MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 11016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015062	ATG	2	6	310573	310578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835423
5502	NC_015062	TCC	2	6	310616	310621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322835423
5503	NC_015062	CGG	2	6	310700	310705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835423
5504	NC_015062	GC	3	6	310750	310755	0 %	0 %	50 %	50 %	322835423
5505	NC_015062	CTGA	2	8	310812	310819	25 %	25 %	25 %	25 %	322835423
5506	NC_015062	GC	4	8	310868	310875	0 %	0 %	50 %	50 %	322835423
5507	NC_015062	GAA	2	6	310878	310883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835423
5508	NC_015062	CGG	2	6	310906	310911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835423
5509	NC_015062	GC	3	6	310976	310981	0 %	0 %	50 %	50 %	322835423
5510	NC_015062	GTGC	2	8	310992	310999	0 %	25 %	50 %	25 %	322835423
5511	NC_015062	ATT	2	6	311009	311014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835423
5512	NC_015062	CAGC	2	8	311054	311061	25 %	0 %	25 %	50 %	322835423
5513	NC_015062	GCC	2	6	311179	311184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835423
5514	NC_015062	CGG	2	6	311207	311212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835423
5515	NC_015062	GCCGC	2	10	311227	311236	0 %	0 %	40 %	60 %	322835423
5516	NC_015062	CGT	2	6	311259	311264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835423
5517	NC_015062	GCA	2	6	311273	311278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835423
5518	NC_015062	GCG	2	6	311359	311364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835423
5519	NC_015062	GTTT	2	8	311368	311375	0 %	75 %	25 %	0 %	322835423
5520	NC_015062	GGC	2	6	311426	311431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835423
5521	NC_015062	CGG	2	6	311485	311490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835423
5522	NC_015062	CGCC	2	8	311508	311515	0 %	0 %	25 %	75 %	322835423
5523	NC_015062	TGC	2	6	311548	311553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835423
5524	NC_015062	GTA	2	6	311888	311893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835424
5525	NC_015062	TTAC	2	8	311903	311910	25 %	50 %	0 %	25 %	322835424
5526	NC_015062	TGG	2	6	311935	311940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835424
5527	NC_015062	TTA	2	6	311955	311960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835424
5528	NC_015062	TAA	2	6	312010	312015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835424
5529	NC_015062	CAG	2	6	312069	312074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835424
5530	NC_015062	ATA	2	6	312210	312215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835424
5531	NC_015062	TAAA	2	8	312228	312235	75 %	25 %	0 %	0 %	322835424
5532	NC_015062	GT	3	6	312236	312241	0 %	50 %	50 %	0 %	322835424
5533	NC_015062	TGA	2	6	312274	312279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835424
5534	NC_015062	CAT	2	6	312286	312291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835424
5535	NC_015062	ATTA	2	8	312415	312422	50 %	50 %	0 %	0 %	322835424
5536	NC_015062	TTA	2	6	312441	312446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835424
5537	NC_015062	AGG	2	6	312469	312474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322835424
5538	NC_015062	AAT	2	6	312584	312589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835424
5539	NC_015062	TTG	2	6	312723	312728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835424
5540	NC_015062	ATT	2	6	312787	312792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835424
5541	NC_015062	TGA	2	6	312835	312840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835424
5542	NC_015062	TTTATC	2	12	312841	312852	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	322835424
5543	NC_015062	AGTA	2	8	312853	312860	50 %	25 %	25 %	0 %	322835424
5544	NC_015062	TC	3	6	312867	312872	0 %	50 %	0 %	50 %	322835424
5545	NC_015062	GTT	2	6	312959	312964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835424
5546	NC_015062	TCT	2	6	313182	313187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835425
5547	NC_015062	GCT	2	6	313441	313446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835425
5548	NC_015062	GCT	2	6	313514	313519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835425
5549	NC_015062	TTCCAG	2	12	313537	313548	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322835425
5550	NC_015062	GGC	2	6	313731	313736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835425
5551	NC_015062	GCT	2	6	313771	313776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835425
5552	NC_015062	ACA	2	6	313884	313889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835425
5553	NC_015062	GGC	2	6	314126	314131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835426
5554	NC_015062	AGA	2	6	314137	314142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835426
5555	NC_015062	CAG	3	9	314273	314281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835426
5556	NC_015062	CTG	2	6	314306	314311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835426
5557	NC_015062	AGC	2	6	314418	314423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835426
5558	NC_015062	CAG	3	9	314450	314458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835426
5559	NC_015062	AGC	2	6	314481	314486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835426
5560	NC_015062	ATG	2	6	314487	314492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835426
5561	NC_015062	GTT	2	6	314620	314625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835426
5562	NC_015062	GCA	2	6	314626	314631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835426
5563	NC_015062	TCT	2	6	314683	314688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835426
5564	NC_015062	GGC	2	6	314689	314694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835426
5565	NC_015062	CTGC	2	8	314757	314764	0 %	25 %	25 %	50 %	322835426
5566	NC_015062	CAGG	2	8	314836	314843	25 %	0 %	50 %	25 %	322835426
5567	NC_015062	ACC	2	6	314865	314870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835426
5568	NC_015062	GGT	2	6	314906	314911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835426
