MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL03

Total Repeats: 1128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015694	GCC	2	6	59103	59108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209519
1002	NC_015694	GCTC	2	8	59195	59202	0 %	25 %	25 %	50 %	338209519
1003	NC_015694	CCTG	2	8	59220	59227	0 %	25 %	25 %	50 %	338209519
1004	NC_015694	TG	3	6	59226	59231	0 %	50 %	50 %	0 %	338209519
1005	NC_015694	GCAG	2	8	59239	59246	25 %	0 %	50 %	25 %	338209519
1006	NC_015694	TGA	2	6	59293	59298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209519
1007	NC_015694	ACA	3	9	59377	59385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209519
1008	NC_015694	A	8	8	59390	59397	100 %	0 %	0 %	0 %	338209519
1009	NC_015694	CGG	2	6	59448	59453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209520
1010	NC_015694	GTT	2	6	59500	59505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209520
1011	NC_015694	ATT	2	6	59560	59565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209520
1012	NC_015694	CGT	3	9	59581	59589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209520
1013	NC_015694	CAGCG	2	10	59626	59635	20 %	0 %	40 %	40 %	338209520
1014	NC_015694	CAGGGT	2	12	59644	59655	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338209520
1015	NC_015694	TGG	2	6	59678	59683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209520
1016	NC_015694	GGT	2	6	59752	59757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209520
1017	NC_015694	GCC	2	6	59782	59787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209520
1018	NC_015694	TGA	2	6	59837	59842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209520
1019	NC_015694	TGAT	2	8	59957	59964	25 %	50 %	25 %	0 %	338209520
1020	NC_015694	GCC	2	6	59992	59997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209520
1021	NC_015694	GCT	2	6	59998	60003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209520
1022	NC_015694	CCG	2	6	60011	60016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209520
1023	NC_015694	GCTCCT	2	12	60026	60037	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	338209520
1024	NC_015694	TGC	2	6	60081	60086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209520
1025	NC_015694	CCGC	2	8	60105	60112	0 %	0 %	25 %	75 %	338209520
1026	NC_015694	CAA	2	6	60193	60198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209520
1027	NC_015694	CCAG	2	8	60228	60235	25 %	0 %	25 %	50 %	338209520
1028	NC_015694	ATTG	2	8	60241	60248	25 %	50 %	25 %	0 %	338209520
1029	NC_015694	GCT	2	6	60253	60258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209520
1030	NC_015694	TGG	2	6	60282	60287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209520
1031	NC_015694	CAA	2	6	60297	60302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209520
1032	NC_015694	GCTT	2	8	60319	60326	0 %	50 %	25 %	25 %	338209520
1033	NC_015694	GAC	2	6	60382	60387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209520
1034	NC_015694	GGC	2	6	60409	60414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209520
1035	NC_015694	CTTA	2	8	60415	60422	25 %	50 %	0 %	25 %	338209520
1036	NC_015694	GGT	2	6	60481	60486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209520
1037	NC_015694	CGG	2	6	60528	60533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209520
1038	NC_015694	TTG	2	6	60569	60574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209520
1039	NC_015694	GTG	2	6	60599	60604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209520
1040	NC_015694	CTC	2	6	60642	60647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209520
1041	NC_015694	C	6	6	60769	60774	0 %	0 %	0 %	100 %	338209520
1042	NC_015694	GAT	2	6	60966	60971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209520
1043	NC_015694	TGC	2	6	61086	61091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209520
1044	NC_015694	ACCG	2	8	61132	61139	25 %	0 %	25 %	50 %	338209520
1045	NC_015694	CAA	2	6	61157	61162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209520
1046	NC_015694	A	6	6	61161	61166	100 %	0 %	0 %	0 %	338209520
1047	NC_015694	GTT	2	6	61269	61274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209521
1048	NC_015694	CCG	2	6	61295	61300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209521
1049	NC_015694	GGT	2	6	61348	61353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209521
1050	NC_015694	TTC	2	6	61357	61362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209521
1051	NC_015694	T	7	7	61406	61412	0 %	100 %	0 %	0 %	338209521
1052	NC_015694	CTG	2	6	61489	61494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209521
1053	NC_015694	TCC	2	6	61585	61590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209521
1054	NC_015694	CTGCC	2	10	61667	61676	0 %	20 %	20 %	60 %	338209521
1055	NC_015694	T	6	6	61759	61764	0 %	100 %	0 %	0 %	338209521
1056	NC_015694	CGGA	2	8	61787	61794	25 %	0 %	50 %	25 %	338209521
1057	NC_015694	T	6	6	61805	61810	0 %	100 %	0 %	0 %	338209521
1058	NC_015694	GATCA	2	10	61867	61876	40 %	20 %	20 %	20 %	338209521
1059	NC_015694	CGG	2	6	61893	61898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209521
1060	NC_015694	GGTA	2	8	62122	62129	25 %	25 %	50 %	0 %	338209521
1061	NC_015694	CGG	2	6	62154	62159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209521
1062	NC_015694	T	7	7	62161	62167	0 %	100 %	0 %	0 %	338209521
