MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 plasmid pRAHAQ01

Total Repeats: 11016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015062	GGC	2	6	254510	254515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835376
4502	NC_015062	CAC	2	6	254529	254534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835376
4503	NC_015062	CCGC	2	8	254585	254592	0 %	0 %	25 %	75 %	322835376
4504	NC_015062	GCT	2	6	254595	254600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835376
4505	NC_015062	GCA	2	6	254619	254624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835376
4506	NC_015062	CTGC	2	8	254643	254650	0 %	25 %	25 %	50 %	322835376
4507	NC_015062	TG	4	8	254663	254670	0 %	50 %	50 %	0 %	322835376
4508	NC_015062	T	6	6	254680	254685	0 %	100 %	0 %	0 %	322835376
4509	NC_015062	ATCT	2	8	254740	254747	25 %	50 %	0 %	25 %	322835376
4510	NC_015062	CGC	2	6	254760	254765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835376
4511	NC_015062	GGC	2	6	254866	254871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835376
4512	NC_015062	GC	3	6	254915	254920	0 %	0 %	50 %	50 %	322835376
4513	NC_015062	GA	3	6	254935	254940	50 %	0 %	50 %	0 %	322835376
4514	NC_015062	TCT	2	6	254949	254954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835376
4515	NC_015062	GCC	2	6	254968	254973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835376
4516	NC_015062	GCA	2	6	255024	255029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835376
4517	NC_015062	T	6	6	255133	255138	0 %	100 %	0 %	0 %	322835376
4518	NC_015062	GTG	2	6	255163	255168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835376
4519	NC_015062	GTG	2	6	255175	255180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835376
4520	NC_015062	CGG	2	6	255185	255190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835376
4521	NC_015062	GCC	2	6	255232	255237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835376
4522	NC_015062	T	6	6	255306	255311	0 %	100 %	0 %	0 %	322835376
4523	NC_015062	TG	3	6	255337	255342	0 %	50 %	50 %	0 %	322835376
4524	NC_015062	CGG	2	6	255374	255379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835376
4525	NC_015062	TCGC	2	8	255409	255416	0 %	25 %	25 %	50 %	322835376
4526	NC_015062	GCC	2	6	255433	255438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835376
4527	NC_015062	CG	3	6	255470	255475	0 %	0 %	50 %	50 %	322835376
4528	NC_015062	ATT	2	6	255607	255612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835377
4529	NC_015062	GGC	2	6	255686	255691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835377
4530	NC_015062	GGT	2	6	255709	255714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835377
4531	NC_015062	GCG	2	6	255719	255724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835377
4532	NC_015062	GGC	2	6	255727	255732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835377
4533	NC_015062	GCAG	2	8	255758	255765	25 %	0 %	50 %	25 %	322835377
4534	NC_015062	GTG	2	6	255767	255772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835377
4535	NC_015062	GAA	2	6	255803	255808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835377
4536	NC_015062	TCG	2	6	255816	255821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835377
4537	NC_015062	TGGCG	2	10	255844	255853	0 %	20 %	60 %	20 %	322835377
4538	NC_015062	ACA	2	6	255913	255918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835377
4539	NC_015062	T	6	6	255924	255929	0 %	100 %	0 %	0 %	322835377
4540	NC_015062	CTGC	2	8	255992	255999	0 %	25 %	25 %	50 %	322835377
4541	NC_015062	ACC	2	6	256067	256072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835377
4542	NC_015062	ATTT	2	8	256086	256093	25 %	75 %	0 %	0 %	322835377
4543	NC_015062	TGG	2	6	256158	256163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835377
4544	NC_015062	GCG	2	6	256172	256177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835377
4545	NC_015062	TGC	2	6	256236	256241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835377
4546	NC_015062	AGC	2	6	256255	256260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835377
4547	NC_015062	GAA	2	6	256375	256380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835377
4548	NC_015062	AC	3	6	256389	256394	50 %	0 %	0 %	50 %	322835377
4549	NC_015062	CAGG	2	8	256477	256484	25 %	0 %	50 %	25 %	322835377
4550	NC_015062	TCAA	2	8	256528	256535	50 %	25 %	0 %	25 %	322835377
4551	NC_015062	GAA	2	6	256541	256546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835377
4552	NC_015062	ATG	2	6	256589	256594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835378
4553	NC_015062	A	7	7	256595	256601	100 %	0 %	0 %	0 %	322835378
4554	NC_015062	CGC	2	6	256651	256656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835378
4555	NC_015062	A	6	6	256659	256664	100 %	0 %	0 %	0 %	322835378
4556	NC_015062	TGG	2	6	256746	256751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835378
4557	NC_015062	CTG	2	6	256811	256816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835378
4558	NC_015062	ATG	2	6	256821	256826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835378
4559	NC_015062	CTGAA	2	10	257010	257019	40 %	20 %	20 %	20 %	322835378
4560	NC_015062	AAG	2	6	257051	257056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322835378
4561	NC_015062	CGG	2	6	257070	257075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835378
4562	NC_015062	CGT	2	6	257347	257352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835379
4563	NC_015062	TCT	2	6	257385	257390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835379
4564	NC_015062	TGC	2	6	257424	257429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835379
4565	NC_015062	GCGA	2	8	257448	257455	25 %	0 %	50 %	25 %	322835379
4566	NC_015062	CTTC	2	8	257491	257498	0 %	50 %	0 %	50 %	322835379
4567	NC_015062	TCT	2	6	257541	257546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835379
4568	NC_015062	GCCA	2	8	257547	257554	25 %	0 %	25 %	50 %	322835379
4569	NC_015062	CTG	2	6	257555	257560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835379
4570	NC_015062	TCA	2	6	257562	257567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835379
4571	NC_015062	CGG	2	6	257580	257585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835379
4572	NC_015062	T	6	6	257594	257599	0 %	100 %	0 %	0 %	322835379
4573	NC_015062	CGC	2	6	257666	257671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835379
4574	NC_015062	CAGC	2	8	257801	257808	25 %	0 %	25 %	50 %	322835379
4575	NC_015062	CTG	2	6	257816	257821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835379
4576	NC_015062	GCA	2	6	257824	257829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835379
4577	NC_015062	TTCAG	2	10	257886	257895	20 %	40 %	20 %	20 %	322835379
