MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia heilongjiangensis 054 chromosome

Total Repeats: 15338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015866	ATT	2	6	408	413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583223
2	NC_015866	TTC	2	6	428	433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583223
3	NC_015866	GCA	2	6	453	458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583223
4	NC_015866	TAT	2	6	577	582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583223
5	NC_015866	ATT	2	6	669	674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583223
6	NC_015866	ATG	2	6	787	792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583223
7	NC_015866	ATA	2	6	828	833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583223
8	NC_015866	GCT	2	6	900	905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583223
9	NC_015866	GTA	2	6	969	974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583223
10	NC_015866	TTA	2	6	982	987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583223
11	NC_015866	CAG	2	6	1162	1167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583223
12	NC_015866	TAA	2	6	1171	1176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583223
13	NC_015866	ATA	2	6	1207	1212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583223
14	NC_015866	ATA	2	6	1438	1443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583224
15	NC_015866	TGA	2	6	1497	1502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583224
16	NC_015866	GTA	2	6	1535	1540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583224
17	NC_015866	CAA	2	6	1597	1602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583224
18	NC_015866	TAA	2	6	1626	1631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583224
19	NC_015866	TCT	2	6	1746	1751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583225
20	NC_015866	ATA	3	9	2010	2018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583225
21	NC_015866	TGG	2	6	2074	2079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341583225
22	NC_015866	TGA	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583225
23	NC_015866	GAA	2	6	2233	2238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583225
24	NC_015866	AAT	2	6	2263	2268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583225
25	NC_015866	AAG	2	6	2280	2285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583225
26	NC_015866	TTA	2	6	2318	2323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583225
27	NC_015866	CAA	3	9	2381	2389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583225
28	NC_015866	CGG	2	6	2602	2607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583226
29	NC_015866	AGC	2	6	2633	2638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583226
30	NC_015866	ATA	2	6	2678	2683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583226
31	NC_015866	ATA	2	6	2816	2821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583226
32	NC_015866	TAA	2	6	2847	2852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583226
33	NC_015866	ATG	2	6	3077	3082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583226
34	NC_015866	TAT	2	6	3097	3102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583226
35	NC_015866	TTA	2	6	3111	3116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583226
36	NC_015866	CTC	2	6	3308	3313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583227
37	NC_015866	ATT	2	6	3332	3337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583227
38	NC_015866	ATT	2	6	3445	3450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583227
39	NC_015866	AGA	2	6	3618	3623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583227
40	NC_015866	AGA	2	6	3633	3638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583227
41	NC_015866	AGC	2	6	3648	3653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583227
42	NC_015866	TGC	2	6	3660	3665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583227
43	NC_015866	ATT	2	6	3851	3856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583227
44	NC_015866	GAG	2	6	3925	3930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583227
45	NC_015866	TAT	2	6	4086	4091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583227
46	NC_015866	GCA	2	6	4114	4119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583227
47	NC_015866	AGA	2	6	4212	4217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583227
48	NC_015866	CTA	2	6	4307	4312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583227
49	NC_015866	TAT	2	6	4363	4368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583227
50	NC_015866	TTA	2	6	4369	4374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583227
51	NC_015866	TGT	2	6	4389	4394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583227
52	NC_015866	ATA	2	6	4583	4588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583227
53	NC_015866	GGC	2	6	4834	4839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583227
54	NC_015866	GCA	2	6	4858	4863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583227
55	NC_015866	GGA	2	6	4935	4940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583227
56	NC_015866	GAA	2	6	4957	4962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583227
57	NC_015866	AAG	2	6	4988	4993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583227
58	NC_015866	AAT	2	6	4999	5004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583227
59	NC_015866	GAA	2	6	5005	5010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583227
60	NC_015866	TAA	2	6	5025	5030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583227
61	NC_015866	CTA	2	6	5049	5054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583227
62	NC_015866	AGT	2	6	5410	5415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583227
63	NC_015866	AAG	2	6	5441	5446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583227
64	NC_015866	ACG	2	6	5450	5455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583227
65	NC_015866	ATA	2	6	5477	5482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583227
66	NC_015866	ATT	2	6	5528	5533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583227
67	NC_015866	TAA	2	6	5550	5555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583227
