MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014834	CCT	2	6	145929	145934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931525
3502	NC_014834	TGG	2	6	145935	145940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931525
3503	NC_014834	GAA	2	6	145942	145947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931525
3504	NC_014834	TGC	2	6	145962	145967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3505	NC_014834	GCGATC	2	12	146000	146011	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3506	NC_014834	TCA	2	6	146021	146026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931525
3507	NC_014834	CCA	2	6	146064	146069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931525
3508	NC_014834	GCC	2	6	146098	146103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931525
3509	NC_014834	TCGCG	2	10	146112	146121	0 %	20 %	40 %	40 %	316931525
3510	NC_014834	GCA	2	6	146238	146243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3511	NC_014834	AGC	2	6	146261	146266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3512	NC_014834	GCT	2	6	146298	146303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3513	NC_014834	AGC	3	9	146318	146326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3514	NC_014834	CGG	2	6	146349	146354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931525
3515	NC_014834	CGC	2	6	146377	146382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931525
3516	NC_014834	TGA	2	6	146412	146417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931525
3517	NC_014834	TGT	2	6	146448	146453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931525
3518	NC_014834	GCC	2	6	146470	146475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931525
3519	NC_014834	TCT	2	6	146499	146504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931525
3520	NC_014834	GCT	2	6	146517	146522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3521	NC_014834	TCT	2	6	146535	146540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931525
3522	NC_014834	GAC	2	6	146566	146571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3523	NC_014834	GCC	2	6	146594	146599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931525
3524	NC_014834	ATC	2	6	146618	146623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931525
3525	NC_014834	CCTCGA	2	12	146643	146654	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	316931525
3526	NC_014834	GCT	2	6	146728	146733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3527	NC_014834	CG	3	6	146782	146787	0 %	0 %	50 %	50 %	316931525
3528	NC_014834	AGC	2	6	146798	146803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3529	NC_014834	GAT	2	6	146878	146883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931525
3530	NC_014834	CTG	2	6	146896	146901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3531	NC_014834	GCG	2	6	146905	146910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931525
3532	NC_014834	CTT	2	6	146926	146931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931525
3533	NC_014834	AGC	2	6	147092	147097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3534	NC_014834	CGAA	2	8	147144	147151	50 %	0 %	25 %	25 %	316931525
3535	NC_014834	CG	4	8	147198	147205	0 %	0 %	50 %	50 %	316931525
3536	NC_014834	CTC	2	6	147307	147312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931525
3537	NC_014834	CGAG	2	8	147320	147327	25 %	0 %	50 %	25 %	316931525
3538	NC_014834	CGC	3	9	147328	147336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931525
3539	NC_014834	CGC	3	9	147370	147378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931525
3540	NC_014834	ACC	2	6	147397	147402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931525
3541	NC_014834	TCGA	2	8	147446	147453	25 %	25 %	25 %	25 %	316931525
3542	NC_014834	GCC	2	6	147535	147540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931525
3543	NC_014834	TGG	2	6	147546	147551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931525
3544	NC_014834	CCG	2	6	147561	147566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931525
3545	NC_014834	CGA	2	6	147583	147588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3546	NC_014834	CGA	2	6	147603	147608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3547	NC_014834	GTC	2	6	147733	147738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3548	NC_014834	CCGA	2	8	147754	147761	25 %	0 %	25 %	50 %	316931525
3549	NC_014834	CG	3	6	147777	147782	0 %	0 %	50 %	50 %	316931525
3550	NC_014834	GCA	2	6	147795	147800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3551	NC_014834	AGT	2	6	147801	147806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931525
3552	NC_014834	GAC	2	6	147820	147825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3553	NC_014834	GAT	2	6	147829	147834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931525
3554	NC_014834	CG	3	6	147874	147879	0 %	0 %	50 %	50 %	316931525
3555	NC_014834	CAC	2	6	147892	147897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931525
3556	NC_014834	AGA	2	6	147899	147904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931525
3557	NC_014834	GCG	2	6	147923	147928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931525
3558	NC_014834	TTG	2	6	147989	147994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931525
3559	NC_014834	CGG	2	6	148024	148029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931525
3560	NC_014834	CCTT	2	8	148040	148047	0 %	50 %	0 %	50 %	316931525
3561	NC_014834	CGC	2	6	148062	148067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931525
3562	NC_014834	CGG	2	6	148084	148089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931525
3563	NC_014834	GCC	3	9	148102	148110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931525
3564	NC_014834	CGT	2	6	148149	148154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3565	NC_014834	CGA	2	6	148206	148211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3566	NC_014834	CGG	2	6	148240	148245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931525
3567	NC_014834	GGT	2	6	148255	148260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931525
3568	NC_014834	CGCGC	2	10	148272	148281	0 %	0 %	40 %	60 %	316931525
3569	NC_014834	ACG	2	6	148299	148304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3570	NC_014834	CAG	2	6	148360	148365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3571	NC_014834	CAC	2	6	148411	148416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931525
3572	NC_014834	GGT	2	6	148459	148464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931525
3573	NC_014834	CGC	2	6	148840	148845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931526
