MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL01

Total Repeats: 256

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015693	TTTC	2	8	212	219	0 %	75 %	0 %	25 %	338209373
2	NC_015693	AAAT	2	8	603	610	75 %	25 %	0 %	0 %	338209373
3	NC_015693	CGGC	2	8	1445	1452	0 %	0 %	50 %	50 %	338209373
4	NC_015693	ATTC	2	8	1506	1513	25 %	50 %	0 %	25 %	338209373
5	NC_015693	TAGG	2	8	2568	2575	25 %	25 %	50 %	0 %	338209373
6	NC_015693	CAAT	2	8	2579	2586	50 %	25 %	0 %	25 %	338209373
7	NC_015693	GGAA	2	8	3908	3915	50 %	0 %	50 %	0 %	338209374
8	NC_015693	CAAT	2	8	4148	4155	50 %	25 %	0 %	25 %	338209374
9	NC_015693	GACC	2	8	4249	4256	25 %	0 %	25 %	50 %	338209374
10	NC_015693	TGAA	2	8	6254	6261	50 %	25 %	25 %	0 %	338209375
11	NC_015693	ACGC	2	8	6696	6703	25 %	0 %	25 %	50 %	338209375
12	NC_015693	ATCA	2	8	6976	6983	50 %	25 %	0 %	25 %	338209375
13	NC_015693	GGGT	2	8	7321	7328	0 %	25 %	75 %	0 %	338209375
14	NC_015693	GAAA	2	8	7344	7351	75 %	0 %	25 %	0 %	338209375
15	NC_015693	ATTT	2	8	8378	8385	25 %	75 %	0 %	0 %	338209375
16	NC_015693	GGGT	2	8	8408	8415	0 %	25 %	75 %	0 %	338209375
17	NC_015693	CGGG	2	8	8669	8676	0 %	0 %	75 %	25 %	338209375
18	NC_015693	ACTA	2	8	9091	9098	50 %	25 %	0 %	25 %	338209376
19	NC_015693	CTGT	2	8	9391	9398	0 %	50 %	25 %	25 %	338209377
20	NC_015693	ATCA	2	8	9871	9878	50 %	25 %	0 %	25 %	338209377
21	NC_015693	TGAG	2	8	10214	10221	25 %	25 %	50 %	0 %	338209377
22	NC_015693	AGGT	2	8	10465	10472	25 %	25 %	50 %	0 %	338209377
23	NC_015693	CAAT	2	8	10493	10500	50 %	25 %	0 %	25 %	338209377
24	NC_015693	GACA	2	8	10576	10583	50 %	0 %	25 %	25 %	338209377
25	NC_015693	GCCT	2	8	11077	11084	0 %	25 %	25 %	50 %	338209379
26	NC_015693	TTCC	2	8	11731	11738	0 %	50 %	0 %	50 %	338209380
27	NC_015693	GTAC	2	8	11968	11975	25 %	25 %	25 %	25 %	338209380
28	NC_015693	GTAC	2	8	12006	12013	25 %	25 %	25 %	25 %	338209380
29	NC_015693	GAAT	2	8	12475	12482	50 %	25 %	25 %	0 %	338209380
30	NC_015693	TTCT	2	8	13178	13185	0 %	75 %	0 %	25 %	338209380
31	NC_015693	AAAC	2	8	13552	13559	75 %	0 %	0 %	25 %	338209381
32	NC_015693	GGTC	2	8	13955	13962	0 %	25 %	50 %	25 %	338209381
33	NC_015693	CTTC	2	8	14009	14016	0 %	50 %	0 %	50 %	338209381
34	NC_015693	GGTT	2	8	14152	14159	0 %	50 %	50 %	0 %	338209381
35	NC_015693	GGTC	2	8	15878	15885	0 %	25 %	50 %	25 %	338209384
36	NC_015693	ACGT	2	8	16008	16015	25 %	25 %	25 %	25 %	338209384
37	NC_015693	GGGC	2	8	16318	16325	0 %	0 %	75 %	25 %	338209385
38	NC_015693	ATCT	2	8	16326	16333	25 %	50 %	0 %	25 %	338209385
39	NC_015693	TTGG	2	8	16581	16588	0 %	50 %	50 %	0 %	338209385
40	NC_015693	TTGA	2	8	16592	16599	25 %	50 %	25 %	0 %	338209385
41	NC_015693	TTCA	2	8	16626	16633	25 %	50 %	0 %	25 %	338209385
42	NC_015693	GGTT	2	8	17080	17087	0 %	50 %	50 %	0 %	338209387
43	NC_015693	TTTG	2	8	17206	17213	0 %	75 %	25 %	0 %	338209387
44	NC_015693	GTTT	2	8	17902	17909	0 %	75 %	25 %	0 %	338209387
45	NC_015693	CGTG	2	8	18588	18595	0 %	25 %	50 %	25 %	338209388
46	NC_015693	ACTG	2	8	19346	19353	25 %	25 %	25 %	25 %	338209389
