MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL03

Total Repeats: 163

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015694	TGTA	2	8	1095	1102	25 %	50 %	25 %	0 %	338209458
2	NC_015694	ATCA	2	8	1460	1467	50 %	25 %	0 %	25 %	338209458
3	NC_015694	AAAT	2	8	1747	1754	75 %	25 %	0 %	0 %	338209459
4	NC_015694	TACT	2	8	1958	1965	25 %	50 %	0 %	25 %	338209459
5	NC_015694	CAAC	2	8	4284	4291	50 %	0 %	0 %	50 %	338209463
6	NC_015694	GATA	2	8	4724	4731	50 %	25 %	25 %	0 %	338209464
7	NC_015694	TGAC	2	8	4801	4808	25 %	25 %	25 %	25 %	338209464
8	NC_015694	GCGG	2	8	4973	4980	0 %	0 %	75 %	25 %	338209464
9	NC_015694	CGGA	2	8	5133	5140	25 %	0 %	50 %	25 %	338209464
10	NC_015694	TCAA	2	8	6047	6054	50 %	25 %	0 %	25 %	338209465
11	NC_015694	TGTT	2	8	6749	6756	0 %	75 %	25 %	0 %	338209467
12	NC_015694	AAAT	2	8	6840	6847	75 %	25 %	0 %	0 %	338209467
13	NC_015694	GGCA	2	8	7145	7152	25 %	0 %	50 %	25 %	338209467
14	NC_015694	TACT	2	8	7399	7406	25 %	50 %	0 %	25 %	338209468
15	NC_015694	TGAG	2	8	7754	7761	25 %	25 %	50 %	0 %	338209468
16	NC_015694	ATGA	2	8	8448	8455	50 %	25 %	25 %	0 %	338209469
17	NC_015694	TTTC	2	8	8460	8467	0 %	75 %	0 %	25 %	338209469
18	NC_015694	TGAA	2	8	9155	9162	50 %	25 %	25 %	0 %	338209470
19	NC_015694	GGAT	2	8	9607	9614	25 %	25 %	50 %	0 %	338209472
20	NC_015694	ATTT	2	8	11279	11286	25 %	75 %	0 %	0 %	338209473
21	NC_015694	AACC	2	8	11470	11477	50 %	0 %	0 %	50 %	338209473
22	NC_015694	GTTG	2	8	12102	12109	0 %	50 %	50 %	0 %	338209473
23	NC_015694	TTTC	2	8	13440	13447	0 %	75 %	0 %	25 %	338209474
24	NC_015694	TATC	2	8	13701	13708	25 %	50 %	0 %	25 %	338209474
25	NC_015694	AGAC	2	8	13798	13805	50 %	0 %	25 %	25 %	338209474
26	NC_015694	CTGA	2	8	14354	14361	25 %	25 %	25 %	25 %	338209474
27	NC_015694	CAGG	2	8	14628	14635	25 %	0 %	50 %	25 %	338209475
28	NC_015694	GGCT	2	8	14857	14864	0 %	25 %	50 %	25 %	338209475
29	NC_015694	TGTT	2	8	14872	14879	0 %	75 %	25 %	0 %	338209475
30	NC_015694	CAGT	2	8	15468	15475	25 %	25 %	25 %	25 %	338209477
31	NC_015694	GACA	2	8	15559	15566	50 %	0 %	25 %	25 %	338209477
32	NC_015694	GTGG	2	8	15688	15695	0 %	25 %	75 %	0 %	338209477
33	NC_015694	GGCA	2	8	15836	15843	25 %	0 %	50 %	25 %	338209478
34	NC_015694	CTTA	2	8	15942	15949	25 %	50 %	0 %	25 %	338209478
35	NC_015694	CCTG	2	8	16212	16219	0 %	25 %	25 %	50 %	338209479
36	NC_015694	CAAA	2	8	16342	16349	75 %	0 %	0 %	25 %	338209479
