MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 11016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_015062	CCA	2	6	587932	587937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835697
10502	NC_015062	TCA	2	6	587962	587967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835697
10503	NC_015062	CAGCAA	2	12	588005	588016	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	322835697
10504	NC_015062	CCG	2	6	588036	588041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835697
10505	NC_015062	AAC	3	9	588134	588142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835697
10506	NC_015062	GAGG	2	8	588389	588396	25 %	0 %	75 %	0 %	322835698
10507	NC_015062	ATA	2	6	588417	588422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835698
10508	NC_015062	GCG	2	6	588438	588443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835698
10509	NC_015062	TGC	2	6	588475	588480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835698
10510	NC_015062	CGA	2	6	588481	588486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835698
10511	NC_015062	CGG	2	6	588498	588503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835698
10512	NC_015062	GAA	2	6	588519	588524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835698
10513	NC_015062	GCA	2	6	588538	588543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835698
10514	NC_015062	CTGC	2	8	588675	588682	0 %	25 %	25 %	50 %	322835698
10515	NC_015062	CGC	2	6	588719	588724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835698
10516	NC_015062	GAC	2	6	588793	588798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835698
10517	NC_015062	A	6	6	588827	588832	100 %	0 %	0 %	0 %	322835698
10518	NC_015062	CCA	2	6	588835	588840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835698
10519	NC_015062	CAA	2	6	588944	588949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835699
10520	NC_015062	CAA	2	6	588989	588994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835699
10521	NC_015062	AGC	2	6	589075	589080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835699
10522	NC_015062	TCA	2	6	589205	589210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835699
10523	NC_015062	GGT	2	6	589229	589234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835699
10524	NC_015062	AAT	2	6	589299	589304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835699
10525	NC_015062	TTC	2	6	589305	589310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835699
10526	NC_015062	TGA	2	6	589333	589338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835699
10527	NC_015062	GCC	2	6	589456	589461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835699
10528	NC_015062	CCA	2	6	589529	589534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835699
10529	NC_015062	GAT	2	6	589563	589568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835699
10530	NC_015062	AGTC	2	8	589583	589590	25 %	25 %	25 %	25 %	322835699
10531	NC_015062	CAA	2	6	589696	589701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835700
10532	NC_015062	GCC	2	6	589722	589727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835700
10533	NC_015062	GATA	2	8	589733	589740	50 %	25 %	25 %	0 %	322835700
10534	NC_015062	TGA	2	6	589765	589770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835700
10535	NC_015062	CTG	2	6	589790	589795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835700
10536	NC_015062	TGC	2	6	590382	590387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835701
10537	NC_015062	GC	4	8	590447	590454	0 %	0 %	50 %	50 %	322835701
10538	NC_015062	ACG	2	6	590510	590515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835701
10539	NC_015062	CTG	2	6	591193	591198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835702
10540	NC_015062	ACG	2	6	591270	591275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835702
10541	NC_015062	TAT	2	6	591324	591329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835702
10542	NC_015062	TGC	2	6	591339	591344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835702
10543	NC_015062	TGGC	2	8	591354	591361	0 %	25 %	50 %	25 %	322835702
10544	NC_015062	TGG	2	6	591368	591373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835702
10545	NC_015062	GCA	2	6	591446	591451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835702
10546	NC_015062	GTA	2	6	591457	591462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835702
10547	NC_015062	CGC	2	6	591463	591468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835702
10548	NC_015062	GC	3	6	591533	591538	0 %	0 %	50 %	50 %	322835702
10549	NC_015062	AGC	2	6	591567	591572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835702
10550	NC_015062	CTTC	2	8	591679	591686	0 %	50 %	0 %	50 %	322835702
10551	NC_015062	GCG	2	6	591749	591754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835702
10552	NC_015062	CTG	2	6	591775	591780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835702
10553	NC_015062	GAA	2	6	591849	591854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835702
