MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL02

Total Repeats: 1714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015704	AGCCAA	2	12	29738	29749	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	338215113
502	NC_015704	CCT	2	6	29752	29757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338215113
503	NC_015704	A	6	6	29965	29970	100 %	0 %	0 %	0 %	338215113
504	NC_015704	GTAG	2	8	30039	30046	25 %	25 %	50 %	0 %	338215113
505	NC_015704	GTG	2	6	30150	30155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215113
506	NC_015704	TGCC	2	8	30254	30261	0 %	25 %	25 %	50 %	338215113
507	NC_015704	TGG	2	6	30298	30303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215113
508	NC_015704	GTAA	2	8	30426	30433	50 %	25 %	25 %	0 %	338215113
509	NC_015704	AG	3	6	30485	30490	50 %	0 %	50 %	0 %	338215113
510	NC_015704	TGT	2	6	30518	30523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215113
511	NC_015704	ACA	2	6	30563	30568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215113
512	NC_015704	TAC	2	6	30621	30626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215113
513	NC_015704	ATGA	2	8	30645	30652	50 %	25 %	25 %	0 %	338215113
514	NC_015704	TAT	2	6	30680	30685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215113
515	NC_015704	CAG	2	6	30808	30813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215113
516	NC_015704	AGC	2	6	30920	30925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215113
517	NC_015704	ACA	3	9	30941	30949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215113
518	NC_015704	TAG	2	6	30958	30963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215113
519	NC_015704	TCA	2	6	31139	31144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215113
520	NC_015704	GCA	2	6	31191	31196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215113
521	NC_015704	A	6	6	31305	31310	100 %	0 %	0 %	0 %	338215113
522	NC_015704	GAA	2	6	31419	31424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215114
523	NC_015704	GAA	2	6	31482	31487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215114
524	NC_015704	GGT	2	6	31514	31519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215114
525	NC_015704	GACT	2	8	31565	31572	25 %	25 %	25 %	25 %	338215115
526	NC_015704	GTT	2	6	31677	31682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215115
527	NC_015704	AAT	2	6	31715	31720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215115
528	NC_015704	AG	3	6	31730	31735	50 %	0 %	50 %	0 %	338215115
529	NC_015704	ATA	2	6	31744	31749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215115
530	NC_015704	ATA	2	6	31762	31767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215115
531	NC_015704	GCTTGG	2	12	31921	31932	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	338215115
532	NC_015704	AATTC	2	10	31963	31972	40 %	40 %	0 %	20 %	338215115
533	NC_015704	ACC	2	6	31990	31995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215115
534	NC_015704	TTTCG	2	10	32049	32058	0 %	60 %	20 %	20 %	338215115
535	NC_015704	CGAC	2	8	32141	32148	25 %	0 %	25 %	50 %	338215115
536	NC_015704	CAC	3	9	32166	32174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215115
537	NC_015704	A	7	7	32534	32540	100 %	0 %	0 %	0 %	338215116
538	NC_015704	CTT	2	6	32575	32580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215116
539	NC_015704	TTC	2	6	32618	32623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215116
540	NC_015704	TTC	2	6	32652	32657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215116
541	NC_015704	ACG	2	6	32683	32688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215116
542	NC_015704	TCG	2	6	32706	32711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
543	NC_015704	TGC	2	6	32790	32795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
544	NC_015704	GTC	2	6	32801	32806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
545	NC_015704	CGAC	2	8	32827	32834	25 %	0 %	25 %	50 %	338215116
546	NC_015704	TCG	2	6	32862	32867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
547	NC_015704	CTT	2	6	32986	32991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215116
548	NC_015704	TTG	2	6	33006	33011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215116
549	NC_015704	GTTG	2	8	33025	33032	0 %	50 %	50 %	0 %	338215116
550	NC_015704	TCG	2	6	33063	33068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
551	NC_015704	A	6	6	33080	33085	100 %	0 %	0 %	0 %	338215116
552	NC_015704	TCAG	2	8	33096	33103	25 %	25 %	25 %	25 %	338215116
553	NC_015704	AT	3	6	33136	33141	50 %	50 %	0 %	0 %	338215116
554	NC_015704	CGG	2	6	33172	33177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215116
555	NC_015704	ATC	2	6	33227	33232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215116
556	NC_015704	GAT	2	6	33247	33252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215116
557	NC_015704	CCA	2	6	33271	33276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215116
558	NC_015704	CTG	2	6	33295	33300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
559	NC_015704	ATG	2	6	33348	33353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215116
560	NC_015704	ACA	2	6	33367	33372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215116
561	NC_015704	ACA	2	6	33420	33425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215116
562	NC_015704	GTC	4	12	33452	33463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
563	NC_015704	CTT	2	6	33498	33503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215116
564	NC_015704	TGGG	2	8	33609	33616	0 %	25 %	75 %	0 %	338215116
