MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015061	GCG	2	6	266944	266949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830969
5002	NC_015061	GT	3	6	267086	267091	0 %	50 %	50 %	0 %	322830969
5003	NC_015061	CAGC	2	8	267215	267222	25 %	0 %	25 %	50 %	322830969
5004	NC_015061	TCT	2	6	267233	267238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830969
5005	NC_015061	GCG	2	6	267295	267300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830969
5006	NC_015061	TTG	2	6	267421	267426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830969
5007	NC_015061	CCAGTT	2	12	267437	267448	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322830969
5008	NC_015061	CGG	2	6	267551	267556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830969
5009	NC_015061	CAG	2	6	267615	267620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830969
5010	NC_015061	GCAG	2	8	267631	267638	25 %	0 %	50 %	25 %	322830969
5011	NC_015061	GCA	2	6	267641	267646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830969
5012	NC_015061	CTT	2	6	267686	267691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830969
5013	NC_015061	ACGCTG	2	12	267715	267726	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322830969
5014	NC_015061	GTT	2	6	267737	267742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830969
5015	NC_015061	CAG	2	6	267743	267748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830969
5016	NC_015061	TCA	2	6	267975	267980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830970
5017	NC_015061	GCCC	2	8	268083	268090	0 %	0 %	25 %	75 %	322830970
5018	NC_015061	TCATC	2	10	268129	268138	20 %	40 %	0 %	40 %	322830970
5019	NC_015061	ACA	2	6	268171	268176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830971
5020	NC_015061	GCC	2	6	268178	268183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830971
5021	NC_015061	TG	3	6	268287	268292	0 %	50 %	50 %	0 %	322830971
5022	NC_015061	GCC	2	6	268313	268318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830971
5023	NC_015061	AGA	2	6	268362	268367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830971
5024	NC_015061	TTTC	2	8	268599	268606	0 %	75 %	0 %	25 %	322830971
5025	NC_015061	CGC	2	6	268611	268616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830971
5026	NC_015061	CGG	2	6	268674	268679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830971
5027	NC_015061	TA	3	6	268680	268685	50 %	50 %	0 %	0 %	322830971
5028	NC_015061	ACC	3	9	268703	268711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830971
5029	NC_015061	ACTG	2	8	268804	268811	25 %	25 %	25 %	25 %	322830971
5030	NC_015061	TTACC	2	10	268902	268911	20 %	40 %	0 %	40 %	322830971
5031	NC_015061	GC	3	6	268913	268918	0 %	0 %	50 %	50 %	322830971
5032	NC_015061	GCA	3	9	268950	268958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830971
5033	NC_015061	CGC	2	6	269016	269021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830971
5034	NC_015061	ATG	2	6	269024	269029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830971
5035	NC_015061	CAG	3	9	269038	269046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830971
5036	NC_015061	CATGA	2	10	269162	269171	40 %	20 %	20 %	20 %	322830971
5037	NC_015061	CAT	2	6	269179	269184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830971
5038	NC_015061	CG	3	6	269202	269207	0 %	0 %	50 %	50 %	322830971
5039	NC_015061	ATA	2	6	269231	269236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830971
5040	NC_015061	CAT	2	6	269377	269382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830971
5041	NC_015061	GCA	2	6	269403	269408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830971
5042	NC_015061	TGAA	2	8	269498	269505	50 %	25 %	25 %	0 %	322830971
5043	NC_015061	CGG	2	6	269511	269516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830971
5044	NC_015061	CAC	2	6	269544	269549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830971
5045	NC_015061	CAG	2	6	269587	269592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830971
5046	NC_015061	CAG	2	6	269728	269733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830971
5047	NC_015061	CAGC	2	8	269757	269764	25 %	0 %	25 %	50 %	322830971
5048	NC_015061	AAT	2	6	269783	269788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830971
5049	NC_015061	TGCG	2	8	269803	269810	0 %	25 %	50 %	25 %	322830971
5050	NC_015061	GCCA	2	8	269846	269853	25 %	0 %	25 %	50 %	322830971
5051	NC_015061	GCG	2	6	269854	269859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830971
5052	NC_015061	TTG	2	6	269860	269865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830971
5053	NC_015061	TGGC	2	8	269874	269881	0 %	25 %	50 %	25 %	322830971
5054	NC_015061	CGG	2	6	269889	269894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830971
5055	NC_015061	TGT	2	6	269912	269917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830971
5056	NC_015061	GAT	2	6	269925	269930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830971
5057	NC_015061	TCG	2	6	269966	269971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830971
5058	NC_015061	GGC	2	6	269974	269979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830971
5059	NC_015061	CCA	2	6	270021	270026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830971
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5061	NC_015061	CGA	2	6	270180	270185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830971
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5065	NC_015061	TGG	2	6	270264	270269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830971
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5070	NC_015061	GAC	2	6	270591	270596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830972
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5121	NC_015061	GTCGC	2	10	273645	273654	0 %	20 %	40 %	40 %	322830974
5122	NC_015061	GTG	2	6	273663	273668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830974
5123	NC_015061	ACC	2	6	273669	273674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830974
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5125	NC_015061	T	6	6	273692	273697	0 %	100 %	0 %	0 %	322830974
5126	NC_015061	GC	5	10	273703	273712	0 %	0 %	50 %	50 %	322830974
5127	NC_015061	CGT	2	6	273793	273798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830974
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5131	NC_015061	CAGTT	2	10	274031	274040	20 %	40 %	20 %	20 %	322830974
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5135	NC_015061	CCTG	2	8	274448	274455	0 %	25 %	25 %	50 %	322830975
5136	NC_015061	GGCT	2	8	274472	274479	0 %	25 %	50 %	25 %	322830975
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5153	NC_015061	GGT	2	6	275335	275340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830975
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5240	NC_015061	GAT	2	6	280389	280394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830976
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5242	NC_015061	T	7	7	280454	280460	0 %	100 %	0 %	0 %	322830976
5243	NC_015061	GAT	2	6	280467	280472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830976
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5251	NC_015061	ATTT	2	8	280942	280949	25 %	75 %	0 %	0 %	322830976
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5262	NC_015061	TGC	2	6	281507	281512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830976
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5264	NC_015061	TCA	2	6	281891	281896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830976
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5323	NC_015061	TGAC	2	8	285072	285079	25 %	25 %	25 %	25 %	322830978
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5486	NC_015061	TGA	2	6	293616	293621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830987
5487	NC_015061	GGCA	2	8	293645	293652	25 %	0 %	50 %	25 %	322830987
5488	NC_015061	CAG	2	6	293657	293662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830987
5489	NC_015061	TGG	3	9	293677	293685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830987
5490	NC_015061	CAA	2	6	293744	293749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830987
5491	NC_015061	GCC	2	6	293753	293758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830987
5492	NC_015061	GCA	2	6	293760	293765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830987
5493	NC_015061	AGT	2	6	293830	293835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830987
5494	NC_015061	ACG	2	6	293874	293879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830987
5495	NC_015061	ATC	2	6	293937	293942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830987
5496	NC_015061	CGC	2	6	293989	293994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830987
5497	NC_015061	TTG	2	6	294006	294011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322830987
5498	NC_015061	CAG	2	6	294095	294100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830987
5499	NC_015061	CCA	2	6	294109	294114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830987
5500	NC_015061	CAG	2	6	294125	294130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830987

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