MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015061	CTG	2	6	160608	160613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830871
3002	NC_015061	GTC	2	6	160617	160622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830871
3003	NC_015061	CGC	2	6	160733	160738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830871
3004	NC_015061	CGC	2	6	160916	160921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830871
3005	NC_015061	AGC	2	6	161048	161053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830871
3006	NC_015061	CAT	2	6	161066	161071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830871
3007	NC_015061	CGA	2	6	161087	161092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830871
3008	NC_015061	ATC	2	6	161212	161217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830871
3009	NC_015061	TC	3	6	161416	161421	0 %	50 %	0 %	50 %	322830872
3010	NC_015061	GC	3	6	161660	161665	0 %	0 %	50 %	50 %	322830872
3011	NC_015061	TGC	2	6	161714	161719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830872
3012	NC_015061	A	6	6	161777	161782	100 %	0 %	0 %	0 %	322830872
3013	NC_015061	GGC	2	6	161808	161813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830872
3014	NC_015061	GATG	2	8	161814	161821	25 %	25 %	50 %	0 %	322830872
3015	NC_015061	GCA	2	6	161879	161884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830872
3016	NC_015061	GGC	2	6	162003	162008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830872
3017	NC_015061	TAA	2	6	162030	162035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830872
3018	NC_015061	GCC	2	6	162043	162048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830872
3019	NC_015061	GCGG	2	8	162055	162062	0 %	0 %	75 %	25 %	322830872
3020	NC_015061	GCC	2	6	162130	162135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830872
3021	NC_015061	GCA	2	6	162186	162191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830872
3022	NC_015061	GTT	2	6	162195	162200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830872
3023	NC_015061	TCAA	2	8	162247	162254	50 %	25 %	0 %	25 %	322830872
3024	NC_015061	CAG	2	6	162322	162327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830872
3025	NC_015061	CGC	2	6	162389	162394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830872
3026	NC_015061	CCGC	2	8	162437	162444	0 %	0 %	25 %	75 %	322830872
3027	NC_015061	GC	3	6	162443	162448	0 %	0 %	50 %	50 %	322830872
3028	NC_015061	GGC	2	6	162493	162498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830872
3029	NC_015061	GCA	2	6	162522	162527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830872
3030	NC_015061	CAG	2	6	162535	162540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830872
3031	NC_015061	GAC	2	6	162565	162570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830872
3032	NC_015061	AAT	2	6	162598	162603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830872
3033	NC_015061	ATT	2	6	162752	162757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830872
3034	NC_015061	ATA	2	6	162767	162772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830872
3035	NC_015061	GGC	3	9	162775	162783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830872
3036	NC_015061	CGG	3	9	162866	162874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830872
3037	NC_015061	GCT	2	6	162885	162890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830872
3038	NC_015061	GAC	2	6	162898	162903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830872
3039	NC_015061	CGC	2	6	162989	162994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830872
3040	NC_015061	CAA	2	6	163137	163142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830872
3041	NC_015061	ATGAC	2	10	163148	163157	40 %	20 %	20 %	20 %	322830872
3042	NC_015061	CTG	2	6	163162	163167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830872
3043	NC_015061	GCA	2	6	163218	163223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830872
3044	NC_015061	GCC	2	6	163284	163289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830872
3045	NC_015061	GCC	2	6	163336	163341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830872
3046	NC_015061	GCTG	2	8	163371	163378	0 %	25 %	50 %	25 %	322830872
3047	NC_015061	ATG	2	6	163379	163384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830872
3048	NC_015061	GGGC	2	8	163407	163414	0 %	0 %	75 %	25 %	322830872
3049	NC_015061	GGA	2	6	163548	163553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322830872
3050	NC_015061	GAT	2	6	163716	163721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830873
3051	NC_015061	TGC	2	6	163730	163735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830873
3052	NC_015061	GCTTT	2	10	163765	163774	0 %	60 %	20 %	20 %	322830873
3053	NC_015061	T	6	6	163798	163803	0 %	100 %	0 %	0 %	322830873
3054	NC_015061	GCC	2	6	163804	163809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830873
3055	NC_015061	GCCG	2	8	163906	163913	0 %	0 %	50 %	50 %	322830873
3056	NC_015061	GCTG	2	8	163955	163962	0 %	25 %	50 %	25 %	322830873
3057	NC_015061	CCG	2	6	164036	164041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830873
