MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_015061	GGT	2	6	103827	103832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830830
2003	NC_015061	GCC	2	6	103865	103870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830830
2004	NC_015061	CGG	2	6	103896	103901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830830
2005	NC_015061	CGG	2	6	103946	103951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830830
2006	NC_015061	AGA	2	6	103967	103972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830830
2007	NC_015061	GAA	2	6	104074	104079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830830
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2009	NC_015061	CGG	2	6	104160	104165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830830
2010	NC_015061	TCAGCG	2	12	104166	104177	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322830830
2011	NC_015061	CGTG	2	8	104256	104263	0 %	25 %	50 %	25 %	322830830
2012	NC_015061	TGA	2	6	104279	104284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830830
2013	NC_015061	GCA	2	6	104292	104297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830830
2014	NC_015061	CGT	2	6	104340	104345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830830
2015	NC_015061	GTGATG	2	12	104365	104376	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322830830
2016	NC_015061	CCAT	2	8	104433	104440	25 %	25 %	0 %	50 %	322830830
2017	NC_015061	TGT	2	6	104453	104458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830830
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2024	NC_015061	GTT	2	6	104953	104958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830831
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2050	NC_015061	T	6	6	106948	106953	0 %	100 %	0 %	0 %	322830833
2051	NC_015061	GACT	2	8	107013	107020	25 %	25 %	25 %	25 %	322830833
2052	NC_015061	GC	3	6	107062	107067	0 %	0 %	50 %	50 %	322830833
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2122	NC_015061	CGA	2	6	110741	110746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830836
2123	NC_015061	GCC	3	9	111010	111018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830836
2124	NC_015061	GC	3	6	111032	111037	0 %	0 %	50 %	50 %	322830836
2125	NC_015061	GCG	2	6	111097	111102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830836
2126	NC_015061	GC	3	6	111157	111162	0 %	0 %	50 %	50 %	322830836
2127	NC_015061	CTG	2	6	111193	111198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830836
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2130	NC_015061	CTG	2	6	111408	111413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830836
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2235	NC_015061	AT	3	6	116965	116970	50 %	50 %	0 %	0 %	322830838
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2239	NC_015061	GGT	2	6	117192	117197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830838
2240	NC_015061	CAA	2	6	117213	117218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830838
2241	NC_015061	TTG	2	6	117275	117280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830838
2242	NC_015061	CAT	2	6	117330	117335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830838
2243	NC_015061	ATG	2	6	117343	117348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830838
2244	NC_015061	CAC	2	6	117354	117359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830838
2245	NC_015061	ATG	3	9	117454	117462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830838
2246	NC_015061	CTG	2	6	117464	117469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830838
2247	NC_015061	GCA	3	9	117476	117484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830838
2248	NC_015061	AAG	2	6	117492	117497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830838
2249	NC_015061	TAA	2	6	117550	117555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830839
2250	NC_015061	GCG	2	6	117571	117576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830839
2251	NC_015061	GGC	2	6	117612	117617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830839
2252	NC_015061	T	6	6	117621	117626	0 %	100 %	0 %	0 %	322830839
2253	NC_015061	AAT	2	6	117675	117680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830839
2254	NC_015061	CA	3	6	117708	117713	50 %	0 %	0 %	50 %	322830839
2255	NC_015061	TAA	2	6	117735	117740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830839
2256	NC_015061	CGG	2	6	117793	117798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830839
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2258	NC_015061	ATA	2	6	117819	117824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830839
2259	NC_015061	AATT	2	8	117855	117862	50 %	50 %	0 %	0 %	322830839
2260	NC_015061	T	7	7	117865	117871	0 %	100 %	0 %	0 %	322830839
2261	NC_015061	TAA	2	6	117882	117887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830839
2262	NC_015061	ATG	2	6	117893	117898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830839
2263	NC_015061	ACC	2	6	117916	117921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830839
2264	NC_015061	GGGA	2	8	117972	117979	25 %	0 %	75 %	0 %	322830839
2265	NC_015061	ATA	2	6	117988	117993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830839
