MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014834	GCG	2	6	125343	125348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931508
3002	NC_014834	GTCG	2	8	125352	125359	0 %	25 %	50 %	25 %	316931508
3003	NC_014834	CGG	2	6	125393	125398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931508
3004	NC_014834	CAC	2	6	125403	125408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931508
3005	NC_014834	GCA	2	6	125485	125490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931508
3006	NC_014834	GAA	2	6	125514	125519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931508
3007	NC_014834	CCAG	2	8	125558	125565	25 %	0 %	25 %	50 %	316931508
3008	NC_014834	GCC	2	6	126081	126086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931509
3009	NC_014834	GC	3	6	126095	126100	0 %	0 %	50 %	50 %	316931509
3010	NC_014834	CTG	2	6	126170	126175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931509
3011	NC_014834	CCGGC	2	10	126223	126232	0 %	0 %	40 %	60 %	316931509
3012	NC_014834	TCG	2	6	126240	126245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931509
3013	NC_014834	GTG	2	6	126266	126271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931509
3014	NC_014834	GCG	2	6	126281	126286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931509
3015	NC_014834	TCG	2	6	126291	126296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931509
3016	NC_014834	GCC	2	6	126299	126304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931509
3017	NC_014834	CGT	2	6	126307	126312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931509
3018	NC_014834	GCG	4	12	126332	126343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931509
3019	NC_014834	GC	3	6	126391	126396	0 %	0 %	50 %	50 %	316931509
3020	NC_014834	GCG	2	6	126458	126463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931509
3021	NC_014834	CGG	2	6	126466	126471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931509
3022	NC_014834	TCCGG	2	10	126496	126505	0 %	20 %	40 %	40 %	316931509
3023	NC_014834	CGACC	2	10	126532	126541	20 %	0 %	20 %	60 %	316931509
3024	NC_014834	GCA	2	6	126598	126603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931509
3025	NC_014834	GC	3	6	126607	126612	0 %	0 %	50 %	50 %	316931509
3026	NC_014834	GC	3	6	126681	126686	0 %	0 %	50 %	50 %	316931509
3027	NC_014834	CG	4	8	126694	126701	0 %	0 %	50 %	50 %	316931509
3028	NC_014834	GCG	2	6	126704	126709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931509
3029	NC_014834	GCG	2	6	126720	126725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931509
3030	NC_014834	GAA	2	6	126801	126806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931510
3031	NC_014834	CCGC	2	8	126869	126876	0 %	0 %	25 %	75 %	316931510
3032	NC_014834	CCGG	2	8	126953	126960	0 %	0 %	50 %	50 %	316931510
3033	NC_014834	CG	3	6	126961	126966	0 %	0 %	50 %	50 %	316931510
3034	NC_014834	CGAT	2	8	126998	127005	25 %	25 %	25 %	25 %	316931510
3035	NC_014834	CGT	2	6	127050	127055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931510
3036	NC_014834	CGA	3	9	127071	127079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931510
3037	NC_014834	CGC	2	6	127083	127088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931510
3038	NC_014834	GC	4	8	127131	127138	0 %	0 %	50 %	50 %	316931510
3039	NC_014834	AGC	2	6	127159	127164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931510
3040	NC_014834	CAT	2	6	127203	127208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931510
3041	NC_014834	CCGG	2	8	127209	127216	0 %	0 %	50 %	50 %	316931510
3042	NC_014834	GC	3	6	127217	127222	0 %	0 %	50 %	50 %	316931510
3043	NC_014834	CGC	2	6	127283	127288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931510
3044	NC_014834	CAC	2	6	127320	127325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931510
3045	NC_014834	CCG	2	6	127330	127335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931510
3046	NC_014834	AGCG	2	8	127336	127343	25 %	0 %	50 %	25 %	316931510
3047	NC_014834	ATG	2	6	127369	127374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931510
3048	NC_014834	CGG	3	9	127440	127448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931510
3049	NC_014834	GTG	2	6	127557	127562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931510
3050	NC_014834	GGT	2	6	127626	127631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931510
3051	NC_014834	GCT	2	6	127638	127643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931510
3052	NC_014834	GCG	2	6	127793	127798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931511
3053	NC_014834	CAT	2	6	127800	127805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931511
3054	NC_014834	CGA	2	6	127896	127901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931511
3055	NC_014834	TGC	2	6	127916	127921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931511
3056	NC_014834	GCC	2	6	127956	127961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931511
3057	NC_014834	CGGGC	2	10	127998	128007	0 %	0 %	60 %	40 %	316931511
3058	NC_014834	CT	3	6	128025	128030	0 %	50 %	0 %	50 %	316931511
3059	NC_014834	TCCT	2	8	128077	128084	0 %	50 %	0 %	50 %	316931511
3060	NC_014834	CCG	2	6	128168	128173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931511
3061	NC_014834	CGC	2	6	128214	128219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931511
3062	NC_014834	TTC	2	6	128248	128253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931511
3063	NC_014834	CGA	2	6	128358	128363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931511
3064	NC_014834	CGAC	2	8	128396	128403	25 %	0 %	25 %	50 %	316931511
3065	NC_014834	GCG	2	6	128418	128423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931511
3066	NC_014834	CTG	2	6	128482	128487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931511
3067	NC_014834	GCG	2	6	128488	128493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931511
3068	NC_014834	CGC	2	6	128498	128503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931511
3069	NC_014834	GAA	2	6	128574	128579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931511
3070	NC_014834	GAAG	2	8	128616	128623	50 %	0 %	50 %	0 %	316931511
