MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 chromosome

Total Repeats: 3759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015703	GAAAA	2	10	874	883	80 %	0 %	20 %	0 %	338209546
2	NC_015703	TCAAC	2	10	2022	2031	40 %	20 %	0 %	40 %	338209547
3	NC_015703	TGCGC	2	10	3409	3418	0 %	20 %	40 %	40 %	338209549
4	NC_015703	GGGAA	2	10	3571	3580	40 %	0 %	60 %	0 %	338209549
5	NC_015703	CCTGA	2	10	3723	3732	20 %	20 %	20 %	40 %	338209549
6	NC_015703	GGGCA	2	10	4430	4439	20 %	0 %	60 %	20 %	338209550
7	NC_015703	ACCGC	2	10	6595	6604	20 %	0 %	20 %	60 %	338209552
8	NC_015703	TTTCC	2	10	6878	6887	0 %	60 %	0 %	40 %	338209552
9	NC_015703	ATGAA	2	10	7693	7702	60 %	20 %	20 %	0 %	338209553
10	NC_015703	AACTC	2	10	9604	9613	40 %	20 %	0 %	40 %	338209554
11	NC_015703	CCAAC	2	10	13565	13574	40 %	0 %	0 %	60 %	338209557
12	NC_015703	CTTTT	2	10	18881	18890	0 %	80 %	0 %	20 %	338209560
13	NC_015703	CGCCA	2	10	22613	22622	20 %	0 %	20 %	60 %	338209562
14	NC_015703	TCCAT	2	10	23102	23111	20 %	40 %	0 %	40 %	338209562
15	NC_015703	CCTCC	2	10	24990	24999	0 %	20 %	0 %	80 %	338209564
16	NC_015703	CAAAA	2	10	25445	25454	80 %	0 %	0 %	20 %	338209564
17	NC_015703	CATCC	2	10	26932	26941	20 %	20 %	0 %	60 %	338209565
18	NC_015703	TTTAT	2	10	28602	28611	20 %	80 %	0 %	0 %	338209566
19	NC_015703	TACCA	2	10	29219	29228	40 %	20 %	0 %	40 %	338209566
20	NC_015703	AAAGA	2	10	31965	31974	80 %	0 %	20 %	0 %	338209568
21	NC_015703	CCCTG	2	10	32456	32465	0 %	20 %	20 %	60 %	338209569
22	NC_015703	GGCCG	2	10	34235	34244	0 %	0 %	60 %	40 %	338209571
23	NC_015703	GAGCG	2	10	34308	34317	20 %	0 %	60 %	20 %	338209571
24	NC_015703	CCATT	2	10	34588	34597	20 %	40 %	0 %	40 %	338209571
25	NC_015703	AATAA	2	10	40170	40179	80 %	20 %	0 %	0 %	338209577
26	NC_015703	GCCGA	2	10	40732	40741	20 %	0 %	40 %	40 %	338209577
27	NC_015703	CATTC	2	10	41248	41257	20 %	40 %	0 %	40 %	338209578
28	NC_015703	TGGGC	2	10	41877	41886	0 %	20 %	60 %	20 %	338209578
29	NC_015703	TCGGC	2	10	42329	42338	0 %	20 %	40 %	40 %	338209578
30	NC_015703	GAAAT	2	10	44134	44143	60 %	20 %	20 %	0 %	338209580
31	NC_015703	TCAAA	2	10	44238	44247	60 %	20 %	0 %	20 %	338209580
32	NC_015703	GTAAA	2	10	44843	44852	60 %	20 %	20 %	0 %	338209580
33	NC_015703	GGGGC	2	10	46201	46210	0 %	0 %	80 %	20 %	338209581
34	NC_015703	CAAGC	2	10	48896	48905	40 %	0 %	20 %	40 %	338209582
35	NC_015703	CCCAA	2	10	49633	49642	40 %	0 %	0 %	60 %	338209582
36	NC_015703	CGTTG	2	10	51568	51577	0 %	40 %	40 %	20 %	338209584
37	NC_015703	AGCAT	2	10	51651	51660	40 %	20 %	20 %	20 %	338209584
38	NC_015703	ATGAA	2	10	54059	54068	60 %	20 %	20 %	0 %	338209585
39	NC_015703	CGATG	2	10	56706	56715	20 %	20 %	40 %	20 %	338209586
40	NC_015703	TGGTT	2	10	58561	58570	0 %	60 %	40 %	0 %	338209587
41	NC_015703	TTCTT	2	10	62822	62831	0 %	80 %	0 %	20 %	338209589
42	NC_015703	CGATC	2	10	63611	63620	20 %	20 %	20 %	40 %	338209590
43	NC_015703	GGTTC	2	10	63627	63636	0 %	40 %	40 %	20 %	338209590
44	NC_015703	CTGTT	2	10	64083	64092	0 %	60 %	20 %	20 %	338209590
45	NC_015703	GGGTC	2	10	66688	66697	0 %	20 %	60 %	20 %	338209592