1063	NC_015694	GACG	2	8	62203	62210	25 %	0 %	50 %	25 %	338209521
1064	NC_015694	CTG	2	6	62226	62231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209521
1065	NC_015694	CAG	2	6	62251	62256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209521
1066	NC_015694	TGTCC	2	10	62265	62274	0 %	40 %	20 %	40 %	338209521
1067	NC_015694	A	7	7	62281	62287	100 %	0 %	0 %	0 %	338209521
1068	NC_015694	CAGAA	2	10	62303	62312	60 %	0 %	20 %	20 %	338209521
1069	NC_015694	AAG	2	6	62315	62320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209521
1070	NC_015694	TAT	2	6	63163	63168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209522
1071	NC_015694	CTG	2	6	63274	63279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209522
1072	NC_015694	TCC	2	6	63290	63295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209522
1073	NC_015694	AGA	2	6	63298	63303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209522
1074	NC_015694	CAC	2	6	63356	63361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209522
1075	NC_015694	A	7	7	63363	63369	100 %	0 %	0 %	0 %	338209522
1076	NC_015694	CTT	2	6	63444	63449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209522
1077	NC_015694	CCG	2	6	63541	63546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209522
1078	NC_015694	TTAA	2	8	63580	63587	50 %	50 %	0 %	0 %	338209522
1079	NC_015694	TAAT	2	8	63618	63625	50 %	50 %	0 %	0 %	338209523
1080	NC_015694	CTGT	2	8	63648	63655	0 %	50 %	25 %	25 %	338209523
1081	NC_015694	TTA	2	6	63717	63722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209523
1082	NC_015694	TGA	3	9	63748	63756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209523
1083	NC_015694	TTA	2	6	63761	63766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209523
1084	NC_015694	GAACC	2	10	63770	63779	40 %	0 %	20 %	40 %	338209523
1085	NC_015694	T	7	7	63787	63793	0 %	100 %	0 %	0 %	338209523
1086	NC_015694	GAA	2	6	63830	63835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209523
1087	NC_015694	TTTC	2	8	63858	63865	0 %	75 %	0 %	25 %	338209523
1088	NC_015694	TTTA	2	8	63883	63890	25 %	75 %	0 %	0 %	338209523
1089	NC_015694	CAA	2	6	63924	63929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209523
1090	NC_015694	ATTA	2	8	64129	64136	50 %	50 %	0 %	0 %	338209524
1091	NC_015694	A	6	6	64150	64155	100 %	0 %	0 %	0 %	338209524
1092	NC_015694	CAT	2	6	64195	64200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209524
1093	NC_015694	ACC	2	6	64222	64227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209524
1094	NC_015694	A	6	6	64232	64237	100 %	0 %	0 %	0 %	338209524
1095	NC_015694	ACC	2	6	64268	64273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209524
1096	NC_015694	CCGT	2	8	64279	64286	0 %	25 %	25 %	50 %	338209524
1097	NC_015694	AAG	2	6	64406	64411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209524
1098	NC_015694	ACAG	2	8	64469	64476	50 %	0 %	25 %	25 %	338209524
1099	NC_015694	CTT	2	6	64498	64503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209524
1100	NC_015694	GGA	2	6	64531	64536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209524
1101	NC_015694	AT	3	6	64558	64563	50 %	50 %	0 %	0 %	338209524
1102	NC_015694	AG	3	6	64568	64573	50 %	0 %	50 %	0 %	338209524
1103	NC_015694	A	6	6	64586	64591	100 %	0 %	0 %	0 %	338209524
1104	NC_015694	AT	3	6	64633	64638	50 %	50 %	0 %	0 %	338209524
1105	NC_015694	A	6	6	64727	64732	100 %	0 %	0 %	0 %	338209524
1106	NC_015694	TAC	2	6	64742	64747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209524
1107	NC_015694	AGG	2	6	64851	64856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209524
1108	NC_015694	CCG	2	6	64932	64937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209524
1109	NC_015694	GGTT	2	8	64949	64956	0 %	50 %	50 %	0 %	338209524
1110	NC_015694	GAT	2	6	64970	64975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209524
1111	NC_015694	GCA	2	6	64998	65003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209524
1112	NC_015694	GCC	2	6	65006	65011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209524
1113	NC_015694	T	6	6	65678	65683	0 %	100 %	0 %	0 %	338209525
1114	NC_015694	TCA	2	6	65706	65711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209525
1115	NC_015694	TGA	2	6	65797	65802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209525
1116	NC_015694	CTTT	2	8	65820	65827	0 %	75 %	0 %	25 %	338209525
1117	NC_015694	C	6	6	65997	66002	0 %	0 %	0 %	100 %	338209526
1118	NC_015694	T	6	6	66246	66251	0 %	100 %	0 %	0 %	338209526
1119	NC_015694	TTCC	2	8	66254	66261	0 %	50 %	0 %	50 %	338209526
1120	NC_015694	GATA	2	8	66461	66468	50 %	25 %	25 %	0 %	338209526
1121	NC_015694	T	6	6	66529	66534	0 %	100 %	0 %	0 %	338209526
1122	NC_015694	ATT	2	6	66571	66576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209526
1123	NC_015694	CT	3	6	66640	66645	0 %	50 %	0 %	50 %	338209526
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1125	NC_015694	CCT	2	6	66686	66691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209526
1126	NC_015694	ACTGCC	2	12	66704	66715	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	338209526
1127	NC_015694	TA	3	6	66745	66750	50 %	50 %	0 %	0 %	338209526
1128	NC_015694	TAT	2	6	66854	66859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209526

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