MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 chromosome

Total Repeats: 77662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015730	TCA	2	6	58526	58531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501631
1002	NC_015730	CCT	2	6	58709	58714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501631
1003	NC_015730	TCCCC	2	10	58758	58767	0 %	20 %	0 %	80 %	339501631
1004	NC_015730	A	6	6	58808	58813	100 %	0 %	0 %	0 %	339501631
1005	NC_015730	GCC	2	6	58858	58863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501631
1006	NC_015730	GAA	2	6	58904	58909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501631
1007	NC_015730	GCG	2	6	58957	58962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501631
1008	NC_015730	CTC	2	6	58989	58994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501632
1009	NC_015730	A	6	6	59018	59023	100 %	0 %	0 %	0 %	339501632
1010	NC_015730	CAG	2	6	59093	59098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501632
1011	NC_015730	CCT	2	6	59120	59125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501632
1012	NC_015730	ATC	2	6	59490	59495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501632
1013	NC_015730	CG	3	6	59531	59536	0 %	0 %	50 %	50 %	339501632
1014	NC_015730	CAG	2	6	59537	59542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501632
1015	NC_015730	ATGA	2	8	59580	59587	50 %	25 %	25 %	0 %	339501632
1016	NC_015730	GCC	2	6	59622	59627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501632
1017	NC_015730	GACC	2	8	59630	59637	25 %	0 %	25 %	50 %	339501632
1018	NC_015730	CAT	2	6	59747	59752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501632
1019	NC_015730	AGC	2	6	59802	59807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501632
1020	NC_015730	TTG	2	6	59813	59818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501632
1021	NC_015730	CAG	2	6	59828	59833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501632
1022	NC_015730	GGA	2	6	59882	59887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501632
1023	NC_015730	CG	3	6	60027	60032	0 %	0 %	50 %	50 %	339501632
1024	NC_015730	CGA	2	6	60058	60063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501632
1025	NC_015730	TCC	2	6	60087	60092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501632
1026	NC_015730	CG	3	6	60139	60144	0 %	0 %	50 %	50 %	339501632
1027	NC_015730	A	6	6	60157	60162	100 %	0 %	0 %	0 %	339501632
1028	NC_015730	CAC	2	6	60170	60175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501632
1029	NC_015730	AGAA	2	8	60225	60232	75 %	0 %	25 %	0 %	339501632
1030	NC_015730	TGC	2	6	60403	60408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501632
1031	NC_015730	GACGCA	2	12	60463	60474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501632
1032	NC_015730	ACCA	2	8	60500	60507	50 %	0 %	0 %	50 %	339501632
1033	NC_015730	GGCA	2	8	60536	60543	25 %	0 %	50 %	25 %	339501632
1034	NC_015730	GAC	2	6	60584	60589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501632
1035	NC_015730	AAT	2	6	60608	60613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501632
1036	NC_015730	AGC	2	6	60721	60726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501632
1037	NC_015730	TCG	2	6	60795	60800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501632
1038	NC_015730	CAA	2	6	60808	60813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501632
1039	NC_015730	GAC	2	6	60836	60841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501632
1040	NC_015730	TGC	2	6	60861	60866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501632
1041	NC_015730	A	6	6	60954	60959	100 %	0 %	0 %	0 %	339501632
1042	NC_015730	GCA	2	6	60972	60977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501632
1043	NC_015730	GCG	2	6	61007	61012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501632
1044	NC_015730	TG	3	6	61043	61048	0 %	50 %	50 %	0 %	339501632
1045	NC_015730	CGA	2	6	61049	61054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501632
1046	NC_015730	CTT	2	6	61192	61197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501632
1047	NC_015730	GAG	2	6	61201	61206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501632
1048	NC_015730	GT	4	8	61209	61216	0 %	50 %	50 %	0 %	339501632
1049	NC_015730	CT	3	6	61232	61237	0 %	50 %	0 %	50 %	339501633
1050	NC_015730	TGA	2	6	61257	61262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501633
1051	NC_015730	TGC	2	6	61386	61391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501633
1052	NC_015730	GAC	2	6	61459	61464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501633
1053	NC_015730	CGT	2	6	61467	61472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501633
1054	NC_015730	GCGG	2	8	61501	61508	0 %	0 %	75 %	25 %	339501633
1055	NC_015730	ATG	2	6	61534	61539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501633
1056	NC_015730	TCG	2	6	61703	61708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501633
1057	NC_015730	CAG	2	6	61771	61776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501633
1058	NC_015730	CGC	2	6	61821	61826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501633
1059	NC_015730	TTGG	2	8	61864	61871	0 %	50 %	50 %	0 %	339501633
1060	NC_015730	CGT	2	6	61890	61895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501633
