MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014834	CCG	2	6	21802	21807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931415
502	NC_014834	AGT	2	6	21814	21819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931415
503	NC_014834	TCG	2	6	21837	21842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931415
504	NC_014834	CGGA	2	8	21848	21855	25 %	0 %	50 %	25 %	316931415
505	NC_014834	GCG	2	6	21976	21981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931415
506	NC_014834	GCC	2	6	21995	22000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931415
507	NC_014834	ACG	2	6	22008	22013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931415
508	NC_014834	CGA	2	6	22024	22029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931415
509	NC_014834	GAC	2	6	22034	22039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931415
510	NC_014834	TTGC	2	8	22081	22088	0 %	50 %	25 %	25 %	316931415
511	NC_014834	GC	3	6	22183	22188	0 %	0 %	50 %	50 %	316931416
512	NC_014834	CCG	3	9	22203	22211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931416
513	NC_014834	GCG	2	6	22212	22217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931416
514	NC_014834	CGAC	2	8	22246	22253	25 %	0 %	25 %	50 %	316931416
515	NC_014834	CGAG	2	8	22279	22286	25 %	0 %	50 %	25 %	316931416
516	NC_014834	GCT	2	6	22405	22410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931416
517	NC_014834	GC	3	6	22444	22449	0 %	0 %	50 %	50 %	316931416
518	NC_014834	GC	3	6	22477	22482	0 %	0 %	50 %	50 %	316931416
519	NC_014834	CAT	2	6	22547	22552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931416
520	NC_014834	CGAC	2	8	22585	22592	25 %	0 %	25 %	50 %	316931416
521	NC_014834	ACC	2	6	22593	22598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931416
522	NC_014834	GCA	2	6	22606	22611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931416
523	NC_014834	TCA	2	6	22651	22656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931416
524	NC_014834	GCC	2	6	22670	22675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931416
525	NC_014834	GGT	2	6	22753	22758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931416
526	NC_014834	GAT	2	6	22802	22807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931416
527	NC_014834	CCGC	2	8	22837	22844	0 %	0 %	25 %	75 %	316931416
528	NC_014834	AGT	2	6	22855	22860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931416
529	NC_014834	ATG	2	6	22863	22868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931416
530	NC_014834	CGG	2	6	22879	22884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931416
531	NC_014834	GAA	2	6	22889	22894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931416
532	NC_014834	ACC	2	6	22915	22920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931416
533	NC_014834	TTG	2	6	22998	23003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931416
534	NC_014834	GCA	2	6	23011	23016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931416
535	NC_014834	TGA	3	9	23026	23034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931416
536	NC_014834	TCA	2	6	23083	23088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931416
537	NC_014834	CAG	2	6	23105	23110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931416
538	NC_014834	GAA	2	6	23219	23224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931416
539	NC_014834	GC	3	6	23270	23275	0 %	0 %	50 %	50 %	316931416
540	NC_014834	TCT	2	6	23284	23289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931416
541	NC_014834	ACG	2	6	23292	23297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931416
542	NC_014834	CAG	2	6	23312	23317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931416
543	NC_014834	GCC	2	6	23324	23329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931416
544	NC_014834	GCCG	2	8	23368	23375	0 %	0 %	50 %	50 %	316931416
545	NC_014834	CGG	2	6	23437	23442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931416
546	NC_014834	GCG	2	6	23530	23535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931416
547	NC_014834	GAT	2	6	23564	23569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931416
548	NC_014834	CGAG	2	8	23602	23609	25 %	0 %	50 %	25 %	316931416
549	NC_014834	CGC	2	6	23645	23650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931416
550	NC_014834	ACC	2	6	23693	23698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931416
551	NC_014834	CAC	2	6	24040	24045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931417
552	NC_014834	GCT	2	6	24095	24100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931417
553	NC_014834	GCGG	2	8	24133	24140	0 %	0 %	75 %	25 %	316931417
554	NC_014834	CAG	2	6	24144	24149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931417
555	NC_014834	GAT	2	6	24228	24233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931417
556	NC_014834	TTC	2	6	24253	24258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931417
557	NC_014834	CG	3	6	24269	24274	0 %	0 %	50 %	50 %	316931417
558	NC_014834	CGC	2	6	24321	24326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931417
559	NC_014834	GCC	2	6	24336	24341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931417
560	NC_014834	GAA	2	6	24366	24371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931417
561	NC_014834	TCCCG	2	10	24412	24421	0 %	20 %	20 %	60 %	316931417
562	NC_014834	GGT	2	6	24474	24479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931417
563	NC_014834	GCG	2	6	24533	24538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931417
