MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 4183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014834	CGTCG	2	10	1359	1368	0 %	20 %	40 %	40 %	316931397
2	NC_014834	ACCAC	2	10	1470	1479	40 %	0 %	0 %	60 %	316931397
3	NC_014834	GCGCC	2	10	3290	3299	0 %	0 %	40 %	60 %	316931399
4	NC_014834	TCGGC	2	10	3457	3466	0 %	20 %	40 %	40 %	316931399
5	NC_014834	GTGCT	2	10	5328	5337	0 %	40 %	40 %	20 %	316931400
6	NC_014834	CCGCG	2	10	5387	5396	0 %	0 %	40 %	60 %	316931400
7	NC_014834	CGATC	2	10	8083	8092	20 %	20 %	20 %	40 %	316931401
8	NC_014834	GCTCC	2	10	11131	11140	0 %	20 %	20 %	60 %	316931404
9	NC_014834	GCCGC	2	10	11778	11787	0 %	0 %	40 %	60 %	316931404
10	NC_014834	CCTGG	2	10	13276	13285	0 %	20 %	40 %	40 %	316931405
11	NC_014834	ATCGA	2	10	13775	13784	40 %	20 %	20 %	20 %	316931405
12	NC_014834	GACGT	2	10	14430	14439	20 %	20 %	40 %	20 %	316931406
13	NC_014834	CCCGA	2	10	14747	14756	20 %	0 %	20 %	60 %	316931406
14	NC_014834	GCGCA	2	10	16468	16477	20 %	0 %	40 %	40 %	316931410
15	NC_014834	CCGCA	2	10	16605	16614	20 %	0 %	20 %	60 %	316931410
16	NC_014834	CTGCG	2	10	16711	16720	0 %	20 %	40 %	40 %	316931410
17	NC_014834	ATCGC	2	10	16886	16895	20 %	20 %	20 %	40 %	316931410
18	NC_014834	GCAGC	2	10	17839	17848	20 %	0 %	40 %	40 %	316931410
19	NC_014834	TCCAC	2	10	17970	17979	20 %	20 %	0 %	60 %	316931410
20	NC_014834	TCCCG	2	10	24412	24421	0 %	20 %	20 %	60 %	316931417
21	NC_014834	GTTGC	2	10	24757	24766	0 %	40 %	40 %	20 %	316931417
22	NC_014834	CGAAC	2	10	24971	24980	40 %	0 %	20 %	40 %	316931418
23	NC_014834	GCGGG	2	10	25480	25489	0 %	0 %	80 %	20 %	316931418
24	NC_014834	CTGGC	2	10	26296	26305	0 %	20 %	40 %	40 %	316931419
25	NC_014834	CCCCA	2	10	28119	28128	20 %	0 %	0 %	80 %	316931421
26	NC_014834	TGCCC	2	10	28406	28415	0 %	20 %	20 %	60 %	316931421
27	NC_014834	CGGGT	2	10	28962	28971	0 %	20 %	60 %	20 %	316931421
28	NC_014834	GATCG	2	10	29783	29792	20 %	20 %	40 %	20 %	316931422
29	NC_014834	GCCGG	2	10	36864	36873	0 %	0 %	60 %	40 %	316931426
30	NC_014834	GCGCC	2	10	37296	37305	0 %	0 %	40 %	60 %	316931426
31	NC_014834	GCATC	2	10	37954	37963	20 %	20 %	20 %	40 %	316931427
32	NC_014834	GGTCG	2	10	39017	39026	0 %	20 %	60 %	20 %	316931429
33	NC_014834	CCATG	2	10	39870	39879	20 %	20 %	20 %	40 %	316931430
34	NC_014834	ACCGC	2	10	40475	40484	20 %	0 %	20 %	60 %	316931430
35	NC_014834	CGCTG	2	10	41190	41199	0 %	20 %	40 %	40 %	316931430
36	NC_014834	GGCGC	2	10	42907	42916	0 %	0 %	60 %	40 %	316931431
