MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 11016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015062	CAC	2	6	198058	198063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835311
3502	NC_015062	TGGC	2	8	198173	198180	0 %	25 %	50 %	25 %	322835311
3503	NC_015062	CTG	2	6	198240	198245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835311
3504	NC_015062	ACTG	2	8	198252	198259	25 %	25 %	25 %	25 %	322835311
3505	NC_015062	GAA	2	6	198310	198315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835311
3506	NC_015062	TG	3	6	198531	198536	0 %	50 %	50 %	0 %	322835311
3507	NC_015062	CTG	2	6	198543	198548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835311
3508	NC_015062	TGCCGG	2	12	198559	198570	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322835311
3509	NC_015062	CCG	2	6	198579	198584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835311
3510	NC_015062	ATT	2	6	198613	198618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835311
3511	NC_015062	TCA	2	6	198794	198799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835312
3512	NC_015062	GCC	2	6	198817	198822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835312
3513	NC_015062	CGG	2	6	198827	198832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835312
3514	NC_015062	GTT	2	6	199003	199008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835312
3515	NC_015062	TGCC	2	8	199035	199042	0 %	25 %	25 %	50 %	322835312
3516	NC_015062	ATC	2	6	199063	199068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835312
3517	NC_015062	GC	3	6	199131	199136	0 %	0 %	50 %	50 %	322835312
3518	NC_015062	CAT	2	6	199171	199176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835312
3519	NC_015062	CAG	2	6	199204	199209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835312
3520	NC_015062	GCA	2	6	199538	199543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835313
3521	NC_015062	C	6	6	199558	199563	0 %	0 %	0 %	100 %	322835313
3522	NC_015062	CCAC	2	8	199587	199594	25 %	0 %	0 %	75 %	322835313
3523	NC_015062	CCG	2	6	199602	199607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835313
3524	NC_015062	ACA	2	6	199641	199646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835313
3525	NC_015062	TCA	2	6	199824	199829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835313
3526	NC_015062	C	7	7	200023	200029	0 %	0 %	0 %	100 %	322835313
3527	NC_015062	CCG	2	6	200036	200041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835313
3528	NC_015062	CGT	2	6	200047	200052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835313
3529	NC_015062	CCA	2	6	200053	200058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835313
3530	NC_015062	CGG	2	6	200088	200093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835313
3531	NC_015062	GGAA	2	8	200115	200122	50 %	0 %	50 %	0 %	322835313
3532	NC_015062	GCTG	2	8	200160	200167	0 %	25 %	50 %	25 %	322835313
3533	NC_015062	CTG	2	6	200215	200220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835313
3534	NC_015062	CGT	2	6	200226	200231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835313
3535	NC_015062	GAT	2	6	200289	200294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835313
3536	NC_015062	CGGCT	2	10	200329	200338	0 %	20 %	40 %	40 %	322835313
3537	NC_015062	CCAG	2	8	200343	200350	25 %	0 %	25 %	50 %	322835313
3538	NC_015062	CG	3	6	200408	200413	0 %	0 %	50 %	50 %	322835313
3539	NC_015062	TG	3	6	200420	200425	0 %	50 %	50 %	0 %	322835313
3540	NC_015062	AAG	2	6	200432	200437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835313
3541	NC_015062	AC	3	6	200469	200474	50 %	0 %	0 %	50 %	322835313
3542	NC_015062	ATTTC	2	10	200505	200514	20 %	60 %	0 %	20 %	322835313
3543	NC_015062	GAA	2	6	200659	200664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835313
3544	NC_015062	GCC	2	6	200697	200702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835313
3545	NC_015062	CTG	2	6	200731	200736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835313
3546	NC_015062	GCG	2	6	200790	200795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835313
3547	NC_015062	CG	3	6	200806	200811	0 %	0 %	50 %	50 %	322835313
3548	NC_015062	CGG	2	6	200847	200852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835313
3549	NC_015062	CTG	2	6	201043	201048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835313
3550	NC_015062	CATC	2	8	201144	201151	25 %	25 %	0 %	50 %	322835313
3551	NC_015062	CAC	2	6	201243	201248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835313
3552	NC_015062	GCA	2	6	201366	201371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835313
3553	NC_015062	GC	3	6	201410	201415	0 %	0 %	50 %	50 %	322835313
3554	NC_015062	TGAT	2	8	201574	201581	25 %	50 %	25 %	0 %	322835314
3555	NC_015062	TGG	2	6	201590	201595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835314
3556	NC_015062	GC	3	6	201626	201631	0 %	0 %	50 %	50 %	322835314
3557	NC_015062	CTG	2	6	201699	201704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835314
3558	NC_015062	ACC	2	6	201748	201753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835314
3559	NC_015062	CCAT	2	8	201811	201818	25 %	25 %	0 %	50 %	322835314
