253164	253169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302123
5590	NC_015966	TGC	2	6	253189	253194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302123
5591	NC_015966	GGC	2	6	253345	253350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302123
5592	NC_015966	GGC	2	6	253361	253366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302123
5593	NC_015966	GCG	2	6	253386	253391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302123
5594	NC_015966	GCA	2	6	253426	253431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302123
5595	NC_015966	TGG	2	6	253489	253494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302123
5596	NC_015966	GCG	2	6	253508	253513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302123
5597	NC_015966	GCG	2	6	253613	253618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302123
5598	NC_015966	CG	3	6	253617	253622	0 %	0 %	50 %	50 %	345302123
5599	NC_015966	CTG	2	6	253668	253673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302123
5600	NC_015966	GCG	2	6	253775	253780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302123
5601	NC_015966	GGC	2	6	253796	253801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302123
5602	NC_015966	CGG	2	6	253931	253936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302124
5603	NC_015966	GCT	2	6	253978	253983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302124
5604	NC_015966	CGA	2	6	253986	253991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302124
5605	NC_015966	GCCG	2	8	254012	254019	0 %	0 %	50 %	50 %	345302124
5606	NC_015966	GCT	2	6	254023	254028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302124
5607	NC_015966	GC	3	6	254049	254054	0 %	0 %	50 %	50 %	345302124
5608	NC_015966	GCT	3	9	254086	254094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302124
5609	NC_015966	GCC	2	6	254129	254134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302124
5610	NC_015966	CGC	2	6	254135	254140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302124
5611	NC_015966	CTA	2	6	254164	254169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302124
5612	NC_015966	TTCCGT	2	12	254172	254183	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	345302124
5613	NC_015966	CGCT	2	8	254243	254250	0 %	25 %	25 %	50 %	345302124
5614	NC_015966	TCG	2	6	254286	254291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302124
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5616	NC_015966	CGC	2	6	254331	254336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302124
5617	NC_015966	CTAC	2	8	254337	254344	25 %	25 %	0 %	50 %	345302124
5618	NC_015966	CTG	2	6	254345	254350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302124
5619	NC_015966	TCCG	2	8	254404	254411	0 %	25 %	25 %	50 %	345302124
5620	NC_015966	GCT	2	6	254464	254469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302124
5621	NC_015966	T	6	6	254488	254493	0 %	100 %	0 %	0 %	345302124
5622	NC_015966	GCC	2	6	254503	254508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302124
5623	NC_015966	CTGG	2	8	254548	254555	0 %	25 %	50 %	25 %	345302124
5624	NC_015966	CTG	2	6	254579	254584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302124
5625	NC_015966	CGG	2	6	254602	254607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302124
5626	NC_015966	GCG	2	6	254632	254637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302124
5627	NC_015966	CGG	2	6	254645	254650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302124
5628	NC_015966	CTG	3	9	254669	254677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302124
5629	NC_015966	CTG	2	6	254723	254728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302124
5630	NC_015966	AGG	2	6	254730	254735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302124
5631	NC_015966	TGG	2	6	254741	254746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302124
5632	NC_015966	GCCG	2	8	254752	254759	0 %	0 %	50 %	50 %	345302124
5633	NC_015966	TACCTG	2	12	254786	254797	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345302124
5634	NC_015966	TGC	2	6	254838	254843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302124
5635	NC_015966	GGCC	2	8	254881	254888	0 %	0 %	50 %	50 %	345302124
5636	NC_015966	ATC	2	6	254933	254938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302124
5637	NC_015966	ATC	2	6	254958	254963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302124
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5639	NC_015966	GCTGG	2	10	255007	255016	0 %	20 %	60 %	20 %	345302124
5640	NC_015966	CTGAT	2	10	255065	255074	20 %	40 %	20 %	20 %	345302124
5641	NC_015966	TCT	2	6	255191	255196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302125
5642	NC_015966	GCGG	2	8	255211	255218	0 %	0 %	75 %	25 %	345302125
5643	NC_015966	GGT	2	6	255276	255281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302125
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5645	NC_015966	GC	3	6	255385	255390	0 %	0 %	50 %	50 %	345302125
5646	NC_015966	TCG	2	6	255422	255427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302125
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5651	NC_015966	CGG	2	6	255624	255629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302125
5652	NC_015966	GAA	2	6	255643	255648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302125
5653	NC_015966	GCC	2	6	255690	255695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302125
5654	NC_015966	GGT	2	6	255708	255713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302125
5655	NC_015966	CAA	2	6	255771	255776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302125
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5657	NC_015966	CTG	2	6	255790	255795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302125
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5660	NC_015966	GCG	2	6	255839	255844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302125
5661	NC_015966	ATCG	2	8	255934	255941	25 %	25 %	25 %	25 %	345302125
5662	NC_015966	GAG	2	6	255958	255963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302125
5663	NC_015966	GCT	3	9	256009	256017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302126
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5666	NC_015966	GACCT	2	10	256166	256175	20 %	20 %	20 %	40 %	345302126
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5669	NC_015966	GACGCG	2	12	256227	256238	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345302126
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5697	NC_015966	GCC	2	6	257425	257430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302126
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5700	NC_015966	GGCGCT	2	12	257649	257660	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345302127
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5711	NC_015966	GCA	2	6	258149	258154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302127
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5723	NC_015966	GC	3	6	258748	258753	0 %	0 %	50 %	50 %	345302128
5724	NC_015966	CGGCGC	2	12	258759	258770	0 %	0 %	50 %	50 %	345302128
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5730	NC_015966	CGT	2	6	259084	259089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302128
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5736	NC_015966	AGC	2	6	259272	259277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302129
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5739	NC_015966	T	6	6	259351	259356	0 %	100 %	0 %	0 %	345302129
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5856	NC_015966	GTAG	2	8	264667	264674	25 %	25 %	50 %	0 %	345302137
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5859	NC_015966	GC	3	6	264726	264731	0 %	0 %	50 %	50 %	345302137
5860	NC_015966	CAGTTC	2	12	264739	264750	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345302137
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