MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 chromosome

Total Repeats: 51184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015730	GCG	2	6	313	318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501578
2	NC_015730	GTG	2	6	393	398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501578
3	NC_015730	CGC	2	6	411	416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501578
4	NC_015730	GCC	2	6	500	505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501578
5	NC_015730	GGC	2	6	560	565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501578
6	NC_015730	CCG	2	6	651	656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501578
7	NC_015730	ATG	2	6	701	706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501578
8	NC_015730	TGG	2	6	744	749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501578
9	NC_015730	ATG	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501578
10	NC_015730	GCA	2	6	777	782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501578
11	NC_015730	TGG	2	6	816	821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501578
12	NC_015730	CGA	2	6	1050	1055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501578
13	NC_015730	TGC	2	6	1158	1163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501578
14	NC_015730	ACA	2	6	1221	1226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501578
15	NC_015730	CGC	2	6	1340	1345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501578
16	NC_015730	ACG	2	6	1364	1369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501578
17	NC_015730	TGC	2	6	1440	1445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501578
18	NC_015730	GCG	2	6	1673	1678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501579
19	NC_015730	CGA	2	6	1804	1809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501579
20	NC_015730	CGA	2	6	1819	1824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501579
21	NC_015730	CCG	2	6	1876	1881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501579
22	NC_015730	GCC	2	6	1894	1899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501579
23	NC_015730	AGA	2	6	1949	1954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501579
24	NC_015730	TGC	2	6	2011	2016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501579
25	NC_015730	ACG	2	6	2251	2256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501579
26	NC_015730	GCG	2	6	2403	2408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501579
27	NC_015730	GTG	2	6	2521	2526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501579
28	NC_015730	CCG	2	6	2527	2532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501579
29	NC_015730	CTG	2	6	2595	2600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501579
30	NC_015730	TCA	2	6	2649	2654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501579
31	NC_015730	GTC	2	6	2703	2708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501579
32	NC_015730	TGA	2	6	2806	2811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501580
33	NC_015730	TCT	2	6	2921	2926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501580
34	NC_015730	CGG	2	6	2973	2978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501580
35	NC_015730	GAA	2	6	3054	3059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501580
36	NC_015730	CCG	2	6	3094	3099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501580
37	NC_015730	TAT	2	6	3130	3135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501580
38	NC_015730	GTG	2	6	3348	3353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501580
39	NC_015730	CGG	2	6	3366	3371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501580
40	NC_015730	GGC	2	6	3389	3394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501580
41	NC_015730	GGC	2	6	3590	3595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501580
42	NC_015730	GCA	2	6	3681	3686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501580
43	NC_015730	GCC	2	6	3711	3716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501580
44	NC_015730	GAT	2	6	3822	3827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501580
45	NC_015730	ATC	2	6	3843	3848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501580
46	NC_015730	CTG	2	6	3902	3907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501581
47	NC_015730	CGG	2	6	3985	3990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501581
48	NC_015730	GCA	2	6	3995	4000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501581
49	NC_015730	TGG	2	6	4050	4055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501581
50	NC_015730	TGC	2	6	4107	4112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501581
51	NC_015730	GCG	2	6	4125	4130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501581
52	NC_015730	TCA	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501581
53	NC_015730	CGC	2	6	4342	4347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501581
54	NC_015730	GGC	2	6	4384	4389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501581
55	NC_015730	GCA	2	6	4407	4412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501581
56	NC_015730	ATC	2	6	4448	4453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501581
57	NC_015730	TGG	2	6	4473	4478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501581
58	NC_015730	TAT	2	6	4494	4499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501581
59	NC_015730	GAA	2	6	4604	4609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501582
60	NC_015730	CGA	2	6	4687	4692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501582
61	NC_015730	CGA	2	6	4741	4746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501582
62	NC_015730	GAA	3	9	4847	4855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501582
63	NC_015730	ACC	2	6	5052	5057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501582
64	NC_015730	ATT	2	6	5201	5206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501582
65	NC_015730	AGA	2	6	5227	5232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501582
66	NC_015730	TCA	2	6	5325	5330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501582
67	NC_015730	GAC	2	6	5342	5347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501582
68	NC_015730	TGG	2	6	5369	5374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501582
69	NC_015730	AAC	2	6	5411	5416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501582
70	NC_015730	CAA	2	6	5479	5484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501582
