MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL04

Total Repeats: 696

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015705	AAT	2	6	32948	32953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215067
502	NC_015705	CAA	2	6	32977	32982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215067
503	NC_015705	TCT	2	6	32995	33000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215067
504	NC_015705	A	6	6	33014	33019	100 %	0 %	0 %	0 %	338215067
505	NC_015705	AGA	2	6	33087	33092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215067
506	NC_015705	AACA	2	8	33132	33139	75 %	0 %	0 %	25 %	338215067
507	NC_015705	ATTC	2	8	33229	33236	25 %	50 %	0 %	25 %	338215067
508	NC_015705	GTA	2	6	33254	33259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215067
509	NC_015705	ATA	2	6	33284	33289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215067
510	NC_015705	CT	3	6	33303	33308	0 %	50 %	0 %	50 %	338215067
511	NC_015705	AT	3	6	33321	33326	50 %	50 %	0 %	0 %	338215067
512	NC_015705	A	7	7	33355	33361	100 %	0 %	0 %	0 %	338215067
513	NC_015705	TCT	2	6	33405	33410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215067
514	NC_015705	AAT	2	6	33430	33435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215067
515	NC_015705	T	8	8	33471	33478	0 %	100 %	0 %	0 %	338215067
516	NC_015705	CTA	2	6	33539	33544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215068
517	NC_015705	A	6	6	33654	33659	100 %	0 %	0 %	0 %	338215068
518	NC_015705	CGT	2	6	33743	33748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215068
519	NC_015705	AAT	2	6	33789	33794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215068
520	NC_015705	CTG	2	6	33804	33809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215068
521	NC_015705	ATG	2	6	33811	33816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215068
522	NC_015705	CAG	2	6	33852	33857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215068
523	NC_015705	TCA	2	6	33860	33865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215068
524	NC_015705	TCTT	2	8	33897	33904	0 %	75 %	0 %	25 %	338215068
525	NC_015705	T	6	6	34049	34054	0 %	100 %	0 %	0 %	338215068
526	NC_015705	A	6	6	34097	34102	100 %	0 %	0 %	0 %	338215068
527	NC_015705	A	6	6	34129	34134	100 %	0 %	0 %	0 %	338215068
528	NC_015705	CTT	2	6	34142	34147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215068
529	NC_015705	CGAC	2	8	34148	34155	25 %	0 %	25 %	50 %	338215068
530	NC_015705	CGTG	2	8	34200	34207	0 %	25 %	50 %	25 %	338215068
531	NC_015705	A	7	7	34283	34289	100 %	0 %	0 %	0 %	338215069
532	NC_015705	TAA	2	6	34324	34329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215069
533	NC_015705	AGT	2	6	34376	34381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215069
534	NC_015705	TGT	2	6	34396	34401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215069
535	NC_015705	AAT	2	6	34465	34470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215069
536	NC_015705	CATA	2	8	34555	34562	50 %	25 %	0 %	25 %	338215069
537	NC_015705	A	6	6	34671	34676	100 %	0 %	0 %	0 %	338215069
538	NC_015705	TTC	2	6	34697	34702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215069
539	NC_015705	A	6	6	34758	34763	100 %	0 %	0 %	0 %	338215069
540	NC_015705	CTG	2	6	34775	34780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215069
541	NC_015705	T	6	6	34790	34795	0 %	100 %	0 %	0 %	338215069
542	NC_015705	GCG	2	6	34850	34855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215069
543	NC_015705	ATA	2	6	34881	34886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215069
544	NC_015705	GAA	2	6	34908	34913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215069
545	NC_015705	A	9	9	34989	34997	100 %	0 %	0 %	0 %	338215069
546	NC_015705	AGA	2	6	35028	35033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215069
547	NC_015705	TAA	2	6	35116	35121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215069
548	NC_015705	ATTGAT	2	12	35126	35137	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	338215069
549	NC_015705	GAA	2	6	35149	35154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215069
550	NC_015705	AGT	2	6	35244	35249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215069
551	NC_015705	T	6	6	35320	35325	0 %	100 %	0 %	0 %	338215070
552	NC_015705	TC	3	6	35375	35380	0 %	50 %	0 %	50 %	338215070
553	NC_015705	C	8	8	35380	35387	0 %	0 %	0 %	100 %	338215070
554	NC_015705	T	6	6	35406	35411	0 %	100 %	0 %	0 %	338215070
555	NC_015705	GCC	2	6	35427	35432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215070
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558	NC_015705	TG	3	6	35471	35476	0 %	50 %	50 %	0 %	338215071