37	NC_014834	GGCGC	2	10	47705	47714	0 %	0 %	60 %	40 %	316931437
38	NC_014834	GAATC	2	10	49463	49472	40 %	20 %	20 %	20 %	316931438
39	NC_014834	TGCGC	2	10	53188	53197	0 %	20 %	40 %	40 %	316931442
40	NC_014834	CCCGA	2	10	55374	55383	20 %	0 %	20 %	60 %	316931446
41	NC_014834	GAACA	2	10	55699	55708	60 %	0 %	20 %	20 %	316931446
42	NC_014834	GATCA	2	10	60022	60031	40 %	20 %	20 %	20 %	316931451
43	NC_014834	CGAGC	2	10	61256	61265	20 %	0 %	40 %	40 %	316931452
44	NC_014834	GTCTT	2	10	64117	64126	0 %	60 %	20 %	20 %	316931455
45	NC_014834	CACCG	2	10	64542	64551	20 %	0 %	20 %	60 %	316931455
46	NC_014834	ATCGG	2	10	65230	65239	20 %	20 %	40 %	20 %	316931456
47	NC_014834	ACCGG	2	10	65328	65337	20 %	0 %	40 %	40 %	316931456
48	NC_014834	GCGAG	2	10	66046	66055	20 %	0 %	60 %	20 %	316931456
49	NC_014834	GCCTC	2	10	68387	68396	0 %	20 %	20 %	60 %	316931458
50	NC_014834	CGCGC	2	10	69607	69616	0 %	0 %	40 %	60 %	316931460
51	NC_014834	ACCCG	2	10	70297	70306	20 %	0 %	20 %	60 %	316931461
52	NC_014834	GATCG	2	10	70518	70527	20 %	20 %	40 %	20 %	316931461
53	NC_014834	CAGCG	2	10	71769	71778	20 %	0 %	40 %	40 %	316931461
54	NC_014834	CGGGC	2	10	73517	73526	0 %	0 %	60 %	40 %	316931463
55	NC_014834	GCCGC	2	10	74297	74306	0 %	0 %	40 %	60 %	316931465
56	NC_014834	CCCGG	2	10	74555	74564	0 %	0 %	40 %	60 %	316931465
57	NC_014834	GCTGT	2	10	75835	75844	0 %	40 %	40 %	20 %	316931466
58	NC_014834	GAGCC	2	10	75872	75881	20 %	0 %	40 %	40 %	316931466
59	NC_014834	CCGAT	2	10	76175	76184	20 %	20 %	20 %	40 %	316931467
60	NC_014834	CGGCG	2	10	80821	80830	0 %	0 %	60 %	40 %	316931471
61	NC_014834	GCCAG	2	10	81291	81300	20 %	0 %	40 %	40 %	316931471
62	NC_014834	GCCGC	2	10	81505	81514	0 %	0 %	40 %	60 %	316931471
63	NC_014834	GCCGC	2	10	82151	82160	0 %	0 %	40 %	60 %	316931471
64	NC_014834	GAGCA	2	10	82312	82321	40 %	0 %	40 %	20 %	316931471
65	NC_014834	GCATC	2	10	83987	83996	20 %	20 %	20 %	40 %	316931472
66	NC_014834	GGCTC	2	10	84905	84914	0 %	20 %	40 %	40 %	316931472
67	NC_014834	CGCTG	2	10	85790	85799	0 %	20 %	40 %	40 %	316931472
68	NC_014834	CAGCT	2	10	87472	87481	20 %	20 %	20 %	40 %	316931474
69	NC_014834	CGGCG	2	10	88709	88718	0 %	0 %	60 %	40 %	316931475
70	NC_014834	GCGCC	2	10	88962	88971	0 %	0 %	40 %	60 %	316931475
71	NC_014834	TCGAC	2	10	89393	89402	20 %	20 %	20 %	40 %	316931476
72	NC_014834	CGGCG	2	10	91091	91100	0 %	0 %	60 %	40 %	316931476
73	NC_014834	CAGTG	2	10	91431	91440	20 %	20 %	40 %	20 %	316931476
