MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella sp. Y9602 chromosome

Total Repeats: 86290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015061	TGA	2	6	240826	240831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830940
4502	NC_015061	AG	3	6	240853	240858	50 %	0 %	50 %	0 %	322830940
4503	NC_015061	GAT	2	6	240913	240918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830940
4504	NC_015061	GAT	2	6	241107	241112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830940
4505	NC_015061	GC	3	6	241182	241187	0 %	0 %	50 %	50 %	322830940
4506	NC_015061	TAA	2	6	241194	241199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830940
4507	NC_015061	CCG	2	6	241203	241208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830940
4508	NC_015061	CGT	2	6	241239	241244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830940
4509	NC_015061	GTC	2	6	241304	241309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830940
4510	NC_015061	A	6	6	241328	241333	100 %	0 %	0 %	0 %	322830940
4511	NC_015061	ATG	2	6	241336	241341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830940
4512	NC_015061	GCG	2	6	241354	241359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830940
4513	NC_015061	GAC	2	6	241408	241413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830940
4514	NC_015061	GGGC	2	8	241505	241512	0 %	0 %	75 %	25 %	322830940
4515	NC_015061	GCC	2	6	241513	241518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830940
4516	NC_015061	GGC	2	6	241606	241611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830940
4517	NC_015061	TGAA	2	8	241628	241635	50 %	25 %	25 %	0 %	322830940
4518	NC_015061	AGG	2	6	241636	241641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322830940
4519	NC_015061	AGC	2	6	241642	241647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830940
4520	NC_015061	CAT	2	6	241650	241655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830940
4521	NC_015061	TCA	2	6	241679	241684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830940
4522	NC_015061	GC	3	6	241701	241706	0 %	0 %	50 %	50 %	322830940
4523	NC_015061	CAG	2	6	241732	241737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830940
4524	NC_015061	TCA	2	6	241809	241814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830940
4525	NC_015061	TTC	2	6	242077	242082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830941
4526	NC_015061	T	7	7	242096	242102	0 %	100 %	0 %	0 %	322830941
4527	NC_015061	CAC	2	6	242114	242119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830941
4528	NC_015061	A	6	6	242152	242157	100 %	0 %	0 %	0 %	322830941
4529	NC_015061	TAT	2	6	242210	242215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830941
4530	NC_015061	GGC	2	6	242300	242305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830941
4531	NC_015061	ATC	2	6	242313	242318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830941
4532	NC_015061	CAA	2	6	242325	242330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830941
4533	NC_015061	TGC	2	6	242457	242462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830941
4534	NC_015061	GCG	2	6	242472	242477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830941
4535	NC_015061	AGACGA	2	12	242488	242499	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	322830941
4536	NC_015061	GGC	2	6	242779	242784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830942
4537	NC_015061	TGA	2	6	242869	242874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830942
4538	NC_015061	GCG	2	6	242901	242906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830942
4539	NC_015061	GCC	2	6	242912	242917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830942
4540	NC_015061	TGC	2	6	242985	242990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830942
4541	NC_015061	GCC	2	6	243140	243145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830942
4542	NC_015061	GCC	2	6	243186	243191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830942
4543	NC_015061	TAT	2	6	243310	243315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322830942
4544	NC_015061	ACTG	2	8	243323	243330	25 %	25 %	25 %	25 %	322830942
4545	NC_015061	CGG	2	6	243334	243339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830942
4546	NC_015061	CCA	2	6	243403	243408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830942
4547	NC_015061	CAC	2	6	243410	243415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830942
4548	NC_015061	T	6	6	243423	243428	0 %	100 %	0 %	0 %	322830942
4549	NC_015061	GCA	2	6	243490	243495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830942
4550	NC_015061	CAC	2	6	243503	243508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830942
4551	NC_015061	GCC	2	6	243518	243523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830942
4552	NC_015061	ATGA	2	8	243539	243546	50 %	25 %	25 %	0 %	322830942
4553	NC_015061	CAG	2	6	243563	243568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830942
4554	NC_015061	AAC	2	6	243573	243578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830942
4555	NC_015061	TGCCA	2	10	243593	243602	20 %	20 %	20 %	40 %	322830942
4556	NC_015061	CGG	2	6	243616	243621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830942
4557	NC_015061	GCC	2	6	243639	243644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830942
4558	NC_015061	TTC	2	6	243704	243709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830942
4559	NC_015061	GCG	2	6	243762	243767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830942
4560	NC_015061	GCT	2	6	243805	243810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830942
4561	NC_015061	AGCG	2	8	243824	243831	25 %	0 %	50 %	25 %	322830942
4562	NC_015061	T	6	6	243863	243868	0 %	100 %	0 %	0 %	322830942
4563	NC_015061	CCG	2	6	244058	244063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830943
4564	NC_015061	GCT	2	6	244120	244125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830943
4565	NC_015061	CTG	2	6	244171	244176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830943
4566	NC_015061	GCAG	2	8	244184	244191	25 %	0 %	50 %	25 %	322830943
4567	NC_015061	TGC	2	6	244228	244233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830943
4568	NC_015061	GAT	2	6	244459	244464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830944
4569	NC_015061	TCA	2	6	244466	244471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830944
4570	NC_015061	CTT	2	6	244476	244481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830944
4571	NC_015061	CG	3	6	244531	244536	0 %	0 %	50 %	50 %	322830944
4572	NC_015061	TGC	2	6	244548	244553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830944
4573	NC_015061	TCT	2	6	244593	244598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830944
4574	NC_015061	CGG	2	6	244641	244646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830944
4575	NC_015061	CGC	2	6	244656	244661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830944
4576	NC_015061	TGAC	2	8	244723	244730	25 %	25 %	25 %	25 %	322830944
4577	NC_015061	CAC	2	6	244756	244761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830944
