MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 11016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015062	GA	3	6	25751	25756	50 %	0 %	50 %	0 %	322835147
502	NC_015062	GAT	2	6	25786	25791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835147
503	NC_015062	AGC	2	6	25823	25828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835147
504	NC_015062	CAG	2	6	25858	25863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835147
505	NC_015062	CCG	2	6	25907	25912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835147
506	NC_015062	TAAA	2	8	25932	25939	75 %	25 %	0 %	0 %	322835147
507	NC_015062	TCA	2	6	26383	26388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835148
508	NC_015062	TGCAC	2	10	26609	26618	20 %	20 %	20 %	40 %	322835148
509	NC_015062	CAG	3	9	26652	26660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835148
510	NC_015062	AAC	2	6	26671	26676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835148
511	NC_015062	GCC	2	6	26742	26747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835148
512	NC_015062	TCC	2	6	26759	26764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835148
513	NC_015062	AGC	2	6	26803	26808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835148
514	NC_015062	TCC	2	6	26812	26817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835148
515	NC_015062	CAC	2	6	26874	26879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835148
516	NC_015062	CAG	2	6	27104	27109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835148
517	NC_015062	GCAC	2	8	27206	27213	25 %	0 %	25 %	50 %	322835148
518	NC_015062	AGA	2	6	27223	27228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835148
519	NC_015062	T	7	7	27254	27260	0 %	100 %	0 %	0 %	322835148
520	NC_015062	TTC	2	6	27267	27272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835148
521	NC_015062	TGA	2	6	27621	27626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835149
522	NC_015062	ATT	2	6	27629	27634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835149
523	NC_015062	ACT	2	6	27635	27640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835149
524	NC_015062	ACC	2	6	27698	27703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835149
525	NC_015062	CTA	2	6	27715	27720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835149
526	NC_015062	A	6	6	27724	27729	100 %	0 %	0 %	0 %	322835149
527	NC_015062	GCT	2	6	27754	27759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835149
528	NC_015062	CCA	2	6	27764	27769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835149
529	NC_015062	T	6	6	27790	27795	0 %	100 %	0 %	0 %	322835149
530	NC_015062	GTC	2	6	27822	27827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835149
531	NC_015062	TGC	2	6	27828	27833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835149
532	NC_015062	GGC	2	6	27856	27861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835149
533	NC_015062	AGA	2	6	27862	27867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835149
534	NC_015062	GTG	2	6	27885	27890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835149
535	NC_015062	CTG	2	6	27959	27964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835149
536	NC_015062	ACC	2	6	28067	28072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835149
537	NC_015062	CG	3	6	28255	28260	0 %	0 %	50 %	50 %	322835149
538	NC_015062	TCG	2	6	28263	28268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835149
539	NC_015062	AGT	2	6	28276	28281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835149
540	NC_015062	AGA	2	6	28333	28338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835149
541	NC_015062	AGC	2	6	28347	28352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835149
542	NC_015062	ACT	2	6	28573	28578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835150
543	NC_015062	TCA	2	6	28693	28698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835150
544	NC_015062	CCA	2	6	28758	28763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835150
545	NC_015062	GGA	2	6	28819	28824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322835150
546	NC_015062	GCGT	2	8	28851	28858	0 %	25 %	50 %	25 %	322835150
547	NC_015062	GAT	2	6	29032	29037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835151
548	NC_015062	CA	3	6	29141	29146	50 %	0 %	0 %	50 %	322835151
549	NC_015062	TTG	2	6	29205	29210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835151
550	NC_015062	GAT	2	6	29321	29326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835151
551	NC_015062	GTT	2	6	29455	29460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835151
552	NC_015062	TTTTTA	2	12	29578	29589	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	322835152
553	NC_015062	TAC	2	6	29595	29600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835152
554	NC_015062	CTG	2	6	29601	29606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835152
555	NC_015062	GGCT	2	8	29619	29626	0 %	25 %	50 %	25 %	322835152
556	NC_015062	GATT	2	8	29627	29634	25 %	50 %	25 %	0 %	322835152
557	NC_015062	ATT	2	6	29665	29670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835152
558	NC_015062	TGA	2	6	29680	29685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835152
559	NC_015062	C	7	7	29701	29707	0 %	0 %	0 %	100 %	322835152
560	NC_015062	GAT	2	6	29724	29729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835152
561	NC_015062	TTG	2	6	29772	29777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835152
562	NC_015062	AGGC	2	8	29806	29813	25 %	0 %	50 %	25 %	322835152
563	NC_015062	TTAT	2	8	29898	29905	25 %	75 %	0 %	0 %	322835153
564	NC_015062	GTT	2	6	29933	29938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835153
565	NC_015062	TCA	2	6	30019	30024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835153
566	NC_015062	CTG	2	6	30090	30095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835153
567	NC_015062	CAC	2	6	30096	30101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835153
568	NC_015062	TTGA	2	8	30108	30115	25 %	50 %	25 %	0 %	322835153
569	NC_015062	GC	3	6	30119	30124	0 %	0 %	50 %	50 %	322835153
570	NC_015062	GCCC	2	8	30245	30252	0 %	0 %	25 %	75 %	322835153
571	NC_015062	CCG	2	6	30259	30264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835153
572	NC_015062	AAT	2	6	30270	30275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835153
573	NC_015062	CGCTT	2	10	30336	30345	0 %	40 %	20 %	40 %	322835153
574	NC_015062	ACC	2	6	30433	30438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835153
575	NC_015062	CAG	2	6	30477	30482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835153
576	NC_015062	GC	3	6	30496	30501	0 %	0 %	50 %	50 %	322835153
577	NC_015062	AAT	2	6	30504	30509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835153
578	NC_015062	CGT	2	6	30539	30544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835153
579	NC_015062	TCG	2	6	30574	30579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835153
580	NC_015062	CA	3	6	30586	30591	50 %	0 %	0 %	50 %	322835153
