MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014834	CGA	2	6	42369	42374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931431
1002	NC_014834	CAC	2	6	42424	42429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931431
1003	NC_014834	CGA	2	6	42473	42478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931431
1004	NC_014834	GTC	2	6	42547	42552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931431
1005	NC_014834	ACC	2	6	42569	42574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931431
1006	NC_014834	GCC	2	6	42592	42597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931431
1007	NC_014834	GCA	2	6	42639	42644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931431
1008	NC_014834	CGC	2	6	42660	42665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931431
1009	NC_014834	GC	3	6	42679	42684	0 %	0 %	50 %	50 %	316931431
1010	NC_014834	GGT	2	6	42763	42768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931431
1011	NC_014834	AGC	2	6	42777	42782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931431
1012	NC_014834	GCGA	2	8	42809	42816	25 %	0 %	50 %	25 %	316931431
1013	NC_014834	TCG	2	6	42830	42835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931431
1014	NC_014834	CGA	2	6	42850	42855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931431
1015	NC_014834	CAG	2	6	42886	42891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931431
1016	NC_014834	GGCGC	2	10	42907	42916	0 %	0 %	60 %	40 %	316931431
1017	NC_014834	ACC	2	6	42917	42922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931431
1018	NC_014834	GGC	2	6	42940	42945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931431
1019	NC_014834	GCGA	2	8	42966	42973	25 %	0 %	50 %	25 %	316931431
1020	NC_014834	CGG	3	9	43200	43208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931431
1021	NC_014834	CG	4	8	43215	43222	0 %	0 %	50 %	50 %	316931431
1022	NC_014834	CGGC	2	8	43329	43336	0 %	0 %	50 %	50 %	316931431
1023	NC_014834	GAT	2	6	43342	43347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931431
1024	NC_014834	CGT	2	6	43350	43355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931431
1025	NC_014834	GCC	2	6	43379	43384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931431
1026	NC_014834	CGC	2	6	43410	43415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931431
1027	NC_014834	GCG	2	6	43467	43472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931431
1028	NC_014834	GC	3	6	43506	43511	0 %	0 %	50 %	50 %	316931431
1029	NC_014834	CAC	2	6	43516	43521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931431
1030	NC_014834	CGG	2	6	43593	43598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931431
1031	NC_014834	GCCTTG	2	12	43631	43642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931431
1032	NC_014834	CCTCAA	2	12	43653	43664	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	316931431
1033	NC_014834	TCG	2	6	43706	43711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931431
1034	NC_014834	GAT	2	6	43719	43724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931431
1035	NC_014834	GTT	2	6	43912	43917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931432
1036	NC_014834	GGC	2	6	43918	43923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931432
1037	NC_014834	CGC	2	6	43945	43950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931432
1038	NC_014834	GC	3	6	43949	43954	0 %	0 %	50 %	50 %	316931432
1039	NC_014834	GC	3	6	43958	43963	0 %	0 %	50 %	50 %	316931432
1040	NC_014834	TCG	2	6	44138	44143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931432
1041	NC_014834	ACC	2	6	44155	44160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931432
1042	NC_014834	ACC	2	6	44171	44176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931432
1043	NC_014834	T	6	6	44179	44184	0 %	100 %	0 %	0 %	316931432
1044	NC_014834	CG	4	8	44316	44323	0 %	0 %	50 %	50 %	316931432
1045	NC_014834	GGC	2	6	44325	44330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931432
1046	NC_014834	C	6	6	44625	44630	0 %	0 %	0 %	100 %	316931433
1047	NC_014834	CGAT	2	8	44739	44746	25 %	25 %	25 %	25 %	316931433
1048	NC_014834	CTTCGC	2	12	44848	44859	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	316931433
1049	NC_014834	CGG	2	6	44883	44888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931433
1050	NC_014834	GAA	2	6	44927	44932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931433
1051	NC_014834	GAA	2	6	44969	44974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931433
1052	NC_014834	GTCACT	2	12	45077	45088	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	316931433
1053	NC_014834	CGG	2	6	45122	45127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931433
1054	NC_014834	CTTC	2	8	45196	45203	0 %	50 %	0 %	50 %	316931433