2266	NC_015061	A	6	6	118036	118041	100 %	0 %	0 %	0 %	322830839
2267	NC_015061	ATC	2	6	118359	118364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830840
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2269	NC_015061	GCG	2	6	118417	118422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830840
2270	NC_015061	CAG	2	6	118462	118467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830840
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2272	NC_015061	CGG	2	6	118508	118513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830840
2273	NC_015061	TGG	2	6	118515	118520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830840
2274	NC_015061	CGGCG	2	10	118526	118535	0 %	0 %	60 %	40 %	322830840
2275	NC_015061	GTT	2	6	118540	118545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830840
2276	NC_015061	TGAC	2	8	118645	118652	25 %	25 %	25 %	25 %	322830840
2277	NC_015061	TG	3	6	118673	118678	0 %	50 %	50 %	0 %	322830840
2278	NC_015061	GCTG	2	8	118716	118723	0 %	25 %	50 %	25 %	322830840
2279	NC_015061	GGA	2	6	118782	118787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322830840
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2281	NC_015061	CTG	2	6	118856	118861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830840
2282	NC_015061	GCTG	2	8	118967	118974	0 %	25 %	50 %	25 %	322830840
2283	NC_015061	TCA	2	6	119097	119102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830840
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2285	NC_015061	GGC	2	6	119708	119713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830841
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2295	NC_015061	CTG	2	6	120399	120404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830841
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2300	NC_015061	CTG	2	6	120495	120500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830841
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2303	NC_015061	GC	3	6	120594	120599	0 %	0 %	50 %	50 %	322830841
2304	NC_015061	CTG	2	6	120621	120626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830841
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2308	NC_015061	CAG	2	6	120831	120836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830841
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2312	NC_015061	TGC	2	6	121003	121008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830841
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2315	NC_015061	GTCA	2	8	121163	121170	25 %	25 %	25 %	25 %	322830841
2316	NC_015061	TC	3	6	121172	121177	0 %	50 %	0 %	50 %	322830841
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2322	NC_015061	CTG	2	6	121308	121313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830841
2323	NC_015061	TGA	2	6	121355	121360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830841
2324	NC_015061	TCA	2	6	121423	121428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830841
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2339	NC_015061	CAT	2	6	122275	122280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830842
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2344	NC_015061	CAT	2	6	122452	122457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830842
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2351	NC_015061	GGT	2	6	122755	122760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830842
2352	NC_015061	GCA	2	6	122825	122830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830842
2353	NC_015061	TGC	2	6	122895	122900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830842
2354	NC_015061	TGT	2	6	122901	122906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830842
2355	NC_015061	GGC	2	6	122917	122922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830842
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2358	NC_015061	TGG	2	6	123054	123059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830842
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2360	NC_015061	TGG	2	6	123531	123536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830843
2361	NC_015061	TGC	2	6	123539	123544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830843
2362	NC_015061	GCA	2	6	123547	123552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830843
2363	NC_015061	GCA	2	6	123600	123605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830843
2364	NC_015061	CGC	2	6	123647	123652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830843
2365	NC_015061	TGG	2	6	123683	123688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830843
2366	NC_015061	TTCC	2	8	123739	123746	0 %	50 %	0 %	50 %	322830843
2367	NC_015061	GCA	2	6	123804	123809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830843
2368	NC_015061	GCC	2	6	123834	123839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830843
2369	NC_015061	CTGG	2	8	123921	123928	0 %	25 %	50 %	25 %	322830843
2370	NC_015061	CGG	2	6	123935	123940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830843
2371	NC_015061	TGG	2	6	124033	124038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830843
2372	NC_015061	TGGT	2	8	124064	124071	0 %	50 %	50 %	0 %	322830843
