MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL04

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015705	T	7	7	487	493	0 %	100 %	0 %	0 %	338215038
2	NC_015705	A	6	6	977	982	100 %	0 %	0 %	0 %	338215038
3	NC_015705	T	6	6	1125	1130	0 %	100 %	0 %	0 %	338215038
4	NC_015705	G	7	7	2157	2163	0 %	0 %	100 %	0 %	338215039
5	NC_015705	A	7	7	2325	2331	100 %	0 %	0 %	0 %	338215039
6	NC_015705	A	6	6	2417	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	338215039
7	NC_015705	T	6	6	2853	2858	0 %	100 %	0 %	0 %	338215039
8	NC_015705	A	8	8	3299	3306	100 %	0 %	0 %	0 %	338215040
9	NC_015705	T	6	6	5381	5386	0 %	100 %	0 %	0 %	338215042
10	NC_015705	A	7	7	5987	5993	100 %	0 %	0 %	0 %	338215043
11	NC_015705	A	7	7	6707	6713	100 %	0 %	0 %	0 %	338215044
12	NC_015705	A	6	6	6752	6757	100 %	0 %	0 %	0 %	338215044
13	NC_015705	A	6	6	7058	7063	100 %	0 %	0 %	0 %	338215044
14	NC_015705	A	6	6	7626	7631	100 %	0 %	0 %	0 %	338215044
15	NC_015705	A	6	6	7633	7638	100 %	0 %	0 %	0 %	338215044
16	NC_015705	A	6	6	8769	8774	100 %	0 %	0 %	0 %	338215045
17	NC_015705	A	7	7	8975	8981	100 %	0 %	0 %	0 %	338215045
18	NC_015705	A	6	6	9991	9996	100 %	0 %	0 %	0 %	338215047
19	NC_015705	T	6	6	10030	10035	0 %	100 %	0 %	0 %	338215047
20	NC_015705	A	6	6	10048	10053	100 %	0 %	0 %	0 %	338215047
21	NC_015705	A	6	6	10204	10209	100 %	0 %	0 %	0 %	338215047
22	NC_015705	A	6	6	10685	10690	100 %	0 %	0 %	0 %	338215048
23	NC_015705	T	6	6	11190	11195	0 %	100 %	0 %	0 %	338215048
24	NC_015705	A	6	6	11349	11354	100 %	0 %	0 %	0 %	338215048
25	NC_015705	C	6	6	11409	11414	0 %	0 %	0 %	100 %	338215048
26	NC_015705	A	7	7	11508	11514	100 %	0 %	0 %	0 %	338215048
27	NC_015705	T	6	6	12438	12443	0 %	100 %	0 %	0 %	338215049
28	NC_015705	T	6	6	12894	12899	0 %	100 %	0 %	0 %	338215049
29	NC_015705	A	6	6	13384	13389	100 %	0 %	0 %	0 %	338215049
30	NC_015705	T	6	6	14343	14348	0 %	100 %	0 %	0 %	338215051
31	NC_015705	A	6	6	14877	14882	100 %	0 %	0 %	0 %	338215051
32	NC_015705	T	7	7	14887	14893	0 %	100 %	0 %	0 %	338215051
33	NC_015705	A	6	6	15010	15015	100 %	0 %	0 %	0 %	338215052
34	NC_015705	T	6	6	15113	15118	0 %	100 %	0 %	0 %	338215052
35	NC_015705	A	6	6	15261	15266	100 %	0 %	0 %	0 %	338215053
36	NC_015705	A	6	6	15602	15607	100 %	0 %	0 %	0 %	338215054
37	NC_015705	T	7	7	15712	15718	0 %	100 %	0 %	0 %	338215054
38	NC_015705	A	6	6	15782	15787	100 %	0 %	0 %	0 %	338215054
39	NC_015705	T	6	6	15940	15945	0 %	100 %	0 %	0 %	338215054
40	NC_015705	T	6	6	16239	16244	0 %	100 %	0 %	0 %	338215055
41	NC_015705	A	6	6	16545	16550	100 %	0 %	0 %	0 %	338215055
42	NC_015705	A	7	7	16859	16865	100 %	0 %	0 %	0 %	338215056
43	NC_015705	T	7	7	17939	17945	0 %	100 %	0 %	0 %	338215057
44	NC_015705	A	6	6	18163	18168	100 %	0 %	0 %	0 %	338215057
45	NC_015705	A	7	7	18804	18810	100 %	0 %	0 %	0 %	338215058
46	NC_015705	T	6	6	18929	18934	0 %	100 %	0 %	0 %	338215058
47	NC_015705	C	6	6	19286	19291	0 %	0 %	0 %	100 %	338215059
48	NC_015705	T	6	6	19298	19303	0 %	100 %	0 %	0 %	338215059
49	NC_015705	T	6	6	19398	19403	0 %	100 %	0 %	0 %	338215059