3071	NC_014834	CAT	2	6	128653	128658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931511
3072	NC_014834	GGC	2	6	128694	128699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931511
3073	NC_014834	GCT	2	6	128724	128729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931511
3074	NC_014834	GAAG	2	8	128739	128746	50 %	0 %	50 %	0 %	316931511
3075	NC_014834	CTG	2	6	128806	128811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931511
3076	NC_014834	GC	3	6	128841	128846	0 %	0 %	50 %	50 %	316931511
3077	NC_014834	GCTC	2	8	128852	128859	0 %	25 %	25 %	50 %	316931511
3078	NC_014834	GAT	2	6	128874	128879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931511
3079	NC_014834	CGG	2	6	128886	128891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931511
3080	NC_014834	CGG	2	6	128907	128912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931511
3081	NC_014834	AC	3	6	128933	128938	50 %	0 %	0 %	50 %	316931511
3082	NC_014834	GCT	2	6	128952	128957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931511
3083	NC_014834	GCT	2	6	128973	128978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931511
3084	NC_014834	CGC	2	6	128985	128990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931511
3085	NC_014834	CCG	2	6	129029	129034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931511
3086	NC_014834	CG	3	6	129247	129252	0 %	0 %	50 %	50 %	316931511
3087	NC_014834	GAC	2	6	129265	129270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931511
3088	NC_014834	GCC	2	6	129280	129285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931511
3089	NC_014834	TCG	2	6	129314	129319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931511
3090	NC_014834	CCG	2	6	129404	129409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931511
3091	NC_014834	CCA	2	6	129435	129440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931511
3092	NC_014834	CAC	2	6	129444	129449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931511
3093	NC_014834	CGA	2	6	129480	129485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931511
3094	NC_014834	CAG	2	6	129496	129501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931511
3095	NC_014834	CCA	2	6	129506	129511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931511
3096	NC_014834	GCT	2	6	129552	129557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931511
3097	NC_014834	GGC	2	6	129571	129576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931511
3098	NC_014834	AGC	2	6	129582	129587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931511
3099	NC_014834	CG	3	6	129639	129644	0 %	0 %	50 %	50 %	316931511
3100	NC_014834	CGC	2	6	129809	129814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931511
3101	NC_014834	CTA	2	6	129819	129824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931511
3102	NC_014834	CGG	2	6	129966	129971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931511
3103	NC_014834	GCC	2	6	130087	130092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931512
3104	NC_014834	TGC	2	6	130098	130103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931512
3105	NC_014834	GCTGAT	2	12	130135	130146	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	316931512
3106	NC_014834	CAG	2	6	130265	130270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931512
3107	NC_014834	TCA	2	6	130287	130292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931512
3108	NC_014834	GCT	2	6	130321	130326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931512
3109	NC_014834	GCT	2	6	130333	130338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931512
3110	NC_014834	CAG	2	6	130364	130369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931512
3111	NC_014834	CCG	2	6	130381	130386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931512
3112	NC_014834	CGC	2	6	130391	130396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931512
3113	NC_014834	GGT	2	6	130459	130464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931512
3114	NC_014834	GC	3	6	130516	130521	0 %	0 %	50 %	50 %	316931512
3115	NC_014834	GCA	2	6	130525	130530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931512
3116	NC_014834	GCC	2	6	130604	130609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931512
3117	NC_014834	TGA	2	6	130614	130619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931512
3118	NC_014834	ACG	2	6	130653	130658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931512
3119	NC_014834	CGC	2	6	130684	130689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931512
3120	NC_014834	CCG	2	6	130743	130748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931512
3121	NC_014834	GCAC	2	8	130767	130774	25 %	0 %	25 %	50 %	316931512
3122	NC_014834	ACC	2	6	130806	130811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931512
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3124	NC_014834	GC	3	6	130893	130898	0 %	0 %	50 %	50 %	316931512
3125	NC_014834	CGG	2	6	130911	130916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931512
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3133	NC_014834	CGA	3	9	131122	131130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931512
3134	NC_014834	GCGATC	2	12	131144	131155	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	316931512
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3142	NC_014834	GC	3	6	131463	131468	0 %	0 %	50 %	50 %	316931512
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3230	NC_014834	CGA	3	9	134768	134776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931516
3231	NC_014834	TGA	2	6	134783	134788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931516
3232	NC_014834	CGG	2	6	134798	134803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931516
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3234	NC_014834	GCTG	2	8	134879	134886	0 %	25 %	50 %	25 %	316931516
3235	NC_014834	AAT	2	6	134909	134914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	316931516
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3238	NC_014834	CG	3	6	135022	135027	0 %	0 %	50 %	50 %	316931516
3239	NC_014834	GAA	2	6	135057	135062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931516
3240	NC_014834	GC	3	6	135131	135136	0 %	0 %	50 %	50 %	316931516