46	NC_015703	AGAAA	2	10	67773	67782	80 %	0 %	20 %	0 %	338209593
47	NC_015703	CCAAT	2	10	68249	68258	40 %	20 %	0 %	40 %	338209593
48	NC_015703	CAATT	2	10	71570	71579	40 %	40 %	0 %	20 %	338209595
49	NC_015703	TACCT	2	10	72442	72451	20 %	40 %	0 %	40 %	338209597
50	NC_015703	TTGAC	2	10	75046	75055	20 %	40 %	20 %	20 %	338209602
51	NC_015703	TAGCG	2	10	83859	83868	20 %	20 %	40 %	20 %	338209612
52	NC_015703	TTCGC	2	10	84531	84540	0 %	40 %	20 %	40 %	338209612
53	NC_015703	TCATT	2	10	87348	87357	20 %	60 %	0 %	20 %	338209614
54	NC_015703	TGAAA	2	10	88298	88307	60 %	20 %	20 %	0 %	338209614
55	NC_015703	GCCCA	2	10	88478	88487	20 %	0 %	20 %	60 %	338209615
56	NC_015703	ATCGA	2	10	91338	91347	40 %	20 %	20 %	20 %	338209617
57	NC_015703	GGTCA	2	10	91608	91617	20 %	20 %	40 %	20 %	338209617
58	NC_015703	AGATT	2	10	92262	92271	40 %	40 %	20 %	0 %	338209618
59	NC_015703	CAACC	2	10	95358	95367	40 %	0 %	0 %	60 %	338209620
60	NC_015703	CCAAA	2	10	95742	95751	60 %	0 %	0 %	40 %	338209620
61	NC_015703	AAAAC	2	10	95808	95817	80 %	0 %	0 %	20 %	338209620
62	NC_015703	TTTGC	2	10	97474	97483	0 %	60 %	20 %	20 %	338209620
63	NC_015703	GGGCA	2	10	98436	98445	20 %	0 %	60 %	20 %	338209622
64	NC_015703	CTTTA	2	10	102233	102242	20 %	60 %	0 %	20 %	338209625
65	NC_015703	CGGTA	2	10	102805	102814	20 %	20 %	40 %	20 %	338209626
66	NC_015703	CGGCT	2	10	102898	102907	0 %	20 %	40 %	40 %	338209626
67	NC_015703	TCAAC	2	10	103147	103156	40 %	20 %	0 %	40 %	338209626
68	NC_015703	AGAGC	2	10	104771	104780	40 %	0 %	40 %	20 %	338209627
69	NC_015703	CAGCA	2	10	105443	105452	40 %	0 %	20 %	40 %	338209628
70	NC_015703	TCTCC	2	10	107759	107768	0 %	40 %	0 %	60 %	338209628
71	NC_015703	AAAGC	2	10	109793	109802	60 %	0 %	20 %	20 %	338209631
72	NC_015703	TCTTT	2	10	113662	113671	0 %	80 %	0 %	20 %	338209633
73	NC_015703	GCTGG	2	10	115082	115091	0 %	20 %	60 %	20 %	338209634
74	NC_015703	CTTAC	2	10	115095	115104	20 %	40 %	0 %	40 %	338209634
75	NC_015703	TACGG	2	10	115441	115450	20 %	20 %	40 %	20 %	338209634
76	NC_015703	TGTTC	2	10	115856	115865	0 %	60 %	20 %	20 %	338209634
77	NC_015703	ACCAC	2	10	116134	116143	40 %	0 %	0 %	60 %	338209634
78	NC_015703	AATCG	2	10	118210	118219	40 %	20 %	20 %	20 %	338209636
79	NC_015703	GTTGT	2	10	121915	121924	0 %	60 %	40 %	0 %	338209637
80	NC_015703	TTGAG	2	10	124667	124676	20 %	40 %	40 %	0 %	338209639
81	NC_015703	GAAAA	2	10	125036	125045	80 %	0 %	20 %	0 %	338209639
82	NC_015703	CCCGG	2	10	126109	126118	0 %	0 %	40 %	60 %	338209639
83	NC_015703	TTGAA	2	10	129015	129024	40 %	40 %	20 %	0 %	338209640
84	NC_015703	AATAA	2	10	130392	130401	80 %	20 %	0 %	0 %	338209641
85	NC_015703	TCAAC	2	10	132314	132323	40 %	20 %	0 %	40 %	338209642
86	NC_015703	GCCGT	2	10	133174	133183	0 %	20 %	40 %	40 %	338209642
87	NC_015703	ATTCT	2	10	134340	134349	20 %	60 %	0 %	20 %	338209645
88	NC_015703	ACGGC	2	10	134590	134599	20 %	0 %	40 %	40 %	338209645
89	NC_015703	GTCTT	2	10	135786	135795	0 %	60 %	20 %	20 %	338209645
90	NC_015703	TTTTC	2	10	135895	135904	0 %	80 %	0 %	20 %	338209645
91	NC_015703	TTTTC	2	10	136224	136233	0 %	80 %	0 %	20 %	338209645
92	NC_015703	ATTAT	2	10	138447	138456	40 %	60 %	0 %	0 %	338209647