2373	NC_015061	ATC	2	6	124130	124135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830843
2374	NC_015061	GTC	2	6	124168	124173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830843
2375	NC_015061	AATC	2	8	124206	124213	50 %	25 %	0 %	25 %	322830843
2376	NC_015061	GCC	2	6	124238	124243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830843
2377	NC_015061	CGC	2	6	124247	124252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830843
2378	NC_015061	GAC	2	6	124278	124283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830843
2379	NC_015061	GTT	2	6	124416	124421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830843
2380	NC_015061	GCA	2	6	124431	124436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830843
2381	NC_015061	A	6	6	124462	124467	100 %	0 %	0 %	0 %	322830843
2382	NC_015061	GC	4	8	124521	124528	0 %	0 %	50 %	50 %	322830843
2383	NC_015061	GTT	2	6	124572	124577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830843
2384	NC_015061	AGA	2	6	124590	124595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830843
2385	NC_015061	ACCGAT	2	12	124699	124710	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322830843
2386	NC_015061	TGA	2	6	124715	124720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830843
2387	NC_015061	CAG	2	6	124789	124794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830843
2388	NC_015061	TTA	2	6	124864	124869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830843
2389	NC_015061	GCGG	2	8	124914	124921	0 %	0 %	75 %	25 %	322830843
2390	NC_015061	CGG	2	6	124988	124993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830843
2391	NC_015061	CGA	2	6	125000	125005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830843
2392	NC_015061	GCCC	2	8	125193	125200	0 %	0 %	25 %	75 %	322830844
2393	NC_015061	CTG	2	6	125338	125343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830844
2394	NC_015061	CGT	2	6	125345	125350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830844
2395	NC_015061	CAT	2	6	125389	125394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830844
2396	NC_015061	GAC	2	6	125444	125449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830844
2397	NC_015061	GC	3	6	125477	125482	0 %	0 %	50 %	50 %	322830844
2398	NC_015061	CGT	3	9	125488	125496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830844
2399	NC_015061	TCA	2	6	125674	125679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830844
2400	NC_015061	CAGATA	2	12	125726	125737	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	322830844
2401	NC_015061	GC	3	6	125795	125800	0 %	0 %	50 %	50 %	322830844
2402	NC_015061	GCA	2	6	125802	125807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830844
2403	NC_015061	CTG	2	6	125918	125923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830844
2404	NC_015061	CCA	2	6	126042	126047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830844
2405	NC_015061	CCAC	2	8	126358	126365	25 %	0 %	0 %	75 %	322830845
2406	NC_015061	GAC	2	6	126396	126401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830845
2407	NC_015061	GTC	2	6	126406	126411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830845
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2410	NC_015061	T	7	7	126524	126530	0 %	100 %	0 %	0 %	322830845
2411	NC_015061	GAT	2	6	126859	126864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830846
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2413	NC_015061	AG	3	6	126936	126941	50 %	0 %	50 %	0 %	322830846
2414	NC_015061	CAC	2	6	126967	126972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830846
2415	NC_015061	GAATT	2	10	126987	126996	40 %	40 %	20 %	0 %	322830846
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2417	NC_015061	AGC	2	6	127098	127103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830846
2418	NC_015061	GCA	2	6	127123	127128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830846
2419	NC_015061	TGC	2	6	127188	127193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830846
2420	NC_015061	GC	4	8	127210	127217	0 %	0 %	50 %	50 %	322830846
2421	NC_015061	CTTC	2	8	127353	127360	0 %	50 %	0 %	50 %	322830846
2422	NC_015061	ACC	2	6	127361	127366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830846
2423	NC_015061	TGA	2	6	127461	127466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830846
2424	NC_015061	ATT	2	6	127487	127492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830846
2425	NC_015061	GGC	2	6	127546	127551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830846
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2427	NC_015061	GC	3	6	127568	127573	0 %	0 %	50 %	50 %	322830846
2428	NC_015061	CCA	2	6	127575	127580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830846
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2430	NC_015061	GC	3	6	128042	128047	0 %	0 %	50 %	50 %	322830847
2431	NC_015061	AAG	2	6	128188	128193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830847
2432	NC_015061	TGC	2	6	128236	128241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830847
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2434	NC_015061	AAGA	2	8	128457	128464	75 %	0 %	25 %	0 %	322830847
