MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_63

Total Repeats: 581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015729	CCG	2	6	325	330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501436
2	NC_015729	TGC	2	6	333	338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501436
3	NC_015729	GCG	2	6	381	386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501436
4	NC_015729	CGA	2	6	403	408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501436
5	NC_015729	TGC	2	6	411	416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501436
6	NC_015729	AAG	2	6	438	443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501436
7	NC_015729	TCG	2	6	498	503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501436
8	NC_015729	GCG	2	6	566	571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501436
9	NC_015729	TGG	2	6	591	596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501436
10	NC_015729	GTC	2	6	622	627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501436
11	NC_015729	GAC	2	6	647	652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501436
12	NC_015729	GCT	2	6	673	678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501436
13	NC_015729	TGA	2	6	754	759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501436
14	NC_015729	ATC	2	6	797	802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501436
15	NC_015729	GGA	2	6	952	957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501436
16	NC_015729	CTG	2	6	1034	1039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501436
17	NC_015729	TGC	2	6	1095	1100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501436
18	NC_015729	GAG	2	6	1121	1126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501436
19	NC_015729	GCC	2	6	1139	1144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501436
20	NC_015729	TGA	2	6	1393	1398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501436
21	NC_015729	TGC	2	6	1405	1410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501436
22	NC_015729	GGC	2	6	1459	1464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501436
23	NC_015729	CGC	2	6	1645	1650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501437
24	NC_015729	CCG	2	6	1664	1669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501437
25	NC_015729	GCC	2	6	1679	1684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501437
26	NC_015729	GAC	2	6	1710	1715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501437
27	NC_015729	GCC	2	6	1742	1747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501437
28	NC_015729	GAG	2	6	1763	1768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501437
29	NC_015729	GGC	2	6	1983	1988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501437
30	NC_015729	CAC	2	6	2064	2069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501437
31	NC_015729	TGG	2	6	2097	2102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501437
32	NC_015729	CCG	2	6	2217	2222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501437
33	NC_015729	TGG	2	6	2265	2270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501437
34	NC_015729	GCA	2	6	2401	2406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501437
35	NC_015729	ACC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501438
36	NC_015729	CAG	2	6	2935	2940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501438
37	NC_015729	TGT	2	6	3025	3030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501438
38	NC_015729	GGT	2	6	3136	3141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501438
39	NC_015729	CGA	2	6	3162	3167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501438
40	NC_015729	ACG	2	6	3194	3199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501438
41	NC_015729	TGC	2	6	3270	3275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501438
42	NC_015729	CAA	2	6	3297	3302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501438
43	NC_015729	GCT	2	6	3319	3324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501438
44	NC_015729	TGG	2	6	3354	3359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501438
45	NC_015729	TTG	2	6	3386	3391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501438
46	NC_015729	TCG	2	6	3486	3491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501438
47	NC_015729	CCG	2	6	4212	4217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501439
48	NC_015729	AAG	2	6	4311	4316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501439
49	NC_015729	CGC	2	6	4339	4344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501439
50	NC_015729	GTC	2	6	4382	4387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501439
51	NC_015729	CGC	2	6	4453	4458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501439
52	NC_015729	TCG	2	6	4492	4497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501439
53	NC_015729	GAT	2	6	4938	4943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501440
54	NC_015729	GTC	2	6	4944	4949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501440
55	NC_015729	CCA	2	6	5105	5110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501440
56	NC_015729	GGT	2	6	5129	5134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501440
57	NC_015729	GCG	2	6	5155	5160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501440
58	NC_015729	CCA	2	6	5327	5332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501440
59	NC_015729	ACG	2	6	5353	5358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501440
60	NC_015729	GCA	2	6	5395	5400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501440
61	NC_015729	GCA	2	6	5411	5416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501440
62	NC_015729	GCC	2	6	5505	5510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501440
63	NC_015729	CTG	2	6	5525	5530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501440
64	NC_015729	ACG	2	6	5539	5544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501440
65	NC_015729	GGC	2	6	5703	5708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501440
66	NC_015729	GCG	2	6	5819	5824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501440
67	NC_015729	CCA	2	6	5849	5854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501440
68	NC_015729	GCG	2	6	6025	6030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501440
69	NC_015729	GGC	3	9	6039	6047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501440
70	NC_015729	CGG	2	6	6053	6058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501440
71	NC_015729	ACC	2	6	6160	6165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501440
72	NC_015729	CGG	2	6	6196	6201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501440
73	NC_015729	CAG	2	6	6231	6236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501440
74	NC_015729	GCC	2	6	6294	6299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501440
75	NC_015729	TGC	2	6	6615	6620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501441
76	NC_015729	GCT	2	6	6645	6650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501441
77	NC_015729	CTG	2	6	6700	6705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501441
78	NC_015729	TGC	2	6	7001	7006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501441
79	NC_015729	AAC	2	6	7032	7037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501441
80	NC_015729	CAT	2	6	7119	7124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501441
81	NC_015729	GTC	2	6	7246	7251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501441
82	NC_015729	CTG	3	9	7252	7260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501441
83	NC_015729	TTC	2	6	7363	7368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501441
84	NC_015729	CCG	2	6	7481	7486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501441
85	NC_015729	CAG	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501441
86	NC_015729	GAT	2	6	7717	7722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501441
87	NC_015729	ATC	2	6	7724	7729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501441
88	NC_015729	CAT	2	6	7923	7928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501441
89	NC_015729	ATG	2	6	7948	7953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501441
90	NC_015729	TAT	2	6	7957	7962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501441
