MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_83

Total Repeats: 1452

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015728	TG	3	6	57256	57261	0 %	50 %	50 %	0 %	339501548
1002	NC_015728	GGA	2	6	57324	57329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501548
1003	NC_015728	AGT	2	6	57361	57366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501548
1004	NC_015728	GCC	3	9	57409	57417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501549
1005	NC_015728	GGC	2	6	57418	57423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501549
1006	NC_015728	CCA	2	6	57446	57451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501549
1007	NC_015728	CCG	2	6	57464	57469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501549
1008	NC_015728	GCT	2	6	57524	57529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501549
1009	NC_015728	GACG	2	8	57552	57559	25 %	0 %	50 %	25 %	339501549
1010	NC_015728	CAA	2	6	57565	57570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339501549
1011	NC_015728	AAG	2	6	57604	57609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501549
1012	NC_015728	TCC	2	6	57614	57619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501549
1013	NC_015728	CG	3	6	57628	57633	0 %	0 %	50 %	50 %	339501549
1014	NC_015728	GAG	2	6	57677	57682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339501549
1015	NC_015728	CGGAC	2	10	57711	57720	20 %	0 %	40 %	40 %	339501549
1016	NC_015728	GCC	2	6	57749	57754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501549
1017	NC_015728	GGTTTC	2	12	57841	57852	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	339501549
1018	NC_015728	TGCC	2	8	58192	58199	0 %	25 %	25 %	50 %	339501549
1019	NC_015728	CTT	2	6	58273	58278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501549
1020	NC_015728	CTG	2	6	58287	58292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501549
1021	NC_015728	GCG	2	6	58301	58306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501549
1022	NC_015728	GCCAGC	2	12	58340	58351	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339501549
1023	NC_015728	GCT	2	6	58410	58415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501549
1024	NC_015728	CCGATC	2	12	58490	58501	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339501549
1025	NC_015728	CTG	2	6	58537	58542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501549
1026	NC_015728	CCG	2	6	58551	58556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501549
1027	NC_015728	TGT	2	6	58596	58601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339501549
1028	NC_015728	CTT	2	6	58665	58670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501549
1029	NC_015728	AGC	2	6	58726	58731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501549
1030	NC_015728	TAG	2	6	58810	58815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501549
1031	NC_015728	GGC	2	6	59168	59173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501550
1032	NC_015728	CTG	2	6	59193	59198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501550
1033	NC_015728	CAG	2	6	59250	59255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501550
1034	NC_015728	TGG	2	6	59269	59274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501550
1035	NC_015728	GCA	2	6	59299	59304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501550
1036	NC_015728	ACG	2	6	59498	59503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501550
1037	NC_015728	CAT	2	6	59551	59556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501550
1038	NC_015728	ATC	3	9	59711	59719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501551
1039	NC_015728	GC	3	6	59859	59864	0 %	0 %	50 %	50 %	339501551
1040	NC_015728	AGA	2	6	59873	59878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501551
1041	NC_015728	CCGTA	2	10	59933	59942	20 %	20 %	20 %	40 %	339501551
1042	NC_015728	TGC	2	6	59948	59953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501551
1043	NC_015728	CG	3	6	60055	60060	0 %	0 %	50 %	50 %	339501551
1044	NC_015728	TCA	2	6	60155	60160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501551
1045	NC_015728	CGC	2	6	60162	60167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501551
1046	NC_015728	CCT	2	6	60171	60176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501551
1047	NC_015728	CGT	2	6	60198	60203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501551
1048	NC_015728	CCG	2	6	60206	60211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501551
1049	NC_015728	CAC	2	6	60219	60224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501551
1050	NC_015728	GGT	2	6	60241	60246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501551
1051	NC_015728	TCT	2	6	60281	60286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501551
1052	NC_015728	GGT	3	9	60297	60305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501551
1053	NC_015728	AGA	2	6	60332	60337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501551
1054	NC_015728	TCC	2	6	60371	60376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501551
1055	NC_015728	TTC	2	6	60445	60450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501552
1056	NC_015728	CAT	2	6	60535	60540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501552
1057	NC_015728	GAGCG	2	10	60758	60767	20 %	0 %	60 %	20 %	339501552
1058	NC_015728	CAGC	2	8	60886	60893	25 %	0 %	25 %	50 %	339501552
1059	NC_015728	AAG	2	6	60894	60899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501552
1060	NC_015728	TTC	2	6	60938	60943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501552
1061	NC_015728	CT	3	6	60979	60984	0 %	50 %	0 %	50 %	339501552
1062	NC_015728	ATG	2	6	60993	60998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501552
1063	NC_015728	TGG	2	6	61008	61013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501552
1064	NC_015728	GC	3	6	61075	61080	0 %	0 %	50 %	50 %	339501552
1065	NC_015728	AAG	2	6	61154	61159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501552
1066	NC_015728	TCG	2	6	61174	61179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501552
