MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015061	CTGC	2	8	77746	77753	0 %	25 %	25 %	50 %	322830808
1502	NC_015061	ACCG	2	8	77759	77766	25 %	0 %	25 %	50 %	322830808
1503	NC_015061	GTG	2	6	77775	77780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830808
1504	NC_015061	GCC	2	6	77846	77851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830808
1505	NC_015061	TG	3	6	77940	77945	0 %	50 %	50 %	0 %	322830808
1506	NC_015061	AGTGTC	2	12	77955	77966	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322830808
1507	NC_015061	TCA	2	6	78012	78017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830808
1508	NC_015061	CGG	2	6	78106	78111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830808
1509	NC_015061	GAT	2	6	78118	78123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830808
1510	NC_015061	CGG	2	6	78176	78181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830808
1511	NC_015061	CTG	2	6	78228	78233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830808
1512	NC_015061	AGT	2	6	78271	78276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830808
1513	NC_015061	CGA	2	6	78331	78336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830808
1514	NC_015061	GGC	2	6	78383	78388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830808
1515	NC_015061	CGGT	2	8	78423	78430	0 %	25 %	50 %	25 %	322830808
1516	NC_015061	ATC	2	6	78453	78458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830808
1517	NC_015061	TTC	2	6	78564	78569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830808
1518	NC_015061	TCT	2	6	78576	78581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830808
1519	NC_015061	CGG	2	6	78652	78657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830808
1520	NC_015061	GCAT	2	8	78667	78674	25 %	25 %	25 %	25 %	322830808
1521	NC_015061	AAAAT	2	10	78746	78755	80 %	20 %	0 %	0 %	322830808
1522	NC_015061	TCG	2	6	78756	78761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830808
1523	NC_015061	CG	4	8	78760	78767	0 %	0 %	50 %	50 %	322830808
1524	NC_015061	CGG	2	6	78829	78834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830808
1525	NC_015061	CCA	2	6	78889	78894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830808
1526	NC_015061	GCG	2	6	78905	78910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830808
1527	NC_015061	CCA	2	6	78940	78945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830808
1528	NC_015061	GGCG	2	8	78985	78992	0 %	0 %	75 %	25 %	322830808
1529	NC_015061	AC	3	6	79015	79020	50 %	0 %	0 %	50 %	322830808
1530	NC_015061	CGC	2	6	79117	79122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830808
1531	NC_015061	ATG	2	6	79140	79145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830808
1532	NC_015061	CGG	2	6	79159	79164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830808
1533	NC_015061	TCA	2	6	79179	79184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830808
1534	NC_015061	CGG	2	6	79282	79287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830808
1535	NC_015061	GCT	2	6	79311	79316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830808
1536	NC_015061	GC	3	6	79378	79383	0 %	0 %	50 %	50 %	322830808
1537	NC_015061	GCG	2	6	79395	79400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830808
1538	NC_015061	ATC	2	6	79416	79421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830808
1539	NC_015061	CGC	2	6	79444	79449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830808
1540	NC_015061	TG	3	6	79473	79478	0 %	50 %	50 %	0 %	322830808
1541	NC_015061	GGT	2	6	79592	79597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830808
1542	NC_015061	TGA	2	6	79628	79633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830809
1543	NC_015061	GCC	2	6	79661	79666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830809
1544	NC_015061	GA	3	6	79748	79753	50 %	0 %	50 %	0 %	322830809
1545	NC_015061	CGA	2	6	79783	79788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830809
1546	NC_015061	GC	3	6	79799	79804	0 %	0 %	50 %	50 %	322830809
1547	NC_015061	CGA	2	6	79825	79830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830809
1548	NC_015061	CGG	2	6	79871	79876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830809
1549	NC_015061	GCA	2	6	79911	79916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830809
1550	NC_015061	GTG	2	6	79917	79922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830809
1551	NC_015061	GGC	2	6	79945	79950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830809
1552	NC_015061	GGC	2	6	80015	80020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830809
1553	NC_015061	TTC	2	6	80045	80050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830809
1554	NC_015061	CAGGCT	2	12	80084	80095	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322830809
1555	NC_015061	CGT	2	6	80128	80133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830809
1556	NC_015061	CGG	2	6	80164	80169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830809
1557	NC_015061	GC	3	6	80181	80186	0 %	0 %	50 %	50 %	322830809
1558	NC_015061	CAGCGC	2	12	80198	80209	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322830809
1559	NC_015061	GC	3	6	80360	80365	0 %	0 %	50 %	50 %	322830809
1560	NC_015061	GC	3	6	80388	80393	0 %	0 %	50 %	50 %	322830809
1561	NC_015061	TTC	2	6	80468	80473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830809
1562	NC_015061	CCAC	2	8	80506	80513	25 %	0 %	0 %	75 %	322830809
1563	NC_015061	AATC	2	8	80557	80564	50 %	25 %	0 %	25 %	322830809
1564	NC_015061	TGG	2	6	80583	80588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830809
1565	NC_015061	A	6	6	80639	80644	100 %	0 %	0 %	0 %	322830809
1566	NC_015061	CGG	2	6	80728	80733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830809
1567	NC_015061	CAGC	2	8	80843	80850	25 %	0 %	25 %	50 %	322830809
1568	NC_015061	ACA	2	6	80871	80876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830809
1569	NC_015061	CCG	2	6	80887	80892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830809
1570	NC_015061	CGG	2	6	80908	80913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830809
1571	NC_015061	CCA	2	6	80935	80940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830809
