MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL02

Total Repeats: 1714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015704	AGT	2	6	55398	55403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215131
1002	NC_015704	T	6	6	55411	55416	0 %	100 %	0 %	0 %	338215131
1003	NC_015704	AAT	2	6	55424	55429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215132
1004	NC_015704	T	7	7	55456	55462	0 %	100 %	0 %	0 %	338215132
1005	NC_015704	A	6	6	55478	55483	100 %	0 %	0 %	0 %	338215132
1006	NC_015704	AAG	2	6	55500	55505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215132
1007	NC_015704	GGT	2	6	55531	55536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215132
1008	NC_015704	TA	3	6	55612	55617	50 %	50 %	0 %	0 %	338215132
1009	NC_015704	TGA	2	6	55688	55693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215132
1010	NC_015704	CGT	2	6	55752	55757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215132
1011	NC_015704	TCA	2	6	55872	55877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215132
1012	NC_015704	CTT	2	6	55938	55943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215132
1013	NC_015704	TGA	2	6	55944	55949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215132
1014	NC_015704	GGT	2	6	56041	56046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215132
1015	NC_015704	GCA	2	6	56140	56145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215133
1016	NC_015704	T	7	7	56181	56187	0 %	100 %	0 %	0 %	338215133
1017	NC_015704	A	6	6	56248	56253	100 %	0 %	0 %	0 %	338215133
1018	NC_015704	CTT	2	6	56264	56269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215133
1019	NC_015704	GTA	2	6	56325	56330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215133
1020	NC_015704	GCT	2	6	56338	56343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215133
1021	NC_015704	TCT	2	6	56387	56392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215133
1022	NC_015704	TCA	2	6	56413	56418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215133
1023	NC_015704	GTC	2	6	56422	56427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215133
1024	NC_015704	GTT	2	6	56478	56483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215133
1025	NC_015704	GTT	2	6	56533	56538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215133
1026	NC_015704	CCA	2	6	56686	56691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215133
1027	NC_015704	TTG	2	6	56841	56846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215133
1028	NC_015704	GCTG	2	8	56865	56872	0 %	25 %	50 %	25 %	338215133
1029	NC_015704	T	6	6	56934	56939	0 %	100 %	0 %	0 %	338215133
1030	NC_015704	GTT	2	6	56951	56956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215134
1031	NC_015704	TA	3	6	56957	56962	50 %	50 %	0 %	0 %	338215134
1032	NC_015704	TGA	2	6	56965	56970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215134
1033	NC_015704	T	7	7	56976	56982	0 %	100 %	0 %	0 %	338215134
1034	NC_015704	T	6	6	57002	57007	0 %	100 %	0 %	0 %	338215134
1035	NC_015704	TTTTG	2	10	57037	57046	0 %	80 %	20 %	0 %	338215134
1036	NC_015704	TTC	2	6	57057	57062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215134
1037	NC_015704	TTTC	2	8	57087	57094	0 %	75 %	0 %	25 %	338215134
1038	NC_015704	TGGA	2	8	57174	57181	25 %	25 %	50 %	0 %	338215134
1039	NC_015704	TTG	2	6	57204	57209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215134
1040	NC_015704	TAA	2	6	57274	57279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215134
1041	NC_015704	ATT	2	6	57305	57310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215134
1042	NC_015704	CTA	2	6	57361	57366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215134
1043	NC_015704	TCT	2	6	57404	57409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215135
1044	NC_015704	GAC	2	6	57425	57430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215135
1045	NC_015704	TA	3	6	57563	57568	50 %	50 %	0 %	0 %	338215135
1046	NC_015704	TGG	2	6	57599	57604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215135
1047	NC_015704	TC	3	6	57642	57647	0 %	50 %	0 %	50 %	338215135
1048	NC_015704	TCT	2	6	57653	57658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215135
1049	NC_015704	CAT	2	6	57666	57671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215135
1050	NC_015704	T	8	8	57676	57683	0 %	100 %	0 %	0 %	338215135
1051	NC_015704	CAT	2	6	57727	57732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215135
1052	NC_015704	T	6	6	57782	57787	0 %	100 %	0 %	0 %	338215135
1053	NC_015704	T	7	7	57811	57817	0 %	100 %	0 %	0 %	338215135
1054	NC_015704	TGT	2	6	57835	57840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215135
1055	NC_015704	CTT	2	6	57879	57884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215135
1056	NC_015704	GTT	2	6	57901	57906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215135