1067	NC_015728	ATG	2	6	61266	61271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501552
1068	NC_015728	ACCA	2	8	61283	61290	50 %	0 %	0 %	50 %	339501552
1069	NC_015728	TTC	2	6	61337	61342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501552
1070	NC_015728	ATTT	2	8	61448	61455	25 %	75 %	0 %	0 %	339501553
1071	NC_015728	GCA	2	6	61485	61490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501553
1072	NC_015728	CGT	2	6	61591	61596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501553
1073	NC_015728	GAAATA	2	12	61612	61623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	339501553
1074	NC_015728	GCC	2	6	61721	61726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501553
1075	NC_015728	ATG	2	6	61730	61735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501553
1076	NC_015728	CAC	2	6	62026	62031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501554
1077	NC_015728	CCG	2	6	62041	62046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501554
1078	NC_015728	CCT	2	6	62085	62090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501554
1079	NC_015728	CAT	2	6	62138	62143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501554
1080	NC_015728	CGA	2	6	62156	62161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501554
1081	NC_015728	CA	3	6	62164	62169	50 %	0 %	0 %	50 %	339501554
1082	NC_015728	CGGC	2	8	62269	62276	0 %	0 %	50 %	50 %	339501554
1083	NC_015728	GCT	2	6	62316	62321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501554
1084	NC_015728	TTTC	2	8	62368	62375	0 %	75 %	0 %	25 %	339501554
1085	NC_015728	TTTG	2	8	62396	62403	0 %	75 %	25 %	0 %	339501555
1086	NC_015728	CAC	2	6	62455	62460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339501555
1087	NC_015728	GCGTC	2	10	62506	62515	0 %	20 %	40 %	40 %	339501555
1088	NC_015728	TGA	2	6	62533	62538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501555
1089	NC_015728	GCC	2	6	62558	62563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501555
1090	NC_015728	TC	3	6	62615	62620	0 %	50 %	0 %	50 %	339501555
1091	NC_015728	GT	3	6	62659	62664	0 %	50 %	50 %	0 %	339501555
1092	NC_015728	TC	3	6	62704	62709	0 %	50 %	0 %	50 %	339501555
1093	NC_015728	TGC	2	6	62713	62718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501555
1094	NC_015728	GC	4	8	62733	62740	0 %	0 %	50 %	50 %	339501555
1095	NC_015728	CGC	2	6	62780	62785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501555
1096	NC_015728	GT	3	6	62817	62822	0 %	50 %	50 %	0 %	339501555
1097	NC_015728	ATC	2	6	62897	62902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339501555
1098	NC_015728	GAT	2	6	62926	62931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501555
1099	NC_015728	GCG	2	6	62983	62988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501555
1100	NC_015728	GCCA	2	8	63003	63010	25 %	0 %	25 %	50 %	339501555
1101	NC_015728	CGG	2	6	63016	63021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501555
1102	NC_015728	GGT	2	6	63025	63030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501555
1103	NC_015728	TG	3	6	63042	63047	0 %	50 %	50 %	0 %	339501555
1104	NC_015728	CGT	2	6	63064	63069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501555
1105	NC_015728	TGC	2	6	63075	63080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501555
1106	NC_015728	ACAG	2	8	63226	63233	50 %	0 %	25 %	25 %	339501555
1107	NC_015728	GCT	2	6	63251	63256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501555
1108	NC_015728	CCGA	2	8	63279	63286	25 %	0 %	25 %	50 %	339501555
1109	NC_015728	CTT	2	6	63405	63410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501556
1110	NC_015728	AGCG	2	8	63431	63438	25 %	0 %	50 %	25 %	339501556
1111	NC_015728	CGGT	2	8	63470	63477	0 %	25 %	50 %	25 %	339501556
1112	NC_015728	CGA	2	6	63496	63501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501556
1113	NC_015728	GTC	2	6	63545	63550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339501556
1114	NC_015728	TCGA	2	8	63642	63649	25 %	25 %	25 %	25 %	339501556
1115	NC_015728	GC	6	12	63658	63669	0 %	0 %	50 %	50 %	339501556
1116	NC_015728	CG	3	6	63710	63715	0 %	0 %	50 %	50 %	339501556
1117	NC_015728	CGCTG	2	10	63727	63736	0 %	20 %	40 %	40 %	339501556
1118	NC_015728	GTA	2	6	63761	63766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501556
1119	NC_015728	TCC	2	6	63828	63833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339501557
1120	NC_015728	GTG	2	6	63865	63870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339501557
1121	NC_015728	GCG	2	6	63908	63913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501557
1122	NC_015728	ACCGAT	2	12	63936	63947	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339501557
1123	NC_015728	CGC	2	6	63965	63970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339501557
1124	NC_015728	AAG	2	6	63983	63988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339501557
1125	NC_015728	CGG	2	6	64015	64020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339501557
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1232	NC_015728	GCATG	2	10	69789	69798	20 %	20 %	40 %	20 %	339501562
1233	NC_015728	CGCGC	2	10	69828	69837	0 %	0 %	40 %	60 %	339501562
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1239	NC_015728	CTT	2	6	70263	70268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339501562
1240	NC_015728	CGA	2	6	70299	70304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501562
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1242	NC_015728	TGA	2	6	70512	70517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501562
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1245	NC_015728	TGTC	2	8	70656	70663	0 %	50 %	25 %	25 %	339501562
1246	NC_015728	GCA	2	6	70700	70705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339501562
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1248	NC_015728	ATG	2	6	70739	70744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339501562
1249	NC_015728	GCAA	2	8	70777	70784	50 %	0 %	25 %	25 %	339501563
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1251	NC_015728	CT	3	6	70853	70858	0 %	50 %	0 %	50 %	339501563
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