MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL01

Total Repeats: 1762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015693	TGG	3	9	56298	56306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209417
1002	NC_015693	GTC	2	6	56323	56328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209417
1003	NC_015693	ACC	2	6	56341	56346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209417
1004	NC_015693	TCG	2	6	56423	56428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209417
1005	NC_015693	CAT	2	6	56511	56516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209417
1006	NC_015693	GCC	2	6	56552	56557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209417
1007	NC_015693	GCC	2	6	56569	56574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209417
1008	NC_015693	CCG	2	6	56585	56590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209417
1009	NC_015693	GAC	2	6	56598	56603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209417
1010	NC_015693	AAGA	2	8	56634	56641	75 %	0 %	25 %	0 %	338209417
1011	NC_015693	T	6	6	56647	56652	0 %	100 %	0 %	0 %	338209417
1012	NC_015693	AGT	2	6	56662	56667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209417
1013	NC_015693	GAT	3	9	56707	56715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209417
1014	NC_015693	CTG	2	6	56719	56724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209417
1015	NC_015693	T	6	6	56757	56762	0 %	100 %	0 %	0 %	338209417
1016	NC_015693	TCA	2	6	56934	56939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209417
1017	NC_015693	T	6	6	56947	56952	0 %	100 %	0 %	0 %	338209417
1018	NC_015693	GTG	2	6	57020	57025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209417
1019	NC_015693	TAC	2	6	57031	57036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209417
1020	NC_015693	C	6	6	57045	57050	0 %	0 %	0 %	100 %	338209417
1021	NC_015693	GTT	2	6	57112	57117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209417
1022	NC_015693	TGC	2	6	57132	57137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209417
1023	NC_015693	TGC	2	6	57177	57182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209417
1024	NC_015693	GCCCG	2	10	57266	57275	0 %	0 %	40 %	60 %	338209417
1025	NC_015693	TTG	2	6	57293	57298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209417
1026	NC_015693	T	7	7	57357	57363	0 %	100 %	0 %	0 %	338209417
1027	NC_015693	ACC	2	6	57380	57385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209417
1028	NC_015693	ACT	2	6	57386	57391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209417
1029	NC_015693	A	6	6	57483	57488	100 %	0 %	0 %	0 %	338209417
1030	NC_015693	CATT	2	8	57552	57559	25 %	50 %	0 %	25 %	338209417
1031	NC_015693	TACT	2	8	57573	57580	25 %	50 %	0 %	25 %	338209417
1032	NC_015693	GCTTT	2	10	58015	58024	0 %	60 %	20 %	20 %	338209418
1033	NC_015693	CTT	2	6	58088	58093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209418
1034	NC_015693	AGC	2	6	58108	58113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209418
1035	NC_015693	CAG	2	6	58215	58220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209418
1036	NC_015693	GGA	2	6	58257	58262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209418
1037	NC_015693	T	6	6	58313	58318	0 %	100 %	0 %	0 %	338209418
1038	NC_015693	GGC	2	6	58386	58391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209418
1039	NC_015693	TTG	2	6	58420	58425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209418
1040	NC_015693	T	6	6	58461	58466	0 %	100 %	0 %	0 %	338209418
1041	NC_015693	ATG	2	6	58510	58515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209418
1042	NC_015693	GGTT	2	8	58569	58576	0 %	50 %	50 %	0 %	338209418
1043	NC_015693	TAT	2	6	58593	58598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209418
1044	NC_015693	CAA	2	6	58776	58781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209419
1045	NC_015693	GTT	2	6	58799	58804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209419
1046	NC_015693	GACC	2	8	58838	58845	25 %	0 %	25 %	50 %	338209419
1047	NC_015693	GCA	2	6	58861	58866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209419
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1049	NC_015693	GAT	2	6	58936	58941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209420
1050	NC_015693	CAT	2	6	59030	59035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209420
1051	NC_015693	AT	3	6	59034	59039	50 %	50 %	0 %	0 %	338209420
1052	NC_015693	GTT	2	6	59055	59060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209420
1053	NC_015693	GCTT	2	8	59168	59175	0 %	50 %	25 %	25 %	338209420
1054	NC_015693	CTCAC	2	10	59194	59203	20 %	20 %	0 %	60 %	338209420
1055	NC_015693	GTCT	2	8	59317	59324	0 %	50 %	25 %	25 %	338209420
1056	NC_015693	CCTTA	2	10	59388	59397	20 %	40 %	0 %	40 %	338209420
1057	NC_015693	CAA	2	6	59752	59757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209421
1058	NC_015693	TTACAA	2	12	59863	59874	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338209421
1059	NC_015693	GTT	2	6	59910	59915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209421
1060	NC_015693	GAAA	2	8	59924	59931	75 %	0 %	25 %	0 %	338209421
1061	NC_015693	TAA	2	6	60053	60058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209421