3058	NC_015061	GC	3	6	164082	164087	0 %	0 %	50 %	50 %	322830873
3059	NC_015061	GCG	2	6	164187	164192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830873
3060	NC_015061	GCCAG	2	10	164221	164230	20 %	0 %	40 %	40 %	322830873
3061	NC_015061	CTGG	2	8	164255	164262	0 %	25 %	50 %	25 %	322830873
3062	NC_015061	GCCA	2	8	164292	164299	25 %	0 %	25 %	50 %	322830873
3063	NC_015061	CTG	2	6	164313	164318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830873
3064	NC_015061	AAC	2	6	164365	164370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830873
3065	NC_015061	ATT	2	6	164385	164390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830873
3066	NC_015061	CGC	2	6	164401	164406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830873
3067	NC_015061	TGAT	2	8	164407	164414	25 %	50 %	25 %	0 %	322830873
3068	NC_015061	GAACTG	2	12	164421	164432	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322830873
3069	NC_015061	GCG	2	6	164433	164438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830873
3070	NC_015061	CA	3	6	164457	164462	50 %	0 %	0 %	50 %	322830873
3071	NC_015061	CGG	2	6	164533	164538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830873
3072	NC_015061	GGC	2	6	164564	164569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830873
3073	NC_015061	CGG	3	9	164687	164695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830873
3074	NC_015061	ACGA	2	8	164725	164732	50 %	0 %	25 %	25 %	322830873
3075	NC_015061	ACA	2	6	164835	164840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830874
3076	NC_015061	GC	3	6	164856	164861	0 %	0 %	50 %	50 %	322830874
3077	NC_015061	GCG	3	9	164915	164923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830874
3078	NC_015061	ACGG	2	8	164968	164975	25 %	0 %	50 %	25 %	322830874
3079	NC_015061	CGC	2	6	165044	165049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830874
3080	NC_015061	TTAT	2	8	165197	165204	25 %	75 %	0 %	0 %	322830874
3081	NC_015061	GC	3	6	165209	165214	0 %	0 %	50 %	50 %	322830874
3082	NC_015061	T	7	7	165316	165322	0 %	100 %	0 %	0 %	322830874
3083	NC_015061	ACC	2	6	165409	165414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830874
3084	NC_015061	GCTG	2	8	165415	165422	0 %	25 %	50 %	25 %	322830874
3085	NC_015061	GCG	2	6	165431	165436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830874
3086	NC_015061	GCTGT	2	10	165506	165515	0 %	40 %	40 %	20 %	322830874
3087	NC_015061	GCC	2	6	165520	165525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830874
3088	NC_015061	AGA	2	6	165542	165547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830875
3089	NC_015061	CAG	2	6	165549	165554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830875
3090	NC_015061	GGC	2	6	165567	165572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830875
3091	NC_015061	CGG	2	6	165594	165599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830875
3092	NC_015061	CA	3	6	165623	165628	50 %	0 %	0 %	50 %	322830875
3093	NC_015061	CGG	2	6	165800	165805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830875
3094	NC_015061	GAT	2	6	165825	165830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830875
3095	NC_015061	GAA	2	6	165831	165836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830875
3096	NC_015061	AGC	2	6	165850	165855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830875
3097	NC_015061	CAG	2	6	165861	165866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830875
3098	NC_015061	TGTTT	2	10	165869	165878	0 %	80 %	20 %	0 %	322830875
3099	NC_015061	GCT	2	6	165885	165890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830875
3100	NC_015061	TAA	2	6	165908	165913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830875
3101	NC_015061	ATC	2	6	165931	165936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830875
3102	NC_015061	GAT	2	6	165945	165950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830875
3103	NC_015061	GCG	2	6	165964	165969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830875
3104	NC_015061	GA	3	6	165994	165999	50 %	0 %	50 %	0 %	322830875
3105	NC_015061	ACC	2	6	166021	166026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830875
3106	NC_015061	TGC	2	6	166037	166042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830875
3107	NC_015061	GAC	2	6	166061	166066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830875
3108	NC_015061	CTGTTC	2	12	166122	166133	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	322830875
3109	NC_015061	GCG	2	6	166139	166144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830875
3110	NC_015061	GCA	2	6	166223	166228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830875
3111	NC_015061	GCCA	2	8	166243	166250	25 %	0 %	25 %	50 %	322830875
3112	NC_015061	CGA	2	6	166260	166265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830875
3113	NC_015061	T	6	6	166322	166327	0 %	100 %	0 %	0 %	322830875
3114	NC_015061	AGC	2	6	166393	166398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830875
3115	NC_015061	CAG	2	6	166407	166412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830875
3116	NC_015061	GCC	2	6	166518	166523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830875
