MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL03

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015694	TA	3	6	1902	1907	50 %	50 %	0 %	0 %	338209459
2	NC_015694	GT	3	6	3266	3271	0 %	50 %	50 %	0 %	338209461
3	NC_015694	TA	3	6	6848	6853	50 %	50 %	0 %	0 %	338209467
4	NC_015694	TA	3	6	7041	7046	50 %	50 %	0 %	0 %	338209467
5	NC_015694	TA	3	6	7736	7741	50 %	50 %	0 %	0 %	338209468
6	NC_015694	TA	3	6	8355	8360	50 %	50 %	0 %	0 %	338209469
7	NC_015694	TA	3	6	11325	11330	50 %	50 %	0 %	0 %	338209473
8	NC_015694	AT	3	6	11345	11350	50 %	50 %	0 %	0 %	338209473
9	NC_015694	TA	3	6	11997	12002	50 %	50 %	0 %	0 %	338209473
10	NC_015694	CG	3	6	12285	12290	0 %	0 %	50 %	50 %	338209473
11	NC_015694	AT	3	6	13772	13777	50 %	50 %	0 %	0 %	338209474
12	NC_015694	AT	3	6	14182	14187	50 %	50 %	0 %	0 %	338209474
13	NC_015694	AT	3	6	15101	15106	50 %	50 %	0 %	0 %	338209476
14	NC_015694	AT	3	6	15497	15502	50 %	50 %	0 %	0 %	338209477
15	NC_015694	GC	3	6	17511	17516	0 %	0 %	50 %	50 %	338209479
16	NC_015694	AT	3	6	17957	17962	50 %	50 %	0 %	0 %	338209479
17	NC_015694	CG	3	6	19202	19207	0 %	0 %	50 %	50 %	338209480
18	NC_015694	AG	3	6	19648	19653	50 %	0 %	50 %	0 %	338209480
19	NC_015694	TA	3	6	20089	20094	50 %	50 %	0 %	0 %	338209481
20	NC_015694	TC	4	8	20543	20550	0 %	50 %	0 %	50 %	338209481
21	NC_015694	AG	3	6	21828	21833	50 %	0 %	50 %	0 %	338209485
22	NC_015694	AG	3	6	22237	22242	50 %	0 %	50 %	0 %	338209485
23	NC_015694	TC	3	6	24675	24680	0 %	50 %	0 %	50 %	338209488
24	NC_015694	TG	3	6	27062	27067	0 %	50 %	50 %	0 %	338209493
25	NC_015694	TC	3	6	27173	27178	0 %	50 %	0 %	50 %	338209493
26	NC_015694	GA	3	6	28355	28360	50 %	0 %	50 %	0 %	338209496
27	NC_015694	AC	3	6	29062	29067	50 %	0 %	0 %	50 %	338209496
28	NC_015694	GA	3	6	30226	30231	50 %	0 %	50 %	0 %	338209497
29	NC_015694	TA	3	6	30801	30806	50 %	50 %	0 %	0 %	338209498
30	NC_015694	TC	3	6	31034	31039	0 %	50 %	0 %	50 %	338209499
31	NC_015694	AC	3	6	31087	31092	50 %	0 %	0 %	50 %	338209499
32	NC_015694	CG	3	6	31249	31254	0 %	0 %	50 %	50 %	338209499
33	NC_015694	AG	3	6	31655	31660	50 %	0 %	50 %	0 %	338209500
34	NC_015694	TA	3	6	32034	32039	50 %	50 %	0 %	0 %	338209500
35	NC_015694	TA	4	8	32384	32391	50 %	50 %	0 %	0 %	338209501
36	NC_015694	AT	3	6	33834	33839	50 %	50 %	0 %	0 %	338209502
37	NC_015694	AT	3	6	34555	34560	50 %	50 %	0 %	0 %	338209502
38	NC_015694	AT	3	6	35307	35312	50 %	50 %	0 %	0 %	338209503
39	NC_015694	AT	3	6	35437	35442	50 %	50 %	0 %	0 %	338209503
