MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015061	GCG	2	6	26164	26169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830757
502	NC_015061	GGC	2	6	26217	26222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830757
503	NC_015061	GGCG	2	8	26247	26254	0 %	0 %	75 %	25 %	322830757
504	NC_015061	ACA	2	6	26270	26275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830757
505	NC_015061	CGG	2	6	26304	26309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830757
506	NC_015061	GC	3	6	26317	26322	0 %	0 %	50 %	50 %	322830757
507	NC_015061	CAG	2	6	26454	26459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830757
508	NC_015061	AT	3	6	26523	26528	50 %	50 %	0 %	0 %	322830757
509	NC_015061	CTGGCG	2	12	26581	26592	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322830757
510	NC_015061	CAG	2	6	26626	26631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830757
511	NC_015061	GAT	2	6	26793	26798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830757
512	NC_015061	GAT	2	6	26821	26826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830757
513	NC_015061	CG	3	6	26861	26866	0 %	0 %	50 %	50 %	322830757
514	NC_015061	GCTC	2	8	26939	26946	0 %	25 %	25 %	50 %	322830757
515	NC_015061	CGC	2	6	26965	26970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830757
516	NC_015061	ACC	2	6	26986	26991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830757
517	NC_015061	CGGA	2	8	26992	26999	25 %	0 %	50 %	25 %	322830757
518	NC_015061	ACGG	2	8	27010	27017	25 %	0 %	50 %	25 %	322830757
519	NC_015061	CGG	2	6	27027	27032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830757
520	NC_015061	CAG	2	6	27111	27116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830757
521	NC_015061	AAC	2	6	27142	27147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830757
522	NC_015061	ACC	3	9	27286	27294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830757
523	NC_015061	CAC	2	6	27330	27335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830757
524	NC_015061	GAC	3	9	27346	27354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830757
525	NC_015061	ACC	2	6	27427	27432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830757
526	NC_015061	CCT	2	6	27455	27460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322830757
527	NC_015061	GCC	2	6	27595	27600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830758
528	NC_015061	AGGCGA	2	12	27645	27656	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	322830758
529	NC_015061	AGA	2	6	27738	27743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830758
530	NC_015061	TTGAA	2	10	27746	27755	40 %	40 %	20 %	0 %	322830758
531	NC_015061	GAA	2	6	27781	27786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830758
532	NC_015061	T	6	6	27823	27828	0 %	100 %	0 %	0 %	322830759
533	NC_015061	AGA	2	6	28006	28011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830759
534	NC_015061	ATC	2	6	28019	28024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830759
535	NC_015061	CT	3	6	28175	28180	0 %	50 %	0 %	50 %	322830760
536	NC_015061	ATT	2	6	28264	28269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830760
537	NC_015061	GCA	2	6	28274	28279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830760
538	NC_015061	GC	3	6	28349	28354	0 %	0 %	50 %	50 %	322830760
539	NC_015061	CCGA	2	8	28404	28411	25 %	0 %	25 %	50 %	322830760
540	NC_015061	GCA	2	6	28442	28447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830760
541	NC_015061	TAT	2	6	28449	28454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830760
542	NC_015061	TGA	2	6	28465	28470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830760
543	NC_015061	ACTT	2	8	28647	28654	25 %	50 %	0 %	25 %	322830760
544	NC_015061	CAG	2	6	28656	28661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830760
545	NC_015061	CGG	2	6	28664	28669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830760
546	NC_015061	ACC	2	6	28788	28793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830760
547	NC_015061	AAG	2	6	28894	28899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830760
548	NC_015061	CTG	2	6	28908	28913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830760
549	NC_015061	CTGC	2	8	28935	28942	0 %	25 %	25 %	50 %	322830760
550	NC_015061	CG	3	6	28988	28993	0 %	0 %	50 %	50 %	322830760
551	NC_015061	A	6	6	29143	29148	100 %	0 %	0 %	0 %	322830761
552	NC_015061	TGG	2	6	29155	29160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830761
553	NC_015061	GAA	2	6	29172	29177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830761
554	NC_015061	GCG	2	6	29244	29249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830761
555	NC_015061	GC	3	6	29512	29517	0 %	0 %	50 %	50 %	322830761
556	NC_015061	AAC	2	6	29518	29523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830761
557	NC_015061	TGC	2	6	29524	29529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830761
558	NC_015061	GAT	2	6	29534	29539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830761
559	NC_015061	CTG	2	6	29631	29636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830761