93	NC_015703	AAACC	2	10	141047	141056	60 %	0 %	0 %	40 %	338209649
94	NC_015703	CAAAT	2	10	143622	143631	60 %	20 %	0 %	20 %	338209649
95	NC_015703	CTTCA	2	10	144066	144075	20 %	40 %	0 %	40 %	338209650
96	NC_015703	TATGG	2	10	147080	147089	20 %	40 %	40 %	0 %	338209653
97	NC_015703	ATTTT	2	10	150215	150224	20 %	80 %	0 %	0 %	338209655
98	NC_015703	TAAAT	2	10	150470	150479	60 %	40 %	0 %	0 %	338209655
99	NC_015703	TCGAA	2	10	151393	151402	40 %	20 %	20 %	20 %	338209656
100	NC_015703	TGAAA	2	10	153807	153816	60 %	20 %	20 %	0 %	338209659
101	NC_015703	AAAGC	2	10	155003	155012	60 %	0 %	20 %	20 %	338209661
102	NC_015703	CGCTC	2	10	156716	156725	0 %	20 %	20 %	60 %	338209663
103	NC_015703	AAGGG	2	10	157295	157304	40 %	0 %	60 %	0 %	338209663
104	NC_015703	AATCA	2	10	157834	157843	60 %	20 %	0 %	20 %	338209663
105	NC_015703	CCGGG	2	10	157881	157890	0 %	0 %	60 %	40 %	338209663
106	NC_015703	CAATC	2	10	162697	162706	40 %	20 %	0 %	40 %	338209668
107	NC_015703	TTCCG	2	10	163461	163470	0 %	40 %	20 %	40 %	338209670
108	NC_015703	TGAAG	2	10	163950	163959	40 %	20 %	40 %	0 %	338209671
109	NC_015703	ATTGG	2	10	167267	167276	20 %	40 %	40 %	0 %	338209673
110	NC_015703	CACCC	2	10	167930	167939	20 %	0 %	0 %	80 %	338209673
111	NC_015703	CCTTT	2	10	169267	169276	0 %	60 %	0 %	40 %	338209673
112	NC_015703	TTTGG	2	10	172482	172491	0 %	60 %	40 %	0 %	338209676
113	NC_015703	TTCCA	2	10	173682	173691	20 %	40 %	0 %	40 %	338209678
114	NC_015703	TTTAT	2	10	173708	173717	20 %	80 %	0 %	0 %	338209678
115	NC_015703	AACCA	2	10	174971	174980	60 %	0 %	0 %	40 %	338209679
116	NC_015703	GGCAC	2	10	174995	175004	20 %	0 %	40 %	40 %	338209679
117	NC_015703	ACGCC	2	10	176379	176388	20 %	0 %	20 %	60 %	338209680
118	NC_015703	CCGGA	2	10	176982	176991	20 %	0 %	40 %	40 %	338209680
119	NC_015703	AGCTT	2	10	178095	178104	20 %	40 %	20 %	20 %	338209681
120	NC_015703	AACAA	2	10	178205	178214	80 %	0 %	0 %	20 %	338209682
121	NC_015703	TAGCA	2	10	178633	178642	40 %	20 %	20 %	20 %	338209683
122	NC_015703	AGCGG	2	10	179275	179284	20 %	0 %	60 %	20 %	338209684
123	NC_015703	AGCGA	2	10	181316	181325	40 %	0 %	40 %	20 %	338209687
124	NC_015703	ACGCC	2	10	184102	184111	20 %	0 %	20 %	60 %	338209691
125	NC_015703	GCGAC	2	10	186816	186825	20 %	0 %	40 %	40 %	338209694
126	NC_015703	TCTTT	2	10	189073	189082	0 %	80 %	0 %	20 %	338209696
127	NC_015703	TATGA	2	10	194505	194514	40 %	40 %	20 %	0 %	338209700
128	NC_015703	TGGCT	2	10	196795	196804	0 %	40 %	40 %	20 %	338209701
129	NC_015703	CTTGT	2	10	196907	196916	0 %	60 %	20 %	20 %	338209701
130	NC_015703	TGCCC	2	10	198484	198493	0 %	20 %	20 %	60 %	338209702
131	NC_015703	AGAAC	2	10	200433	200442	60 %	0 %	20 %	20 %	338209704
132	NC_015703	GAAAA	2	10	200449	200458	80 %	0 %	20 %	0 %	338209704
133	NC_015703	GAAAT	2	10	200770	200779	60 %	20 %	20 %	0 %	338209704
134	NC_015703	CAGTC	2	10	201557	201566	20 %	20 %	20 %	40 %	338209705
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392	NC_015703	CGGAC	2	10	717512	717521	20 %	0 %	40 %	40 %	338210131
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