47	NC_015693	GGCT	2	8	20542	20549	0 %	25 %	50 %	25 %	338209390
48	NC_015693	GCTT	2	8	20943	20950	0 %	50 %	25 %	25 %	338209391
49	NC_015693	TTGG	2	8	20951	20958	0 %	50 %	50 %	0 %	338209391
50	NC_015693	GACT	2	8	20961	20968	25 %	25 %	25 %	25 %	338209391
51	NC_015693	CGCT	2	8	21145	21152	0 %	25 %	25 %	50 %	338209391
52	NC_015693	TCTT	2	8	21258	21265	0 %	75 %	0 %	25 %	338209391
53	NC_015693	TTCG	2	8	24073	24080	0 %	50 %	25 %	25 %	338209391
54	NC_015693	CGGT	2	8	24651	24658	0 %	25 %	50 %	25 %	338209391
55	NC_015693	ACAA	2	8	24696	24703	75 %	0 %	0 %	25 %	338209391
56	NC_015693	TTTC	2	8	25221	25228	0 %	75 %	0 %	25 %	338209393
57	NC_015693	TGCC	2	8	25429	25436	0 %	25 %	25 %	50 %	338209393
58	NC_015693	AACC	2	8	26031	26038	50 %	0 %	0 %	50 %	338209394
59	NC_015693	CTGC	2	8	26114	26121	0 %	25 %	25 %	50 %	338209394
60	NC_015693	AACC	2	8	26131	26138	50 %	0 %	0 %	50 %	338209394
61	NC_015693	GCGT	2	8	26450	26457	0 %	25 %	50 %	25 %	338209394
62	NC_015693	CACG	2	8	26792	26799	25 %	0 %	25 %	50 %	338209395
63	NC_015693	TCCA	2	8	27099	27106	25 %	25 %	0 %	50 %	338209395
64	NC_015693	TTGG	2	8	27336	27343	0 %	50 %	50 %	0 %	338209395
65	NC_015693	CGCC	2	8	27360	27367	0 %	0 %	25 %	75 %	338209395
66	NC_015693	AGCC	2	8	27702	27709	25 %	0 %	25 %	50 %	338209395
67	NC_015693	ACCT	2	8	27879	27886	25 %	25 %	0 %	50 %	338209395
68	NC_015693	GCCA	2	8	28151	28158	25 %	0 %	25 %	50 %	338209395
69	NC_015693	AGTC	2	8	29967	29974	25 %	25 %	25 %	25 %	338209396
70	NC_015693	AATA	2	8	30548	30555	75 %	25 %	0 %	0 %	338209396
71	NC_015693	ACGG	2	8	30801	30808	25 %	0 %	50 %	25 %	338209396
72	NC_015693	CTCG	2	8	31291	31298	0 %	25 %	25 %	50 %	338209397
73	NC_015693	AAGT	2	8	31424	31431	50 %	25 %	25 %	0 %	338209397
74	NC_015693	CATT	2	8	32114	32121	25 %	50 %	0 %	25 %	338209398
75	NC_015693	TTAA	2	8	32843	32850	50 %	50 %	0 %	0 %	338209399
76	NC_015693	TTTA	2	8	32869	32876	25 %	75 %	0 %	0 %	338209399
77	NC_015693	GTAC	2	8	32907	32914	25 %	25 %	25 %	25 %	338209399
78	NC_015693	TTGG	2	8	33251	33258	0 %	50 %	50 %	0 %	338209399
79	NC_015693	GAAA	2	8	33397	33404	75 %	0 %	25 %	0 %	338209399
80	NC_015693	CAAA	2	8	33502	33509	75 %	0 %	0 %	25 %	338209399
81	NC_015693	GACT	2	8	33550	33557	25 %	25 %	25 %	25 %	338209399
82	NC_015693	ACTG	2	8	33560	33567	25 %	25 %	25 %	25 %	338209399
83	NC_015693	CATG	2	8	34070	34077	25 %	25 %	25 %	25 %	338209400
84	NC_015693	AAAC	2	8	35256	35263	75 %	0 %	0 %	25 %	338209401
85	NC_015693	CACC	2	8	35416	35423	25 %	0 %	0 %	75 %	338209401
86	NC_015693	CTAC	2	8	35426	35433	25 %	25 %	0 %	50 %	338209401
87	NC_015693	CGCC	2	8	35693	35700	0 %	0 %	25 %	75 %	338209401
88	NC_015693	TCAT	2	8	36018	36025	25 %	50 %	0 %	25 %	338209402
89	NC_015693	TCGG	2	8	36253	36260	0 %	25 %	50 %	25 %	338209402
90	NC_015693	TTGA	2	8	36338	36345	25 %	50 %	25 %	0 %	338209402
91	NC_015693	CAAA	2	8	36676	36683	75 %	0 %	0 %	25 %	338209402
92	NC_015693	CATT	2	8	37323	37330	25 %	50 %	0 %	25 %	338209402
93	NC_015693	TTTA	2	8	37797	37804	25 %	75 %	0 %	0 %	338209403