5569	NC_015062	ATC	2	6	314976	314981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835426
5570	NC_015062	TGTAA	2	10	314988	314997	40 %	40 %	20 %	0 %	322835426
5571	NC_015062	GCG	2	6	315008	315013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835426
5572	NC_015062	ACG	2	6	315108	315113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835426
5573	NC_015062	GTT	2	6	315264	315269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835426
5574	NC_015062	TCGG	2	8	315390	315397	0 %	25 %	50 %	25 %	322835426
5575	NC_015062	CGC	2	6	315410	315415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835426
5576	NC_015062	ATC	2	6	315416	315421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835426
5577	NC_015062	TCAC	2	8	315444	315451	25 %	25 %	0 %	50 %	322835426
5578	NC_015062	AAAT	2	8	315805	315812	75 %	25 %	0 %	0 %	322835427
5579	NC_015062	CAG	2	6	315856	315861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835427
5580	NC_015062	TGG	2	6	315864	315869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835427
5581	NC_015062	TCT	2	6	315917	315922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835427
5582	NC_015062	GTG	2	6	315959	315964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835427
5583	NC_015062	GTA	2	6	315972	315977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835427
5584	NC_015062	ATC	2	6	316128	316133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835427
5585	NC_015062	CGA	2	6	316212	316217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835427
5586	NC_015062	GCG	2	6	316299	316304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835427
5587	NC_015062	CCG	2	6	316330	316335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835427
5588	NC_015062	CGG	2	6	316351	316356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835427
5589	NC_015062	CGG	3	9	316395	316403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835427
5590	NC_015062	ACGGC	2	10	316419	316428	20 %	0 %	40 %	40 %	322835427
5591	NC_015062	CGC	2	6	316464	316469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835427
5592	NC_015062	CAG	2	6	316532	316537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835427
5593	NC_015062	CTT	2	6	316593	316598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835427
5594	NC_015062	GAT	2	6	316657	316662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835427
5595	NC_015062	TGA	2	6	316726	316731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835427
5596	NC_015062	GCC	2	6	316753	316758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835427
5597	NC_015062	A	7	7	316805	316811	100 %	0 %	0 %	0 %	322835427
5598	NC_015062	CCG	2	6	316858	316863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835427
5599	NC_015062	AG	3	6	316871	316876	50 %	0 %	50 %	0 %	322835427
5600	NC_015062	CAA	2	6	316881	316886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835427
5601	NC_015062	CG	4	8	316948	316955	0 %	0 %	50 %	50 %	322835427
5602	NC_015062	GCT	2	6	316963	316968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835427
5603	NC_015062	CCA	2	6	316971	316976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835427
5604	NC_015062	GGGC	2	8	317007	317014	0 %	0 %	75 %	25 %	322835427
5605	NC_015062	CGG	2	6	317020	317025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835427
5606	NC_015062	CAC	2	6	317044	317049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835427
5607	NC_015062	A	6	6	317082	317087	100 %	0 %	0 %	0 %	322835427
5608	NC_015062	TGA	2	6	317094	317099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835427
5609	NC_015062	CGG	2	6	317155	317160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835427
5610	NC_015062	TC	4	8	317193	317200	0 %	50 %	0 %	50 %	322835427
5611	NC_015062	TTG	2	6	317283	317288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835427
5612	NC_015062	CTG	3	9	317330	317338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835427
5613	NC_015062	TGT	2	6	317403	317408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835427
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5615	NC_015062	TCAG	2	8	317499	317506	25 %	25 %	25 %	25 %	322835427
5616	NC_015062	AGG	2	6	317568	317573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322835427
5617	NC_015062	CCG	2	6	317605	317610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835427
5618	NC_015062	GC	3	6	317625	317630	0 %	0 %	50 %	50 %	322835427
5619	NC_015062	ATA	2	6	317649	317654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835427
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5621	NC_015062	CGTA	2	8	317953	317960	25 %	25 %	25 %	25 %	322835427
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5983	NC_015062	CAT	2	6	337749	337754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835450
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5985	NC_015062	CAG	2	6	337974	337979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835450
5986	NC_015062	TTA	2	6	338001	338006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835450
5987	NC_015062	TGC	2	6	338008	338013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835450
5988	NC_015062	CTGGA	2	10	338070	338079	20 %	20 %	40 %	20 %	322835450
5989	NC_015062	ATG	2	6	338092	338097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835450
5990	NC_015062	ACA	2	6	338168	338173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835450
5991	NC_015062	GC	3	6	338223	338228	0 %	0 %	50 %	50 %	322835450
5992	NC_015062	TGC	2	6	338233	338238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835450
5993	NC_015062	TCAGTA	2	12	338351	338362	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	322835450
5994	NC_015062	CGG	2	6	338612	338617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835451
5995	NC_015062	CAG	2	6	338680	338685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835451
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5998	NC_015062	GCG	2	6	338758	338763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835451
5999	NC_015062	ATT	2	6	338823	338828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835451
6000	NC_015062	GGC	2	6	338835	338840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835451

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