MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia heilongjiangensis 054 chromosome

Total Repeats: 24673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015866	TAT	2	6	25832	25837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583243
502	NC_015866	TAC	2	6	25853	25858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583243
503	NC_015866	ATT	2	6	25876	25881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583243
504	NC_015866	TAAA	2	8	25885	25892	75 %	25 %	0 %	0 %	341583243
505	NC_015866	TCA	2	6	25904	25909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583243
506	NC_015866	A	6	6	26331	26336	100 %	0 %	0 %	0 %	341583244
507	NC_015866	GT	3	6	26383	26388	0 %	50 %	50 %	0 %	341583244
508	NC_015866	GCT	2	6	26467	26472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583244
509	NC_015866	ATA	2	6	26483	26488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583244
510	NC_015866	AAT	2	6	26572	26577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583244
511	NC_015866	CAC	2	6	26591	26596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341583244
512	NC_015866	TTTA	2	8	26617	26624	25 %	75 %	0 %	0 %	341583244
513	NC_015866	AGAAAA	2	12	26677	26688	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	341583245
514	NC_015866	AAT	2	6	26974	26979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583246
515	NC_015866	AAC	2	6	27172	27177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583247
516	NC_015866	TTAT	2	8	27178	27185	25 %	75 %	0 %	0 %	341583247
517	NC_015866	TAA	2	6	27223	27228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583247
518	NC_015866	AGCA	2	8	27239	27246	50 %	0 %	25 %	25 %	341583247
519	NC_015866	AT	3	6	27252	27257	50 %	50 %	0 %	0 %	341583247
520	NC_015866	A	6	6	27547	27552	100 %	0 %	0 %	0 %	341583248
521	NC_015866	TAA	2	6	27566	27571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583248
522	NC_015866	AAC	2	6	27572	27577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583248
523	NC_015866	TAA	2	6	27587	27592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583248
524	NC_015866	TAAAGT	2	12	27651	27662	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	341583248
525	NC_015866	AG	3	6	27673	27678	50 %	0 %	50 %	0 %	341583248
526	NC_015866	AGA	2	6	27726	27731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583248
527	NC_015866	TAC	2	6	28207	28212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583249
528	NC_015866	ATA	2	6	28218	28223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583249
529	NC_015866	TGA	2	6	28231	28236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583249
530	NC_015866	ATATT	2	10	28245	28254	40 %	60 %	0 %	0 %	341583249
531	NC_015866	A	6	6	28268	28273	100 %	0 %	0 %	0 %	341583249
532	NC_015866	ATATT	2	10	28280	28289	40 %	60 %	0 %	0 %	341583249
533	NC_015866	A	6	6	28303	28308	100 %	0 %	0 %	0 %	341583249
534	NC_015866	AAGA	2	8	28318	28325	75 %	0 %	25 %	0 %	341583249
535	NC_015866	ATT	2	6	28335	28340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583249
536	NC_015866	AGA	2	6	28341	28346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583249
537	NC_015866	TCA	2	6	29510	29515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583250
538	NC_015866	T	6	6	29584	29589	0 %	100 %	0 %	0 %	341583250
539	NC_015866	TTC	2	6	29602	29607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583250
540	NC_015866	T	6	6	29619	29624	0 %	100 %	0 %	0 %	341583250
541	NC_015866	TCT	2	6	29657	29662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583250
542	NC_015866	GT	3	6	29708	29713	0 %	50 %	50 %	0 %	341583250
543	NC_015866	AGC	2	6	29725	29730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583250
544	NC_015866	TCT	2	6	29732	29737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583250
545	NC_015866	T	7	7	29809	29815	0 %	100 %	0 %	0 %	341583250
546	NC_015866	ATT	2	6	29888	29893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583250
547	NC_015866	GTA	2	6	29909	29914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583251
548	NC_015866	T	6	6	29942	29947	0 %	100 %	0 %	0 %	341583251
549	NC_015866	AAT	2	6	29949	29954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583251
550	NC_015866	TGC	2	6	29976	29981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583251
551	NC_015866	TTA	2	6	29986	29991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583251
552	NC_015866	AGC	2	6	30006	30011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583251
553	NC_015866	T	6	6	30046	30051	0 %	100 %	0 %	0 %	341583251
554	NC_015866	T	8	8	30070	30077	0 %	100 %	0 %	0 %	341583251
555	NC_015866	T	6	6	30107	30112	0 %	100 %	0 %	0 %	341583251
556	NC_015866	T	7	7	30114	30120	0 %	100 %	0 %	0 %	341583251
557	NC_015866	CTAT	2	8	30124	30131	25 %	50 %	0 %	25 %	341583251
558	NC_015866	TATT	2	8	30137	30144	25 %	75 %	0 %	0 %	341583251
559	NC_015866	ATTT	2	8	30167	30174	25 %	75 %	0 %	0 %	341583251
560	NC_015866	TAT	2	6	30239	30244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583251
561	NC_015866	TTC	2	6	30252	30257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583251
562	NC_015866	A	6	6	30320	30325	100 %	0 %	0 %	0 %	341583251
563	NC_015866	AAT	2	6	30332	30337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583251
