MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015061	CTGCA	2	10	52496	52505	20 %	20 %	20 %	40 %	322830780
1002	NC_015061	TG	3	6	52509	52514	0 %	50 %	50 %	0 %	322830780
1003	NC_015061	GC	3	6	52534	52539	0 %	0 %	50 %	50 %	322830780
1004	NC_015061	TGA	2	6	52555	52560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830780
1005	NC_015061	CGA	2	6	52588	52593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830780
1006	NC_015061	GCG	2	6	52632	52637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830780
1007	NC_015061	GCAG	2	8	52672	52679	25 %	0 %	50 %	25 %	322830780
1008	NC_015061	GAC	2	6	52691	52696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830780
1009	NC_015061	GCT	3	9	52705	52713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830780
1010	NC_015061	CCG	2	6	52773	52778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830780
1011	NC_015061	TGA	2	6	52867	52872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830781
1012	NC_015061	C	6	6	52963	52968	0 %	0 %	0 %	100 %	322830781
1013	NC_015061	GAT	2	6	53031	53036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830781
1014	NC_015061	TGA	2	6	53083	53088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830781
1015	NC_015061	TGC	2	6	53174	53179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830781
1016	NC_015061	CGC	2	6	53202	53207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830781
1017	NC_015061	CTG	2	6	53256	53261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830781
1018	NC_015061	GCT	2	6	53303	53308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830781
1019	NC_015061	TGT	2	6	53349	53354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830781
1020	NC_015061	GT	3	6	53393	53398	0 %	50 %	50 %	0 %	322830781
1021	NC_015061	GC	3	6	53454	53459	0 %	0 %	50 %	50 %	322830781
1022	NC_015061	C	6	6	53466	53471	0 %	0 %	0 %	100 %	322830781
1023	NC_015061	CAT	2	6	53608	53613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830782
1024	NC_015061	GAA	2	6	53648	53653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830782
1025	NC_015061	A	6	6	53675	53680	100 %	0 %	0 %	0 %	322830782
1026	NC_015061	A	7	7	53722	53728	100 %	0 %	0 %	0 %	322830782
1027	NC_015061	GCC	2	6	53819	53824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830782
1028	NC_015061	GCA	2	6	53860	53865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830782
1029	NC_015061	CTG	2	6	53879	53884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830782
1030	NC_015061	CTG	2	6	53918	53923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830782
1031	NC_015061	GTG	2	6	53970	53975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830782
1032	NC_015061	CCT	2	6	54015	54020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322830782
1033	NC_015061	GTG	2	6	54098	54103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830782
1034	NC_015061	GCT	2	6	54130	54135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830782
1035	NC_015061	GGC	2	6	54166	54171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830782
1036	NC_015061	CGC	2	6	54207	54212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830782
1037	NC_015061	CTGC	2	8	54251	54258	0 %	25 %	25 %	50 %	322830782
1038	NC_015061	GCGG	2	8	54284	54291	0 %	0 %	75 %	25 %	322830782
1039	NC_015061	TGC	2	6	54382	54387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830782
1040	NC_015061	TTC	2	6	54440	54445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830782
1041	NC_015061	TTC	2	6	54473	54478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830782
1042	NC_015061	GC	3	6	54651	54656	0 %	0 %	50 %	50 %	322830782
1043	NC_015061	CGG	2	6	54733	54738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830782
1044	NC_015061	GAA	2	6	54742	54747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830782
1045	NC_015061	A	6	6	54746	54751	100 %	0 %	0 %	0 %	322830782
1046	NC_015061	TTA	2	6	54775	54780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830782
1047	NC_015061	GAA	2	6	54830	54835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830782
1048	NC_015061	CGG	2	6	55033	55038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830782
1049	NC_015061	ACAA	2	8	55041	55048	75 %	0 %	0 %	25 %	322830782
1050	NC_015061	GAT	2	6	55075	55080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830782
1051	NC_015061	TTCTGA	2	12	55145	55156	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	322830782
1052	NC_015061	CAC	2	6	55283	55288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830783
1053	NC_015061	CGG	2	6	55295	55300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830783
1054	NC_015061	CAC	2	6	55304	55309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830783
1055	NC_015061	ACC	3	9	55329	55337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830783
1056	NC_015061	GCCA	2	8	55341	55348	25 %	0 %	25 %	50 %	322830783
1057	NC_015061	ATC	2	6	55440	55445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830783
1058	NC_015061	GGC	2	6	55463	55468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830783
1059	NC_015061	CGG	2	6	55564	55569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830783
1060	NC_015061	ACC	2	6	55629	55634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830783
1061	NC_015061	GC	3	6	55688	55693	0 %	0 %	50 %	50 %	322830783
1062	NC_015061	CGC	2	6	55771	55776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830783
1063	NC_015061	CAG	2	6	55811	55816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830783
1064	NC_015061	GC	3	6	55843	55848	0 %	0 %	50 %	50 %	322830783
1065	NC_015061	GCA	2	6	55891	55896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830783
