MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 70422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015966	CGA	2	6	226812	226817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302096
5002	NC_015966	TTC	2	6	226870	226875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302096
5003	NC_015966	CGA	2	6	226974	226979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302096
5004	NC_015966	CTG	3	9	227024	227032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302096
5005	NC_015966	GCG	2	6	227079	227084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302096
5006	NC_015966	CTT	2	6	227104	227109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302096
5007	NC_015966	CAT	2	6	227137	227142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302096
5008	NC_015966	CTC	2	6	227227	227232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302096
5009	NC_015966	CCA	2	6	227269	227274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302096
5010	NC_015966	GCT	2	6	227320	227325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302096
5011	NC_015966	CGC	2	6	227409	227414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302096
5012	NC_015966	GTG	2	6	227519	227524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302096
5013	NC_015966	GCG	2	6	227550	227555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302096
5014	NC_015966	GCT	2	6	227557	227562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302096
5015	NC_015966	ACT	2	6	227583	227588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302096
5016	NC_015966	GCC	2	6	227607	227612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302096
5017	NC_015966	GCT	2	6	227644	227649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302096
5018	NC_015966	CTT	2	6	227674	227679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302096
5019	NC_015966	GCCGC	2	10	227710	227719	0 %	0 %	40 %	60 %	345302096
5020	NC_015966	CAC	2	6	227743	227748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302096
5021	NC_015966	TGC	2	6	227796	227801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302096
5022	NC_015966	TGG	2	6	227802	227807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302096
5023	NC_015966	CTGC	2	8	227812	227819	0 %	25 %	25 %	50 %	345302096
5024	NC_015966	CGC	2	6	227907	227912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302096
5025	NC_015966	CG	3	6	227940	227945	0 %	0 %	50 %	50 %	345302096
5026	NC_015966	ACC	2	6	227958	227963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302096
5027	NC_015966	GAG	2	6	227969	227974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302096
5028	NC_015966	CGG	2	6	228012	228017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302096
5029	NC_015966	TGGC	2	8	228091	228098	0 %	25 %	50 %	25 %	345302097
5030	NC_015966	GCGCAC	2	12	228129	228140	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345302097
5031	NC_015966	CCG	2	6	228144	228149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302097
5032	NC_015966	GCA	2	6	228155	228160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302097
5033	NC_015966	AGC	2	6	228178	228183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302097
5034	NC_015966	CTG	2	6	228234	228239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302097
5035	NC_015966	GGC	2	6	228299	228304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302097
5036	NC_015966	GGC	2	6	228322	228327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302097
5037	NC_015966	CTG	2	6	228351	228356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302097
5038	NC_015966	TCG	2	6	228360	228365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302097
5039	NC_015966	GT	3	6	228454	228459	0 %	50 %	50 %	0 %	345302097
5040	NC_015966	TGG	2	6	228463	228468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302097
5041	NC_015966	CCA	3	9	228497	228505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302097
5042	NC_015966	CGG	2	6	228515	228520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302097
5043	NC_015966	TTC	2	6	228564	228569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302097
5044	NC_015966	TGA	2	6	228583	228588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302097
5045	NC_015966	GGTA	2	8	228614	228621	25 %	25 %	50 %	0 %	345302097
5046	NC_015966	CAG	2	6	228668	228673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302097
5047	NC_015966	TAC	2	6	228678	228683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302097
5048	NC_015966	TGG	2	6	228718	228723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302097
5049	NC_015966	ATC	2	6	228726	228731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302097
5050	NC_015966	GCT	2	6	228749	228754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302097
5051	NC_015966	CAT	2	6	228785	228790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302098
5052	NC_015966	AC	3	6	228801	228806	50 %	0 %	0 %	50 %	345302098
5053	NC_015966	TGG	2	6	228850	228855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302098
5054	NC_015966	CAT	2	6	228863	228868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302098
5055	NC_015966	CTG	2	6	229026	229031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302098
5056	NC_015966	TGG	2	6	229033	229038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302098
5057	NC_015966	GCT	2	6	229058	229063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302098
5058	NC_015966	CCGG	2	8	229143	229150	0 %	0 %	50 %	50 %	345302098
5059	NC_015966	CGT	2	6	229226	229231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302099
5060	NC_015966	CTG	2	6	229271	229276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302099
5061	NC_015966	GTG	2	6	229325	229330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302099
5062	NC_015966	TCGA	2	8	229371	229378	25 %	25 %	25 %	25 %	345302099
5063	NC_015966	GCC	2	6	229436	229441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302099
5064	NC_015966	C	6	6	229440	229445	0 %	0 %	0 %	100 %	345302099
5065	NC_015966	CCG	2	6	229685	229690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302100
5066	NC_015966	GAA	2	6	229709	229714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302100
5067	NC_015966	GTG	2	6	229724	229729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302100
5068	NC_015966	CGC	2	6	229777	229782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302100