4578	NC_015061	CAC	2	6	244879	244884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830944
4579	NC_015061	ACG	2	6	245059	245064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830944
4580	NC_015061	ATCA	2	8	245092	245099	50 %	25 %	0 %	25 %	322830944
4581	NC_015061	GCA	2	6	245130	245135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830944
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4583	NC_015061	AAGA	2	8	245291	245298	75 %	0 %	25 %	0 %	322830945
4584	NC_015061	GTA	2	6	245321	245326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830945
4585	NC_015061	GTC	2	6	245332	245337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830945
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4588	NC_015061	T	6	6	245443	245448	0 %	100 %	0 %	0 %	322830945
4589	NC_015061	TGG	2	6	245507	245512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830945
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4591	NC_015061	CAC	2	6	245586	245591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830945
4592	NC_015061	GTA	2	6	245653	245658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830945
4593	NC_015061	CGC	2	6	245676	245681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830945
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4595	NC_015061	CG	3	6	245725	245730	0 %	0 %	50 %	50 %	322830945
4596	NC_015061	CAT	2	6	245737	245742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830945
4597	NC_015061	CAC	2	6	245842	245847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830945
4598	NC_015061	TCA	2	6	245859	245864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830945
4599	NC_015061	CA	3	6	245908	245913	50 %	0 %	0 %	50 %	322830945
4600	NC_015061	CAG	2	6	245940	245945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830945
4601	NC_015061	CGG	2	6	245964	245969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830945
4602	NC_015061	GTGG	2	8	246001	246008	0 %	25 %	75 %	0 %	322830945
4603	NC_015061	GTG	2	6	246059	246064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830945
4604	NC_015061	CTT	2	6	246082	246087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322830945
4605	NC_015061	TGG	2	6	246110	246115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322830945
4606	NC_015061	TCA	2	6	246123	246128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830945
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4608	NC_015061	TTGC	2	8	246145	246152	0 %	50 %	25 %	25 %	322830945
4609	NC_015061	CGC	2	6	246186	246191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830945
4610	NC_015061	CAGCC	2	10	246218	246227	20 %	0 %	20 %	60 %	322830945
4611	NC_015061	T	6	6	246794	246799	0 %	100 %	0 %	0 %	322830946
4612	NC_015061	TGC	2	6	246825	246830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830946
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4615	NC_015061	CGC	2	6	247127	247132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830946
4616	NC_015061	CAT	2	6	247150	247155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830946
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4619	NC_015061	ACC	2	6	247232	247237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322830946
4620	NC_015061	ATG	2	6	247289	247294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830946
4621	NC_015061	CAG	2	6	247346	247351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830946
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4736	NC_015061	TGA	2	6	252707	252712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830953
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4740	NC_015061	TGAT	2	8	252943	252950	25 %	50 %	25 %	0 %	322830953
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4744	NC_015061	CTG	2	6	253179	253184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830953
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4851	NC_015061	A	8	8	258494	258501	100 %	0 %	0 %	0 %	322830958
4852	NC_015061	GGC	2	6	258548	258553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830958
4853	NC_015061	GAT	2	6	258557	258562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830958
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4855	NC_015061	AGA	2	6	258650	258655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322830958
4856	NC_015061	TGA	2	6	258671	258676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830958
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4859	NC_015061	AAT	2	6	258751	258756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322830958
4860	NC_015061	CGC	2	6	259102	259107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830959
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4862	NC_015061	TCCGT	2	10	259136	259145	0 %	40 %	20 %	40 %	322830959
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4867	NC_015061	GTC	2	6	259702	259707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830959
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4972	NC_015061	ATGC	2	8	265135	265142	25 %	25 %	25 %	25 %	322830965
4973	NC_015061	AC	3	6	265175	265180	50 %	0 %	0 %	50 %	322830965
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4975	NC_015061	G	6	6	265266	265271	0 %	0 %	100 %	0 %	322830965
4976	NC_015061	CAT	2	6	265305	265310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830965
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4979	NC_015061	CG	3	6	265561	265566	0 %	0 %	50 %	50 %	322830966
4980	NC_015061	CGG	3	9	265670	265678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830966
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4982	NC_015061	GCT	2	6	265989	265994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830966
4983	NC_015061	GCG	2	6	266005	266010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322830966
4984	NC_015061	CCCG	2	8	266045	266052	0 %	0 %	25 %	75 %	322830966
4985	NC_015061	AAC	2	6	266073	266078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322830966
4986	NC_015061	GT	3	6	266084	266089	0 %	50 %	50 %	0 %	322830966
4987	NC_015061	A	6	6	266102	266107	100 %	0 %	0 %	0 %	322830966
4988	NC_015061	GAC	2	6	266113	266118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322830966
4989	NC_015061	GCC	2	6	266205	266210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830966
4990	NC_015061	CGC	2	6	266236	266241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322830966
4991	NC_015061	AACG	2	8	266323	266330	50 %	0 %	25 %	25 %	322830966
4992	NC_015061	TAC	2	6	266445	266450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830967
4993	NC_015061	T	6	6	266467	266472	0 %	100 %	0 %	0 %	322830967
4994	NC_015061	CAT	2	6	266507	266512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322830967
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4998	NC_015061	GAAT	2	8	266656	266663	50 %	25 %	25 %	0 %	322830967
4999	NC_015061	TGA	2	6	266687	266692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322830968
5000	NC_015061	CTG	2	6	266760	266765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322830968

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