MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL01

Total Repeats: 1762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015693	TTC	2	6	28722	28727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209395
502	NC_015693	T	6	6	28757	28762	0 %	100 %	0 %	0 %	338209395
503	NC_015693	A	6	6	28809	28814	100 %	0 %	0 %	0 %	338209395
504	NC_015693	TCA	2	6	28911	28916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209396
505	NC_015693	CCA	2	6	29051	29056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209396
506	NC_015693	CAA	2	6	29100	29105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209396
507	NC_015693	GCT	2	6	29132	29137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209396
508	NC_015693	AGA	2	6	29146	29151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209396
509	NC_015693	TTC	2	6	29179	29184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209396
510	NC_015693	TGG	2	6	29196	29201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209396
511	NC_015693	TGC	2	6	29275	29280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209396
512	NC_015693	AAAAG	2	10	29291	29300	80 %	0 %	20 %	0 %	338209396
513	NC_015693	CAA	2	6	29386	29391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209396
514	NC_015693	ATT	2	6	29392	29397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209396
515	NC_015693	C	6	6	29418	29423	0 %	0 %	0 %	100 %	338209396
516	NC_015693	AGC	2	6	29528	29533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209396
517	NC_015693	AAT	2	6	29541	29546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209396
518	NC_015693	GTT	2	6	29592	29597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209396
519	NC_015693	CAC	2	6	29622	29627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209396
520	NC_015693	T	6	6	29751	29756	0 %	100 %	0 %	0 %	338209396
521	NC_015693	AGTC	2	8	29967	29974	25 %	25 %	25 %	25 %	338209396
522	NC_015693	GTT	2	6	30090	30095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209396
523	NC_015693	GTT	2	6	30151	30156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209396
524	NC_015693	CGG	2	6	30500	30505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209396
525	NC_015693	TAG	2	6	30531	30536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209396
526	NC_015693	AATA	2	8	30548	30555	75 %	25 %	0 %	0 %	338209396
527	NC_015693	AGAAA	2	10	30638	30647	80 %	0 %	20 %	0 %	338209396
528	NC_015693	CCAAC	2	10	30679	30688	40 %	0 %	0 %	60 %	338209396
529	NC_015693	GTC	2	6	30700	30705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209396
530	NC_015693	ACG	2	6	30730	30735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209396
531	NC_015693	CGG	2	6	30738	30743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209396
532	NC_015693	CAA	2	6	30761	30766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209396
533	NC_015693	GCC	2	6	30785	30790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209396
534	NC_015693	ACGG	2	8	30801	30808	25 %	0 %	50 %	25 %	338209396
535	NC_015693	TGA	2	6	30825	30830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209396
536	NC_015693	TAA	2	6	30861	30866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209396
537	NC_015693	GTAGCG	2	12	30871	30882	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338209396
538	NC_015693	GGC	2	6	30909	30914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209396
539	NC_015693	GTT	2	6	30916	30921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209396
540	NC_015693	GCA	2	6	30942	30947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209396
541	NC_015693	CAC	2	6	31117	31122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209396
542	NC_015693	CTG	2	6	31125	31130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209396
543	NC_015693	ACCTT	2	10	31142	31151	20 %	40 %	0 %	40 %	338209396
544	NC_015693	GTA	2	6	31235	31240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209396
545	NC_015693	CTCG	2	8	31291	31298	0 %	25 %	25 %	50 %	338209397
546	NC_015693	TCA	2	6	31351	31356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209397
547	NC_015693	AAGT	2	8	31424	31431	50 %	25 %	25 %	0 %	338209397
548	NC_015693	ACC	2	6	31443	31448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209397
549	NC_015693	AAC	2	6	31449	31454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209397
550	NC_015693	T	6	6	31481	31486	0 %	100 %	0 %	0 %	338209397
551	NC_015693	TCG	2	6	31494	31499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209397
552	NC_015693	ATC	2	6	31635	31640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209397
553	NC_015693	ACC	2	6	31661	31666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209397
554	NC_015693	TC	3	6	31698	31703	0 %	50 %	0 %	50 %	338209397
555	NC_015693	GGT	2	6	31796	31801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209397
556	NC_015693	CAC	2	6	31832	31837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209397
557	NC_015693	GGT	2	6	31904	31909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209397
558	NC_015693	CGG	2	6	31933	31938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209397
559	NC_015693	TGA	2	6	32022	32027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209398
560	NC_015693	TTC	2	6	32032	32037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209398