559	NC_015705	T	7	7	35493	35499	0 %	100 %	0 %	0 %	338215071
560	NC_015705	AAT	2	6	35519	35524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215071
561	NC_015705	GGT	2	6	35526	35531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215071
562	NC_015705	TATTT	2	10	35735	35744	20 %	80 %	0 %	0 %	338215072
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565	NC_015705	GTG	2	6	35917	35922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215072
566	NC_015705	TCA	2	6	35931	35936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215072
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569	NC_015705	T	7	7	36066	36072	0 %	100 %	0 %	0 %	338215072
570	NC_015705	AAT	2	6	36117	36122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215072
571	NC_015705	A	6	6	36140	36145	100 %	0 %	0 %	0 %	338215072
572	NC_015705	CAT	2	6	36241	36246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215072
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579	NC_015705	GT	3	6	36449	36454	0 %	50 %	50 %	0 %	338215072
580	NC_015705	GTT	2	6	36547	36552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215072
581	NC_015705	TTC	2	6	36617	36622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215072
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584	NC_015705	TAA	2	6	36687	36692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215072
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588	NC_015705	GTGCG	2	10	36845	36854	0 %	20 %	60 %	20 %	338215072
589	NC_015705	T	7	7	36922	36928	0 %	100 %	0 %	0 %	338215072
590	NC_015705	TGG	2	6	36956	36961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215072
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592	NC_015705	TGA	2	6	37083	37088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215072
593	NC_015705	A	6	6	37177	37182	100 %	0 %	0 %	0 %	338215072
594	NC_015705	TTTG	2	8	37187	37194	0 %	75 %	25 %	0 %	338215072
595	NC_015705	T	7	7	37245	37251	0 %	100 %	0 %	0 %	338215072
596	NC_015705	CTA	2	6	37396	37401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215073
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598	NC_015705	TTC	2	6	37449	37454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215073
599	NC_015705	TG	3	6	37536	37541	0 %	50 %	50 %	0 %	338215073
600	NC_015705	ATG	2	6	37636	37641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215074
601	NC_015705	GGC	2	6	37669	37674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215074
602	NC_015705	AAAGC	2	10	37688	37697	60 %	0 %	20 %	20 %	338215074
603	NC_015705	TTTC	2	8	37714	37721	0 %	75 %	0 %	25 %	338215074
604	NC_015705	CAA	2	6	37728	37733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215074
605	NC_015705	AACC	2	8	37768	37775	50 %	0 %	0 %	50 %	338215074
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608	NC_015705	CGG	2	6	37853	37858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215074
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610	NC_015705	TGC	2	6	38075	38080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215075
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612	NC_015705	CCG	2	6	38108	38113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215075
613	NC_015705	CATT	2	8	38180	38187	25 %	50 %	0 %	25 %	338215075
614	NC_015705	GCG	2	6	38217	38222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215075
615	NC_015705	TCA	2	6	38224	38229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215075
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617	NC_015705	TGT	2	6	38534	38539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215075
618	NC_015705	GTA	2	6	38575	38580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215075
619	NC_015705	TGG	2	6	38600	38605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215075
620	NC_015705	C	6	6	38658	38663	0 %	0 %	0 %	100 %	338215075
621	NC_015705	TATTGC	2	12	38837	38848	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338215075
622	NC_015705	TTG	2	6	38943	38948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215075
623	NC_015705	TAA	2	6	38951	38956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215075
624	NC_015705	TCCA	2	8	39000	39007	25 %	25 %	0 %	50 %	338215075
625	NC_015705	TGGA	2	8	39116	39123	25 %	25 %	50 %	0 %	338215075
626	NC_015705	CCAT	2	8	39208	39215	25 %	25 %	0 %	50 %	338215075
627	NC_015705	ACT	2	6	39343	39348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215075
628	NC_015705	CTT	2	6	39488	39493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215075
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