MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia heilongjiangensis 054 chromosome

Total Repeats: 24673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015866	ATG	2	6	277059	277064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583496
5502	NC_015866	AAAAC	2	10	277095	277104	80 %	0 %	0 %	20 %	341583496
5503	NC_015866	ATTC	2	8	277113	277120	25 %	50 %	0 %	25 %	341583496
5504	NC_015866	CT	3	6	277180	277185	0 %	50 %	0 %	50 %	341583496
5505	NC_015866	TAA	2	6	277209	277214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583496
5506	NC_015866	AT	3	6	277240	277245	50 %	50 %	0 %	0 %	341583496
5507	NC_015866	TAAA	2	8	277257	277264	75 %	25 %	0 %	0 %	341583496
5508	NC_015866	TTA	2	6	277281	277286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583496
5509	NC_015866	ATT	2	6	277292	277297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583496
5510	NC_015866	T	6	6	277356	277361	0 %	100 %	0 %	0 %	341583496
5511	NC_015866	TAA	2	6	277611	277616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583496
5512	NC_015866	AAT	2	6	277706	277711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583496
5513	NC_015866	GAA	2	6	277763	277768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583496
5514	NC_015866	A	6	6	277808	277813	100 %	0 %	0 %	0 %	341583496
5515	NC_015866	CTA	2	6	277818	277823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583496
5516	NC_015866	ACT	2	6	277826	277831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583496
5517	NC_015866	AAAAT	2	10	277923	277932	80 %	20 %	0 %	0 %	341583496
5518	NC_015866	TAA	2	6	277947	277952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583496
5519	NC_015866	TAGT	2	8	278031	278038	25 %	50 %	25 %	0 %	341583496
5520	NC_015866	GCT	2	6	278056	278061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583496
5521	NC_015866	ATA	2	6	278178	278183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583496
5522	NC_015866	AGT	2	6	278218	278223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583496
5523	NC_015866	GTA	2	6	278226	278231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583496
5524	NC_015866	CGA	2	6	278247	278252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583496
5525	NC_015866	GCTT	2	8	278259	278266	0 %	50 %	25 %	25 %	341583496
5526	NC_015866	CAA	2	6	278333	278338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583496
5527	NC_015866	ACGAT	2	10	278388	278397	40 %	20 %	20 %	20 %	341583496
5528	NC_015866	AT	3	6	278396	278401	50 %	50 %	0 %	0 %	341583496
5529	NC_015866	ACA	2	6	278403	278408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583496
5530	NC_015866	TAA	2	6	278419	278424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583496
5531	NC_015866	GCA	2	6	278426	278431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583496
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5533	NC_015866	A	6	6	278458	278463	100 %	0 %	0 %	0 %	341583496
5534	NC_015866	TTA	2	6	278481	278486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583496
5535	NC_015866	GA	3	6	278522	278527	50 %	0 %	50 %	0 %	341583496
5536	NC_015866	ATTGCA	2	12	278561	278572	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	341583496
5537	NC_015866	A	6	6	278584	278589	100 %	0 %	0 %	0 %	341583496
5538	NC_015866	AT	3	6	278597	278602	50 %	50 %	0 %	0 %	341583496
5539	NC_015866	TGA	2	6	278608	278613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583496
5540	NC_015866	CAA	2	6	278616	278621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341583496
5541	NC_015866	CAAG	2	8	278654	278661	50 %	0 %	25 %	25 %	341583496
5542	NC_015866	TAC	2	6	278686	278691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341583496
5543	NC_015866	TAT	2	6	278719	278724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583496
5544	NC_015866	TA	3	6	278759	278764	50 %	50 %	0 %	0 %	341583496
5545	NC_015866	TAT	2	6	278807	278812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583496
5546	NC_015866	AAG	2	6	278835	278840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583496
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5548	NC_015866	ATA	2	6	279352	279357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583497
5549	NC_015866	ATT	2	6	279359	279364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583497
5550	NC_015866	AGC	2	6	279475	279480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583497
5551	NC_015866	AAT	2	6	279505	279510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583497
5552	NC_015866	TCT	3	9	279890	279898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341583498
5553	NC_015866	AGATG	2	10	279922	279931	40 %	20 %	40 %	0 %	341583498
5554	NC_015866	TATCT	2	10	279936	279945	20 %	60 %	0 %	20 %	341583498
5555	NC_015866	AGTA	2	8	279967	279974	50 %	25 %	25 %	0 %	341583498
5556	NC_015866	CATG	2	8	280033	280040	25 %	25 %	25 %	25 %	341583498
5557	NC_015866	ACG	2	6	280137	280142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583498
5558	NC_015866	GATG	2	8	280213	280220	25 %	25 %	50 %	0 %	341583498
5559	NC_015866	GCG	2	6	280226	280231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341583498
5560	NC_015866	GCA	2	6	280232	280237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341583498
5561	NC_015866	GAA	2	6	280337	280342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583498
5562	NC_015866	CGGT	2	8	280404	280411	0 %	25 %	50 %	25 %	341583498
5563	NC_015866	TA	4	8	280467	280474	50 %	50 %	0 %	0 %	341583498
5564	NC_015866	ATA	2	6	280476	280481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583498
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5566	NC_015866	GTA	2	6	280593	280598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583498
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5569	NC_015866	TGA	2	6	280756	280761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583498
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5571	NC_015866	AGT	2	6	280819	280824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583498
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5573	NC_015866	TGCT	2	8	280878	280885	0 %	50 %	25 %	25 %	341583498
5574	NC_015866	TGA	2	6	280908	280913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583498
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5578	NC_015866	TAA	2	6	280987	280992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341583498
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5589	NC_015866	GTA	2	6	281601	281606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583498
5590	NC_015866	TGT	2	6	281619	281624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341583498
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5593	NC_015866	AT	3	6	281712	281717	50 %	50 %	0 %	0 %	341583498
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5601	NC_015866	CCGTG	2	10	282120	282129	0 %	20 %	40 %	40 %	341583498
5602	NC_015866	GAA	2	6	282173	282178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583498
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5604	NC_015866	GCGGTA	2	12	282306	282317	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	341583498
5605	NC_015866	GTC	2	6	282353	282358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583498
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5607	NC_015866	GTCT	2	8	282508	282515	0 %	50 %	25 %	25 %	341583498
5608	NC_015866	CTG	2	6	282531	282536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341583498
5609	NC_015866	GAA	2	6	282542	282547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341583498
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5617	NC_015866	TGTT	2	8	283280	283287	0 %	75 %	25 %	0 %	341583499
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5620	NC_015866	TAT	3	9	283430	283438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341583500
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5997	NC_015866	ATG	2	6	304360	304365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341583522
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