3560	NC_015062	CCA	2	6	201848	201853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835314
3561	NC_015062	CAT	2	6	201861	201866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835314
3562	NC_015062	GTG	3	9	201880	201888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835314
3563	NC_015062	CAG	2	6	201927	201932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835314
3564	NC_015062	GAA	2	6	201951	201956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835314
3565	NC_015062	CGC	2	6	201960	201965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835314
3566	NC_015062	TGC	2	6	202013	202018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835314
3567	NC_015062	CAG	2	6	202041	202046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835314
3568	NC_015062	TG	3	6	202070	202075	0 %	50 %	50 %	0 %	322835314
3569	NC_015062	CAG	2	6	202080	202085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835314
3570	NC_015062	ATA	2	6	202113	202118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835314
3571	NC_015062	CAT	2	6	202131	202136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835314
3572	NC_015062	CAC	2	6	202149	202154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835314
3573	NC_015062	GAA	2	6	202170	202175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835314
3574	NC_015062	CCA	2	6	202187	202192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835314
3575	NC_015062	GA	3	6	202231	202236	50 %	0 %	50 %	0 %	322835314
3576	NC_015062	CGG	2	6	202251	202256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835314
3577	NC_015062	CAG	2	6	202290	202295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835314
3578	NC_015062	CAC	2	6	202302	202307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835314
3579	NC_015062	CAT	2	6	202368	202373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835314
3580	NC_015062	CAT	2	6	202386	202391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835314
3581	NC_015062	CGC	2	6	202409	202414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835314
3582	NC_015062	GAA	2	6	202428	202433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835314
3583	NC_015062	TAT	2	6	202463	202468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835314
3584	NC_015062	CAT	2	6	202527	202532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835314
3585	NC_015062	GCCA	2	8	202630	202637	25 %	0 %	25 %	50 %	322835314
3586	NC_015062	CAA	2	6	202730	202735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835314
3587	NC_015062	TAA	2	6	202783	202788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835314
3588	NC_015062	TGA	3	9	203357	203365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835315
3589	NC_015062	AC	3	6	203418	203423	50 %	0 %	0 %	50 %	322835315
3590	NC_015062	GCA	2	6	203433	203438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835315
3591	NC_015062	TGC	2	6	203513	203518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835315
3592	NC_015062	CAG	2	6	203535	203540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835315
3593	NC_015062	GC	3	6	203566	203571	0 %	0 %	50 %	50 %	322835315
3594	NC_015062	CG	3	6	203579	203584	0 %	0 %	50 %	50 %	322835315
3595	NC_015062	TTA	2	6	203630	203635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835315
3596	NC_015062	CGG	2	6	203642	203647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835315
3597	NC_015062	CAG	2	6	203686	203691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835315
3598	NC_015062	CTG	2	6	203749	203754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835315
3599	NC_015062	CGG	2	6	204023	204028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835316
3600	NC_015062	ACA	3	9	204118	204126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835316
3601	NC_015062	GGT	2	6	204250	204255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835316
3602	NC_015062	T	6	6	204442	204447	0 %	100 %	0 %	0 %	322835316
3603	NC_015062	GAT	2	6	204466	204471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835316
3604	NC_015062	T	6	6	204532	204537	0 %	100 %	0 %	0 %	322835317
3605	NC_015062	ACAG	2	8	204580	204587	50 %	0 %	25 %	25 %	322835317
3606	NC_015062	ACC	2	6	204610	204615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835317
3607	NC_015062	TAC	2	6	204623	204628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835317
3608	NC_015062	G	6	6	204646	204651	0 %	0 %	100 %	0 %	322835317
3609	NC_015062	AGC	2	6	204663	204668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835317
3610	NC_015062	ATT	2	6	204721	204726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835317
3611	NC_015062	GAT	2	6	204731	204736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835317
3612	NC_015062	TTGA	2	8	204740	204747	25 %	50 %	25 %	0 %	322835317
3613	NC_015062	ACCA	2	8	204886	204893	50 %	0 %	0 %	50 %	322835317
3614	NC_015062	CAA	2	6	204906	204911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835317
3615	NC_015062	AT	3	6	204957	204962	50 %	50 %	0 %	0 %	322835318
3616	NC_015062	TGGC	2	8	204974	204981	0 %	25 %	50 %	25 %	322835318
3617	NC_015062	A	6	6	205058	205063	100 %	0 %	0 %	0 %	322835318
3618	NC_015062	GAAA	2	8	205172	205179	75 %	0 %	25 %	0 %	322835318