37	NC_015694	ACCG	2	8	16790	16797	25 %	0 %	25 %	50 %	338209479
38	NC_015694	GCAG	2	8	17014	17021	25 %	0 %	50 %	25 %	338209479
39	NC_015694	ACCG	2	8	17297	17304	25 %	0 %	25 %	50 %	338209479
40	NC_015694	AAGG	2	8	17666	17673	50 %	0 %	50 %	0 %	338209479
41	NC_015694	GCTT	2	8	18633	18640	0 %	50 %	25 %	25 %	338209480
42	NC_015694	GCTT	2	8	20519	20526	0 %	50 %	25 %	25 %	338209481
43	NC_015694	TACA	2	8	20559	20566	50 %	25 %	0 %	25 %	338209481
44	NC_015694	GTAT	2	8	21003	21010	25 %	50 %	25 %	0 %	338209483
45	NC_015694	ACGA	2	8	21039	21046	50 %	0 %	25 %	25 %	338209483
46	NC_015694	CCGG	2	8	21119	21126	0 %	0 %	50 %	50 %	338209483
47	NC_015694	ATCA	2	8	22243	22250	50 %	25 %	0 %	25 %	338209485
48	NC_015694	CCTG	2	8	22320	22327	0 %	25 %	25 %	50 %	338209485
49	NC_015694	AGGC	2	8	22439	22446	25 %	0 %	50 %	25 %	338209485
50	NC_015694	TATT	2	8	22670	22677	25 %	75 %	0 %	0 %	338209485
51	NC_015694	CTAT	2	8	22706	22713	25 %	50 %	0 %	25 %	338209485
52	NC_015694	ATGG	2	8	22738	22745	25 %	25 %	50 %	0 %	338209485
53	NC_015694	CCTA	2	8	23026	23033	25 %	25 %	0 %	50 %	338209485
54	NC_015694	TTCC	2	8	23226	23233	0 %	50 %	0 %	50 %	338209486
55	NC_015694	GATT	2	8	23692	23699	25 %	50 %	25 %	0 %	338209486
56	NC_015694	TTTC	2	8	23711	23718	0 %	75 %	0 %	25 %	338209486
57	NC_015694	TGTT	2	8	23820	23827	0 %	75 %	25 %	0 %	338209486
58	NC_015694	GTCA	2	8	24223	24230	25 %	25 %	25 %	25 %	338209487
59	NC_015694	AGGA	2	8	24999	25006	50 %	0 %	50 %	0 %	338209490
60	NC_015694	TAAA	2	8	25522	25529	75 %	25 %	0 %	0 %	338209490
61	NC_015694	GCAG	2	8	25787	25794	25 %	0 %	50 %	25 %	338209491
62	NC_015694	TCAG	2	8	25986	25993	25 %	25 %	25 %	25 %	338209491
63	NC_015694	CATA	2	8	26613	26620	50 %	25 %	0 %	25 %	338209492
64	NC_015694	ATGC	2	8	27273	27280	25 %	25 %	25 %	25 %	338209493
65	NC_015694	TAAA	2	8	28249	28256	75 %	25 %	0 %	0 %	338209496
66	NC_015694	TTTC	2	8	29696	29703	0 %	75 %	0 %	25 %	338209497
67	NC_015694	TTTC	2	8	29762	29769	0 %	75 %	0 %	25 %	338209497
68	NC_015694	AGGA	2	8	29856	29863	50 %	0 %	50 %	0 %	338209497
69	NC_015694	TGTA	2	8	30165	30172	25 %	50 %	25 %	0 %	338209497
70	NC_015694	CAGT	2	8	30625	30632	25 %	25 %	25 %	25 %	338209497
71	NC_015694	AATA	2	8	30816	30823	75 %	25 %	0 %	0 %	338209498
72	NC_015694	AGGC	2	8	31992	31999	25 %	0 %	50 %	25 %	338209500