3241	NC_014834	GCA	3	9	135146	135154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931516
3242	NC_014834	GCG	2	6	135179	135184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931516
3243	NC_014834	GGC	2	6	135258	135263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931516
3244	NC_014834	ATG	2	6	135384	135389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931516
3245	NC_014834	GCG	2	6	135496	135501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931516
3246	NC_014834	TCG	2	6	135528	135533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931516
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3362	NC_014834	CCTG	2	8	140501	140508	0 %	25 %	25 %	50 %	316931522
3363	NC_014834	AGC	2	6	140515	140520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931522
3364	NC_014834	GGT	2	6	140523	140528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931522
3365	NC_014834	GGC	2	6	140529	140534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931522
3366	NC_014834	CGGC	2	8	140563	140570	0 %	0 %	50 %	50 %	316931522
3367	NC_014834	GCA	2	6	140651	140656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931522
3368	NC_014834	CAG	2	6	140667	140672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931522
3369	NC_014834	ACA	2	6	140696	140701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931522
3370	NC_014834	TGC	2	6	140705	140710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931522
3371	NC_014834	CG	3	6	140747	140752	0 %	0 %	50 %	50 %	316931522
3372	NC_014834	ACG	2	6	140779	140784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931522
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3374	NC_014834	GCC	2	6	140824	140829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931522
3375	NC_014834	AGGTCG	2	12	140834	140845	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	316931522
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3377	NC_014834	CG	3	6	140955	140960	0 %	0 %	50 %	50 %	316931522
3378	NC_014834	GCC	2	6	141049	141054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931522
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3382	NC_014834	TGC	2	6	141172	141177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931523
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3384	NC_014834	GCA	2	6	141209	141214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931523
3385	NC_014834	GCA	2	6	141245	141250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931523
3386	NC_014834	TTG	2	6	141280	141285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931523
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3390	NC_014834	GCC	2	6	141399	141404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931523
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3400	NC_014834	CGT	2	6	141803	141808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931523
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3429	NC_014834	TCG	2	6	142925	142930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931523
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3442	NC_014834	CTG	2	6	143452	143457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931524
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3445	NC_014834	GCTC	2	8	143544	143551	0 %	25 %	25 %	50 %	316931524
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3447	NC_014834	CGGC	2	8	143673	143680	0 %	0 %	50 %	50 %	316931524
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3452	NC_014834	GCG	2	6	143805	143810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931524
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3463	NC_014834	GCA	3	9	144141	144149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931524
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3475	NC_014834	CA	3	6	144615	144620	50 %	0 %	0 %	50 %	316931524
3476	NC_014834	GTC	2	6	144658	144663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931524
3477	NC_014834	CATC	2	8	144678	144685	25 %	25 %	0 %	50 %	316931524
3478	NC_014834	CGG	3	9	144765	144773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931524
3479	NC_014834	GAA	2	6	144826	144831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931524
3480	NC_014834	CGT	2	6	144867	144872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931524
3481	NC_014834	TCG	2	6	144926	144931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931524
3482	NC_014834	CGT	2	6	144939	144944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931524
3483	NC_014834	ACC	2	6	144971	144976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931524
3484	NC_014834	ACCG	2	8	145304	145311	25 %	0 %	25 %	50 %	316931525
3485	NC_014834	GAC	2	6	145318	145323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3486	NC_014834	CGG	2	6	145397	145402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931525
3487	NC_014834	ATC	2	6	145403	145408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931525
3488	NC_014834	CAG	3	9	145441	145449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3489	NC_014834	CAC	2	6	145582	145587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931525
3490	NC_014834	CAG	2	6	145597	145602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3491	NC_014834	CCGA	2	8	145652	145659	25 %	0 %	25 %	50 %	316931525
3492	NC_014834	GTG	2	6	145664	145669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931525
3493	NC_014834	CGT	2	6	145716	145721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3494	NC_014834	GCC	2	6	145747	145752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931525
3495	NC_014834	GC	6	12	145799	145810	0 %	0 %	50 %	50 %	316931525
3496	NC_014834	CGT	2	6	145828	145833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931525
3497	NC_014834	CTC	2	6	145843	145848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931525
3498	NC_014834	CCG	2	6	145868	145873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931525
3499	NC_014834	TGA	2	6	145881	145886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931525
3500	NC_014834	GAGGCC	2	12	145903	145914	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	316931525

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