1062	NC_015693	AGAAA	2	10	60077	60086	80 %	0 %	20 %	0 %	338209421
1063	NC_015693	TGC	2	6	60173	60178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209421
1064	NC_015693	TTAC	2	8	60181	60188	25 %	50 %	0 %	25 %	338209421
1065	NC_015693	T	6	6	60204	60209	0 %	100 %	0 %	0 %	338209421
1066	NC_015693	TAA	2	6	60232	60237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209421
1067	NC_015693	TTAC	2	8	60240	60247	25 %	50 %	0 %	25 %	338209421
1068	NC_015693	A	6	6	60261	60266	100 %	0 %	0 %	0 %	338209421
1069	NC_015693	T	7	7	60359	60365	0 %	100 %	0 %	0 %	338209421
1070	NC_015693	TAAA	2	8	60370	60377	75 %	25 %	0 %	0 %	338209421
1071	NC_015693	T	6	6	60391	60396	0 %	100 %	0 %	0 %	338209422
1072	NC_015693	ACG	2	6	60419	60424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209422
1073	NC_015693	AAG	2	6	60437	60442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209422
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1075	NC_015693	TAA	2	6	60476	60481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209422
1076	NC_015693	TAA	2	6	60566	60571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209422
1077	NC_015693	TAA	2	6	60575	60580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209422
1078	NC_015693	A	6	6	60677	60682	100 %	0 %	0 %	0 %	338209422
1079	NC_015693	AGA	2	6	60726	60731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209422
1080	NC_015693	AGA	2	6	60753	60758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209422
1081	NC_015693	TAC	2	6	60774	60779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209422
1082	NC_015693	ATT	2	6	60823	60828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209422
1083	NC_015693	AGC	2	6	60861	60866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209422
1084	NC_015693	A	6	6	60987	60992	100 %	0 %	0 %	0 %	338209422
1085	NC_015693	AAT	2	6	61017	61022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209422
1086	NC_015693	TTAC	2	8	61055	61062	25 %	50 %	0 %	25 %	338209422
1087	NC_015693	A	6	6	61085	61090	100 %	0 %	0 %	0 %	338209422
1088	NC_015693	A	6	6	61158	61163	100 %	0 %	0 %	0 %	338209422
1089	NC_015693	ATG	2	6	61184	61189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209422
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1091	NC_015693	T	6	6	61476	61481	0 %	100 %	0 %	0 %	338209423
1092	NC_015693	TA	3	6	61919	61924	50 %	50 %	0 %	0 %	338209424
1093	NC_015693	T	6	6	61928	61933	0 %	100 %	0 %	0 %	338209424
1094	NC_015693	AGT	2	6	61962	61967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209424
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1096	NC_015693	ACA	2	6	62042	62047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209424
1097	NC_015693	GGT	2	6	62077	62082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209424
1098	NC_015693	CCT	2	6	62163	62168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209424
1099	NC_015693	T	6	6	62219	62224	0 %	100 %	0 %	0 %	338209424
1100	NC_015693	ATCC	2	8	62272	62279	25 %	25 %	0 %	50 %	338209424
1101	NC_015693	CTT	2	6	62283	62288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209424
1102	NC_015693	A	6	6	62342	62347	100 %	0 %	0 %	0 %	338209424
1103	NC_015693	CGA	2	6	62372	62377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209424
1104	NC_015693	TCAA	2	8	62492	62499	50 %	25 %	0 %	25 %	338209424
1105	NC_015693	ATC	2	6	62521	62526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209424
1106	NC_015693	GTT	2	6	62546	62551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209424
1107	NC_015693	CTC	2	6	62614	62619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209424
1108	NC_015693	TAA	2	6	62634	62639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209424
1109	NC_015693	TTC	2	6	62650	62655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209424
1110	NC_015693	TC	3	6	62680	62685	0 %	50 %	0 %	50 %	338209424
1111	NC_015693	GA	3	6	62700	62705	50 %	0 %	50 %	0 %	338209424
1112	NC_015693	A	6	6	62984	62989	100 %	0 %	0 %	0 %	338209425
1113	NC_015693	TTA	2	6	63201	63206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209425
1114	NC_015693	T	6	6	63214	63219	0 %	100 %	0 %	0 %	338209425
1115	NC_015693	CAA	2	6	63340	63345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209425
1116	NC_015693	TGA	2	6	63360	63365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209425
1117	NC_015693	TTG	2	6	63516	63521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209425
1118	NC_015693	CTT	2	6	63640	63645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209425
1119	NC_015693	ATA	3	9	63714	63722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209425
1120	NC_015693	A	6	6	64372	64377	100 %	0 %	0 %	0 %	338209426
1121	NC_015693	ATG	2	6	64461	64466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209426
1122	NC_015693	A	6	6	64475	64480	100 %	0 %	0 %	0 %	338209426
1123	NC_015693	CTA	2	6	64502	64507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209426
1124	NC_015693	GA	3	6	64517	64522	50 %	0 %	50 %	0 %	338209426
1125	NC_015693	CTG	2	6	64626	64631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209426
1126	NC_015693	TCA	2	6	64647	64652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209426
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