1055	NC_014834	GTC	2	6	45278	45283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931433
1056	NC_014834	CTGA	2	8	45356	45363	25 %	25 %	25 %	25 %	316931433
1057	NC_014834	GCCG	2	8	45373	45380	0 %	0 %	50 %	50 %	316931433
1058	NC_014834	GCG	2	6	45450	45455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931433
1059	NC_014834	CGG	2	6	45471	45476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931433
1060	NC_014834	CGC	2	6	45518	45523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931433
1061	NC_014834	GCT	2	6	45538	45543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931433
1062	NC_014834	AGC	2	6	45570	45575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931433
1063	NC_014834	CTT	2	6	45590	45595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931433
1064	NC_014834	TCG	2	6	45633	45638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931433
1065	NC_014834	GGC	3	9	45641	45649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931433
1066	NC_014834	CGC	2	6	45855	45860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931434
1067	NC_014834	CGA	3	9	45899	45907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931434
1068	NC_014834	TGA	2	6	45929	45934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931434
1069	NC_014834	GC	3	6	45992	45997	0 %	0 %	50 %	50 %	316931434
1070	NC_014834	CTT	2	6	46008	46013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931434
1071	NC_014834	GGCC	2	8	46040	46047	0 %	0 %	50 %	50 %	316931434
1072	NC_014834	CGA	2	6	46087	46092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931434
1073	NC_014834	CTT	2	6	46122	46127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931434
1074	NC_014834	AAG	2	6	46274	46279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931435
1075	NC_014834	CTT	2	6	46282	46287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931435
1076	NC_014834	TGT	2	6	46290	46295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931435
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1078	NC_014834	ACC	2	6	46394	46399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931435
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1081	NC_014834	AGC	2	6	46889	46894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931436
1082	NC_014834	GAA	2	6	46969	46974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931436
1083	NC_014834	CGT	2	6	46998	47003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931436
1084	NC_014834	TCG	2	6	47012	47017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931436
1085	NC_014834	ATC	2	6	47018	47023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931436
1086	NC_014834	CGA	2	6	47049	47054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931436
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1088	NC_014834	GC	3	6	47068	47073	0 %	0 %	50 %	50 %	316931436
1089	NC_014834	CGG	2	6	47076	47081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931436
1090	NC_014834	CTT	2	6	47083	47088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931436
1091	NC_014834	TACTTG	2	12	47099	47110	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	316931436
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1093	NC_014834	CGA	2	6	47140	47145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931436
1094	NC_014834	CCA	2	6	47160	47165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931436
1095	NC_014834	G	6	6	47302	47307	0 %	0 %	100 %	0 %	316931436
1096	NC_014834	GCG	2	6	47323	47328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931436
1097	NC_014834	TTC	2	6	47662	47667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931437
1098	NC_014834	GGCGC	2	10	47705	47714	0 %	0 %	60 %	40 %	316931437
1099	NC_014834	CGG	2	6	47767	47772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931437
1100	NC_014834	GTC	2	6	47875	47880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931437
1101	NC_014834	AG	3	6	47920	47925	50 %	0 %	50 %	0 %	316931437
1102	NC_014834	CTC	2	6	47974	47979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931437
1103	NC_014834	GGC	2	6	47984	47989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931437
1104	NC_014834	CTG	3	9	47999	48007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931437
1105	NC_014834	GC	4	8	48008	48015	0 %	0 %	50 %	50 %	316931437
1106	NC_014834	CGG	2	6	48028	48033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931437
1107	NC_014834	GGC	2	6	48037	48042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931437
1108	NC_014834	CGCCGG	2	12	48072	48083	0 %	0 %	50 %	50 %	316931437
1109	NC_014834	G	6	6	48147	48152	0 %	0 %	100 %	0 %	316931437
1110	NC_014834	ATC	2	6	48222	48227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931437