564	NC_014834	GCGTCG	2	12	24544	24555	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316931417
565	NC_014834	CG	3	6	24601	24606	0 %	0 %	50 %	50 %	316931417
566	NC_014834	GCC	2	6	24615	24620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931417
567	NC_014834	GGC	2	6	24621	24626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931417
568	NC_014834	CCA	2	6	24638	24643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931417
569	NC_014834	GCG	2	6	24644	24649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931417
570	NC_014834	CGGC	2	8	24670	24677	0 %	0 %	50 %	50 %	316931417
571	NC_014834	CGG	2	6	24695	24700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931417
572	NC_014834	CTT	2	6	24705	24710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931417
573	NC_014834	GTTGC	2	10	24757	24766	0 %	40 %	40 %	20 %	316931417
574	NC_014834	GAA	2	6	24938	24943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931418
575	NC_014834	CGA	2	6	24955	24960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931418
576	NC_014834	CGAAC	2	10	24971	24980	40 %	0 %	20 %	40 %	316931418
577	NC_014834	CAG	2	6	25052	25057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931418
578	NC_014834	CGA	3	9	25076	25084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931418
579	NC_014834	GCC	2	6	25089	25094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931418
580	NC_014834	GCG	2	6	25095	25100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931418
581	NC_014834	TCT	2	6	25117	25122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931418
582	NC_014834	CCG	2	6	25195	25200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931418
583	NC_014834	CCG	2	6	25333	25338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931418
584	NC_014834	TTG	3	9	25344	25352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931418
585	NC_014834	GCC	2	6	25367	25372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931418
586	NC_014834	CCG	2	6	25409	25414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931418
587	NC_014834	GCGGG	2	10	25480	25489	0 %	0 %	80 %	20 %	316931418
588	NC_014834	CAT	2	6	25726	25731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931419
589	NC_014834	CAA	2	6	25734	25739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931419
590	NC_014834	TCGC	2	8	25743	25750	0 %	25 %	25 %	50 %	316931419
591	NC_014834	GGA	2	6	25770	25775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931419
592	NC_014834	ATG	2	6	25822	25827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931419
593	NC_014834	GC	3	6	25842	25847	0 %	0 %	50 %	50 %	316931419
594	NC_014834	CAT	2	6	25914	25919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931419
595	NC_014834	CGGC	2	8	25947	25954	0 %	0 %	50 %	50 %	316931419
596	NC_014834	CGC	2	6	25961	25966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931419
597	NC_014834	GCC	2	6	26028	26033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931419
598	NC_014834	CTG	2	6	26038	26043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931419
599	NC_014834	GCT	2	6	26046	26051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931419
600	NC_014834	GAT	2	6	26058	26063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931419
601	NC_014834	TGG	2	6	26105	26110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931419
602	NC_014834	GC	3	6	26117	26122	0 %	0 %	50 %	50 %	316931419
603	NC_014834	TCG	2	6	26132	26137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931419
604	NC_014834	CGA	2	6	26205	26210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931419
605	NC_014834	CCG	3	9	26216	26224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931419
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607	NC_014834	CGG	2	6	26265	26270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931419
608	NC_014834	CTGGC	2	10	26296	26305	0 %	20 %	40 %	40 %	316931419
609	NC_014834	CGCC	2	8	26319	26326	0 %	0 %	25 %	75 %	316931419
610	NC_014834	CG	3	6	26338	26343	0 %	0 %	50 %	50 %	316931419
611	NC_014834	GTA	2	6	26379	26384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931419
612	NC_014834	GCG	2	6	26519	26524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931420
613	NC_014834	GCG	2	6	26540	26545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931420
614	NC_014834	GTC	2	6	26553	26558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931420
615	NC_014834	GAA	2	6	26565	26570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931420
616	NC_014834	GTC	2	6	26646	26651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931420
617	NC_014834	CG	3	6	26675	26680	0 %	0 %	50 %	50 %	316931420
618	NC_014834	GCG	2	6	26704	26709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931420
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621	NC_014834	CCG	3	9	26774	26782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931420
622	NC_014834	GTG	2	6	26791	26796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931420
623	NC_014834	CCA	2	6	26858	26863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931420
624	NC_014834	CGC	2	6	26901	26906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931420
625	NC_014834	GCG	3	9	26930	26938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931420
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627	NC_014834	CTT	2	6	26967	26972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931420
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