5069	NC_015966	GCC	2	6	229865	229870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302100
5070	NC_015966	TCTGC	2	10	229906	229915	0 %	40 %	20 %	40 %	345302100
5071	NC_015966	CG	3	6	229926	229931	0 %	0 %	50 %	50 %	345302100
5072	NC_015966	C	6	6	230026	230031	0 %	0 %	0 %	100 %	345302100
5073	NC_015966	CAT	2	6	230197	230202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302100
5074	NC_015966	GGCG	2	8	230224	230231	0 %	0 %	75 %	25 %	345302100
5075	NC_015966	CAC	2	6	230242	230247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302100
5076	NC_015966	TTC	2	6	230255	230260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302100
5077	NC_015966	ACT	2	6	230271	230276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302100
5078	NC_015966	CTC	2	6	230366	230371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345302100
5079	NC_015966	GGA	2	6	230398	230403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302100
5080	NC_015966	TGG	2	6	230406	230411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302100
5081	NC_015966	GCG	2	6	230467	230472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302100
5082	NC_015966	CAT	2	6	230521	230526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302100
5083	NC_015966	GCA	2	6	230826	230831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302101
5084	NC_015966	CGT	2	6	230832	230837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302101
5085	NC_015966	CGT	2	6	230840	230845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302101
5086	NC_015966	A	6	6	230861	230866	100 %	0 %	0 %	0 %	345302101
5087	NC_015966	TCA	2	6	230878	230883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302101
5088	NC_015966	AGG	2	6	230894	230899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302101
5089	NC_015966	ACT	2	6	230917	230922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302101
5090	NC_015966	ATC	2	6	230928	230933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302101
5091	NC_015966	AGCG	2	8	230934	230941	25 %	0 %	50 %	25 %	345302101
5092	NC_015966	TCG	2	6	230971	230976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302101
5093	NC_015966	GTG	2	6	231021	231026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302101
5094	NC_015966	CGA	2	6	231032	231037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302101
5095	NC_015966	GGC	2	6	231050	231055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302101
5096	NC_015966	GCA	2	6	231077	231082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302101
5097	NC_015966	TGC	2	6	231227	231232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302102
5098	NC_015966	AGG	2	6	231355	231360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345302102
5099	NC_015966	GCCA	2	8	231435	231442	25 %	0 %	25 %	50 %	345302102
5100	NC_015966	CAG	2	6	231474	231479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302102
5101	NC_015966	TGG	2	6	231496	231501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302102
5102	NC_015966	GCT	2	6	231517	231522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302102
5103	NC_015966	GCT	2	6	231548	231553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302102
5104	NC_015966	GCC	2	6	231575	231580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302102
5105	NC_015966	AGC	2	6	231594	231599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302102
5106	NC_015966	GTC	2	6	231644	231649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302102
5107	NC_015966	TCG	2	6	231703	231708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302103
5108	NC_015966	GCT	2	6	231721	231726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302103
5109	NC_015966	GAA	2	6	231878	231883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302103
5110	NC_015966	GTG	2	6	231890	231895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302103
5111	NC_015966	CGG	2	6	231924	231929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302103
5112	NC_015966	CA	3	6	231961	231966	50 %	0 %	0 %	50 %	345302103
5113	NC_015966	GTG	2	6	231983	231988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302103
5114	NC_015966	CTG	2	6	231995	232000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302103
5115	NC_015966	ACG	2	6	232014	232019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302103
5116	NC_015966	GCC	2	6	232076	232081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302103
5117	NC_015966	GCT	2	6	232084	232089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302103
5118	NC_015966	TTC	2	6	232103	232108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302104
5119	NC_015966	CGC	2	6	232117	232122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302104
5120	NC_015966	TGC	2	6	232131	232136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5121	NC_015966	GTC	2	6	232175	232180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5122	NC_015966	GCC	3	9	232212	232220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302104
5123	NC_015966	CAT	2	6	232238	232243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302104
5124	NC_015966	GAT	2	6	232256	232261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302104
5125	NC_015966	GGC	2	6	232274	232279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302104
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5127	NC_015966	CTG	2	6	232379	232384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302104
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5130	NC_015966	TCG	2	6	232479	232484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5131	NC_015966	CTG	2	6	232493	232498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302104
5132	NC_015966	CCA	2	6	232543	232548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302104
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5134	NC_015966	TCG	2	6	232563	232568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302104
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5145	NC_015966	GTC	2	6	233195	233200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302104
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5149	NC_015966	CGG	2	6	233296	233301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302104
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5152	NC_015966	ACCC	2	8	233396	233403	25 %	0 %	0 %	75 %	345302104