4578	NC_015062	TGG	2	6	258032	258037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322835380
4579	NC_015062	AACA	2	8	258048	258055	75 %	0 %	0 %	25 %	322835380
4580	NC_015062	ACAG	2	8	258104	258111	50 %	0 %	25 %	25 %	322835380
4581	NC_015062	TCT	2	6	258118	258123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835380
4582	NC_015062	AC	3	6	258135	258140	50 %	0 %	0 %	50 %	322835380
4583	NC_015062	GCG	2	6	258233	258238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835380
4584	NC_015062	ACA	2	6	258272	258277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835380
4585	NC_015062	GGC	2	6	258297	258302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835380
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4587	NC_015062	CTG	2	6	258355	258360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835380
4588	NC_015062	CGG	2	6	258385	258390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835380
4589	NC_015062	GGC	2	6	258440	258445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835380
4590	NC_015062	TGC	2	6	258451	258456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835380
4591	NC_015062	GCA	2	6	258521	258526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835380
4592	NC_015062	TTC	2	6	258546	258551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835380
4593	NC_015062	GCA	2	6	258557	258562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835380
4594	NC_015062	GTC	2	6	258564	258569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835380
4595	NC_015062	CCA	2	6	258608	258613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322835380
4596	NC_015062	CAA	2	6	258696	258701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835380
4597	NC_015062	CAT	2	6	258776	258781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322835380
4598	NC_015062	GCA	2	6	258851	258856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835380
4599	NC_015062	TGC	2	6	258874	258879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835380
4600	NC_015062	TGGCGG	2	12	258880	258891	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	322835380
4601	NC_015062	AG	3	6	259103	259108	50 %	0 %	50 %	0 %	322835380
4602	NC_015062	CTG	2	6	259110	259115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835380
4603	NC_015062	CAG	3	9	259128	259136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835380
4604	NC_015062	CAA	2	6	259142	259147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835380
4605	NC_015062	C	6	6	259150	259155	0 %	0 %	0 %	100 %	322835380
4606	NC_015062	GTC	2	6	259239	259244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835381
4607	NC_015062	TTC	2	6	259333	259338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322835381
4608	NC_015062	TGT	2	6	259382	259387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322835381
4609	NC_015062	GGCA	2	8	259424	259431	25 %	0 %	50 %	25 %	322835381
4610	NC_015062	TAT	2	6	259452	259457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835381
4611	NC_015062	CGC	2	6	259473	259478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835381
4612	NC_015062	ATA	2	6	259554	259559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322835381
4613	NC_015062	GGTTTA	2	12	259562	259573	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	322835381
4614	NC_015062	GCG	2	6	259644	259649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835381
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4616	NC_015062	ATG	2	6	259745	259750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835381
4617	NC_015062	TG	3	6	259757	259762	0 %	50 %	50 %	0 %	322835381
4618	NC_015062	TGA	2	6	259774	259779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835381
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4620	NC_015062	CTG	2	6	259828	259833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835381
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4622	NC_015062	AAC	2	6	259961	259966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835381
4623	NC_015062	CAA	2	6	259995	260000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322835381
4624	NC_015062	CGG	2	6	260012	260017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835381
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4630	NC_015062	CCG	2	6	260307	260312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835381
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4635	NC_015062	CAG	2	6	260407	260412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835381
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4637	NC_015062	CGTCA	2	10	260527	260536	20 %	20 %	20 %	40 %	322835381
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4645	NC_015062	AGCATC	2	12	260893	260904	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322835382
4646	NC_015062	TTGA	2	8	260964	260971	25 %	50 %	25 %	0 %	322835382
4647	NC_015062	GCC	2	6	261004	261009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835382
4648	NC_015062	GACCA	2	10	261021	261030	40 %	0 %	20 %	40 %	322835382
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4653	NC_015062	GGCC	2	8	261265	261272	0 %	0 %	50 %	50 %	322835382
4654	NC_015062	ATGA	2	8	261273	261280	50 %	25 %	25 %	0 %	322835382
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4733	NC_015062	ATT	2	6	266133	266138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835386
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4741	NC_015062	T	7	7	266670	266676	0 %	100 %	0 %	0 %	322835386
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4987	NC_015062	CCG	3	9	278853	278861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835398
4988	NC_015062	ATG	2	6	278867	278872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322835398
4989	NC_015062	GACG	2	8	278948	278955	25 %	0 %	50 %	25 %	322835398
4990	NC_015062	CG	3	6	278967	278972	0 %	0 %	50 %	50 %	322835398
4991	NC_015062	CGA	2	6	279043	279048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835398
4992	NC_015062	GCG	2	6	279092	279097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322835398
4993	NC_015062	GCC	2	6	279127	279132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322835398
4994	NC_015062	ACG	2	6	279182	279187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835398
4995	NC_015062	ACG	2	6	279219	279224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322835398
4996	NC_015062	TGCCGT	2	12	279289	279300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322835398
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4999	NC_015062	TAT	2	6	279370	279375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322835398
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