MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 11016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015062	GCG	2	6	54465	54470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835171
1002	NC_015062	GAA	2	6	54478	54483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835171
1003	NC_015062	ACG	2	6	54545	54550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835171
1004	NC_015062	CCAG	2	8	54588	54595	25 %	0 %	25 %	50 %	322835171
1005	NC_015062	CCAC	2	8	54665	54672	25 %	0 %	0 %	75 %	322835171
1006	NC_015062	ATG	4	12	54776	54787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835171
1007	NC_015062	GAA	2	6	54835	54840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835171
1008	NC_015062	GCC	2	6	54844	54849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835171
1009	NC_015062	GGC	2	6	54889	54894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835171
1010	NC_015062	AC	3	6	54963	54968	50 %	0 %	0 %	50 %	322835171
1011	NC_015062	TGC	2	6	55000	55005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835171
1012	NC_015062	T	6	6	55018	55023	0 %	100 %	0 %	0 %	322835171
1013	NC_015062	GTC	2	6	55033	55038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835171
1014	NC_015062	T	7	7	55078	55084	0 %	100 %	0 %	0 %	322835171
1015	NC_015062	AATTT	2	10	55410	55419	40 %	60 %	0 %	0 %	322835172
1016	NC_015062	CGC	2	6	55467	55472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835172
1017	NC_015062	TGTGT	2	10	55477	55486	0 %	60 %	40 %	0 %	322835172
1018	NC_015062	ATT	2	6	55494	55499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835172
1019	NC_015062	TGT	2	6	55536	55541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835172
1020	NC_015062	CTG	2	6	55577	55582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835172
1021	NC_015062	CT	3	6	55649	55654	0 %	50 %	0 %	50 %	322835172
1022	NC_015062	TAC	2	6	55673	55678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835172
1023	NC_015062	GAA	2	6	55751	55756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835172
1024	NC_015062	TGG	2	6	55803	55808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835172
1025	NC_015062	TGA	2	6	55981	55986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835172
1026	NC_015062	TGAA	2	8	56049	56056	50 %	25 %	25 %	0 %	322835172
1027	NC_015062	GCA	2	6	56061	56066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835172
1028	NC_015062	CA	3	6	56107	56112	50 %	0 %	0 %	50 %	322835172
1029	NC_015062	ATGT	2	8	56144	56151	25 %	50 %	25 %	0 %	322835172
1030	NC_015062	CCG	2	6	56185	56190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835172
1031	NC_015062	TGTC	2	8	56215	56222	0 %	50 %	25 %	25 %	322835172
1032	NC_015062	TGA	2	6	56223	56228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835172
1033	NC_015062	TGA	2	6	56250	56255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835172
1034	NC_015062	GCT	2	6	56272	56277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835172
1035	NC_015062	GCCA	2	8	56321	56328	25 %	0 %	25 %	50 %	322835172
1036	NC_015062	CTC	2	6	56385	56390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835172
1037	NC_015062	CAC	2	6	56488	56493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835172
1038	NC_015062	CTC	2	6	56543	56548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835172
1039	NC_015062	A	6	6	56585	56590	100 %	0 %	0 %	0 %	322835173
1040	NC_015062	ATG	2	6	56654	56659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835173
1041	NC_015062	GAA	2	6	56678	56683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835173
1042	NC_015062	TGT	2	6	56733	56738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835173
1043	NC_015062	GAA	2	6	56765	56770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835173
1044	NC_015062	A	6	6	56804	56809	100 %	0 %	0 %	0 %	322835173
1045	NC_015062	CAT	2	6	56815	56820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835173
1046	NC_015062	GTCT	2	8	56831	56838	0 %	50 %	25 %	25 %	322835173
1047	NC_015062	GT	3	6	56847	56852	0 %	50 %	50 %	0 %	322835173
1048	NC_015062	CGC	2	6	56868	56873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835173
1049	NC_015062	T	6	6	56884	56889	0 %	100 %	0 %	0 %	322835173
1050	NC_015062	GAA	2	6	57015	57020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835174
1051	NC_015062	TCAGC	2	10	57227	57236	20 %	20 %	20 %	40 %	322835174
1052	NC_015062	GTT	2	6	57282	57287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835174
1053	NC_015062	CCG	2	6	57311	57316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835174
1054	NC_015062	ATG	2	6	57439	57444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835174
1055	NC_015062	GATG	2	8	57449	57456	25 %	25 %	50 %	0 %	322835174
1056	NC_015062	GGT	2	6	57464	57469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835174
1057	NC_015062	GAT	2	6	57546	57551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835174
1058	NC_015062	CAT	2	6	57579	57584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835174