2435	NC_015061	AAAACC	2	12	128472	128483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830847
2436	NC_015061	G	6	6	128670	128675	0 %	0 %	100 %	0 %	322830847
2437	NC_015061	TGC	3	9	128737	128745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830847
2438	NC_015061	GTG	2	6	128989	128994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830847
2439	NC_015061	CTGG	2	8	129189	129196	0 %	25 %	50 %	25 %	322830847
2440	NC_015061	CCA	2	6	129211	129216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830847
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2442	NC_015061	TGC	2	6	129292	129297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830847
2443	NC_015061	GCT	2	6	129380	129385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830847
2444	NC_015061	TTA	2	6	129415	129420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830847
2445	NC_015061	GTG	2	6	129480	129485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830847
2446	NC_015061	GAT	2	6	129501	129506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830847
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2449	NC_015061	GCGT	2	8	129670	129677	0 %	25 %	50 %	25 %	322830847
2450	NC_015061	GCT	2	6	129812	129817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830847
2451	NC_015061	TC	3	6	129826	129831	0 %	50 %	0 %	50 %	322830847
2452	NC_015061	GAA	2	6	129843	129848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830847
2453	NC_015061	GCA	2	6	129869	129874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830847
2454	NC_015061	TTC	2	6	129988	129993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830848
2455	NC_015061	TTGAGT	2	12	130007	130018	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	322830848
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2457	NC_015061	AGC	2	6	130037	130042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830848
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2459	NC_015061	GT	3	6	130184	130189	0 %	50 %	50 %	0 %	322830848
2460	NC_015061	AGC	2	6	130193	130198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830848
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2462	NC_015061	CCGT	2	8	130309	130316	0 %	25 %	25 %	50 %	322830848
2463	NC_015061	TCA	2	6	130349	130354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830848
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2465	NC_015061	CAC	2	6	130513	130518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830848
2466	NC_015061	TGT	2	6	130526	130531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830848
2467	NC_015061	GC	3	6	130542	130547	0 %	0 %	50 %	50 %	322830848
2468	NC_015061	TGA	2	6	130596	130601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830848
2469	NC_015061	GT	3	6	130628	130633	0 %	50 %	50 %	0 %	322830848
2470	NC_015061	TAA	2	6	130659	130664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830848
2471	NC_015061	CAGG	2	8	130683	130690	25 %	0 %	50 %	25 %	322830848
2472	NC_015061	CAG	3	9	130800	130808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830849
2473	NC_015061	TCAGCG	2	12	130814	130825	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322830849
2474	NC_015061	AAC	2	6	130858	130863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830849
2475	NC_015061	GCCA	2	8	130876	130883	25 %	0 %	25 %	50 %	322830849
2476	NC_015061	GCA	2	6	130982	130987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830849
2477	NC_015061	CA	3	6	131030	131035	50 %	0 %	0 %	50 %	322830849
2478	NC_015061	ATC	2	6	131104	131109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830849
2479	NC_015061	AGC	2	6	131110	131115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830849
2480	NC_015061	ATC	2	6	131203	131208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830849
2481	NC_015061	CAG	2	6	131214	131219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830849
2482	NC_015061	ATG	2	6	131290	131295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830849
2483	NC_015061	TCG	2	6	131339	131344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830849
2484	NC_015061	CGA	2	6	131456	131461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830849
2485	NC_015061	TCG	2	6	131518	131523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830849
2486	NC_015061	CAG	2	6	131526	131531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830849
2487	NC_015061	CAG	3	9	131538	131546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830849
2488	NC_015061	GAA	3	9	131562	131570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830849
2489	NC_015061	TTC	2	6	131617	131622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830849
2490	NC_015061	AGC	2	6	131644	131649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830849
2491	NC_015061	CGCCAG	2	12	131697	131708	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322830849
2492	NC_015061	GCA	2	6	131747	131752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830849
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2500	NC_015061	TGC	2	6	132026	132031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830849

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