73	NC_015694	AAGC	2	8	32315	32322	50 %	0 %	25 %	25 %	338209501
74	NC_015694	ATTA	2	8	33693	33700	50 %	50 %	0 %	0 %	338209502
75	NC_015694	ACCC	2	8	33940	33947	25 %	0 %	0 %	75 %	338209502
76	NC_015694	AGGT	2	8	33989	33996	25 %	25 %	50 %	0 %	338209502
77	NC_015694	TAAA	2	8	34124	34131	75 %	25 %	0 %	0 %	338209502
78	NC_015694	TATC	2	8	34584	34591	25 %	50 %	0 %	25 %	338209502
79	NC_015694	AATT	2	8	34667	34674	50 %	50 %	0 %	0 %	338209502
80	NC_015694	GAAA	2	8	34685	34692	75 %	0 %	25 %	0 %	338209502
81	NC_015694	AATC	2	8	35364	35371	50 %	25 %	0 %	25 %	338209503
82	NC_015694	TATT	2	8	35514	35521	25 %	75 %	0 %	0 %	338209504
83	NC_015694	CGAA	2	8	36329	36336	50 %	0 %	25 %	25 %	338209505
84	NC_015694	ACAG	2	8	36360	36367	50 %	0 %	25 %	25 %	338209505
85	NC_015694	TGGA	2	8	37363	37370	25 %	25 %	50 %	0 %	338209506
86	NC_015694	TGAT	2	8	40208	40215	25 %	50 %	25 %	0 %	338209508
87	NC_015694	TCAT	2	8	40289	40296	25 %	50 %	0 %	25 %	338209508
88	NC_015694	TCGA	2	8	40355	40362	25 %	25 %	25 %	25 %	338209508
89	NC_015694	ATTA	2	8	40593	40600	50 %	50 %	0 %	0 %	338209508
90	NC_015694	AGTT	2	8	40625	40632	25 %	50 %	25 %	0 %	338209508
91	NC_015694	AAAG	2	8	41004	41011	75 %	0 %	25 %	0 %	338209508
92	NC_015694	TTAT	2	8	41021	41028	25 %	75 %	0 %	0 %	338209508
93	NC_015694	TGGT	2	8	41075	41082	0 %	50 %	50 %	0 %	338209508
94	NC_015694	GAAT	2	8	41282	41289	50 %	25 %	25 %	0 %	338209508
95	NC_015694	TAGA	2	8	41318	41325	50 %	25 %	25 %	0 %	338209508
96	NC_015694	TCAT	2	8	41441	41448	25 %	50 %	0 %	25 %	338209508
97	NC_015694	GAAA	2	8	41490	41497	75 %	0 %	25 %	0 %	338209508
98	NC_015694	AATC	2	8	41705	41712	50 %	25 %	0 %	25 %	338209508
99	NC_015694	GTTT	2	8	42126	42133	0 %	75 %	25 %	0 %	338209508
100	NC_015694	TGAT	2	8	42224	42231	25 %	50 %	25 %	0 %	338209508
101	NC_015694	ACTT	2	8	42455	42462	25 %	50 %	0 %	25 %	338209508
102	NC_015694	CAGC	2	8	43547	43554	25 %	0 %	25 %	50 %	338209509
103	NC_015694	CCTG	2	8	43794	43801	0 %	25 %	25 %	50 %	338209509
104	NC_015694	CAGT	2	8	44535	44542	25 %	25 %	25 %	25 %	338209510
105	NC_015694	CATT	2	8	44789	44796	25 %	50 %	0 %	25 %	338209511
106	NC_015694	TTGC	2	8	45574	45581	0 %	50 %	25 %	25 %	338209511
107	NC_015694	CCAG	2	8	45751	45758	25 %	0 %	25 %	50 %	338209511
108	NC_015694	GATA	2	8	47514	47521	50 %	25 %	25 %	0 %	338209513
109	NC_015694	ATTT	2	8	47641	47648	25 %	75 %	0 %	0 %	338209513