564	NC_015866	GTA	2	6	30340	30345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583251
565	NC_015866	A	6	6	30386	30391	100 %	0 %	0 %	0 %	341583252
566	NC_015866	A	6	6	30416	30421	100 %	0 %	0 %	0 %	341583252
567	NC_015866	AG	3	6	30511	30516	50 %	0 %	50 %	0 %	341583252
568	NC_015866	AT	3	6	30521	30526	50 %	50 %	0 %	0 %	341583252
569	NC_015866	CAT	2	6	30818	30823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583253
570	NC_015866	ATAC	2	8	30828	30835	50 %	25 %	0 %	25 %	341583253
571	NC_015866	CAA	2	6	30872	30877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583253
572	NC_015866	TAA	2	6	30969	30974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583253
573	NC_015866	CAT	2	6	30987	30992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583253
574	NC_015866	ATC	2	6	31057	31062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583253
575	NC_015866	A	7	7	31096	31102	100 %	0 %	0 %	0 %	341583253
576	NC_015866	A	6	6	31108	31113	100 %	0 %	0 %	0 %	341583253
577	NC_015866	ATA	2	6	31186	31191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583253
578	NC_015866	TAG	2	6	31196	31201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583253
579	NC_015866	ATAA	2	8	31252	31259	75 %	25 %	0 %	0 %	341583253
580	NC_015866	ATT	2	6	31336	31341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583253
581	NC_015866	CACT	2	8	31346	31353	25 %	25 %	0 %	50 %	341583253
582	NC_015866	T	6	6	31491	31496	0 %	100 %	0 %	0 %	341583253
583	NC_015866	TAT	2	6	31542	31547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583254
584	NC_015866	TAT	2	6	31588	31593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583254
585	NC_015866	ATA	2	6	31601	31606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583254
586	NC_015866	A	6	6	31627	31632	100 %	0 %	0 %	0 %	341583254
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588	NC_015866	CTG	2	6	31962	31967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583255
589	NC_015866	GAA	2	6	32014	32019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583255
590	NC_015866	ATT	2	6	32095	32100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583255
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592	NC_015866	TAA	2	6	32155	32160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583255
593	NC_015866	TATT	2	8	32168	32175	25 %	75 %	0 %	0 %	341583255
594	NC_015866	TTG	2	6	32194	32199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583255
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596	NC_015866	TAG	2	6	32283	32288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583255
597	NC_015866	AT	3	6	32330	32335	50 %	50 %	0 %	0 %	341583255
598	NC_015866	T	6	6	32335	32340	0 %	100 %	0 %	0 %	341583255
599	NC_015866	TGA	2	6	32363	32368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583255
600	NC_015866	TAA	2	6	32369	32374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583255
601	NC_015866	ACT	2	6	32408	32413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583255
602	NC_015866	T	6	6	32425	32430	0 %	100 %	0 %	0 %	341583255
603	NC_015866	ATC	2	6	32452	32457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583255
604	NC_015866	T	7	7	32495	32501	0 %	100 %	0 %	0 %	341583255
605	NC_015866	TCA	2	6	32528	32533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583255
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607	NC_015866	TAT	2	6	32644	32649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583255
608	NC_015866	TCT	2	6	32684	32689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583255
609	NC_015866	ATA	2	6	32706	32711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583255
610	NC_015866	TAA	2	6	32901	32906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583256
611	NC_015866	ACA	2	6	32915	32920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583256
612	NC_015866	TAG	2	6	33085	33090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583256
613	NC_015866	GTT	2	6	33098	33103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583256
614	NC_015866	AT	3	6	33143	33148	50 %	50 %	0 %	0 %	341583256
615	NC_015866	AGA	2	6	33194	33199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583256
616	NC_015866	TAA	2	6	33385	33390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583256
617	NC_015866	TAG	2	6	33417	33422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583256
618	NC_015866	CTA	2	6	33669	33674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583257
619	NC_015866	CAA	2	6	33723	33728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583257
620	NC_015866	TAA	2	6	33736	33741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583257
621	NC_015866	AATT	2	8	33795	33802	50 %	50 %	0 %	0 %	341583257
622	NC_015866	T	6	6	33801	33806	0 %	100 %	0 %	0 %	341583257
623	NC_015866	ATC	2	6	33826	33831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583257
624	NC_015866	AT	3	6	33863	33868	50 %	50 %	0 %	0 %	341583257
625	NC_015866	TACC	2	8	33885	33892	25 %	25 %	0 %	50 %	341583257
626	NC_015866	ATT	2	6	33934	33939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583257
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628	NC_015866	CTT	2	6	34125	34130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583257
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