71	NC_015730	GAT	2	6	5537	5542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501582
72	NC_015730	TCG	2	6	5597	5602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501582
73	NC_015730	TCC	2	6	5624	5629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501582
74	NC_015730	CCG	2	6	5640	5645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501582
75	NC_015730	TCG	2	6	5709	5714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501582
76	NC_015730	GCG	2	6	5732	5737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501582
77	NC_015730	TTG	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501582
78	NC_015730	CGA	2	6	6040	6045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501582
79	NC_015730	TCA	2	6	6081	6086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501582
80	NC_015730	TGC	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501582
81	NC_015730	CTT	2	6	6136	6141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501582
82	NC_015730	GCC	2	6	6193	6198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501582
83	NC_015730	GGA	2	6	6256	6261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501582
84	NC_015730	CAG	2	6	6272	6277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501582
85	NC_015730	TGC	2	6	6294	6299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501582
86	NC_015730	GAA	2	6	6314	6319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501582
87	NC_015730	GAA	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501582
88	NC_015730	GCG	2	6	6627	6632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501582
89	NC_015730	AGG	2	6	6672	6677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501582
90	NC_015730	AAG	2	6	6762	6767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501582
91	NC_015730	CGA	2	6	6880	6885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501582
92	NC_015730	TGT	2	6	6928	6933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501582
93	NC_015730	CGC	2	6	6941	6946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501582
94	NC_015730	CCT	2	6	7173	7178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501583
95	NC_015730	CAC	2	6	7192	7197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501583
96	NC_015730	GCG	2	6	7207	7212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501583
97	NC_015730	TGA	2	6	7320	7325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501583
98	NC_015730	TGC	2	6	7347	7352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501583
99	NC_015730	GCA	2	6	7436	7441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501583
100	NC_015730	GAC	2	6	7491	7496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501583
101	NC_015730	ATC	2	6	7571	7576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501584
102	NC_015730	CGA	2	6	7626	7631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501584
103	NC_015730	TAT	2	6	7683	7688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501584
104	NC_015730	CGG	2	6	7746	7751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501584
105	NC_015730	ATG	2	6	7763	7768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501584
106	NC_015730	AGC	2	6	7859	7864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501584
107	NC_015730	CCG	2	6	7868	7873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501584
108	NC_015730	CCG	2	6	7892	7897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501584
109	NC_015730	CGA	2	6	7930	7935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501584
110	NC_015730	CCG	2	6	7941	7946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501584
111	NC_015730	CAG	2	6	7981	7986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501584
112	NC_015730	CCT	2	6	8108	8113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501584
113	NC_015730	ACG	2	6	8180	8185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501584
114	NC_015730	CAG	2	6	8203	8208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501584
115	NC_015730	ATG	2	6	8504	8509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501585
116	NC_015730	CCA	2	6	8531	8536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501585
117	NC_015730	TGA	2	6	8639	8644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501585
118	NC_015730	GGT	2	6	8727	8732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501585
119	NC_015730	GTT	2	6	8775	8780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501585
120	NC_015730	ATC	2	6	8794	8799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501585
121	NC_015730	CGC	2	6	8901	8906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501585
122	NC_015730	CTG	2	6	8932	8937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501585
123	NC_015730	ACA	2	6	8988	8993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501585
124	NC_015730	GCG	2	6	9084	9089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501585
125	NC_015730	ATT	2	6	9130	9135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501585
126	NC_015730	GAT	2	6	9142	9147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501585
127	NC_015730	TAT	2	6	9214	9219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501585
128	NC_015730	GGA	2	6	9339	9344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501585
129	NC_015730	TGC	3	9	9461	9469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501585
130	NC_015730	CGC	2	6	9517	9522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501585
131	NC_015730	TCA	2	6	9587	9592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501585
132	NC_015730	CGC	2	6	9653	9658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501585
133	NC_015730	GCA	2	6	9663	9668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501585
134	NC_015730	CGC	2	6	9957	9962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501586
135	NC_015730	TGA	2	6	9966	9971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501586
136	NC_015730	ACA	2	6	10086	10091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501586
137	NC_015730	CAT	2	6	10124	10129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501586
138	NC_015730	GCC	2	6	10462	10467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501586
139	NC_015730	GCA	2	6	10492	10497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501586
140	NC_015730	CCG	2	6	10526	10531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501586
141	NC_015730	TGA	2	6	10629	10634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501586