110	NC_015694	TTTA	2	8	47671	47678	25 %	75 %	0 %	0 %	338209513
111	NC_015694	CAAT	2	8	48215	48222	50 %	25 %	0 %	25 %	338209514
112	NC_015694	CTTT	2	8	48541	48548	0 %	75 %	0 %	25 %	338209515
113	NC_015694	TCTT	2	8	48938	48945	0 %	75 %	0 %	25 %	338209515
114	NC_015694	CAGC	2	8	49273	49280	25 %	0 %	25 %	50 %	338209515
115	NC_015694	TAAA	2	8	49585	49592	75 %	25 %	0 %	0 %	338209515
116	NC_015694	GTTG	2	8	50034	50041	0 %	50 %	50 %	0 %	338209515
117	NC_015694	ATAA	2	8	50114	50121	75 %	25 %	0 %	0 %	338209515
118	NC_015694	CAAA	2	8	50366	50373	75 %	0 %	0 %	25 %	338209515
119	NC_015694	GTTT	2	8	50651	50658	0 %	75 %	25 %	0 %	338209515
120	NC_015694	TTCC	2	8	51469	51476	0 %	50 %	0 %	50 %	338209516
121	NC_015694	TCTT	2	8	52564	52571	0 %	75 %	0 %	25 %	338209518
122	NC_015694	TTTA	2	8	52910	52917	25 %	75 %	0 %	0 %	338209519
123	NC_015694	CTTT	2	8	53041	53048	0 %	75 %	0 %	25 %	338209519
124	NC_015694	TTAA	2	8	53385	53392	50 %	50 %	0 %	0 %	338209519
125	NC_015694	ATAG	2	8	53954	53961	50 %	25 %	25 %	0 %	338209519
126	NC_015694	GTTT	2	8	54474	54481	0 %	75 %	25 %	0 %	338209519
127	NC_015694	ATTG	2	8	55117	55124	25 %	50 %	25 %	0 %	338209519
128	NC_015694	TCGT	2	8	55787	55794	0 %	50 %	25 %	25 %	338209519
129	NC_015694	CTGC	2	8	55884	55891	0 %	25 %	25 %	50 %	338209519
130	NC_015694	ATCC	2	8	56188	56195	25 %	25 %	0 %	50 %	338209519
131	NC_015694	CTGC	2	8	56244	56251	0 %	25 %	25 %	50 %	338209519
132	NC_015694	GGGT	2	8	56527	56534	0 %	25 %	75 %	0 %	338209519
133	NC_015694	TGAC	2	8	56619	56626	25 %	25 %	25 %	25 %	338209519
134	NC_015694	GTTG	2	8	56983	56990	0 %	50 %	50 %	0 %	338209519
135	NC_015694	CCTG	2	8	57246	57253	0 %	25 %	25 %	50 %	338209519
136	NC_015694	AGGC	2	8	58058	58065	25 %	0 %	50 %	25 %	338209519
137	NC_015694	GCAG	2	8	58099	58106	25 %	0 %	50 %	25 %	338209519
138	NC_015694	TAAA	2	8	58364	58371	75 %	25 %	0 %	0 %	338209519
139	NC_015694	GCTC	2	8	59195	59202	0 %	25 %	25 %	50 %	338209519
140	NC_015694	CCTG	2	8	59220	59227	0 %	25 %	25 %	50 %	338209519
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147	NC_015694	CTTA	2	8	60415	60422	25 %	50 %	0 %	25 %	338209520
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162	NC_015694	TTCC	2	8	66254	66261	0 %	50 %	0 %	50 %	338209526
163	NC_015694	GATA	2	8	66461	66468	50 %	25 %	25 %	0 %	338209526

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.