MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ02

Total Repeats: 1814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015063	AAC	2	6	39074	39079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836412
502	NC_015063	GTC	2	6	39167	39172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836412
503	NC_015063	ATG	2	6	39174	39179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836412
504	NC_015063	CCA	2	6	39210	39215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322836412
505	NC_015063	GCG	2	6	39282	39287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836412
506	NC_015063	TCA	2	6	39324	39329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836412
507	NC_015063	CAG	2	6	39337	39342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836412
508	NC_015063	GGT	2	6	39409	39414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322836412
509	NC_015063	GGC	2	6	39422	39427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836412
510	NC_015063	CACAC	2	10	39655	39664	40 %	0 %	0 %	60 %	322836412
511	NC_015063	CTAC	2	8	39693	39700	25 %	25 %	0 %	50 %	322836412
512	NC_015063	CGC	2	6	39715	39720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836412
513	NC_015063	AC	3	6	39794	39799	50 %	0 %	0 %	50 %	322836412
514	NC_015063	CGG	2	6	39826	39831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836412
515	NC_015063	CAA	2	6	39835	39840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836412
516	NC_015063	TCC	2	6	39842	39847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322836412
517	NC_015063	CAT	2	6	39907	39912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836412
518	NC_015063	ACG	2	6	39921	39926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836412
519	NC_015063	CCAA	2	8	39969	39976	50 %	0 %	0 %	50 %	322836412
520	NC_015063	A	6	6	39975	39980	100 %	0 %	0 %	0 %	322836412
521	NC_015063	ATGT	2	8	40088	40095	25 %	50 %	25 %	0 %	322836412
522	NC_015063	GTTG	2	8	40221	40228	0 %	50 %	50 %	0 %	322836412
523	NC_015063	AAGGAC	2	12	40403	40414	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	322836412
524	NC_015063	ACA	2	6	40458	40463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836412
525	NC_015063	GTC	2	6	40492	40497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836412
526	NC_015063	ACA	2	6	40500	40505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836412
527	NC_015063	CAA	2	6	40561	40566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836412
528	NC_015063	CAG	2	6	40592	40597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836412
529	NC_015063	ACA	2	6	40775	40780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836413
530	NC_015063	TAC	2	6	40816	40821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836413
531	NC_015063	TCA	2	6	40854	40859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836413
532	NC_015063	G	9	9	40872	40880	0 %	0 %	100 %	0 %	322836413
533	NC_015063	CAA	2	6	40892	40897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836413
534	NC_015063	GAT	2	6	40899	40904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836413
535	NC_015063	TGA	2	6	40924	40929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836413
536	NC_015063	GCA	2	6	40997	41002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836413
537	NC_015063	GAG	2	6	41022	41027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322836413
538	NC_015063	CGG	2	6	41055	41060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836413
539	NC_015063	GCT	2	6	41093	41098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836413
540	NC_015063	TTAT	2	8	41319	41326	25 %	75 %	0 %	0 %	322836414
541	NC_015063	TGA	2	6	41413	41418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836414
542	NC_015063	A	7	7	41445	41451	100 %	0 %	0 %	0 %	322836414
543	NC_015063	TGA	2	6	41811	41816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836415
544	NC_015063	A	6	6	41915	41920	100 %	0 %	0 %	0 %	322836415
545	NC_015063	GC	3	6	41928	41933	0 %	0 %	50 %	50 %	322836415
546	NC_015063	GCT	2	6	42021	42026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836415
547	NC_015063	TGA	2	6	42037	42042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836415
548	NC_015063	GTT	2	6	42056	42061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322836415
549	NC_015063	TTG	2	6	42083	42088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322836415
550	NC_015063	GGA	2	6	42098	42103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322836415
551	NC_015063	AAG	2	6	42114	42119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836415
552	NC_015063	TCA	2	6	42179	42184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836415
553	NC_015063	TCAA	2	8	42193	42200	50 %	25 %	0 %	25 %	322836415
554	NC_015063	TCT	2	6	42488	42493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836416
555	NC_015063	TA	3	6	42534	42539	50 %	50 %	0 %	0 %	322836416
556	NC_015063	CTG	2	6	42639	42644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836416
557	NC_015063	ATG	2	6	42669	42674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836416
558	NC_015063	TGA	2	6	42743	42748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836416
559	NC_015063	GAT	2	6	42749	42754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836416
560	NC_015063	ATTT	2	8	42806	42813	25 %	75 %	0 %	0 %	322836416
561	NC_015063	TGA	2	6	42821	42826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836416
562	NC_015063	TGA	2	6	42830	42835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836416
563	NC_015063	AGA	2	6	42881	42886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322836416