565	NC_015704	GGC	2	6	33665	33670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215116
566	NC_015704	CGG	2	6	33682	33687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215116
567	NC_015704	CCA	2	6	33754	33759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215116
568	NC_015704	T	8	8	33760	33767	0 %	100 %	0 %	0 %	338215116
569	NC_015704	CTTG	2	8	33889	33896	0 %	50 %	25 %	25 %	338215116
570	NC_015704	TCT	2	6	33897	33902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215116
571	NC_015704	CGT	2	6	33952	33957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
572	NC_015704	TGG	3	9	34042	34050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215116
573	NC_015704	CAG	2	6	34082	34087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215116
574	NC_015704	TCG	2	6	34110	34115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
575	NC_015704	TGC	2	6	34135	34140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
576	NC_015704	CGGT	2	8	34353	34360	0 %	25 %	50 %	25 %	338215116
577	NC_015704	CAT	2	6	34421	34426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215116
578	NC_015704	GAT	2	6	34460	34465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215116
579	NC_015704	CAA	2	6	34496	34501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215116
580	NC_015704	TGG	2	6	34507	34512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215116
581	NC_015704	CTG	2	6	34532	34537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
582	NC_015704	TCG	2	6	34572	34577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
583	NC_015704	G	6	6	34621	34626	0 %	0 %	100 %	0 %	338215116
584	NC_015704	CGA	2	6	34664	34669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215116
585	NC_015704	GT	3	6	34676	34681	0 %	50 %	50 %	0 %	338215116
586	NC_015704	GGTC	2	8	34708	34715	0 %	25 %	50 %	25 %	338215116
587	NC_015704	GCT	2	6	34840	34845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
588	NC_015704	TAT	2	6	34913	34918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215116
589	NC_015704	GAT	2	6	34958	34963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215116
590	NC_015704	TGT	2	6	35017	35022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215116
591	NC_015704	GGT	2	6	35029	35034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215116
592	NC_015704	GGT	2	6	35093	35098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215116
593	NC_015704	GAG	2	6	35105	35110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338215116
594	NC_015704	GAG	2	6	35138	35143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338215116
595	NC_015704	CGG	2	6	35169	35174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215116
596	NC_015704	TTC	2	6	35180	35185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215116
597	NC_015704	CCG	2	6	35267	35272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215116
598	NC_015704	GCT	2	6	35287	35292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
599	NC_015704	GCC	2	6	35324	35329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215116
600	NC_015704	GCT	2	6	35350	35355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
601	NC_015704	GCT	2	6	35365	35370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
602	NC_015704	TCG	2	6	35385	35390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215116
603	NC_015704	CTG	2	6	35463	35468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215117
604	NC_015704	ACCCGC	2	12	35477	35488	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	338215117
605	NC_015704	TCTCCA	2	12	35547	35558	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	338215117
606	NC_015704	CTC	2	6	35605	35610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338215117
607	NC_015704	ATAAA	2	10	35688	35697	80 %	20 %	0 %	0 %	338215117
608	NC_015704	GAA	2	6	35720	35725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215117
609	NC_015704	TGA	2	6	35789	35794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215117
610	NC_015704	CCT	2	6	35852	35857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338215117
611	NC_015704	TCAT	2	8	35858	35865	25 %	50 %	0 %	25 %	338215117
612	NC_015704	GTAA	2	8	35973	35980	50 %	25 %	25 %	0 %	338215117
613	NC_015704	TAC	2	6	35991	35996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215117
614	NC_015704	C	6	6	36066	36071	0 %	0 %	0 %	100 %	338215117
615	NC_015704	GAG	2	6	36160	36165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338215117
616	NC_015704	GCT	2	6	36267	36272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215117
617	NC_015704	GGGGA	2	10	36286	36295	20 %	0 %	80 %	0 %	338215117
618	NC_015704	AACC	2	8	36342	36349	50 %	0 %	0 %	50 %	338215117
619	NC_015704	T	6	6	36400	36405	0 %	100 %	0 %	0 %	338215117
620	NC_015704	ACC	2	6	36445	36450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215117
621	NC_015704	ATTGA	2	10	36613	36622	40 %	40 %	20 %	0 %	338215117
622	NC_015704	T	7	7	36628	36634	0 %	100 %	0 %	0 %	338215117
623	NC_015704	ACAA	2	8	36640	36647	75 %	0 %	0 %	25 %	338215117
624	NC_015704	GGT	2	6	36691	36696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215117
625	NC_015704	TGG	2	6	36702	36707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215117
626	NC_015704	AGTTG	2	10	36737	36746	20 %	40 %	40 %	0 %	338215118
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628	NC_015704	TGA	2	6	36893	36898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215118
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