1059	NC_015062	GCCA	2	8	57675	57682	25 %	0 %	25 %	50 %	322835175
1060	NC_015062	GCC	2	6	57683	57688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835175
1061	NC_015062	ATCAG	2	10	57756	57765	40 %	20 %	20 %	20 %	322835175
1062	NC_015062	CAG	2	6	57784	57789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835175
1063	NC_015062	GTT	2	6	57845	57850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835175
1064	NC_015062	TGT	2	6	57889	57894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835175
1065	NC_015062	CATT	2	8	57903	57910	25 %	50 %	0 %	25 %	322835175
1066	NC_015062	CAG	2	6	57914	57919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835175
1067	NC_015062	AAG	2	6	57958	57963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835175
1068	NC_015062	GCC	2	6	58016	58021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835175
1069	NC_015062	GAA	2	6	58064	58069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835175
1070	NC_015062	TCA	2	6	58090	58095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835175
1071	NC_015062	CAT	2	6	58096	58101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835175
1072	NC_015062	CGG	2	6	58137	58142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835175
1073	NC_015062	CGG	2	6	58257	58262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835175
1074	NC_015062	CAA	2	6	58315	58320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835175
1075	NC_015062	ATG	2	6	58428	58433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835175
1076	NC_015062	GCA	2	6	58673	58678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835176
1077	NC_015062	TGA	2	6	58686	58691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835176
1078	NC_015062	ATC	2	6	58697	58702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835176
1079	NC_015062	GGA	2	6	58704	58709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322835176
1080	NC_015062	GA	3	6	58740	58745	50 %	0 %	50 %	0 %	322835176
1081	NC_015062	GCAG	2	8	58831	58838	25 %	0 %	50 %	25 %	322835176
1082	NC_015062	ACG	2	6	58868	58873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835176
1083	NC_015062	ACT	2	6	58976	58981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835177
1084	NC_015062	T	6	6	59009	59014	0 %	100 %	0 %	0 %	322835177
1085	NC_015062	TTC	2	6	59123	59128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835177
1086	NC_015062	GATC	2	8	59137	59144	25 %	25 %	25 %	25 %	322835177
1087	NC_015062	TGAA	2	8	59160	59167	50 %	25 %	25 %	0 %	322835177
1088	NC_015062	AAATAA	2	12	59528	59539	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	322835178
1089	NC_015062	TGA	2	6	59540	59545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835178
1090	NC_015062	GTT	2	6	59563	59568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835178
1091	NC_015062	CGG	2	6	59583	59588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835178
1092	NC_015062	ACA	2	6	59651	59656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835178
1093	NC_015062	TGC	2	6	59670	59675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835178
1094	NC_015062	ACC	2	6	59676	59681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835178
1095	NC_015062	GTT	2	6	59850	59855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835178
1096	NC_015062	CGA	2	6	59862	59867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835178
1097	NC_015062	CCGCG	2	10	59877	59886	0 %	0 %	40 %	60 %	322835178
1098	NC_015062	GC	3	6	59917	59922	0 %	0 %	50 %	50 %	322835178
1099	NC_015062	GCTG	2	8	59979	59986	0 %	25 %	50 %	25 %	322835178
1100	NC_015062	AAG	2	6	59993	59998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835178
1101	NC_015062	CGT	2	6	60010	60015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835178
1102	NC_015062	GAT	2	6	60135	60140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835178
1103	NC_015062	GGT	2	6	60192	60197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835178
1104	NC_015062	TCGATG	2	12	60224	60235	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322835178
1105	NC_015062	TGG	2	6	60323	60328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835178
1106	NC_015062	CGT	2	6	60354	60359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835178
1107	NC_015062	CTG	2	6	60415	60420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835178
1108	NC_015062	CTG	2	6	60496	60501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835178
1109	NC_015062	TGG	2	6	60551	60556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835178
1110	NC_015062	CGG	2	6	60606	60611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835178
1111	NC_015062	TCA	2	6	60653	60658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835178
1112	NC_015062	GGC	2	6	60720	60725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835178
1113	NC_015062	CTG	2	6	60869	60874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835179