3117	NC_015061	ACT	2	6	166530	166535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830875
3118	NC_015061	GCA	2	6	166586	166591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830875
3119	NC_015061	GAT	2	6	166592	166597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830875
3120	NC_015061	TCAG	2	8	166603	166610	25 %	25 %	25 %	25 %	322830875
3121	NC_015061	GGC	2	6	166690	166695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830875
3122	NC_015061	A	6	6	166782	166787	100 %	0 %	0 %	0 %	322830876
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3237	NC_015061	GC	4	8	171849	171856	0 %	0 %	50 %	50 %	322830880
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3240	NC_015061	ATTC	2	8	171984	171991	25 %	50 %	0 %	25 %	322830880
3241	NC_015061	GCG	2	6	172046	172051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830880
3242	NC_015061	CGG	2	6	172062	172067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830880
3243	NC_015061	CAGCGT	2	12	172069	172080	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322830880
3244	NC_015061	CGA	2	6	172235	172240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830880
3245	NC_015061	TGG	2	6	172259	172264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830880
3246	NC_015061	TTG	2	6	172283	172288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830880
3247	NC_015061	GCT	2	6	172308	172313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830880
3248	NC_015061	CGG	2	6	172320	172325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830880
3249	NC_015061	GC	3	6	172333	172338	0 %	0 %	50 %	50 %	322830880
3250	NC_015061	CGT	2	6	172398	172403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830881
3251	NC_015061	GCA	2	6	172413	172418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830881
3252	NC_015061	CGG	2	6	172449	172454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830881
3253	NC_015061	A	6	6	172469	172474	100 %	0 %	0 %	0 %	322830881
3254	NC_015061	GCA	2	6	172548	172553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830881
3255	NC_015061	ATTCC	2	10	172611	172620	20 %	40 %	0 %	40 %	322830881
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3259	NC_015061	GTGAG	2	10	172965	172974	20 %	20 %	60 %	0 %	322830881
3260	NC_015061	TGC	2	6	173042	173047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830881
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3263	NC_015061	TG	3	6	173100	173105	0 %	50 %	50 %	0 %	322830881
3264	NC_015061	GCA	2	6	173162	173167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830881
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3271	NC_015061	GCT	2	6	173442	173447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830881
3272	NC_015061	TGCG	2	8	173829	173836	0 %	25 %	50 %	25 %	322830882
3273	NC_015061	ACG	2	6	173856	173861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830882
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3276	NC_015061	AACA	2	8	174140	174147	75 %	0 %	0 %	25 %	322830882
3277	NC_015061	GGC	2	6	174564	174569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830883
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3353	NC_015061	GAT	2	6	178490	178495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830889
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3358	NC_015061	GTTC	2	8	178793	178800	0 %	50 %	25 %	25 %	322830890
3359	NC_015061	TCG	2	6	178835	178840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830890
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3483	NC_015061	GCA	2	6	186363	186368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830895
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3485	NC_015061	TGA	2	6	186422	186427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830895
3486	NC_015061	CAT	2	6	186575	186580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830896
3487	NC_015061	CTG	2	6	186648	186653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830896
3488	NC_015061	TG	3	6	186658	186663	0 %	50 %	50 %	0 %	322830896
3489	NC_015061	GCA	2	6	186725	186730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830896
3490	NC_015061	CGCC	2	8	186742	186749	0 %	0 %	25 %	75 %	322830896
3491	NC_015061	GCTGG	2	10	186820	186829	0 %	20 %	60 %	20 %	322830896
3492	NC_015061	CGCTGG	2	12	186832	186843	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322830896
3493	NC_015061	ATG	3	9	186912	186920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830896
3494	NC_015061	TTC	2	6	186927	186932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830896
3495	NC_015061	AAT	2	6	187004	187009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830897
3496	NC_015061	CGGC	2	8	187014	187021	0 %	0 %	50 %	50 %	322830897
3497	NC_015061	CGC	2	6	187032	187037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830897
3498	NC_015061	TCA	2	6	187139	187144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830897
3499	NC_015061	GCG	2	6	187151	187156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830897
3500	NC_015061	GCA	2	6	187175	187180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830897

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