68	NC_015866	GAT	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583227
69	NC_015866	TGC	2	6	5607	5612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583227
70	NC_015866	ATT	2	6	5651	5656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583227
71	NC_015866	TGC	2	6	5664	5669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583227
72	NC_015866	CTA	2	6	5759	5764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583227
73	NC_015866	AGT	2	6	5796	5801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583227
74	NC_015866	CGC	2	6	5822	5827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583227
75	NC_015866	TTG	2	6	5858	5863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583227
76	NC_015866	TTA	2	6	5887	5892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583227
77	NC_015866	ATA	2	6	5909	5914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583227
78	NC_015866	TAA	2	6	5978	5983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583227
79	NC_015866	ATA	2	6	6001	6006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583227
80	NC_015866	GAA	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583227
81	NC_015866	ATA	2	6	6055	6060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583227
82	NC_015866	ATG	2	6	6088	6093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583227
83	NC_015866	GTT	2	6	6295	6300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583228
84	NC_015866	CTT	2	6	6338	6343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583228
85	NC_015866	ATA	2	6	6365	6370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583228
86	NC_015866	CAA	2	6	6409	6414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583228
87	NC_015866	GTT	2	6	6446	6451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583228
88	NC_015866	GAT	2	6	6474	6479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583228
89	NC_015866	AAC	2	6	6499	6504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583228
90	NC_015866	CAA	2	6	6549	6554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583228
91	NC_015866	TAT	2	6	6574	6579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583228
92	NC_015866	CTA	3	9	6912	6920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583229
93	NC_015866	ATT	2	6	6959	6964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583229
94	NC_015866	TTC	2	6	7025	7030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583229
95	NC_015866	ATC	2	6	7176	7181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583229
96	NC_015866	CCG	2	6	7224	7229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583229
97	NC_015866	ATT	2	6	7230	7235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583229
98	NC_015866	TAC	2	6	7286	7291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583229
99	NC_015866	ATT	2	6	7292	7297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583229
100	NC_015866	ATT	3	9	7343	7351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583229
101	NC_015866	TCA	2	6	7363	7368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583229
102	NC_015866	CCA	2	6	7371	7376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341583229
103	NC_015866	TAT	2	6	7417	7422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583229
104	NC_015866	TAC	2	6	7541	7546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583229
105	NC_015866	GTA	2	6	7656	7661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583229
106	NC_015866	CTT	2	6	7874	7879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583230
107	NC_015866	TAG	2	6	7886	7891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583230
108	NC_015866	AGC	2	6	7917	7922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583230
109	NC_015866	TAA	3	9	8064	8072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583230
110	NC_015866	ATA	3	9	8359	8367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583231
111	NC_015866	ATA	2	6	8386	8391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583231
112	NC_015866	GCC	2	6	8406	8411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583231
113	NC_015866	TCC	2	6	8508	8513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583231
114	NC_015866	ATA	2	6	8569	8574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583231
115	NC_015866	TAG	2	6	8672	8677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583231
116	NC_015866	ATT	2	6	8697	8702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583231
117	NC_015866	ACG	2	6	8803	8808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583231
118	NC_015866	TGT	2	6	8842	8847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583231
119	NC_015866	TAT	2	6	8912	8917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583231
120	NC_015866	TAA	2	6	8924	8929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583231
121	NC_015866	CAA	2	6	8993	8998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583231
122	NC_015866	ATT	2	6	9010	9015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583231
123	NC_015866	TAA	2	6	9093	9098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583231
124	NC_015866	AGC	3	9	9147	9155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583231
125	NC_015866	AGG	2	6	9270	9275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341583231
126	NC_015866	TAC	2	6	9344	9349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583231
127	NC_015866	TAT	2	6	9406	9411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583232
128	NC_015866	CAA	2	6	9413	9418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583232
129	NC_015866	AGC	2	6	9474	9479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583232
130	NC_015866	ATA	2	6	9507	9512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583232
131	NC_015866	ATG	2	6	9560	9565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583232
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252	NC_015866	ACA	2	6	22387	22392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583243
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254	NC_015866	AAC	2	6	22492	22497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583243
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