3574	NC_014834	TCT	2	6	148866	148871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931526
3575	NC_014834	CG	3	6	148879	148884	0 %	0 %	50 %	50 %	316931526
3576	NC_014834	CAG	2	6	148930	148935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931526
3577	NC_014834	CGC	2	6	149057	149062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931526
3578	NC_014834	TCGT	2	8	149438	149445	0 %	50 %	25 %	25 %	316931527
3579	NC_014834	CCG	2	6	149458	149463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931527
3580	NC_014834	GC	3	6	149497	149502	0 %	0 %	50 %	50 %	316931527
3581	NC_014834	GCT	2	6	149515	149520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931527
3582	NC_014834	GCG	2	6	149540	149545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931527
3583	NC_014834	GCG	3	9	149552	149560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931527
3584	NC_014834	TCGC	2	8	149591	149598	0 %	25 %	25 %	50 %	316931527
3585	NC_014834	CGA	3	9	149638	149646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931527
3586	NC_014834	CAC	2	6	149671	149676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931527
3587	NC_014834	CGG	2	6	149782	149787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931527
3588	NC_014834	AAG	2	6	149789	149794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931527
3589	NC_014834	CGA	2	6	149841	149846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931527
3590	NC_014834	GAGCCG	2	12	149849	149860	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	316931527
3591	NC_014834	CCG	3	9	149858	149866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931527
3592	NC_014834	CCG	2	6	149899	149904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931527
3593	NC_014834	GATC	2	8	149911	149918	25 %	25 %	25 %	25 %	316931527
3594	NC_014834	CGC	2	6	150136	150141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931527
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3596	NC_014834	CTGG	2	8	150178	150185	0 %	25 %	50 %	25 %	316931527
3597	NC_014834	GGC	2	6	150298	150303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931527
3598	NC_014834	CG	3	6	150659	150664	0 %	0 %	50 %	50 %	316931528
3599	NC_014834	GCT	2	6	150775	150780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931528
3600	NC_014834	CG	4	8	150781	150788	0 %	0 %	50 %	50 %	316931528
3601	NC_014834	ACA	2	6	150795	150800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931528
3602	NC_014834	TCG	2	6	150804	150809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931528
3603	NC_014834	TCGGG	2	10	150811	150820	0 %	20 %	60 %	20 %	316931528
3604	NC_014834	GAG	2	6	150848	150853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931528
3605	NC_014834	CG	3	6	150906	150911	0 %	0 %	50 %	50 %	316931528
3606	NC_014834	CGA	2	6	150937	150942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931528
3607	NC_014834	CGC	2	6	150952	150957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931528
3608	NC_014834	ACCG	2	8	150983	150990	25 %	0 %	25 %	50 %	316931528
3609	NC_014834	CGA	2	6	151038	151043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931528
3610	NC_014834	GAT	2	6	151051	151056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931528
3611	NC_014834	GCT	2	6	151063	151068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931528
3612	NC_014834	CGA	2	6	151177	151182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931528
3613	NC_014834	CGG	2	6	151219	151224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931528
3614	NC_014834	CGC	2	6	151225	151230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931528
3615	NC_014834	GCTC	2	8	151242	151249	0 %	25 %	25 %	50 %	316931528
3616	NC_014834	TCGCCT	2	12	151359	151370	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	316931528
3617	NC_014834	CGC	2	6	151400	151405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931528
3618	NC_014834	CGGG	3	12	151435	151446	0 %	0 %	75 %	25 %	316931528
3619	NC_014834	GC	3	6	151447	151452	0 %	0 %	50 %	50 %	316931528
3620	NC_014834	CAC	2	6	151474	151479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931528
3621	NC_014834	GC	3	6	151488	151493	0 %	0 %	50 %	50 %	316931528
3622	NC_014834	TGC	2	6	151551	151556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931528
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3702	NC_014834	GAG	2	6	155386	155391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931531
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3744	NC_014834	CGA	2	6	157070	157075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931532
3745	NC_014834	GGC	2	6	157208	157213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931532
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3865	NC_014834	CGA	2	6	162281	162286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931537
3866	NC_014834	CTT	2	6	162291	162296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931537
3867	NC_014834	GTA	2	6	162321	162326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931537
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3983	NC_014834	CTG	3	9	166761	166769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931542
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3986	NC_014834	CTT	2	6	167230	167235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931543
3987	NC_014834	GTG	2	6	167267	167272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931543
3988	NC_014834	CGC	2	6	167292	167297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931543
3989	NC_014834	CAGG	2	8	167365	167372	25 %	0 %	50 %	25 %	316931543
3990	NC_014834	TCG	2	6	167384	167389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931543
3991	NC_014834	GAA	2	6	167407	167412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931543
3992	NC_014834	GCG	2	6	167453	167458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931543
3993	NC_014834	ATCG	2	8	167467	167474	25 %	25 %	25 %	25 %	316931543
3994	NC_014834	GTT	2	6	167509	167514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931543
3995	NC_014834	TCA	2	6	167535	167540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931543
3996	NC_014834	GATC	2	8	167541	167548	25 %	25 %	25 %	25 %	316931543
3997	NC_014834	CGG	2	6	167553	167558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931543
3998	NC_014834	CGG	2	6	167610	167615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931543
3999	NC_014834	GGC	3	9	167677	167685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931543
4000	NC_014834	GCA	2	6	167715	167720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931543

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