MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia heilongjiangensis 054 chromosome

Total Repeats: 24673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_015866	TTA	2	6	54892	54897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583284
1003	NC_015866	TTA	2	6	54916	54921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583284
1004	NC_015866	TAT	2	6	54929	54934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583284
1005	NC_015866	ATT	2	6	55038	55043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583284
1006	NC_015866	TTAT	2	8	55044	55051	25 %	75 %	0 %	0 %	341583284
1007	NC_015866	TGCT	2	8	55126	55133	0 %	50 %	25 %	25 %	341583284
1008	NC_015866	GTG	2	6	55135	55140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341583284
1009	NC_015866	CTA	2	6	55159	55164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583284
1010	NC_015866	AT	3	6	55184	55189	50 %	50 %	0 %	0 %	341583284
1011	NC_015866	TCG	2	6	55211	55216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583284
1012	NC_015866	GTGA	2	8	55233	55240	25 %	25 %	50 %	0 %	341583284
1013	NC_015866	CAT	2	6	55299	55304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583284
1014	NC_015866	GCA	2	6	55335	55340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583284
1015	NC_015866	TTGAT	2	10	55393	55402	20 %	60 %	20 %	0 %	341583284
1016	NC_015866	TGA	2	6	55403	55408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583284
1017	NC_015866	AGA	2	6	55448	55453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583284
1018	NC_015866	TGA	2	6	55457	55462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583284
1019	NC_015866	CGT	2	6	55470	55475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583284
1020	NC_015866	ATT	2	6	55476	55481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583284
1021	NC_015866	GCA	2	6	55500	55505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583284
1022	NC_015866	A	6	6	55509	55514	100 %	0 %	0 %	0 %	341583284
1023	NC_015866	AGA	2	6	55649	55654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583284
1024	NC_015866	ATA	2	6	55780	55785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583284
1025	NC_015866	TC	3	6	55834	55839	0 %	50 %	0 %	50 %	341583284
1026	NC_015866	AAG	2	6	55967	55972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583284
1027	NC_015866	ACC	2	6	55999	56004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341583284
1028	NC_015866	GTTC	2	8	56011	56018	0 %	50 %	25 %	25 %	341583284
1029	NC_015866	GACC	2	8	56029	56036	25 %	0 %	25 %	50 %	341583284
1030	NC_015866	TGA	2	6	56084	56089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583284
1031	NC_015866	AT	3	6	56123	56128	50 %	50 %	0 %	0 %	341583284
1032	NC_015866	CTC	2	6	56161	56166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583284
1033	NC_015866	ATT	2	6	56237	56242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583284
1034	NC_015866	TGA	2	6	56243	56248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583284
1035	NC_015866	TGC	2	6	56284	56289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583284
1036	NC_015866	TGA	2	6	56297	56302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583284
1037	NC_015866	TAAAG	2	10	56420	56429	60 %	20 %	20 %	0 %	341583284
1038	NC_015866	ATTAT	2	10	56493	56502	40 %	60 %	0 %	0 %	341583284
1039	NC_015866	TAA	2	6	56519	56524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583284
1040	NC_015866	ATT	2	6	56586	56591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583284
1041	NC_015866	TGA	2	6	56600	56605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583284
1042	NC_015866	ATT	2	6	56617	56622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583284
1043	NC_015866	AAT	2	6	56694	56699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583284
1044	NC_015866	AAAT	2	8	56749	56756	75 %	25 %	0 %	0 %	341583284
1045	NC_015866	TAA	2	6	57034	57039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583285
1046	NC_015866	ATC	2	6	57087	57092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583285
1047	NC_015866	ACT	2	6	57093	57098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583285
1048	NC_015866	ATA	2	6	57125	57130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583285
1049	NC_015866	TCT	2	6	57139	57144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583285
1050	NC_015866	TAAG	2	8	57159	57166	50 %	25 %	25 %	0 %	341583285
1051	NC_015866	GTT	3	9	57202	57210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583285
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1053	NC_015866	GTT	2	6	57304	57309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583285
1054	NC_015866	AT	3	6	57318	57323	50 %	50 %	0 %	0 %	341583285