94	NC_015693	AACC	2	8	38866	38873	50 %	0 %	0 %	50 %	338209404
95	NC_015693	ACTT	2	8	39002	39009	25 %	50 %	0 %	25 %	338209404
96	NC_015693	ATTT	2	8	39075	39082	25 %	75 %	0 %	0 %	338209404
97	NC_015693	GAGT	2	8	39185	39192	25 %	25 %	50 %	0 %	338209404
98	NC_015693	TTTA	2	8	39621	39628	25 %	75 %	0 %	0 %	338209405
99	NC_015693	TTTA	2	8	40386	40393	25 %	75 %	0 %	0 %	338209406
100	NC_015693	CCGC	2	8	40743	40750	0 %	0 %	25 %	75 %	338209406
101	NC_015693	AATC	2	8	40798	40805	50 %	25 %	0 %	25 %	338209406
102	NC_015693	TCGA	2	8	40850	40857	25 %	25 %	25 %	25 %	338209406
103	NC_015693	GCCT	2	8	41036	41043	0 %	25 %	25 %	50 %	338209406
104	NC_015693	TGCC	2	8	41321	41328	0 %	25 %	25 %	50 %	338209406
105	NC_015693	CGGG	2	8	42553	42560	0 %	0 %	75 %	25 %	338209408
106	NC_015693	TCCG	2	8	42696	42703	0 %	25 %	25 %	50 %	338209408
107	NC_015693	ACAT	2	8	43374	43381	50 %	25 %	0 %	25 %	338209409
108	NC_015693	CGGT	2	8	43927	43934	0 %	25 %	50 %	25 %	338209409
109	NC_015693	CAAT	2	8	44089	44096	50 %	25 %	0 %	25 %	338209409
110	NC_015693	CTCA	2	8	44171	44178	25 %	25 %	0 %	50 %	338209409
111	NC_015693	GCCA	2	8	44496	44503	25 %	0 %	25 %	50 %	338209409
112	NC_015693	TGCG	2	8	44536	44543	0 %	25 %	50 %	25 %	338209409
113	NC_015693	GCCA	2	8	44690	44697	25 %	0 %	25 %	50 %	338209410
114	NC_015693	ATCT	2	8	44815	44822	25 %	50 %	0 %	25 %	338209410
115	NC_015693	GGTC	2	8	45498	45505	0 %	25 %	50 %	25 %	338209410
116	NC_015693	CGTA	2	8	46284	46291	25 %	25 %	25 %	25 %	338209410
117	NC_015693	TGTT	2	8	46450	46457	0 %	75 %	25 %	0 %	338209410
118	NC_015693	CCCG	2	8	46647	46654	0 %	0 %	25 %	75 %	338209410
119	NC_015693	GAAC	2	8	47089	47096	50 %	0 %	25 %	25 %	338209410
120	NC_015693	CCTT	2	8	47418	47425	0 %	50 %	0 %	50 %	338209410
121	NC_015693	GATT	2	8	48350	48357	25 %	50 %	25 %	0 %	338209412
122	NC_015693	GTTG	2	8	48569	48576	0 %	50 %	50 %	0 %	338209412
123	NC_015693	ACGG	2	8	48870	48877	25 %	0 %	50 %	25 %	338209412
124	NC_015693	CATC	2	8	48893	48900	25 %	25 %	0 %	50 %	338209412
125	NC_015693	CCCA	2	8	49148	49155	25 %	0 %	0 %	75 %	338209412
126	NC_015693	CAAA	2	8	49341	49348	75 %	0 %	0 %	25 %	338209412
127	NC_015693	GAAT	2	8	49586	49593	50 %	25 %	25 %	0 %	338209412
128	NC_015693	TACG	2	8	49721	49728	25 %	25 %	25 %	25 %	338209412
129	NC_015693	CCAC	2	8	49752	49759	25 %	0 %	0 %	75 %	338209413
130	NC_015693	GCGG	2	8	50186	50193	0 %	0 %	75 %	25 %	338209413
131	NC_015693	GGCA	2	8	51339	51346	25 %	0 %	50 %	25 %	338209414
132	NC_015693	ATCA	2	8	51531	51538	50 %	25 %	0 %	25 %	338209414
133	NC_015693	ATCA	2	8	51768	51775	50 %	25 %	0 %	25 %	338209414
134	NC_015693	ATTT	3	12	52294	52305	25 %	75 %	0 %	0 %	338209414
135	NC_015693	CGTA	2	8	52599	52606	25 %	25 %	25 %	25 %	338209415
136	NC_015693	ATTC	2	8	52788	52795	25 %	50 %	0 %	25 %	338209415
137	NC_015693	GAAA	2	8	52910	52917	75 %	0 %	25 %	0 %	338209415
138	NC_015693	GGTT	2	8	53744	53751	0 %	50 %	50 %	0 %	338209416
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.