40	NC_015694	AT	3	6	36423	36428	50 %	50 %	0 %	0 %	338209505
41	NC_015694	AT	3	6	36532	36537	50 %	50 %	0 %	0 %	338209505
42	NC_015694	TA	3	6	37972	37977	50 %	50 %	0 %	0 %	338209507
43	NC_015694	GA	3	6	38273	38278	50 %	0 %	50 %	0 %	338209507
44	NC_015694	TA	3	6	39082	39087	50 %	50 %	0 %	0 %	338209508
45	NC_015694	CA	3	6	39375	39380	50 %	0 %	0 %	50 %	338209508
46	NC_015694	GA	3	6	41181	41186	50 %	0 %	50 %	0 %	338209508
47	NC_015694	AT	3	6	42157	42162	50 %	50 %	0 %	0 %	338209508
48	NC_015694	TA	3	6	42232	42237	50 %	50 %	0 %	0 %	338209508
49	NC_015694	AT	3	6	42306	42311	50 %	50 %	0 %	0 %	338209508
50	NC_015694	TA	3	6	42481	42486	50 %	50 %	0 %	0 %	338209508
51	NC_015694	GA	3	6	43038	43043	50 %	0 %	50 %	0 %	338209508
52	NC_015694	CT	3	6	43535	43540	0 %	50 %	0 %	50 %	338209509
53	NC_015694	CA	5	10	44578	44587	50 %	0 %	0 %	50 %	338209510
54	NC_015694	TA	3	6	47827	47832	50 %	50 %	0 %	0 %	338209513
55	NC_015694	CT	3	6	48373	48378	0 %	50 %	0 %	50 %	338209515
56	NC_015694	AT	3	6	48499	48504	50 %	50 %	0 %	0 %	338209515
57	NC_015694	AT	3	6	48549	48554	50 %	50 %	0 %	0 %	338209515
58	NC_015694	TG	3	6	48561	48566	0 %	50 %	50 %	0 %	338209515
59	NC_015694	TA	3	6	49160	49165	50 %	50 %	0 %	0 %	338209515
60	NC_015694	AT	3	6	50160	50165	50 %	50 %	0 %	0 %	338209515
61	NC_015694	AT	3	6	50266	50271	50 %	50 %	0 %	0 %	338209515
62	NC_015694	AT	3	6	50812	50817	50 %	50 %	0 %	0 %	338209516
63	NC_015694	TG	3	6	51095	51100	0 %	50 %	50 %	0 %	338209516
64	NC_015694	TC	3	6	51236	51241	0 %	50 %	0 %	50 %	338209516
65	NC_015694	TC	3	6	51296	51301	0 %	50 %	0 %	50 %	338209516
66	NC_015694	AT	3	6	51666	51671	50 %	50 %	0 %	0 %	338209516
67	NC_015694	AT	3	6	51830	51835	50 %	50 %	0 %	0 %	338209517
68	NC_015694	AT	6	12	52862	52873	50 %	50 %	0 %	0 %	338209518
69	NC_015694	TC	3	6	53054	53059	0 %	50 %	0 %	50 %	338209519
70	NC_015694	TC	3	6	55396	55401	0 %	50 %	0 %	50 %	338209519
71	NC_015694	GT	3	6	55542	55547	0 %	50 %	50 %	0 %	338209519
72	NC_015694	TA	3	6	58291	58296	50 %	50 %	0 %	0 %	338209519
73	NC_015694	TG	3	6	59226	59231	0 %	50 %	50 %	0 %	338209519
74	NC_015694	AT	3	6	64558	64563	50 %	50 %	0 %	0 %	338209524
75	NC_015694	AG	3	6	64568	64573	50 %	0 %	50 %	0 %	338209524
76	NC_015694	AT	3	6	64633	64638	50 %	50 %	0 %	0 %	338209524
77	NC_015694	CT	3	6	66640	66645	0 %	50 %	0 %	50 %	338209526
78	NC_015694	TA	3	6	66745	66750	50 %	50 %	0 %	0 %	338209526

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.