1055	NC_015866	A	6	6	57380	57385	100 %	0 %	0 %	0 %	341583285
1056	NC_015866	TTA	2	6	57409	57414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583285
1057	NC_015866	A	6	6	57433	57438	100 %	0 %	0 %	0 %	341583285
1058	NC_015866	ATTGCT	2	12	57510	57521	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	341583285
1059	NC_015866	TTA	2	6	57715	57720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583286
1060	NC_015866	GCA	2	6	57754	57759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583286
1061	NC_015866	ATAA	2	8	57786	57793	75 %	25 %	0 %	0 %	341583286
1062	NC_015866	ACT	2	6	57819	57824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583286
1063	NC_015866	AGC	2	6	57849	57854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583286
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1065	NC_015866	TTC	2	6	57877	57882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583286
1066	NC_015866	ATT	2	6	57891	57896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583286
1067	NC_015866	TAC	2	6	57935	57940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583286
1068	NC_015866	ATT	2	6	58018	58023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583286
1069	NC_015866	ATTTAT	2	12	58097	58108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583286
1070	NC_015866	TCC	2	6	58146	58151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341583286
1071	NC_015866	CAT	2	6	58205	58210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583286
1072	NC_015866	TAG	2	6	58214	58219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583286
1073	NC_015866	ATAAGG	2	12	58296	58307	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	341583286
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1080	NC_015866	TAC	2	6	58554	58559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583286
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1083	NC_015866	T	7	7	58934	58940	0 %	100 %	0 %	0 %	341583287
1084	NC_015866	ACTT	2	8	58995	59002	25 %	50 %	0 %	25 %	341583287
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1088	NC_015866	GTA	2	6	59218	59223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583287
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1091	NC_015866	CCA	2	6	59376	59381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341583287
1092	NC_015866	T	6	6	59409	59414	0 %	100 %	0 %	0 %	341583287
1093	NC_015866	TTGC	2	8	59453	59460	0 %	50 %	25 %	25 %	341583287
1094	NC_015866	ATAA	2	8	59485	59492	75 %	25 %	0 %	0 %	341583287
1095	NC_015866	CCG	2	6	59521	59526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341583287
1096	NC_015866	ATAA	2	8	59539	59546	75 %	25 %	0 %	0 %	341583287
1097	NC_015866	ACA	2	6	59554	59559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583287
1098	NC_015866	GCT	2	6	59569	59574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583287
1099	NC_015866	AAT	2	6	59582	59587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583287
1100	NC_015866	TAA	2	6	59604	59609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583287
1101	NC_015866	CGAT	2	8	59641	59648	25 %	25 %	25 %	25 %	341583287
1102	NC_015866	TAT	2	6	59714	59719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583287
1103	NC_015866	ATG	2	6	59766	59771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583287
1104	NC_015866	ATTT	3	12	59852	59863	25 %	75 %	0 %	0 %	341583287
1105	NC_015866	ATT	2	6	59913	59918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583287
1106	NC_015866	ATA	2	6	59922	59927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583287
1107	NC_015866	ATA	2	6	59998	60003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583287
1108	NC_015866	TAA	2	6	60240	60245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583288
1109	NC_015866	TC	3	6	60267	60272	0 %	50 %	0 %	50 %	341583288
1110	NC_015866	TAT	2	6	60340	60345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583288
1111	NC_015866	A	8	8	60379	60386	100 %	0 %	0 %	0 %	341583288
1112	NC_015866	ATTC	2	8	60424	60431	25 %	50 %	0 %	25 %	341583288
1113	NC_015866	ATT	2	6	60451	60456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583288
1114	NC_015866	TAA	2	6	60483	60488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583288
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1116	NC_015866	CTA	2	6	60540	60545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583288
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1123	NC_015866	A	7	7	60675	60681	100 %	0 %	0 %	0 %	341583289
1124	NC_015866	CT	4	8	60731	60738	0 %	50 %	0 %	50 %	341583289
1125	NC_015866	T	7	7	60767	60773	0 %	100 %	0 %	0 %	341583289
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