581	NC_015062	GAC	2	6	30656	30661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835153
582	NC_015062	CCA	2	6	30665	30670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835153
583	NC_015062	GCACC	2	10	30686	30695	20 %	0 %	20 %	60 %	322835153
584	NC_015062	GCC	2	6	30696	30701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835153
585	NC_015062	CAC	2	6	30711	30716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835153
586	NC_015062	GCC	2	6	30729	30734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835153
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588	NC_015062	AC	3	6	30785	30790	50 %	0 %	0 %	50 %	322835153
589	NC_015062	GTT	2	6	30881	30886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835153
590	NC_015062	GCG	2	6	30887	30892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835153
591	NC_015062	GAA	2	6	30928	30933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835153
592	NC_015062	AGT	2	6	30935	30940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835153
593	NC_015062	CGT	2	6	31218	31223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835154
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595	NC_015062	ACA	2	6	31350	31355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835154
596	NC_015062	ACG	2	6	31482	31487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835154
597	NC_015062	TAT	2	6	31489	31494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835154
598	NC_015062	CCG	2	6	31578	31583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835154
599	NC_015062	CCG	2	6	31715	31720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835154
600	NC_015062	CGT	2	6	31727	31732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835154
601	NC_015062	A	6	6	31745	31750	100 %	0 %	0 %	0 %	322835154
602	NC_015062	GCC	2	6	31757	31762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835154
603	NC_015062	TCGG	2	8	31787	31794	0 %	25 %	50 %	25 %	322835154
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605	NC_015062	GC	3	6	31839	31844	0 %	0 %	50 %	50 %	322835154
606	NC_015062	TCAG	2	8	31902	31909	25 %	25 %	25 %	25 %	322835154
607	NC_015062	TGCG	2	8	31995	32002	0 %	25 %	50 %	25 %	322835154
608	NC_015062	A	6	6	32094	32099	100 %	0 %	0 %	0 %	322835154
609	NC_015062	TGA	2	6	32215	32220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835154
610	NC_015062	AGCAC	2	10	32251	32260	40 %	0 %	20 %	40 %	322835154
611	NC_015062	A	6	6	32261	32266	100 %	0 %	0 %	0 %	322835154
612	NC_015062	TC	3	6	32291	32296	0 %	50 %	0 %	50 %	322835155
613	NC_015062	GGC	2	6	32476	32481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835155
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618	NC_015062	TGAT	2	8	32772	32779	25 %	50 %	25 %	0 %	322835155
619	NC_015062	TGG	2	6	32849	32854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835155
620	NC_015062	GC	3	6	33003	33008	0 %	0 %	50 %	50 %	322835155
621	NC_015062	GGC	3	9	33047	33055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835155
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624	NC_015062	CCGG	2	8	33268	33275	0 %	0 %	50 %	50 %	322835155
625	NC_015062	GAAA	2	8	33361	33368	75 %	0 %	25 %	0 %	322835155
626	NC_015062	ATG	2	6	33401	33406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835155
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756	NC_015062	GAC	2	6	41240	41245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835162
757	NC_015062	CTGC	2	8	41264	41271	0 %	25 %	25 %	50 %	322835162
758	NC_015062	TGA	2	6	41319	41324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835162
759	NC_015062	CTG	2	6	41342	41347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835162
760	NC_015062	GCGCA	2	10	41378	41387	20 %	0 %	40 %	40 %	322835162
761	NC_015062	TGC	2	6	41394	41399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835162
762	NC_015062	ATT	2	6	41429	41434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835162
763	NC_015062	CCG	3	9	41479	41487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835162
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765	NC_015062	AGC	2	6	41576	41581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835162
766	NC_015062	GTGCCG	2	12	41582	41593	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322835162
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768	NC_015062	T	6	6	41687	41692	0 %	100 %	0 %	0 %	322835162
769	NC_015062	CGA	2	6	41725	41730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835162
770	NC_015062	CGG	3	9	41773	41781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835162
771	NC_015062	GAC	2	6	41782	41787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835162
772	NC_015062	AAT	2	6	41831	41836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835162
773	NC_015062	GGCG	2	8	41881	41888	0 %	0 %	75 %	25 %	322835162
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775	NC_015062	GCG	2	6	41939	41944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835162
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777	NC_015062	TGA	2	6	41979	41984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835162
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779	NC_015062	CGG	2	6	42222	42227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835162
780	NC_015062	TCT	2	6	42235	42240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835162
781	NC_015062	TG	3	6	42327	42332	0 %	50 %	50 %	0 %	322835162
782	NC_015062	GTG	2	6	42335	42340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835162
783	NC_015062	TGC	2	6	42363	42368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835162
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786	NC_015062	CTGA	2	8	42653	42660	25 %	25 %	25 %	25 %	322835162
787	NC_015062	GGCC	2	8	42783	42790	0 %	0 %	50 %	50 %	322835162
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789	NC_015062	TGC	2	6	42855	42860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835162
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793	NC_015062	CCT	2	6	42953	42958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835162
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820	NC_015062	CCG	2	6	44298	44303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835163
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879	NC_015062	TGT	2	6	47531	47536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835166
880	NC_015062	GGC	2	6	47548	47553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835166
881	NC_015062	GCG	2	6	47637	47642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835166
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883	NC_015062	CTT	2	6	47664	47669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835166
884	NC_015062	CAT	2	6	47721	47726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835166
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1000	NC_015062	TTC	2	6	54424	54429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835171

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