560	NC_015061	CTG	2	6	29760	29765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830761
561	NC_015061	AGC	2	6	29794	29799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830761
562	NC_015061	CTG	2	6	29874	29879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830761
563	NC_015061	GAA	2	6	29880	29885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830761
564	NC_015061	GGT	2	6	29909	29914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830761
565	NC_015061	ACG	2	6	30007	30012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830761
566	NC_015061	ATCGA	2	10	30054	30063	40 %	20 %	20 %	20 %	322830761
567	NC_015061	GCA	2	6	30071	30076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830761
568	NC_015061	GTG	2	6	30099	30104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830761
569	NC_015061	TTC	3	9	30129	30137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830761
570	NC_015061	ACCG	2	8	30141	30148	25 %	0 %	25 %	50 %	322830761
571	NC_015061	ACCG	2	8	30228	30235	25 %	0 %	25 %	50 %	322830761
572	NC_015061	CTGG	2	8	30250	30257	0 %	25 %	50 %	25 %	322830761
573	NC_015061	CTG	2	6	30306	30311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830761
574	NC_015061	TGA	2	6	30325	30330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830761
575	NC_015061	GCAT	2	8	30373	30380	25 %	25 %	25 %	25 %	322830761
576	NC_015061	ACG	2	6	30391	30396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830761
577	NC_015061	GAA	2	6	30405	30410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830761
578	NC_015061	CGA	2	6	30455	30460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830761
579	NC_015061	GC	3	6	30484	30489	0 %	0 %	50 %	50 %	322830761
580	NC_015061	TAT	2	6	30602	30607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830761
581	NC_015061	GAA	2	6	30648	30653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830761
582	NC_015061	GTA	2	6	30693	30698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830761
583	NC_015061	GAT	2	6	30699	30704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830761
584	NC_015061	CG	3	6	30732	30737	0 %	0 %	50 %	50 %	322830761
585	NC_015061	GAA	2	6	30747	30752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830761
586	NC_015061	CGT	2	6	30789	30794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830761
587	NC_015061	GC	3	6	30819	30824	0 %	0 %	50 %	50 %	322830761
588	NC_015061	GGC	3	9	30872	30880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830761
589	NC_015061	CAA	2	6	30881	30886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830761
590	NC_015061	GT	3	6	30889	30894	0 %	50 %	50 %	0 %	322830761
591	NC_015061	CTG	2	6	30924	30929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830761
592	NC_015061	CTG	2	6	30961	30966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830761
593	NC_015061	TGG	2	6	30988	30993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830761
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595	NC_015061	AAG	2	6	31039	31044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830761
596	NC_015061	TGG	2	6	31048	31053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830761
597	NC_015061	GTGATG	2	12	31098	31109	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	322830761
598	NC_015061	GCT	2	6	31145	31150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830761
599	NC_015061	GTT	2	6	31166	31171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830761
600	NC_015061	GCT	2	6	31193	31198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830761
601	NC_015061	TAAGT	2	10	31203	31212	40 %	40 %	20 %	0 %	322830761
602	NC_015061	GCTG	2	8	31450	31457	0 %	25 %	50 %	25 %	322830762
603	NC_015061	CTG	2	6	31473	31478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830762
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610	NC_015061	CAGCG	2	10	31743	31752	20 %	0 %	40 %	40 %	322830762
611	NC_015061	GGC	2	6	31763	31768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830762
612	NC_015061	GGC	2	6	31832	31837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830762
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615	NC_015061	GTG	2	6	31890	31895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830762
616	NC_015061	CAG	2	6	31983	31988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830762
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620	NC_015061	ATG	2	6	32061	32066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830762
621	NC_015061	TGG	2	6	32074	32079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830762
622	NC_015061	CAG	2	6	32085	32090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830762
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625	NC_015061	TGC	2	6	32375	32380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830763
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627	NC_015061	GCA	2	6	32453	32458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830763
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