1572	NC_015061	GCC	2	6	80978	80983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830809
1573	NC_015061	CAC	2	6	81083	81088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830809
1574	NC_015061	GCAGG	2	10	81150	81159	20 %	0 %	60 %	20 %	322830809
1575	NC_015061	CCG	2	6	81160	81165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830809
1576	NC_015061	GCCA	2	8	81172	81179	25 %	0 %	25 %	50 %	322830809
1577	NC_015061	TGC	3	9	81396	81404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830809
1578	NC_015061	CTGAAG	2	12	81448	81459	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	322830809
1579	NC_015061	CAGC	2	8	81793	81800	25 %	0 %	25 %	50 %	322830810
1580	NC_015061	AGGG	2	8	81819	81826	25 %	0 %	75 %	0 %	322830810
1581	NC_015061	ATA	2	6	81830	81835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830810
1582	NC_015061	GGC	2	6	81919	81924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830810
1583	NC_015061	GATG	2	8	82051	82058	25 %	25 %	50 %	0 %	322830810
1584	NC_015061	GAT	2	6	82106	82111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830810
1585	NC_015061	GAT	2	6	82235	82240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830811
1586	NC_015061	AT	3	6	82248	82253	50 %	50 %	0 %	0 %	322830811
1587	NC_015061	GAT	3	9	82298	82306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830811
1588	NC_015061	GCA	2	6	82316	82321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830811
1589	NC_015061	GCA	2	6	82352	82357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830811
1590	NC_015061	TAT	2	6	82384	82389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830811
1591	NC_015061	TGAC	2	8	82419	82426	25 %	25 %	25 %	25 %	322830811
1592	NC_015061	ATC	2	6	82439	82444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830811
1593	NC_015061	TC	3	6	82506	82511	0 %	50 %	0 %	50 %	322830812
1594	NC_015061	GCC	2	6	82596	82601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830812
1595	NC_015061	CTGG	2	8	82665	82672	0 %	25 %	50 %	25 %	322830812
1596	NC_015061	GC	3	6	82680	82685	0 %	0 %	50 %	50 %	322830812
1597	NC_015061	AGC	2	6	82688	82693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830812
1598	NC_015061	TGAAG	2	10	82704	82713	40 %	20 %	40 %	0 %	322830812
1599	NC_015061	CAG	2	6	82714	82719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830812
1600	NC_015061	AGA	2	6	82740	82745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830812
1601	NC_015061	AGCC	2	8	82844	82851	25 %	0 %	25 %	50 %	322830812
1602	NC_015061	GTG	2	6	82858	82863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830812
1603	NC_015061	TCG	2	6	82920	82925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830812
1604	NC_015061	CGG	2	6	82977	82982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830812
1605	NC_015061	TGGC	2	8	83008	83015	0 %	25 %	50 %	25 %	322830812
1606	NC_015061	TGG	2	6	83078	83083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830812
1607	NC_015061	CGG	2	6	83094	83099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830812
1608	NC_015061	TGA	2	6	83133	83138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830812
1609	NC_015061	GTG	2	6	83164	83169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830812
1610	NC_015061	GAT	2	6	83181	83186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830812
1611	NC_015061	GC	3	6	83203	83208	0 %	0 %	50 %	50 %	322830812
1612	NC_015061	GCC	2	6	83320	83325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830812
1613	NC_015061	GCA	3	9	83355	83363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830812
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1615	NC_015061	GTT	2	6	83428	83433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830812
1616	NC_015061	GTG	2	6	83458	83463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830812
1617	NC_015061	GTT	2	6	83469	83474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830812
1618	NC_015061	CAGC	2	8	83496	83503	25 %	0 %	25 %	50 %	322830812
1619	NC_015061	TTTG	2	8	83508	83515	0 %	75 %	25 %	0 %	322830812
1620	NC_015061	TGC	2	6	83546	83551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830812
1621	NC_015061	TCCT	2	8	83553	83560	0 %	50 %	0 %	50 %	322830812
1622	NC_015061	CAG	3	9	83567	83575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830812
1623	NC_015061	CG	3	6	83597	83602	0 %	0 %	50 %	50 %	322830812
1624	NC_015061	GAC	2	6	83610	83615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830812
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1626	NC_015061	GCG	2	6	83668	83673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830812
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1876	NC_015061	TCA	2	6	96321	96326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830824
1877	NC_015061	GCG	2	6	96360	96365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830824
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1879	NC_015061	GAG	2	6	96380	96385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322830824
1880	NC_015061	GC	4	8	96500	96507	0 %	0 %	50 %	50 %	322830824
1881	NC_015061	GGC	2	6	96520	96525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830824
1882	NC_015061	CTT	2	6	96531	96536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830824
1883	NC_015061	CCG	2	6	96537	96542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830824
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1885	NC_015061	GGC	2	6	96619	96624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830824
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1888	NC_015061	GCC	2	6	96754	96759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830824
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1996	NC_015061	AGA	2	6	103592	103597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830829
1997	NC_015061	CTGCG	2	10	103600	103609	0 %	20 %	40 %	40 %	322830829
1998	NC_015061	GAT	2	6	103653	103658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830829
1999	NC_015061	A	6	6	103726	103731	100 %	0 %	0 %	0 %	322830830
2000	NC_015061	GAA	2	6	103743	103748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830830

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