MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015061	T	7	7	187191	187197	0 %	100 %	0 %	0 %	322830897
3502	NC_015061	CGC	2	6	187241	187246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830897
3503	NC_015061	CTG	2	6	187247	187252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830897
3504	NC_015061	GTT	2	6	187264	187269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830897
3505	NC_015061	GGCG	2	8	187273	187280	0 %	0 %	75 %	25 %	322830897
3506	NC_015061	TGT	2	6	187299	187304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830897
3507	NC_015061	AAT	2	6	187310	187315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830897
3508	NC_015061	CGG	2	6	187354	187359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830897
3509	NC_015061	GCG	2	6	187367	187372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830897
3510	NC_015061	GCGG	2	8	187487	187494	0 %	0 %	75 %	25 %	322830897
3511	NC_015061	CGGTGC	2	12	187516	187527	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322830897
3512	NC_015061	TGA	2	6	187545	187550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830897
3513	NC_015061	TGG	2	6	187580	187585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830897
3514	NC_015061	AGCC	2	8	187663	187670	25 %	0 %	25 %	50 %	322830897
3515	NC_015061	TGC	3	9	187686	187694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830897
3516	NC_015061	TGC	2	6	187761	187766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830897
3517	NC_015061	CCG	2	6	187773	187778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830897
3518	NC_015061	TGC	2	6	187836	187841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830897
3519	NC_015061	CCG	3	9	187899	187907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830897
3520	NC_015061	TGC	2	6	187914	187919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830897
3521	NC_015061	TGGC	2	8	187940	187947	0 %	25 %	50 %	25 %	322830897
3522	NC_015061	GTG	2	6	187949	187954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830897
3523	NC_015061	TGG	2	6	187959	187964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830897
3524	NC_015061	TGC	2	6	188022	188027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830897
3525	NC_015061	GGC	2	6	188086	188091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830897
3526	NC_015061	TTA	2	6	188144	188149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830897
3527	NC_015061	CGC	2	6	188173	188178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830897
3528	NC_015061	GGC	2	6	188190	188195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830897
3529	NC_015061	AGGCG	2	10	188209	188218	20 %	0 %	60 %	20 %	322830897
3530	NC_015061	GGT	2	6	188251	188256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830897
3531	NC_015061	TGA	2	6	188289	188294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830897
3532	NC_015061	AAG	2	6	188319	188324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830897
3533	NC_015061	GC	3	6	188366	188371	0 %	0 %	50 %	50 %	322830897
3534	NC_015061	TGG	2	6	188430	188435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830897
3535	NC_015061	TGG	2	6	188445	188450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830897
3536	NC_015061	GT	3	6	188484	188489	0 %	50 %	50 %	0 %	322830897
3537	NC_015061	ATGCCG	2	12	188493	188504	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322830897
3538	NC_015061	CAT	2	6	188558	188563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830897
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3540	NC_015061	CCA	2	6	188673	188678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830898
3541	NC_015061	CGG	2	6	188731	188736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830898
3542	NC_015061	GAC	2	6	188750	188755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830898
3543	NC_015061	G	6	6	188783	188788	0 %	0 %	100 %	0 %	322830898
3544	NC_015061	ACC	2	6	188932	188937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830898
3545	NC_015061	GCGAG	2	10	188984	188993	20 %	0 %	60 %	20 %	322830898
3546	NC_015061	GCG	2	6	189002	189007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830898
3547	NC_015061	CCAG	2	8	189026	189033	25 %	0 %	25 %	50 %	322830898
3548	NC_015061	TCAA	2	8	189190	189197	50 %	25 %	0 %	25 %	322830898
3549	NC_015061	AGC	2	6	189205	189210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830898
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3551	NC_015061	GCA	3	9	189305	189313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830898
3552	NC_015061	CG	3	6	189357	189362	0 %	0 %	50 %	50 %	322830898
3553	NC_015061	GGC	2	6	189453	189458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830898
3554	NC_015061	CAG	2	6	189501	189506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830898
3555	NC_015061	ATT	2	6	189526	189531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830898
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3557	NC_015061	GCTG	2	8	189749	189756	0 %	25 %	50 %	25 %	322830899