5153	NC_015966	GAA	2	6	233417	233422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302104
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5231	NC_015966	ACG	2	6	236288	236293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302106
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5233	NC_015966	GTC	2	6	236326	236331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302106
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5236	NC_015966	T	6	6	236419	236424	0 %	100 %	0 %	0 %	345302106
5237	NC_015966	GGC	2	6	236473	236478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302106
5238	NC_015966	GCC	2	6	236529	236534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302106
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5240	NC_015966	GTG	2	6	236678	236683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302106
5241	NC_015966	CGT	2	6	236686	236691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302106
5242	NC_015966	CCAG	2	8	236854	236861	25 %	0 %	25 %	50 %	345302107
5243	NC_015966	CGAA	2	8	236887	236894	50 %	0 %	25 %	25 %	345302107
5244	NC_015966	CCG	2	6	237042	237047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302107
5245	NC_015966	CAGG	2	8	237110	237117	25 %	0 %	50 %	25 %	345302107
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5249	NC_015966	GCCG	2	8	237288	237295	0 %	0 %	50 %	50 %	345302107
5250	NC_015966	GGC	2	6	237314	237319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302107
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5254	NC_015966	TGCA	2	8	237359	237366	25 %	25 %	25 %	25 %	345302107
5255	NC_015966	GCA	2	6	237385	237390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302107
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5260	NC_015966	CGT	2	6	237470	237475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302107
5261	NC_015966	CGGT	2	8	237477	237484	0 %	25 %	50 %	25 %	345302107
5262	NC_015966	CTT	2	6	237493	237498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345302107
5263	NC_015966	CAGCCG	2	12	237533	237544	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345302107
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5266	NC_015966	CGC	2	6	237694	237699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302107
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5268	NC_015966	CGT	2	6	237787	237792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302107
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5270	NC_015966	GGT	2	6	237862	237867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302107
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5272	NC_015966	CAT	2	6	237899	237904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345302107
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5329	NC_015966	ACC	2	6	240258	240263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345302109
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5346	NC_015966	AGT	2	6	241052	241057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302110
5347	NC_015966	GGT	2	6	241145	241150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345302110
5348	NC_015966	TTTC	2	8	241214	241221	0 %	75 %	0 %	25 %	345302110
5349	NC_015966	AGA	2	6	241238	241243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345302110
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5351	NC_015966	GTC	2	6	241311	241316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302110
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5353	NC_015966	GTA	2	6	241467	241472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345302111
5354	NC_015966	CGGCG	2	10	241517	241526	0 %	0 %	60 %	40 %	345302111
5355	NC_015966	GCGG	2	8	241527	241534	0 %	0 %	75 %	25 %	345302111
5356	NC_015966	GC	3	6	241545	241550	0 %	0 %	50 %	50 %	345302111
5357	NC_015966	TCG	3	9	241558	241566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302111
5358	NC_015966	CGA	2	6	241640	241645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345302111
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5360	NC_015966	CGC	2	6	241688	241693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302111
5361	NC_015966	CGT	3	9	241808	241816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302111
5362	NC_015966	TCGG	2	8	241843	241850	0 %	25 %	50 %	25 %	345302111
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5365	NC_015966	CGC	2	6	242107	242112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302111
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5381	NC_015966	ACA	2	6	242847	242852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345302112
5382	NC_015966	CTG	2	6	243005	243010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302112
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5384	NC_015966	TCCG	2	8	243091	243098	0 %	25 %	25 %	50 %	345302112
5385	NC_015966	CTG	2	6	243173	243178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302112
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5466	NC_015966	CGG	2	6	246827	246832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302115
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5472	NC_015966	TGC	2	6	247137	247142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302116
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5475	NC_015966	GATC	2	8	247222	247229	25 %	25 %	25 %	25 %	345302116
5476	NC_015966	CGT	2	6	247300	247305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302116
5477	NC_015966	GGC	2	6	247318	247323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302116
5478	NC_015966	GCT	2	6	247324	247329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302116
5479	NC_015966	G	6	6	247400	247405	0 %	0 %	100 %	0 %	345302116
5480	NC_015966	CTG	2	6	247447	247452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302116
5481	NC_015966	CCG	2	6	247457	247462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345302116
5482	NC_015966	GCG	2	6	247592	247597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345302116
5483	NC_015966	GCT	2	6	247624	247629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302116
5484	NC_015966	CG	3	6	247638	247643	0 %	0 %	50 %	50 %	345302116
5485	NC_015966	CGT	2	6	247648	247653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302116
5486	NC_015966	CTG	2	6	247667	247672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345302116
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