1061	NC_015730	ATCT	2	8	61918	61925	25 %	50 %	0 %	25 %	339501633
1062	NC_015730	GAA	2	6	61937	61942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501633
1063	NC_015730	TCTG	2	8	61949	61956	0 %	50 %	25 %	25 %	339501633
1064	NC_015730	GTTT	2	8	61970	61977	0 %	75 %	25 %	0 %	339501633
1065	NC_015730	CAG	2	6	62008	62013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501633
1066	NC_015730	GCA	2	6	62025	62030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501633
1067	NC_015730	GGC	2	6	62065	62070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501633
1068	NC_015730	TGA	2	6	62202	62207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501633
1069	NC_015730	TGAC	2	8	62214	62221	25 %	25 %	25 %	25 %	339501633
1070	NC_015730	ATC	2	6	62273	62278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501633
1071	NC_015730	GTT	2	6	62316	62321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501633
1072	NC_015730	AATG	2	8	62464	62471	50 %	25 %	25 %	0 %	339501633
1073	NC_015730	TGC	2	6	62485	62490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501633
1074	NC_015730	GGC	2	6	62491	62496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501633
1075	NC_015730	GTG	2	6	62506	62511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501633
1076	NC_015730	GCA	2	6	62547	62552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501633
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1078	NC_015730	GCC	2	6	62693	62698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501633
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1080	NC_015730	ATC	2	6	62771	62776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501633
1081	NC_015730	GGC	2	6	62847	62852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501633
1082	NC_015730	CGG	2	6	63005	63010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501634
1083	NC_015730	TCCA	2	8	63080	63087	25 %	25 %	0 %	50 %	339501634
1084	NC_015730	CCG	2	6	63121	63126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501634
1085	NC_015730	CCAG	2	8	63156	63163	25 %	0 %	25 %	50 %	339501634
1086	NC_015730	CAA	2	6	63176	63181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501634
1087	NC_015730	C	7	7	63227	63233	0 %	0 %	0 %	100 %	339501634
1088	NC_015730	TCG	2	6	63244	63249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501634
1089	NC_015730	TCG	2	6	63271	63276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501634
1090	NC_015730	CACCGT	2	12	63278	63289	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339501634
1091	NC_015730	AG	3	6	63315	63320	50 %	0 %	50 %	0 %	339501634
1092	NC_015730	CAT	2	6	63323	63328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501634
1093	NC_015730	CCCGCC	2	12	63330	63341	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	339501634
1094	NC_015730	GCC	2	6	63399	63404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501634
1095	NC_015730	TGC	2	6	63484	63489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501634
1096	NC_015730	GCT	2	6	63510	63515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501634
1097	NC_015730	GTT	2	6	63549	63554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501634
1098	NC_015730	GCC	2	6	63564	63569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501634
1099	NC_015730	GCC	2	6	63762	63767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501634
1100	NC_015730	CG	3	6	63788	63793	0 %	0 %	50 %	50 %	339501634
1101	NC_015730	A	6	6	63794	63799	100 %	0 %	0 %	0 %	339501634
1102	NC_015730	GTC	2	6	63810	63815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501634
1103	NC_015730	TCA	2	6	63895	63900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501634
1104	NC_015730	GTC	2	6	64107	64112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501634
1105	NC_015730	TCA	2	6	64135	64140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501634
1106	NC_015730	CAC	2	6	64145	64150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501634
1107	NC_015730	CCG	2	6	64174	64179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501634
1108	NC_015730	TCA	2	6	64270	64275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501634
1109	NC_015730	CGC	2	6	64319	64324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501634
1110	NC_015730	TCG	2	6	64357	64362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501634
1111	NC_015730	GCC	2	6	64374	64379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501634
1112	NC_015730	CTGT	2	8	64387	64394	0 %	50 %	25 %	25 %	339501634
1113	NC_015730	GCA	2	6	64423	64428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501634
1114	NC_015730	AGGT	2	8	64498	64505	25 %	25 %	50 %	0 %	339501634
1115	NC_015730	TGC	2	6	64508	64513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501634
1116	NC_015730	GCC	3	9	64572	64580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501634
1117	NC_015730	CG	3	6	64598	64603	0 %	0 %	50 %	50 %	339501634
1118	NC_015730	AGA	2	6	64604	64609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501634
1119	NC_015730	CTG	2	6	64614	64619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501634
1120	NC_015730	CGC	2	6	64772	64777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501634