1057	NC_015704	ATA	2	6	57915	57920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215135
1058	NC_015704	TTC	2	6	58064	58069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215136
1059	NC_015704	TCA	2	6	58172	58177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215136
1060	NC_015704	TAG	2	6	58198	58203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215136
1061	NC_015704	GTA	2	6	58219	58224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215136
1062	NC_015704	T	7	7	58254	58260	0 %	100 %	0 %	0 %	338215136
1063	NC_015704	TGA	2	6	58329	58334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215136
1064	NC_015704	CCA	2	6	58377	58382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215136
1065	NC_015704	GAT	2	6	58442	58447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215136
1066	NC_015704	AG	3	6	58458	58463	50 %	0 %	50 %	0 %	338215136
1067	NC_015704	AAT	2	6	58484	58489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215136
1068	NC_015704	GTTT	2	8	58492	58499	0 %	75 %	25 %	0 %	338215136
1069	NC_015704	T	6	6	58699	58704	0 %	100 %	0 %	0 %	338215137
1070	NC_015704	TTG	2	6	58793	58798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215137
1071	NC_015704	TAG	2	6	58890	58895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215137
1072	NC_015704	T	6	6	58910	58915	0 %	100 %	0 %	0 %	338215137
1073	NC_015704	ATG	2	6	59051	59056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215137
1074	NC_015704	TTTG	2	8	59093	59100	0 %	75 %	25 %	0 %	338215137
1075	NC_015704	AG	3	6	59161	59166	50 %	0 %	50 %	0 %	338215137
1076	NC_015704	TCAC	2	8	59219	59226	25 %	25 %	0 %	50 %	338215137
1077	NC_015704	TTG	3	9	59258	59266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215137
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1079	NC_015704	TTC	2	6	59431	59436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215137
1080	NC_015704	GCC	2	6	59567	59572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215137
1081	NC_015704	TTC	2	6	59581	59586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215137
1082	NC_015704	GTT	2	6	59631	59636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215137
1083	NC_015704	T	7	7	59732	59738	0 %	100 %	0 %	0 %	338215137
1084	NC_015704	TTG	2	6	59988	59993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215138
1085	NC_015704	GTC	2	6	60079	60084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215138
1086	NC_015704	TTG	2	6	60196	60201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215138
1087	NC_015704	GTT	2	6	60255	60260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215138
1088	NC_015704	ATC	2	6	60271	60276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215138
1089	NC_015704	TACTTT	2	12	60288	60299	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338215138
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1091	NC_015704	GGC	2	6	60430	60435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215138
1092	NC_015704	GCT	2	6	60471	60476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215138
1093	NC_015704	CAC	2	6	60545	60550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215138
1094	NC_015704	T	6	6	60585	60590	0 %	100 %	0 %	0 %	338215138
1095	NC_015704	TGT	2	6	60709	60714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215138
1096	NC_015704	CAT	2	6	60845	60850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215138
1097	NC_015704	ACC	2	6	60874	60879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215138
1098	NC_015704	T	6	6	60881	60886	0 %	100 %	0 %	0 %	338215138
1099	NC_015704	ATAC	2	8	60926	60933	50 %	25 %	0 %	25 %	338215138
1100	NC_015704	CCT	2	6	60994	60999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338215138
1101	NC_015704	T	7	7	60999	61005	0 %	100 %	0 %	0 %	338215138
1102	NC_015704	CTT	2	6	61103	61108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215138
1103	NC_015704	T	8	8	61107	61114	0 %	100 %	0 %	0 %	338215138
1104	NC_015704	ACAGG	2	10	61135	61144	40 %	0 %	40 %	20 %	338215138
1105	NC_015704	AGT	2	6	61190	61195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215138
1106	NC_015704	TTGC	2	8	61197	61204	0 %	50 %	25 %	25 %	338215138
1107	NC_015704	T	6	6	61209	61214	0 %	100 %	0 %	0 %	338215138
1108	NC_015704	CAT	2	6	61224	61229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215138
1109	NC_015704	TGG	2	6	61255	61260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215138
1110	NC_015704	ACAGG	2	10	61291	61300	40 %	0 %	40 %	20 %	338215138
1111	NC_015704	TTG	2	6	61321	61326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215138
1112	NC_015704	GGCA	2	8	61343	61350	25 %	0 %	50 %	25 %	338215138
1113	NC_015704	AT	3	6	61396	61401	50 %	50 %	0 %	0 %	338215138
1114	NC_015704	T	6	6	61458	61463	0 %	100 %	0 %	0 %	338215138