564	NC_015063	TAC	2	6	42890	42895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836416
565	NC_015063	GACT	2	8	42901	42908	25 %	25 %	25 %	25 %	322836416
566	NC_015063	CTG	2	6	42956	42961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836416
567	NC_015063	CTTT	2	8	43105	43112	0 %	75 %	0 %	25 %	322836416
568	NC_015063	GAAA	2	8	43148	43155	75 %	0 %	25 %	0 %	322836416
569	NC_015063	TGG	2	6	43158	43163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322836416
570	NC_015063	ATC	2	6	43174	43179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836416
571	NC_015063	TTG	2	6	43200	43205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322836416
572	NC_015063	A	6	6	43228	43233	100 %	0 %	0 %	0 %	322836416
573	NC_015063	ATTAAA	2	12	43291	43302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836416
574	NC_015063	T	6	6	43337	43342	0 %	100 %	0 %	0 %	322836417
575	NC_015063	CGG	2	6	43344	43349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322836417
576	NC_015063	TCT	2	6	43359	43364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836417
577	NC_015063	T	6	6	43504	43509	0 %	100 %	0 %	0 %	322836417
578	NC_015063	GGGAT	2	10	43511	43520	20 %	20 %	60 %	0 %	322836417
579	NC_015063	TTTA	2	8	43552	43559	25 %	75 %	0 %	0 %	322836417
580	NC_015063	A	6	6	43592	43597	100 %	0 %	0 %	0 %	322836417
581	NC_015063	CAT	2	6	43687	43692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836417
582	NC_015063	ACA	2	6	43732	43737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322836417
583	NC_015063	GAC	2	6	44802	44807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836418
584	NC_015063	TCA	2	6	44891	44896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836418
585	NC_015063	A	6	6	45128	45133	100 %	0 %	0 %	0 %	322836419
586	NC_015063	CAG	2	6	45209	45214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836419
587	NC_015063	AAAT	2	8	45310	45317	75 %	25 %	0 %	0 %	322836419
588	NC_015063	ACT	2	6	45330	45335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322836419
589	NC_015063	GCA	2	6	45403	45408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836419
590	NC_015063	CAG	2	6	45419	45424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836419
591	NC_015063	T	6	6	45673	45678	0 %	100 %	0 %	0 %	322836420
592	NC_015063	GCC	2	6	45707	45712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322836420
593	NC_015063	TAT	2	6	45732	45737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322836420
594	NC_015063	AGGC	2	8	45930	45937	25 %	0 %	50 %	25 %	322836420
595	NC_015063	TGC	2	6	45964	45969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836420
596	NC_015063	GAT	2	6	45974	45979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836420
597	NC_015063	TGA	2	6	46012	46017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836420
598	NC_015063	CAGT	2	8	47547	47554	25 %	25 %	25 %	25 %	322836421
599	NC_015063	AAAT	2	8	47600	47607	75 %	25 %	0 %	0 %	322836421
600	NC_015063	AC	3	6	47657	47662	50 %	0 %	0 %	50 %	322836421
601	NC_015063	GACA	2	8	47676	47683	50 %	0 %	25 %	25 %	322836421
602	NC_015063	ATG	2	6	47782	47787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836421
603	NC_015063	ACAG	2	8	47822	47829	50 %	0 %	25 %	25 %	322836421
604	NC_015063	AC	3	6	47849	47854	50 %	0 %	0 %	50 %	322836421
605	NC_015063	GGTAA	2	10	47905	47914	40 %	20 %	40 %	0 %	322836421
606	NC_015063	TAA	2	6	48024	48029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836421
607	NC_015063	CAG	2	6	48070	48075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836421
608	NC_015063	CAGA	2	8	48181	48188	50 %	0 %	25 %	25 %	322836421
609	NC_015063	TGG	2	6	48192	48197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322836421
610	NC_015063	CAGC	2	8	48225	48232	25 %	0 %	25 %	50 %	322836421
611	NC_015063	GCT	2	6	48264	48269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836421
612	NC_015063	GCT	2	6	48282	48287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322836421
613	NC_015063	TC	3	6	48370	48375	0 %	50 %	0 %	50 %	322836421
614	NC_015063	TAA	2	6	48471	48476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836421
615	NC_015063	TGGC	2	8	48500	48507	0 %	25 %	50 %	25 %	322836421
616	NC_015063	GAT	2	6	48526	48531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836421
617	NC_015063	A	6	6	48560	48565	100 %	0 %	0 %	0 %	322836421
618	NC_015063	GAGG	2	8	48607	48614	25 %	0 %	75 %	0 %	322836421
619	NC_015063	GAT	2	6	48625	48630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836421
620	NC_015063	AAT	2	6	48694	48699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836421
621	NC_015063	GGT	2	6	48780	48785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322836421
622	NC_015063	GTTT	2	8	48824	48831	0 %	75 %	25 %	0 %	322836421
623	NC_015063	TAA	2	6	48861	48866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322836421
624	NC_015063	GAC	2	6	48957	48962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836421
625	NC_015063	GAT	2	6	49030	49035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322836421
626	NC_015063	GCA	2	6	49079	49084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322836421
627	NC_015063	TGT	2	6	49143	49148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322836421
628	NC_015063	CCA	3	9	49157	49165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322836421
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750	NC_015063	CTT	2	6	61147	61152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322836427
751	NC_015063	G	6	6	61160	61165	0 %	0 %	100 %	0 %	322836427
752	NC_015063	AT	3	6	61173	61178	50 %	50 %	0 %	0 %	322836427
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