74	NC_014834	CGGGG	2	10	93772	93781	0 %	0 %	80 %	20 %	316931478
75	NC_014834	AGCCG	2	10	93816	93825	20 %	0 %	40 %	40 %	316931478
76	NC_014834	GGCCG	2	10	95382	95391	0 %	0 %	60 %	40 %	316931479
77	NC_014834	CAGCG	2	10	96873	96882	20 %	0 %	40 %	40 %	316931481
78	NC_014834	GCCGC	2	10	97828	97837	0 %	0 %	40 %	60 %	316931482
79	NC_014834	AACGC	2	10	99564	99573	40 %	0 %	20 %	40 %	316931483
80	NC_014834	GCTCG	2	10	99682	99691	0 %	20 %	40 %	40 %	316931483
81	NC_014834	CGCGC	2	10	102352	102361	0 %	0 %	40 %	60 %	316931486
82	NC_014834	GCCGC	2	10	104702	104711	0 %	0 %	40 %	60 %	316931490
83	NC_014834	CCGCG	2	10	104738	104747	0 %	0 %	40 %	60 %	316931490
84	NC_014834	GCGCA	2	10	106406	106415	20 %	0 %	40 %	40 %	316931492
85	NC_014834	GGCGA	2	10	107648	107657	20 %	0 %	60 %	20 %	316931493
86	NC_014834	GCCGC	2	10	108640	108649	0 %	0 %	40 %	60 %	316931493
87	NC_014834	CCTCG	2	10	110765	110774	0 %	20 %	20 %	60 %	316931494
88	NC_014834	GGCGC	2	10	111141	111150	0 %	0 %	60 %	40 %	316931495
89	NC_014834	CGGCG	2	10	111549	111558	0 %	0 %	60 %	40 %	316931495
90	NC_014834	GCCGC	2	10	113284	113293	0 %	0 %	40 %	60 %	316931497
91	NC_014834	ATCGA	2	10	113951	113960	40 %	20 %	20 %	20 %	316931498
92	NC_014834	GCGCG	2	10	115228	115237	0 %	0 %	60 %	40 %	316931499
93	NC_014834	ACGGC	2	10	117034	117043	20 %	0 %	40 %	40 %	316931501
94	NC_014834	GCGTC	2	10	117148	117157	0 %	20 %	40 %	40 %	316931501
95	NC_014834	GCCGC	2	10	117663	117672	0 %	0 %	40 %	60 %	316931502
96	NC_014834	CGCGG	2	10	117827	117836	0 %	0 %	60 %	40 %	316931502
97	NC_014834	CGCGG	2	10	119797	119806	0 %	0 %	60 %	40 %	316931503
98	NC_014834	CGGCT	2	10	120630	120639	0 %	20 %	40 %	40 %	316931503
99	NC_014834	CAGCG	2	10	121358	121367	20 %	0 %	40 %	40 %	316931504
100	NC_014834	CCGCA	2	10	122453	122462	20 %	0 %	20 %	60 %	316931505
101	NC_014834	CCGCG	2	10	123525	123534	0 %	0 %	40 %	60 %	316931506
102	NC_014834	CCGGC	2	10	126223	126232	0 %	0 %	40 %	60 %	316931509
103	NC_014834	TCCGG	2	10	126496	126505	0 %	20 %	40 %	40 %	316931509
104	NC_014834	CGACC	2	10	126532	126541	20 %	0 %	20 %	60 %	316931509
105	NC_014834	CGGGC	2	10	127998	128007	0 %	0 %	60 %	40 %	316931511
106	NC_014834	GCGAC	2	10	137237	137246	20 %	0 %	40 %	40 %	316931518
107	NC_014834	GGCGA	2	10	138768	138777	20 %	0 %	60 %	20 %	316931520
108	NC_014834	CCGCT	2	10	139362	139371	0 %	20 %	20 %	60 %	316931521
109	NC_014834	TGCCG	2	10	142598	142607	0 %	20 %	40 %	40 %	316931523
