MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ02

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015063	T	6	6	2640	2645	0 %	100 %	0 %	0 %	322836373
2	NC_015063	T	6	6	4626	4631	0 %	100 %	0 %	0 %	322836375
3	NC_015063	A	6	6	10012	10017	100 %	0 %	0 %	0 %	322836380
4	NC_015063	T	6	6	11982	11987	0 %	100 %	0 %	0 %	322836382
5	NC_015063	T	6	6	12168	12173	0 %	100 %	0 %	0 %	322836382
6	NC_015063	A	7	7	12352	12358	100 %	0 %	0 %	0 %	322836383
7	NC_015063	T	6	6	14458	14463	0 %	100 %	0 %	0 %	322836387
8	NC_015063	T	6	6	14646	14651	0 %	100 %	0 %	0 %	322836387
9	NC_015063	T	6	6	20026	20031	0 %	100 %	0 %	0 %	322836396
10	NC_015063	A	6	6	20300	20305	100 %	0 %	0 %	0 %	322836396
11	NC_015063	T	6	6	21407	21412	0 %	100 %	0 %	0 %	322836397
12	NC_015063	A	7	7	23214	23220	100 %	0 %	0 %	0 %	322836398
13	NC_015063	T	6	6	24077	24082	0 %	100 %	0 %	0 %	322836399
14	NC_015063	T	7	7	24900	24906	0 %	100 %	0 %	0 %	322836401
15	NC_015063	A	7	7	25091	25097	100 %	0 %	0 %	0 %	322836401
16	NC_015063	T	6	6	25303	25308	0 %	100 %	0 %	0 %	322836401
17	NC_015063	T	7	7	25531	25537	0 %	100 %	0 %	0 %	322836401
18	NC_015063	T	6	6	25785	25790	0 %	100 %	0 %	0 %	322836401
19	NC_015063	A	6	6	27409	27414	100 %	0 %	0 %	0 %	322836403
20	NC_015063	A	6	6	29524	29529	100 %	0 %	0 %	0 %	322836405
21	NC_015063	A	6	6	30777	30782	100 %	0 %	0 %	0 %	322836406
22	NC_015063	T	6	6	33631	33636	0 %	100 %	0 %	0 %	322836408
23	NC_015063	G	6	6	34127	34132	0 %	0 %	100 %	0 %	322836408
24	NC_015063	G	6	6	34782	34787	0 %	0 %	100 %	0 %	322836408
25	NC_015063	A	6	6	39975	39980	100 %	0 %	0 %	0 %	322836412
26	NC_015063	G	9	9	40872	40880	0 %	0 %	100 %	0 %	322836413
27	NC_015063	A	7	7	41445	41451	100 %	0 %	0 %	0 %	322836414
28	NC_015063	A	6	6	41915	41920	100 %	0 %	0 %	0 %	322836415
29	NC_015063	A	6	6	43228	43233	100 %	0 %	0 %	0 %	322836416
30	NC_015063	T	6	6	43337	43342	0 %	100 %	0 %	0 %	322836417
31	NC_015063	T	6	6	43504	43509	0 %	100 %	0 %	0 %	322836417
32	NC_015063	A	6	6	43592	43597	100 %	0 %	0 %	0 %	322836417
33	NC_015063	A	6	6	45128	45133	100 %	0 %	0 %	0 %	322836419
34	NC_015063	T	6	6	45673	45678	0 %	100 %	0 %	0 %	322836420
35	NC_015063	A	6	6	48560	48565	100 %	0 %	0 %	0 %	322836421
36	NC_015063	A	7	7	50410	50416	100 %	0 %	0 %	0 %	322836421
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39	NC_015063	A	6	6	60125	60130	100 %	0 %	0 %	0 %	322836426
40	NC_015063	A	7	7	60867	60873	100 %	0 %	0 %	0 %	322836427
41	NC_015063	T	6	6	61011	61016	0 %	100 %	0 %	0 %	322836427
42	NC_015063	G	6	6	61160	61165	0 %	0 %	100 %	0 %	322836427
43	NC_015063	G	6	6	61631	61636	0 %	0 %	100 %	0 %	322836427
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45	NC_015063	A	6	6	62864	62869	100 %	0 %	0 %	0 %	322836429
46	NC_015063	A	8	8	64301	64308	100 %	0 %	0 %	0 %	322836430
47	NC_015063	A	6	6	64313	64318	100 %	0 %	0 %	0 %	322836430
48	NC_015063	A	6	6	65966	65971	100 %	0 %	0 %	0 %	322836432
49	NC_015063	T	6	6	66545	66550	0 %	100 %	0 %	0 %	322836432
50	NC_015063	T	6	6	66842	66847	0 %	100 %	0 %	0 %	322836432
51	NC_015063	A	6	6	67067	67072	100 %	0 %	0 %	0 %	322836432
52	NC_015063	A	6	6	67110	67115	100 %	0 %	0 %	0 %	322836432
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61	NC_015063	T	6	6	73763	73768	0 %	100 %	0 %	0 %	322836437
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65	NC_015063	A	6	6	76408	76413	100 %	0 %	0 %	0 %	322836439
66	NC_015063	A	6	6	76416	76421	100 %	0 %	0 %	0 %	322836439
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70	NC_015063	A	6	6	76784	76789	100 %	0 %	0 %	0 %	322836439
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104	NC_015063	A	6	6	108120	108125	100 %	0 %	0 %	0 %	322836472
105	NC_015063	C	6	6	108392	108397	0 %	0 %	0 %	100 %	322836472
106	NC_015063	T	6	6	108617	108622	0 %	100 %	0 %	0 %	322836472
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109	NC_015063	A	7	7	111371	111377	100 %	0 %	0 %	0 %	322836475
110	NC_015063	A	6	6	114299	114304	100 %	0 %	0 %	0 %	322836476
111	NC_015063	T	6	6	114660	114665	0 %	100 %	0 %	0 %	322836476
112	NC_015063	T	6	6	116622	116627	0 %	100 %	0 %	0 %	322836479
113	NC_015063	C	6	6	117258	117263	0 %	0 %	0 %	100 %	322836480
114	NC_015063	A	6	6	117895	117900	100 %	0 %	0 %	0 %	322836480
115	NC_015063	A	6	6	117968	117973	100 %	0 %	0 %	0 %	322836480
116	NC_015063	A	7	7	118679	118685	100 %	0 %	0 %	0 %	322836482
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118	NC_015063	T	6	6	119720	119725	0 %	100 %	0 %	0 %	322836483
119	NC_015063	A	8	8	120192	120199	100 %	0 %	0 %	0 %	322836483
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121	NC_015063	T	7	7	124468	124474	0 %	100 %	0 %	0 %	322836485
122	NC_015063	A	7	7	125413	125419	100 %	0 %	0 %	0 %	322836486
123	NC_015063	C	6	6	127704	127709	0 %	0 %	0 %	100 %	322836488
124	NC_015063	A	6	6	130557	130562	100 %	0 %	0 %	0 %	322836492
125	NC_015063	C	6	6	131658	131663	0 %	0 %	0 %	100 %	322836493
126	NC_015063	T	6	6	132299	132304	0 %	100 %	0 %	0 %	322836493
127	NC_015063	T	6	6	132632	132637	0 %	100 %	0 %	0 %	322836493

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.