3619	NC_015062	GAA	2	6	205531	205536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835319
3620	NC_015062	CGG	2	6	205565	205570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835319
3621	NC_015062	CTG	2	6	205660	205665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835319
3622	NC_015062	ACG	2	6	205668	205673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835319
3623	NC_015062	TGGCC	2	10	205688	205697	0 %	20 %	40 %	40 %	322835319
3624	NC_015062	TCTG	2	8	205714	205721	0 %	50 %	25 %	25 %	322835319
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3626	NC_015062	CTG	2	6	206047	206052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835319
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3731	NC_015062	ATG	2	6	212214	212219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835326
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3744	NC_015062	TTC	2	6	212728	212733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835327
3745	NC_015062	GCGT	2	8	212931	212938	0 %	25 %	50 %	25 %	322835327
3746	NC_015062	GGC	2	6	213045	213050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835327
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3749	NC_015062	GCT	2	6	213088	213093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835327
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3753	NC_015062	AATCA	2	10	213273	213282	60 %	20 %	0 %	20 %	322835327
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3773	NC_015062	CG	3	6	214110	214115	0 %	0 %	50 %	50 %	322835328
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3866	NC_015062	ATA	2	6	218420	218425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835333
3867	NC_015062	TGG	2	6	218429	218434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835333
3868	NC_015062	AAT	2	6	218488	218493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835333
3869	NC_015062	GCG	2	6	218569	218574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835333
3870	NC_015062	ATA	2	6	218627	218632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835333
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3874	NC_015062	ATGCC	2	10	218760	218769	20 %	20 %	20 %	40 %	322835333
3875	NC_015062	ATA	2	6	218795	218800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835333
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3884	NC_015062	T	6	6	219317	219322	0 %	100 %	0 %	0 %	322835334
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3887	NC_015062	CTTT	2	8	219511	219518	0 %	75 %	0 %	25 %	322835334
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3889	NC_015062	AAAT	2	8	219893	219900	75 %	25 %	0 %	0 %	322835335
3890	NC_015062	GCC	2	6	219949	219954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835335
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3969	NC_015062	CAG	2	6	224586	224591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835338
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3974	NC_015062	CA	3	6	224759	224764	50 %	0 %	0 %	50 %	322835338
3975	NC_015062	GAC	2	6	224773	224778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835338
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3979	NC_015062	GGCG	2	8	225036	225043	0 %	0 %	75 %	25 %	322835338
3980	NC_015062	GCA	2	6	225045	225050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835338
3981	NC_015062	GACG	2	8	225108	225115	25 %	0 %	50 %	25 %	322835338
3982	NC_015062	AAG	2	6	225116	225121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835338
3983	NC_015062	CAA	2	6	225159	225164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835338
3984	NC_015062	CCA	2	6	225332	225337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835339
3985	NC_015062	CTG	2	6	225384	225389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835339
3986	NC_015062	CAC	2	6	225435	225440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835339
3987	NC_015062	A	6	6	225493	225498	100 %	0 %	0 %	0 %	322835339
3988	NC_015062	CA	3	6	225500	225505	50 %	0 %	0 %	50 %	322835339
3989	NC_015062	GAT	2	6	225512	225517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835339
3990	NC_015062	CAG	2	6	225570	225575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835339
3991	NC_015062	TCA	2	6	225577	225582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835339
3992	NC_015062	CTT	2	6	225647	225652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835339
3993	NC_015062	AAT	2	6	225707	225712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835340
3994	NC_015062	ACA	2	6	225736	225741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835340
3995	NC_015062	AAT	2	6	225749	225754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835340
3996	NC_015062	CGC	2	6	225764	225769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835340
3997	NC_015062	GTT	2	6	225904	225909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835340
3998	NC_015062	CTG	2	6	225948	225953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835340
3999	NC_015062	CTG	2	6	225960	225965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835340
4000	NC_015062	CGC	2	6	225986	225991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835340

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