50	NC_015705	T	6	6	19891	19896	0 %	100 %	0 %	0 %	338215059
51	NC_015705	G	6	6	19915	19920	0 %	0 %	100 %	0 %	338215059
52	NC_015705	T	6	6	20568	20573	0 %	100 %	0 %	0 %	338215059
53	NC_015705	T	6	6	20802	20807	0 %	100 %	0 %	0 %	338215060
54	NC_015705	A	6	6	21025	21030	100 %	0 %	0 %	0 %	338215060
55	NC_015705	T	6	6	21132	21137	0 %	100 %	0 %	0 %	338215060
56	NC_015705	A	6	6	21186	21191	100 %	0 %	0 %	0 %	338215060
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58	NC_015705	A	6	6	24162	24167	100 %	0 %	0 %	0 %	338215062
59	NC_015705	A	6	6	25474	25479	100 %	0 %	0 %	0 %	338215063
60	NC_015705	C	6	6	25541	25546	0 %	0 %	0 %	100 %	338215063
61	NC_015705	A	6	6	26048	26053	100 %	0 %	0 %	0 %	338215063
62	NC_015705	A	7	7	26131	26137	100 %	0 %	0 %	0 %	338215063
63	NC_015705	T	6	6	27562	27567	0 %	100 %	0 %	0 %	338215064
64	NC_015705	T	6	6	27905	27910	0 %	100 %	0 %	0 %	338215064
65	NC_015705	A	6	6	27956	27961	100 %	0 %	0 %	0 %	338215064
66	NC_015705	A	6	6	28213	28218	100 %	0 %	0 %	0 %	338215064
67	NC_015705	T	6	6	28495	28500	0 %	100 %	0 %	0 %	338215064
68	NC_015705	T	8	8	29792	29799	0 %	100 %	0 %	0 %	338215064
69	NC_015705	A	6	6	30323	30328	100 %	0 %	0 %	0 %	338215065
70	NC_015705	T	6	6	30595	30600	0 %	100 %	0 %	0 %	338215065
71	NC_015705	T	6	6	31427	31432	0 %	100 %	0 %	0 %	338215066
72	NC_015705	A	6	6	31509	31514	100 %	0 %	0 %	0 %	338215066
73	NC_015705	C	7	7	32159	32165	0 %	0 %	0 %	100 %	338215066
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77	NC_015705	A	7	7	33355	33361	100 %	0 %	0 %	0 %	338215067
78	NC_015705	T	8	8	33471	33478	0 %	100 %	0 %	0 %	338215067
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81	NC_015705	A	6	6	34097	34102	100 %	0 %	0 %	0 %	338215068
82	NC_015705	A	6	6	34129	34134	100 %	0 %	0 %	0 %	338215068
83	NC_015705	A	7	7	34283	34289	100 %	0 %	0 %	0 %	338215069
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86	NC_015705	T	6	6	34790	34795	0 %	100 %	0 %	0 %	338215069
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88	NC_015705	T	6	6	35320	35325	0 %	100 %	0 %	0 %	338215070
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91	NC_015705	T	7	7	35493	35499	0 %	100 %	0 %	0 %	338215071
92	NC_015705	T	7	7	36066	36072	0 %	100 %	0 %	0 %	338215072
93	NC_015705	A	6	6	36140	36145	100 %	0 %	0 %	0 %	338215072
94	NC_015705	A	6	6	36355	36360	100 %	0 %	0 %	0 %	338215072
95	NC_015705	T	7	7	36922	36928	0 %	100 %	0 %	0 %	338215072
96	NC_015705	A	6	6	37177	37182	100 %	0 %	0 %	0 %	338215072
97	NC_015705	T	7	7	37245	37251	0 %	100 %	0 %	0 %	338215072
98	NC_015705	T	6	6	37836	37841	0 %	100 %	0 %	0 %	338215074
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100	NC_015705	T	6	6	39734	39739	0 %	100 %	0 %	0 %	338215075
101	NC_015705	A	6	6	40294	40299	100 %	0 %	0 %	0 %	338215075
102	NC_015705	T	6	6	42888	42893	0 %	100 %	0 %	0 %	338215076
103	NC_015705	T	7	7	42911	42917	0 %	100 %	0 %	0 %	338215076
104	NC_015705	T	6	6	43448	43453	0 %	100 %	0 %	0 %	338215077

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.