1111	NC_014834	CGG	2	6	48235	48240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931437
1112	NC_014834	CCGA	2	8	48335	48342	25 %	0 %	25 %	50 %	316931437
1113	NC_014834	ACC	2	6	48375	48380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931437
1114	NC_014834	GCC	2	6	48387	48392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931437
1115	NC_014834	GGC	2	6	48415	48420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931437
1116	NC_014834	GAG	2	6	48425	48430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931437
1117	NC_014834	TCCG	2	8	48451	48458	0 %	25 %	25 %	50 %	316931438
1118	NC_014834	TCG	2	6	48475	48480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931438
1119	NC_014834	CCG	2	6	48545	48550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931438
1120	NC_014834	AGC	2	6	48580	48585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931438
1121	NC_014834	AAC	2	6	48703	48708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931438
1122	NC_014834	GC	3	6	48745	48750	0 %	0 %	50 %	50 %	316931438
1123	NC_014834	GCG	2	6	48763	48768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931438
1124	NC_014834	GTC	2	6	48825	48830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931438
1125	NC_014834	CG	3	6	48869	48874	0 %	0 %	50 %	50 %	316931438
1126	NC_014834	CGG	2	6	48950	48955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931438
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1132	NC_014834	CG	3	6	49198	49203	0 %	0 %	50 %	50 %	316931438
1133	NC_014834	CGT	2	6	49229	49234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931438
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1245	NC_014834	GTG	2	6	54559	54564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931444
1246	NC_014834	TGG	2	6	54596	54601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931444
1247	NC_014834	GATCAG	2	12	54610	54621	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	316931444
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1249	NC_014834	TCG	2	6	54685	54690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931444
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1359	NC_014834	CCGC	2	8	60160	60167	0 %	0 %	25 %	75 %	316931451
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1365	NC_014834	CGG	3	9	60593	60601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931452
1366	NC_014834	CCGTAA	2	12	60604	60615	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	316931452
1367	NC_014834	GCC	2	6	60636	60641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931452
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1369	NC_014834	ACC	3	9	60693	60701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931452
1370	NC_014834	CCG	2	6	60802	60807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931452
1371	NC_014834	CGG	2	6	60860	60865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931452
1372	NC_014834	CGA	2	6	60940	60945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931452
1373	NC_014834	GGT	2	6	60947	60952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931452
1374	NC_014834	GCCG	2	8	60954	60961	0 %	0 %	50 %	50 %	316931452
1375	NC_014834	TCA	2	6	61009	61014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931452
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1377	NC_014834	GGT	2	6	61073	61078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931452
1378	NC_014834	TCG	2	6	61155	61160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931452
1379	NC_014834	GCC	2	6	61220	61225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931452
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1381	NC_014834	GC	3	6	61274	61279	0 %	0 %	50 %	50 %	316931452
1382	NC_014834	CGGC	2	8	61411	61418	0 %	0 %	50 %	50 %	316931452
1383	NC_014834	GCC	2	6	61439	61444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931452
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1492	NC_014834	GCGAG	2	10	66046	66055	20 %	0 %	60 %	20 %	316931456
1493	NC_014834	TTG	2	6	66075	66080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931456
1494	NC_014834	CGC	2	6	66101	66106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931456
1495	NC_014834	GGA	2	6	66123	66128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931456
1496	NC_014834	TCG	2	6	66144	66149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931456
1497	NC_014834	CGG	2	6	66155	66160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931456
1498	NC_014834	GCC	2	6	66215	66220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931456
1499	NC_014834	GATC	2	8	66235	66242	25 %	25 %	25 %	25 %	316931456
1500	NC_014834	ATG	2	6	66639	66644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931457

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