110	NC_014834	CAGGA	2	10	142864	142873	40 %	0 %	40 %	20 %	316931523
111	NC_014834	GCCGG	2	10	144173	144182	0 %	0 %	60 %	40 %	316931524
112	NC_014834	GCCCA	2	10	144607	144616	20 %	0 %	20 %	60 %	316931524
113	NC_014834	TCGCG	2	10	146112	146121	0 %	20 %	40 %	40 %	316931525
114	NC_014834	CGCGC	2	10	148272	148281	0 %	0 %	40 %	60 %	316931525
115	NC_014834	TCGGG	2	10	150811	150820	0 %	20 %	60 %	20 %	316931528
116	NC_014834	GGTGA	2	10	152132	152141	20 %	20 %	60 %	0 %	316931528
117	NC_014834	CGGAT	2	10	152206	152215	20 %	20 %	40 %	20 %	316931528
118	NC_014834	CTGGC	2	10	152927	152936	0 %	20 %	40 %	40 %	316931528
119	NC_014834	TGAAG	2	10	155229	155238	40 %	20 %	40 %	0 %	316931531
120	NC_014834	GGGCC	2	10	155544	155553	0 %	0 %	60 %	40 %	316931531
121	NC_014834	CGAAG	2	10	155595	155604	40 %	0 %	40 %	20 %	316931531
122	NC_014834	CGCGG	2	10	155804	155813	0 %	0 %	60 %	40 %	316931531
123	NC_014834	GCCGC	2	10	156154	156163	0 %	0 %	40 %	60 %	316931532
124	NC_014834	CAGCG	2	10	157412	157421	20 %	0 %	40 %	40 %	316931532
125	NC_014834	CGGCG	2	10	160395	160404	0 %	0 %	60 %	40 %	316931535
126	NC_014834	GCCGC	2	10	161233	161242	0 %	0 %	40 %	60 %	316931536
127	NC_014834	GCCGG	2	10	162392	162401	0 %	0 %	60 %	40 %	316931537
128	NC_014834	CGGAT	2	10	163770	163779	20 %	20 %	40 %	20 %	316931538
129	NC_014834	ACGCG	2	10	164208	164217	20 %	0 %	40 %	40 %	316931539
130	NC_014834	GCGAT	2	10	164549	164558	20 %	20 %	40 %	20 %	316931539
131	NC_014834	GCGCA	2	10	168244	168253	20 %	0 %	40 %	40 %	316931543
132	NC_014834	GCTCA	2	10	168788	168797	20 %	20 %	20 %	40 %	316931544
133	NC_014834	GGCGA	2	10	170663	170672	20 %	0 %	60 %	20 %	316931545
134	NC_014834	GATCT	2	10	171759	171768	20 %	40 %	20 %	20 %	316931546
135	NC_014834	GGCCG	2	10	175587	175596	0 %	0 %	60 %	40 %	316931549
136	NC_014834	CGTGG	2	10	175842	175851	0 %	20 %	60 %	20 %	316931550
137	NC_014834	GCCGA	2	10	177369	177378	20 %	0 %	40 %	40 %	316931551
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253	NC_014834	CCAAT	2	10	330153	330162	40 %	20 %	0 %	40 %	316931688
254	NC_014834	GACCG	2	10	330633	330642	20 %	0 %	40 %	40 %	316931688
255	NC_014834	CGAAT	2	10	331067	331076	40 %	20 %	20 %	20 %	316931689
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262	NC_014834	CGGTG	2	10	338933	338942	0 %	20 %	60 %	20 %	316931697
263	NC_014834	ACCGC	2	10	340330	340339	20 %	0 %	20 %	60 %	316931698
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