142	NC_015730	AGC	2	6	10644	10649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501586
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147	NC_015730	TGG	3	9	10887	10895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501586
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151	NC_015730	GAT	2	6	11033	11038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501586
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153	NC_015730	CTG	2	6	11298	11303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501587
154	NC_015730	CAG	2	6	11371	11376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501587
155	NC_015730	TTG	2	6	11484	11489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501587
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157	NC_015730	GCG	2	6	11586	11591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501587
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159	NC_015730	CCG	2	6	11667	11672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501587
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161	NC_015730	CCG	2	6	11795	11800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501587
162	NC_015730	CGA	2	6	11959	11964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501587
163	NC_015730	GAT	2	6	11990	11995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501587
164	NC_015730	ATC	2	6	11996	12001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501587
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249	NC_015730	ACC	2	6	19085	19090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501594
250	NC_015730	ACT	2	6	19268	19273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501594
251	NC_015730	TGG	2	6	19313	19318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501594
252	NC_015730	CGG	2	6	19523	19528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501594
253	NC_015730	GGC	2	6	19594	19599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501594
254	NC_015730	GTC	2	6	19617	19622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501594
255	NC_015730	GTC	2	6	19637	19642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501594
256	NC_015730	AGC	2	6	19700	19705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501594
257	NC_015730	GGT	2	6	19732	19737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501594
258	NC_015730	TGC	2	6	19860	19865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501594
259	NC_015730	AGC	2	6	19880	19885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501594
260	NC_015730	GGC	2	6	19926	19931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501594
261	NC_015730	GCG	2	6	19939	19944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501594
262	NC_015730	CCA	2	6	19987	19992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501594
263	NC_015730	CCT	2	6	20278	20283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501595
264	NC_015730	TGC	2	6	20299	20304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501595
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267	NC_015730	GTT	2	6	20535	20540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501595
268	NC_015730	TAT	2	6	20571	20576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501595
269	NC_015730	TGA	2	6	20720	20725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501595
270	NC_015730	CAT	2	6	20783	20788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501595
271	NC_015730	ATC	2	6	21145	21150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501596
272	NC_015730	CGA	2	6	21204	21209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501596
273	NC_015730	GAT	2	6	21223	21228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501596
274	NC_015730	TTG	2	6	21287	21292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501596
275	NC_015730	TGA	2	6	21461	21466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501596
276	NC_015730	GAT	2	6	21598	21603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501596
277	NC_015730	AAC	2	6	21647	21652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501596
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279	NC_015730	CTG	2	6	21942	21947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501597
280	NC_015730	TGC	2	6	22048	22053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501597
281	NC_015730	TCG	2	6	22126	22131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501597
282	NC_015730	GCG	2	6	22164	22169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501597
283	NC_015730	CGG	3	9	22435	22443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501597
284	NC_015730	TGA	2	6	22543	22548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501597
285	NC_015730	GGA	2	6	22583	22588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501597
286	NC_015730	TCG	2	6	22675	22680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501597
287	NC_015730	TCA	2	6	22744	22749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501597
288	NC_015730	GGC	2	6	22898	22903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501597
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292	NC_015730	GGC	2	6	23290	23295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501598
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370	NC_015730	CGG	2	6	30188	30193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501603
371	NC_015730	TAT	2	6	30264	30269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501603
372	NC_015730	AGA	2	6	30476	30481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501603
373	NC_015730	GCA	2	6	30494	30499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501603
374	NC_015730	CGG	2	6	30590	30595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501604
375	NC_015730	ACG	2	6	30742	30747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501604
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377	NC_015730	CCG	2	6	30825	30830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501604
378	NC_015730	GTG	2	6	30853	30858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501604
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499	NC_015730	CGC	3	9	41590	41598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501615
500	NC_015730	CAG	2	6	41995	42000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501616

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