561	NC_015693	ACG	2	6	32045	32050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209398
562	NC_015693	AC	3	6	32074	32079	50 %	0 %	0 %	50 %	338209398
563	NC_015693	TGC	2	6	32090	32095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209398
564	NC_015693	CATT	2	8	32114	32121	25 %	50 %	0 %	25 %	338209398
565	NC_015693	GCA	2	6	32139	32144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209398
566	NC_015693	T	6	6	32163	32168	0 %	100 %	0 %	0 %	338209398
567	NC_015693	CTT	2	6	32292	32297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209398
568	NC_015693	TTAA	2	8	32843	32850	50 %	50 %	0 %	0 %	338209399
569	NC_015693	TTTA	2	8	32869	32876	25 %	75 %	0 %	0 %	338209399
570	NC_015693	GTAC	2	8	32907	32914	25 %	25 %	25 %	25 %	338209399
571	NC_015693	AGA	2	6	32919	32924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209399
572	NC_015693	AAT	2	6	32969	32974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209399
573	NC_015693	AAC	2	6	33011	33016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209399
574	NC_015693	T	7	7	33027	33033	0 %	100 %	0 %	0 %	338209399
575	NC_015693	GGA	2	6	33038	33043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209399
576	NC_015693	GTT	2	6	33107	33112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209399
577	NC_015693	TTGG	2	8	33251	33258	0 %	50 %	50 %	0 %	338209399
578	NC_015693	GAAA	2	8	33397	33404	75 %	0 %	25 %	0 %	338209399
579	NC_015693	CAAA	2	8	33502	33509	75 %	0 %	0 %	25 %	338209399
580	NC_015693	GAG	2	6	33531	33536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209399
581	NC_015693	GACT	2	8	33550	33557	25 %	25 %	25 %	25 %	338209399
582	NC_015693	ACTG	2	8	33560	33567	25 %	25 %	25 %	25 %	338209399
583	NC_015693	T	6	6	33570	33575	0 %	100 %	0 %	0 %	338209399
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586	NC_015693	T	6	6	33722	33727	0 %	100 %	0 %	0 %	338209399
587	NC_015693	TCG	2	6	33765	33770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209399
588	NC_015693	TAA	2	6	33865	33870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209399
589	NC_015693	A	7	7	33969	33975	100 %	0 %	0 %	0 %	338209400
590	NC_015693	ACT	2	6	34002	34007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209400
591	NC_015693	CATG	2	8	34070	34077	25 %	25 %	25 %	25 %	338209400
592	NC_015693	TACCT	2	10	34082	34091	20 %	40 %	0 %	40 %	338209400
593	NC_015693	ATC	3	9	34198	34206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209400
594	NC_015693	AC	3	6	34231	34236	50 %	0 %	0 %	50 %	338209400
595	NC_015693	ATTGG	2	10	34287	34296	20 %	40 %	40 %	0 %	338209400
596	NC_015693	CAA	2	6	34335	34340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209400
597	NC_015693	TGA	2	6	34384	34389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209400
598	NC_015693	GTTGG	2	10	34406	34415	0 %	40 %	60 %	0 %	338209400
599	NC_015693	ATT	2	6	34574	34579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209401
600	NC_015693	TCC	2	6	34582	34587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209401
601	NC_015693	GAA	2	6	34620	34625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209401
602	NC_015693	TGG	2	6	34744	34749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338209401
603	NC_015693	CGG	2	6	34786	34791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209401
604	NC_015693	ACC	2	6	34831	34836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209401
605	NC_015693	TGA	3	9	34879	34887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209401
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608	NC_015693	TA	3	6	35107	35112	50 %	50 %	0 %	0 %	338209401
609	NC_015693	GGC	2	6	35174	35179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209401
610	NC_015693	A	7	7	35202	35208	100 %	0 %	0 %	0 %	338209401
611	NC_015693	AAAC	2	8	35256	35263	75 %	0 %	0 %	25 %	338209401
612	NC_015693	TTC	2	6	35384	35389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209401
613	NC_015693	CACC	2	8	35416	35423	25 %	0 %	0 %	75 %	338209401
614	NC_015693	CTAC	2	8	35426	35433	25 %	25 %	0 %	50 %	338209401
615	NC_015693	TC	3	6	35478	35483	0 %	50 %	0 %	50 %	338209401
616	NC_015693	ATG	2	6	35490	35495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209401
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618	NC_015693	TCA	2	6	35585	35590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209401
619	NC_015693	GGC	2	6	35604	35609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209401
620	NC_015693	CGCC	2	8	35693	35700	0 %	0 %	25 %	75 %	338209401
621	NC_015693	TCA	2	6	35701	35706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209401
622	NC_015693	ATG	2	6	35747	35752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209401
623	NC_015693	A	6	6	35855	35860	100 %	0 %	0 %	0 %	338209402
624	NC_015693	TG	3	6	35996	36001	0 %	50 %	50 %	0 %	338209402
625	NC_015693	TCAT	2	8	36018	36025	25 %	50 %	0 %	25 %	338209402
626	NC_015693	GCG	2	6	36043	36048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338209402
627	NC_015693	A	8	8	36147	36154	100 %	0 %	0 %	0 %	338209402
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629	NC_015693	GTC	2	6	36298	36303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209402
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