1114	NC_015062	CGC	2	6	60972	60977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835179
1115	NC_015062	GAA	2	6	60980	60985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835179
1116	NC_015062	GAC	2	6	61051	61056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835179
1117	NC_015062	TCCG	2	8	61065	61072	0 %	25 %	25 %	50 %	322835179
1118	NC_015062	CCG	2	6	61150	61155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835179
1119	NC_015062	TGG	2	6	61197	61202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835179
1120	NC_015062	CGCGG	2	10	61366	61375	0 %	0 %	60 %	40 %	322835179
1121	NC_015062	GTC	2	6	61500	61505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835179
1122	NC_015062	AGATGA	2	12	61510	61521	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	322835179
1123	NC_015062	ATC	2	6	61532	61537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835179
1124	NC_015062	GC	4	8	61618	61625	0 %	0 %	50 %	50 %	322835179
1125	NC_015062	TAA	3	9	61630	61638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835179
1126	NC_015062	CGAT	2	8	61683	61690	25 %	25 %	25 %	25 %	322835179
1127	NC_015062	GGT	2	6	61804	61809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835179
1128	NC_015062	CA	3	6	61811	61816	50 %	0 %	0 %	50 %	322835179
1129	NC_015062	CGT	2	6	61828	61833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835179
1130	NC_015062	TGG	2	6	61845	61850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835179
1131	NC_015062	GC	3	6	61873	61878	0 %	0 %	50 %	50 %	322835179
1132	NC_015062	GAT	2	6	62006	62011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835179
1133	NC_015062	TGG	3	9	62019	62027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835179
1134	NC_015062	GAG	2	6	62048	62053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322835179
1135	NC_015062	TG	3	6	62130	62135	0 %	50 %	50 %	0 %	322835179
1136	NC_015062	TGC	2	6	62268	62273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835179
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1151	NC_015062	CA	3	6	63397	63402	50 %	0 %	0 %	50 %	322835179
1152	NC_015062	TGC	2	6	63409	63414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835179
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1159	NC_015062	TCT	2	6	64054	64059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835180
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1164	NC_015062	GC	3	6	64242	64247	0 %	0 %	50 %	50 %	322835180
1165	NC_015062	AATA	2	8	64280	64287	75 %	25 %	0 %	0 %	322835180
1166	NC_015062	CCG	2	6	64307	64312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835180
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1171	NC_015062	ATG	2	6	66063	66068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835182
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1226	NC_015062	GAAA	2	8	69609	69616	75 %	0 %	25 %	0 %	322835186
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1230	NC_015062	CTC	2	6	69671	69676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835186
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1232	NC_015062	GC	3	6	69810	69815	0 %	0 %	50 %	50 %	322835186
1233	NC_015062	GAA	2	6	69823	69828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835186
1234	NC_015062	TTTC	2	8	69850	69857	0 %	75 %	0 %	25 %	322835186
1235	NC_015062	TACGAT	2	12	69892	69903	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	322835186
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1238	NC_015062	CCAT	2	8	69985	69992	25 %	25 %	0 %	50 %	322835186
1239	NC_015062	TGC	2	6	70041	70046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835186
1240	NC_015062	TTC	2	6	70819	70824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835187
1241	NC_015062	TCT	2	6	70838	70843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835187
1242	NC_015062	TGGCGG	2	12	70849	70860	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	322835187
1243	NC_015062	T	6	6	70915	70920	0 %	100 %	0 %	0 %	322835187
1244	NC_015062	GCT	2	6	70953	70958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835187
1245	NC_015062	CG	3	6	70976	70981	0 %	0 %	50 %	50 %	322835187
1246	NC_015062	TAA	2	6	71012	71017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835187
1247	NC_015062	TC	3	6	71153	71158	0 %	50 %	0 %	50 %	322835187
1248	NC_015062	TGTT	2	8	71199	71206	0 %	75 %	25 %	0 %	322835187
1249	NC_015062	GCC	2	6	71288	71293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835187
1250	NC_015062	TACCGT	2	12	71314	71325	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322835187
1251	NC_015062	ATG	2	6	71437	71442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835187
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1253	NC_015062	GTA	2	6	71508	71513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835187
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1260	NC_015062	GTACCG	2	12	72054	72065	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322835187
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