1121	NC_015730	GCT	2	6	64803	64808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501634
1122	NC_015730	CTG	2	6	64811	64816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501634
1123	NC_015730	GTT	2	6	64819	64824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501634
1124	NC_015730	TCA	2	6	64841	64846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501634
1125	NC_015730	CAT	2	6	64904	64909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501634
1126	NC_015730	CGC	2	6	64910	64915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501634
1127	NC_015730	GCC	2	6	64917	64922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501634
1128	NC_015730	CTGT	2	8	65044	65051	0 %	50 %	25 %	25 %	339501634
1129	NC_015730	CAA	2	6	65210	65215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501634
1130	NC_015730	GCC	2	6	65244	65249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501634
1131	NC_015730	GTC	2	6	65271	65276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501634
1132	NC_015730	GCC	2	6	65347	65352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501634
1133	NC_015730	TCC	2	6	65391	65396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501634
1134	NC_015730	TGATC	2	10	65447	65456	20 %	40 %	20 %	20 %	339501634
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1141	NC_015730	AGGC	2	8	65651	65658	25 %	0 %	50 %	25 %	339501634
1142	NC_015730	GGC	2	6	65721	65726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501634
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1146	NC_015730	GCT	2	6	66026	66031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501635
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1149	NC_015730	GTA	2	6	66250	66255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501635
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1163	NC_015730	CATC	2	8	67214	67221	25 %	25 %	0 %	50 %	339501637
1164	NC_015730	CGG	2	6	67224	67229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501637
1165	NC_015730	GTC	2	6	67270	67275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501637
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1220	NC_015730	ATA	2	6	70439	70444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501641
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1222	NC_015730	TGA	2	6	70508	70513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501641
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1230	NC_015730	TCTT	2	8	71211	71218	0 %	75 %	0 %	25 %	339501642
1231	NC_015730	CAC	2	6	71305	71310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501642
1232	NC_015730	CTT	2	6	71320	71325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501642
1233	NC_015730	TGA	2	6	71329	71334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501642
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1236	NC_015730	ATC	2	6	71669	71674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501643
1237	NC_015730	AC	3	6	71754	71759	50 %	0 %	0 %	50 %	339501643
1238	NC_015730	CGC	2	6	71800	71805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501643
1239	NC_015730	CG	4	8	71836	71843	0 %	0 %	50 %	50 %	339501643
1240	NC_015730	CGGTGC	2	12	71913	71924	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339501643
1241	NC_015730	GACC	2	8	72123	72130	25 %	0 %	25 %	50 %	339501643
1242	NC_015730	CCGC	2	8	72231	72238	0 %	0 %	25 %	75 %	339501643
1243	NC_015730	CTG	2	6	72272	72277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501643
1244	NC_015730	GGC	2	6	72278	72283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501643
1245	NC_015730	GC	3	6	72363	72368	0 %	0 %	50 %	50 %	339501643
1246	NC_015730	AAT	2	6	72477	72482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501643
1247	NC_015730	GCG	2	6	72510	72515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501643
1248	NC_015730	GTCG	2	8	72523	72530	0 %	25 %	50 %	25 %	339501643
1249	NC_015730	AT	3	6	72533	72538	50 %	50 %	0 %	0 %	339501643
1250	NC_015730	TCG	2	6	72554	72559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501643
1251	NC_015730	GTG	2	6	72563	72568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501643
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1255	NC_015730	TCG	2	6	72774	72779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501643
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1492	NC_015730	ATC	3	9	85872	85880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501655
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1494	NC_015730	CTTGTG	2	12	85890	85901	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	339501655
1495	NC_015730	CCG	2	6	85940	85945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501655
1496	NC_015730	GC	3	6	85953	85958	0 %	0 %	50 %	50 %	339501655
1497	NC_015730	GCA	2	6	86060	86065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501655
1498	NC_015730	TGC	2	6	86167	86172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501655
1499	NC_015730	CTGATC	2	12	86211	86222	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339501655
1500	NC_015730	GAT	2	6	86253	86258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501655

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