10554	NC_015062	GCGTT	2	10	591859	591868	0 %	40 %	40 %	20 %	322835702
10555	NC_015062	CGGG	2	8	591879	591886	0 %	0 %	75 %	25 %	322835702
10556	NC_015062	ACG	2	6	591973	591978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835703
10557	NC_015062	TCT	2	6	592041	592046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835703
10558	NC_015062	CG	3	6	592081	592086	0 %	0 %	50 %	50 %	322835703
10559	NC_015062	CGG	2	6	592093	592098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835703
10560	NC_015062	TAA	2	6	592139	592144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835703
10561	NC_015062	GGT	2	6	592157	592162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835703
10562	NC_015062	CAGC	2	8	592198	592205	25 %	0 %	25 %	50 %	322835703
10563	NC_015062	GC	3	6	592226	592231	0 %	0 %	50 %	50 %	322835703
10564	NC_015062	GTT	2	6	592277	592282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835703
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10566	NC_015062	GAT	2	6	592435	592440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835703
10567	NC_015062	GAT	2	6	592463	592468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835703
10568	NC_015062	TGGT	2	8	592513	592520	0 %	50 %	50 %	0 %	322835703
10569	NC_015062	ATG	2	6	592526	592531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835703
10570	NC_015062	CAC	2	6	592532	592537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835703
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10572	NC_015062	CCA	2	6	592660	592665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835703
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10574	NC_015062	CCA	2	6	592708	592713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835703
10575	NC_015062	GAT	2	6	592721	592726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835703
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10578	NC_015062	ATC	2	6	592856	592861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835703
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10581	NC_015062	TCG	2	6	593046	593051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835703
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10584	NC_015062	CGG	2	6	593304	593309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835703
10585	NC_015062	TA	3	6	593310	593315	50 %	50 %	0 %	0 %	322835703
10586	NC_015062	GCA	2	6	593365	593370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835703
10587	NC_015062	TTC	2	6	593372	593377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835703
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10591	NC_015062	T	7	7	593642	593648	0 %	100 %	0 %	0 %	322835703
10592	NC_015062	CAT	2	6	593651	593656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835703
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10594	NC_015062	TAT	2	6	594190	594195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835704
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10601	NC_015062	CTGG	2	8	594716	594723	0 %	25 %	50 %	25 %	322835704
10602	NC_015062	TGT	2	6	594741	594746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835704
10603	NC_015062	TCG	2	6	594749	594754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835704
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10855	NC_015062	GCCC	2	8	607758	607765	0 %	0 %	25 %	75 %	322835714
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10858	NC_015062	CAGA	2	8	608013	608020	50 %	0 %	25 %	25 %	322835715
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10977	NC_015062	TCA	2	6	614711	614716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835719
10978	NC_015062	ACCC	2	8	614838	614845	25 %	0 %	0 %	75 %	322835720
10979	NC_015062	TTC	2	6	614875	614880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835720
10980	NC_015062	ACA	2	6	614885	614890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835720
10981	NC_015062	ATC	2	6	614971	614976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835720
10982	NC_015062	TGC	2	6	615002	615007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835720
10983	NC_015062	ATG	2	6	615052	615057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835720
10984	NC_015062	AG	3	6	615060	615065	50 %	0 %	50 %	0 %	322835720
10985	NC_015062	GCGT	2	8	615145	615152	0 %	25 %	50 %	25 %	322835720
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10988	NC_015062	GC	3	6	615221	615226	0 %	0 %	50 %	50 %	322835720
10989	NC_015062	GCA	2	6	615230	615235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835720
10990	NC_015062	ATG	2	6	615250	615255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835720
10991	NC_015062	ATA	2	6	615271	615276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835720
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10999	NC_015062	GACG	2	8	615522	615529	25 %	0 %	50 %	25 %	322835720
11000	NC_015062	GAA	2	6	615552	615557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835720

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