3558	NC_015061	CTAT	2	8	189833	189840	25 %	50 %	0 %	25 %	322830899
3559	NC_015061	GGC	2	6	189915	189920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830899
3560	NC_015061	AT	3	6	189948	189953	50 %	50 %	0 %	0 %	322830899
3561	NC_015061	T	6	6	190117	190122	0 %	100 %	0 %	0 %	322830900
3562	NC_015061	GCG	2	6	190184	190189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830900
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3564	NC_015061	CGA	2	6	190206	190211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830900
3565	NC_015061	CTG	2	6	190357	190362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830900
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3569	NC_015061	ATTT	2	8	190502	190509	25 %	75 %	0 %	0 %	322830900
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3573	NC_015061	CGTG	2	8	190615	190622	0 %	25 %	50 %	25 %	322830900
3574	NC_015061	GC	3	6	190690	190695	0 %	0 %	50 %	50 %	322830900
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3581	NC_015061	TAA	2	6	191237	191242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830901
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3588	NC_015061	CAGA	2	8	191918	191925	50 %	0 %	25 %	25 %	322830902
3589	NC_015061	CGA	2	6	191926	191931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830902
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3591	NC_015061	TAT	2	6	191972	191977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830902
3592	NC_015061	CGA	3	9	192023	192031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830902
3593	NC_015061	CAC	2	6	192180	192185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830902
3594	NC_015061	CCA	2	6	192239	192244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830902
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3602	NC_015061	T	6	6	192732	192737	0 %	100 %	0 %	0 %	322830902
3603	NC_015061	GCC	2	6	192765	192770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830902
3604	NC_015061	T	6	6	192798	192803	0 %	100 %	0 %	0 %	322830902
3605	NC_015061	TTGA	2	8	192823	192830	25 %	50 %	25 %	0 %	322830902
3606	NC_015061	CCG	2	6	192838	192843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830902
3607	NC_015061	GCC	3	9	192846	192854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830902
3608	NC_015061	TACT	2	8	193058	193065	25 %	50 %	0 %	25 %	322830903
3609	NC_015061	GTG	2	6	193086	193091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830903
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3613	NC_015061	CGG	2	6	193251	193256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830903
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3621	NC_015061	GAC	2	6	193649	193654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830903
3622	NC_015061	CGC	2	6	193664	193669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830903
3623	NC_015061	TTC	2	6	193673	193678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830903
3624	NC_015061	GC	3	6	193703	193708	0 %	0 %	50 %	50 %	322830903
3625	NC_015061	CGC	2	6	193747	193752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830903
3626	NC_015061	CTTTT	2	10	193802	193811	0 %	80 %	0 %	20 %	322830903
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3730	NC_015061	T	6	6	199100	199105	0 %	100 %	0 %	0 %	322830908
3731	NC_015061	TCTT	2	8	199113	199120	0 %	75 %	0 %	25 %	322830908
3732	NC_015061	CCG	2	6	199129	199134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830908
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3736	NC_015061	ATG	2	6	199329	199334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830908
3737	NC_015061	GAT	2	6	199397	199402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830908
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3739	NC_015061	ACC	2	6	199508	199513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830908
3740	NC_015061	AAG	2	6	199527	199532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830908
3741	NC_015061	AGAAC	2	10	199639	199648	60 %	0 %	20 %	20 %	322830908
3742	NC_015061	GCA	2	6	199708	199713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830908
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3744	NC_015061	GCA	2	6	200080	200085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830909
3745	NC_015061	CTG	3	9	200113	200121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830909
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3857	NC_015061	GC	3	6	206030	206035	0 %	0 %	50 %	50 %	322830914
3858	NC_015061	GCGG	2	8	206104	206111	0 %	0 %	75 %	25 %	322830914
3859	NC_015061	GC	3	6	206137	206142	0 %	0 %	50 %	50 %	322830914
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3866	NC_015061	GTCC	2	8	206458	206465	0 %	25 %	25 %	50 %	322830914
3867	NC_015061	GAT	2	6	206479	206484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830914
3868	NC_015061	CTG	2	6	206684	206689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830914
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