1115	NC_015704	AGT	2	6	61496	61501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215139
1116	NC_015704	TGT	2	6	61502	61507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215139
1117	NC_015704	TCCA	2	8	61544	61551	25 %	25 %	0 %	50 %	338215139
1118	NC_015704	TCG	2	6	61574	61579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215139
1119	NC_015704	CAA	2	6	61597	61602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215139
1120	NC_015704	CAT	2	6	61678	61683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215139
1121	NC_015704	CAG	2	6	61983	61988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215139
1122	NC_015704	AAAG	2	8	62030	62037	75 %	0 %	25 %	0 %	338215139
1123	NC_015704	GCA	2	6	62070	62075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215139
1124	NC_015704	ATCTAA	2	12	62137	62148	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338215139
1125	NC_015704	GGCTTT	2	12	62155	62166	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	338215139
1126	NC_015704	TGC	2	6	62172	62177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215139
1127	NC_015704	CTG	2	6	62211	62216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215139
1128	NC_015704	CTTT	2	8	62246	62253	0 %	75 %	0 %	25 %	338215139
1129	NC_015704	TCT	3	9	62265	62273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215139
1130	NC_015704	TTC	2	6	62380	62385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215139
1131	NC_015704	ATC	2	6	62411	62416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215139
1132	NC_015704	CCCG	2	8	62477	62484	0 %	0 %	25 %	75 %	338215139
1133	NC_015704	CAT	2	6	62491	62496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215139
1134	NC_015704	CATC	2	8	62592	62599	25 %	25 %	0 %	50 %	338215139
1135	NC_015704	GGGT	2	8	62612	62619	0 %	25 %	75 %	0 %	338215139
1136	NC_015704	TGT	2	6	62660	62665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215139
1137	NC_015704	CAT	2	6	62728	62733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215139
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1140	NC_015704	GCT	2	6	62955	62960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215140
1141	NC_015704	GCCACC	2	12	63114	63125	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	338215140
1142	NC_015704	AT	3	6	63153	63158	50 %	50 %	0 %	0 %	338215140
1143	NC_015704	ACA	2	6	63232	63237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215140
1144	NC_015704	AGA	2	6	63241	63246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215140
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1147	NC_015704	AATAA	2	10	63326	63335	80 %	20 %	0 %	0 %	338215140
1148	NC_015704	T	7	7	63347	63353	0 %	100 %	0 %	0 %	338215140
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1150	NC_015704	TCC	2	6	63381	63386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338215140
1151	NC_015704	AGTAC	2	10	63423	63432	40 %	20 %	20 %	20 %	338215140
1152	NC_015704	GAC	2	6	63607	63612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215140
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1155	NC_015704	TCC	2	6	63702	63707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338215140
1156	NC_015704	TAT	2	6	63716	63721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215140
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1158	NC_015704	GATT	2	8	63814	63821	25 %	50 %	25 %	0 %	338215140
1159	NC_015704	TGA	2	6	63895	63900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215140
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1162	NC_015704	T	6	6	63996	64001	0 %	100 %	0 %	0 %	338215140
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1166	NC_015704	AGC	2	6	64185	64190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215140
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1184	NC_015704	CAGCAT	2	12	65046	65057	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338215141
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1235	NC_015704	CTGCC	2	10	68141	68150	0 %	20 %	20 %	60 %	338215143
1236	NC_015704	CCAT	2	8	68172	68179	25 %	25 %	0 %	50 %	338215143
1237	NC_015704	GCA	2	6	68181	68186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215143
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1243	NC_015704	ATA	2	6	68482	68487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215143
1244	NC_015704	CTG	2	6	68509	68514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215143
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1248	NC_015704	CAA	2	6	68902	68907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215144
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1250	NC_015704	TGT	2	6	68934	68939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215144
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