91	NC_015729	CAG	3	9	7969	7977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501441
92	NC_015729	CCG	2	6	7980	7985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501441
93	NC_015729	TGA	2	6	8018	8023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501441
94	NC_015729	CAC	2	6	8034	8039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501441
95	NC_015729	ATC	2	6	9671	9676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501442
96	NC_015729	TCT	2	6	9696	9701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501442
97	NC_015729	GCG	2	6	9718	9723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501442
98	NC_015729	CTT	2	6	9739	9744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501442
99	NC_015729	AAG	2	6	9748	9753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501442
100	NC_015729	TTG	2	6	9763	9768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501442
101	NC_015729	CGG	2	6	9797	9802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501442
102	NC_015729	GTT	2	6	9921	9926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501442
103	NC_015729	AAT	2	6	10089	10094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501442
104	NC_015729	CGT	2	6	10105	10110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501442
105	NC_015729	ATG	2	6	10160	10165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501442
106	NC_015729	CAT	2	6	11011	11016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501443
107	NC_015729	AAC	2	6	11018	11023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501443
108	NC_015729	AAG	2	6	11171	11176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501443
109	NC_015729	AAG	2	6	12990	12995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501444
110	NC_015729	GGC	2	6	13273	13278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501444
111	NC_015729	CAG	2	6	13401	13406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501444
112	NC_015729	GGA	2	6	13533	13538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501444
113	NC_015729	TAG	2	6	13629	13634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501444
114	NC_015729	ATC	2	6	13752	13757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501444
115	NC_015729	GCT	2	6	13917	13922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501444
116	NC_015729	GCC	2	6	13938	13943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501444
117	NC_015729	TGC	2	6	13978	13983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501444
118	NC_015729	ATT	2	6	14184	14189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339501444
119	NC_015729	CGA	2	6	14202	14207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501444
120	NC_015729	CTT	2	6	14239	14244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501444
121	NC_015729	CTG	2	6	14462	14467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501445
122	NC_015729	AAG	2	6	14510	14515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501445
123	NC_015729	TGG	2	6	14520	14525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501445
124	NC_015729	GGT	2	6	14606	14611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501445
125	NC_015729	CGC	2	6	14623	14628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501445
126	NC_015729	CAA	2	6	14674	14679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501445
127	NC_015729	GAT	2	6	14729	14734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501445
128	NC_015729	GAC	2	6	14741	14746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501445
129	NC_015729	TCG	2	6	14754	14759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501445
130	NC_015729	CTG	2	6	14833	14838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501445
131	NC_015729	AGA	2	6	14869	14874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501445
132	NC_015729	ATC	2	6	15048	15053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501445
133	NC_015729	ATA	2	6	15095	15100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339501445
134	NC_015729	GCC	2	6	15176	15181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501445
135	NC_015729	ATG	2	6	15189	15194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501445
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138	NC_015729	CAT	2	6	15758	15763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501446
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140	NC_015729	GCT	3	9	15841	15849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501446
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142	NC_015729	ACC	2	6	16144	16149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501447
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144	NC_015729	TTC	2	6	16407	16412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501447
145	NC_015729	CCA	2	6	16425	16430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501447
146	NC_015729	GCA	2	6	16462	16467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501447
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148	NC_015729	GTT	2	6	16613	16618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501447
149	NC_015729	GAT	2	6	16675	16680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501447
150	NC_015729	ATG	2	6	16787	16792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501447
151	NC_015729	CAG	2	6	16847	16852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501447
152	NC_015729	CGT	2	6	16958	16963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501447
153	NC_015729	GCC	2	6	17629	17634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501448
154	NC_015729	CCA	2	6	18072	18077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501449
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156	NC_015729	GAT	2	6	18154	18159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501449
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160	NC_015729	GCA	2	6	18441	18446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501449
161	NC_015729	ATC	2	6	18485	18490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501449
162	NC_015729	GCG	2	6	18537	18542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501449
163	NC_015729	CTG	2	6	18618	18623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501449
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180	NC_015729	GCC	2	6	19995	20000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501450
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200	NC_015729	CGT	2	6	21390	21395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501452
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203	NC_015729	CAC	2	6	21477	21482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501452
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238	NC_015729	GAT	2	6	30806	30811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501456
239	NC_015729	GGC	2	6	30814	30819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501456
240	NC_015729	CAA	2	6	30968	30973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501456
241	NC_015729	ACC	2	6	31149	31154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501456
242	NC_015729	CAC	2	6	31262	31267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501456
243	NC_015729	CAT	2	6	31420	31425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501456
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245	NC_015729	CAC	2	6	31882	31887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501457
246	NC_015729	CAA	2	6	31935	31940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501457
247	NC_015729	TGC	2	6	31999	32004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501457
248	NC_015729	GTC	2	6	32041	32046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501457
249	NC_015729	TCT	2	6	32096	32101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501457
250	NC_015729	CGT	2	6	32144	32149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501457
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252	NC_015729	TCG	2	6	32258	32263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501457
253	NC_015729	GCT	2	6	32408	32413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501457
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