1066	NC_015061	GCG	2	6	55974	55979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830783
1067	NC_015061	AGC	2	6	56052	56057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830783
1068	NC_015061	CAT	2	6	56081	56086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830783
1069	NC_015061	AC	3	6	56102	56107	50 %	0 %	0 %	50 %	322830783
1070	NC_015061	TTC	2	6	56111	56116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830783
1071	NC_015061	TGA	3	9	56236	56244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830783
1072	NC_015061	CGCC	2	8	56254	56261	0 %	0 %	25 %	75 %	322830783
1073	NC_015061	GAC	2	6	56272	56277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830783
1074	NC_015061	AGC	2	6	56304	56309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830783
1075	NC_015061	GCC	2	6	56324	56329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830783
1076	NC_015061	TTC	2	6	56363	56368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830783
1077	NC_015061	ACG	2	6	56388	56393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830783
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1079	NC_015061	GATA	2	8	56774	56781	50 %	25 %	25 %	0 %	322830784
1080	NC_015061	TGCG	2	8	56785	56792	0 %	25 %	50 %	25 %	322830784
1081	NC_015061	ATG	2	6	56802	56807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830784
1082	NC_015061	GTG	2	6	56808	56813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830784
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1084	NC_015061	CG	3	6	56902	56907	0 %	0 %	50 %	50 %	322830784
1085	NC_015061	TG	3	6	56910	56915	0 %	50 %	50 %	0 %	322830784
1086	NC_015061	A	6	6	56956	56961	100 %	0 %	0 %	0 %	322830784
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1089	NC_015061	CAGC	2	8	57332	57339	25 %	0 %	25 %	50 %	322830784
1090	NC_015061	A	6	6	57349	57354	100 %	0 %	0 %	0 %	322830784
1091	NC_015061	GTAC	2	8	57415	57422	25 %	25 %	25 %	25 %	322830784
1092	NC_015061	GTG	2	6	57510	57515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830784
1093	NC_015061	AC	3	6	57531	57536	50 %	0 %	0 %	50 %	322830784
1094	NC_015061	TGC	2	6	57541	57546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830784
1095	NC_015061	ATC	2	6	57603	57608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830784
1096	NC_015061	CAGC	2	8	57620	57627	25 %	0 %	25 %	50 %	322830784
1097	NC_015061	GCT	2	6	57650	57655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830784
1098	NC_015061	ATT	2	6	57695	57700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830784
1099	NC_015061	CGG	2	6	57729	57734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830784
1100	NC_015061	ATTT	2	8	57803	57810	25 %	75 %	0 %	0 %	322830785
1101	NC_015061	TTATT	2	10	57815	57824	20 %	80 %	0 %	0 %	322830785
1102	NC_015061	ATT	2	6	57880	57885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830785
1103	NC_015061	GCC	2	6	57924	57929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830785
1104	NC_015061	AAAT	2	8	57935	57942	75 %	25 %	0 %	0 %	322830785
1105	NC_015061	ATC	2	6	57962	57967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830785
1106	NC_015061	TTG	2	6	57983	57988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830785
1107	NC_015061	GCCA	2	8	57996	58003	25 %	0 %	25 %	50 %	322830785
1108	NC_015061	TCAT	2	8	58143	58150	25 %	50 %	0 %	25 %	322830785
1109	NC_015061	ATTC	2	8	58151	58158	25 %	50 %	0 %	25 %	322830785
1110	NC_015061	TAAA	2	8	58175	58182	75 %	25 %	0 %	0 %	322830785
1111	NC_015061	TTA	2	6	58201	58206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830785
1112	NC_015061	GCATCA	2	12	58218	58229	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	322830785
1113	NC_015061	TAT	2	6	58240	58245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830785
1114	NC_015061	ATT	2	6	58271	58276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830785
1115	NC_015061	GTTT	2	8	58277	58284	0 %	75 %	25 %	0 %	322830785
1116	NC_015061	T	6	6	58282	58287	0 %	100 %	0 %	0 %	322830785
1117	NC_015061	A	6	6	58296	58301	100 %	0 %	0 %	0 %	322830785
1118	NC_015061	GGTG	2	8	58311	58318	0 %	25 %	75 %	0 %	322830785
1119	NC_015061	TGA	2	6	58334	58339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830785
1120	NC_015061	GA	4	8	58350	58357	50 %	0 %	50 %	0 %	322830785
1121	NC_015061	ATGG	2	8	58382	58389	25 %	25 %	50 %	0 %	322830785
1122	NC_015061	CAA	2	6	58439	58444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830785
1123	NC_015061	CGG	2	6	58704	58709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830786
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1125	NC_015061	TGT	2	6	58751	58756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830786
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1127	NC_015061	CGG	2	6	58893	58898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830786
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1252	NC_015061	TTC	2	6	64638	64643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830793
1253	NC_015061	CGCTGC	2	12	64656	64667	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322830793
1254	NC_015061	TCT	2	6	64906	64911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830793
1255	NC_015061	GCA	2	6	64954	64959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830793
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1257	NC_015061	GTT	2	6	65003	65008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830794
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1373	NC_015061	CCG	2	6	71914	71919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830804
1374	NC_015061	TCAGCG	2	12	72020	72031	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322830804
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