MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014834	GGTC	2	8	229044	229051	0 %	25 %	50 %	25 %	316931596
5502	NC_014834	GAG	2	6	229052	229057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931596
5503	NC_014834	GGT	2	6	229599	229604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931598
5504	NC_014834	AGAC	2	8	229624	229631	50 %	0 %	25 %	25 %	316931598
5505	NC_014834	TTCC	2	8	229778	229785	0 %	50 %	0 %	50 %	316931598
5506	NC_014834	GAA	2	6	229826	229831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931598
5507	NC_014834	GCT	2	6	229864	229869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931598
5508	NC_014834	TGC	2	6	229933	229938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931598
5509	NC_014834	CGGCC	2	10	230011	230020	0 %	0 %	40 %	60 %	316931598
5510	NC_014834	GGT	4	12	230021	230032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931598
5511	NC_014834	GCA	2	6	230070	230075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931598
5512	NC_014834	GGT	2	6	230111	230116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931598
5513	NC_014834	GCC	2	6	231140	231145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931599
5514	NC_014834	GCT	2	6	231174	231179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931599
5515	NC_014834	GTCG	2	8	231181	231188	0 %	25 %	50 %	25 %	316931599
5516	NC_014834	TCGG	2	8	231278	231285	0 %	25 %	50 %	25 %	316931599
5517	NC_014834	CAC	2	6	231302	231307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931599
5518	NC_014834	GTG	2	6	231374	231379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931599
5519	NC_014834	CTT	2	6	231390	231395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931599
5520	NC_014834	TGG	2	6	231399	231404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931599
5521	NC_014834	GTT	2	6	231627	231632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931600
5522	NC_014834	ACG	2	6	231665	231670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931600
5523	NC_014834	CGG	2	6	231687	231692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931600
5524	NC_014834	CGC	2	6	232549	232554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931601
5525	NC_014834	TCC	2	6	232561	232566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931601
5526	NC_014834	CCA	3	9	232568	232576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931601
5527	NC_014834	CCG	2	6	232586	232591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931601
5528	NC_014834	CGG	2	6	232658	232663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931601
5529	NC_014834	CGA	2	6	232682	232687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931601
5530	NC_014834	GAT	2	6	232716	232721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931601
5531	NC_014834	GCC	2	6	232722	232727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931601
5532	NC_014834	CGA	2	6	232766	232771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931601
5533	NC_014834	ATC	2	6	232845	232850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931601
5534	NC_014834	GTG	2	6	232891	232896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931601
5535	NC_014834	CGA	2	6	232919	232924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931601
5536	NC_014834	AGC	2	6	232951	232956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931601
5537	NC_014834	GGC	2	6	232960	232965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931601
5538	NC_014834	CCA	2	6	232991	232996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931601
5539	NC_014834	AGCC	2	8	233074	233081	25 %	0 %	25 %	50 %	316931601
5540	NC_014834	GCA	2	6	233105	233110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931601
5541	NC_014834	CGA	2	6	233126	233131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931601
5542	NC_014834	GGT	2	6	233139	233144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931601
5543	NC_014834	CCG	2	6	233165	233170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931601
5544	NC_014834	GCA	2	6	233204	233209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931601
5545	NC_014834	CCGG	2	8	233229	233236	0 %	0 %	50 %	50 %	316931601
5546	NC_014834	GATC	2	8	233243	233250	25 %	25 %	25 %	25 %	316931601
5547	NC_014834	GCC	2	6	233274	233279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931601
5548	NC_014834	GCCG	2	8	233303	233310	0 %	0 %	50 %	50 %	316931601
5549	NC_014834	CAG	2	6	233355	233360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931601
5550	NC_014834	CTT	2	6	233378	233383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931601
5551	NC_014834	CGG	2	6	233426	233431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931601
5552	NC_014834	TGG	2	6	233465	233470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931601
5553	NC_014834	CGT	2	6	233562	233567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931601
5554	NC_014834	TCG	2	6	233593	233598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931601
5555	NC_014834	CCG	2	6	233599	233604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931601
5556	NC_014834	CGCC	2	8	233648	233655	0 %	0 %	25 %	75 %	316931601
5557	NC_014834	CCT	2	6	233705	233710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	316931601
5558	NC_014834	CAG	3	9	233730	233738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931601
5559	NC_014834	GCT	2	6	233843	233848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931601
5560	NC_014834	GCC	2	6	233852	233857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931601
5561	NC_014834	GAT	2	6	233940	233945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931601
5562	NC_014834	CG	3	6	233954	233959	0 %	0 %	50 %	50 %	316931601
5563	NC_014834	GC	3	6	233960	233965	0 %	0 %	50 %	50 %	316931601
5564	NC_014834	TGC	3	9	234005	234013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931601
5565	NC_014834	TCG	2	6	234052	234057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931601
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5568	NC_014834	GCCGA	2	10	234189	234198	20 %	0 %	40 %	40 %	316931601
5569	NC_014834	AGC	2	6	234243	234248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931601
5570	NC_014834	TCGC	2	8	234265	234272	0 %	25 %	25 %	50 %	316931601
5571	NC_014834	TCT	3	9	234430	234438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931601
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5573	NC_014834	AGC	2	6	234529	234534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931601
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5575	NC_014834	TCGAA	2	10	234683	234692	40 %	20 %	20 %	20 %	316931601
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5579	NC_014834	GGTCA	2	10	234822	234831	20 %	20 %	40 %	20 %	316931601
5580	NC_014834	CGC	2	6	234843	234848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931601
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5586	NC_014834	CGGC	2	8	235484	235491	0 %	0 %	50 %	50 %	316931602
5587	NC_014834	GCC	2	6	235525	235530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931602
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5591	NC_014834	GCG	2	6	235640	235645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931602
5592	NC_014834	GAT	2	6	235768	235773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931602
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5597	NC_014834	GGC	2	6	235948	235953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931602
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5601	NC_014834	CGC	2	6	236220	236225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931602
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5605	NC_014834	GGT	2	6	236422	236427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931602
5606	NC_014834	CGGG	2	8	236436	236443	0 %	0 %	75 %	25 %	316931602
5607	NC_014834	GTCGCC	2	12	236679	236690	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	316931603
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5610	NC_014834	CG	3	6	236743	236748	0 %	0 %	50 %	50 %	316931603
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5615	NC_014834	CGCTGC	2	12	237032	237043	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	316931603
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5621	NC_014834	CG	3	6	237243	237248	0 %	0 %	50 %	50 %	316931604
5622	NC_014834	CAC	2	6	237290	237295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931604
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5625	NC_014834	CGC	2	6	237357	237362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931604
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5727	NC_014834	CGGT	2	8	242086	242093	0 %	25 %	50 %	25 %	316931609
5728	NC_014834	GT	3	6	242095	242100	0 %	50 %	50 %	0 %	316931609
5729	NC_014834	CAGCGT	2	12	242187	242198	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	316931609
5730	NC_014834	ACG	2	6	242252	242257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931609
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5732	NC_014834	GTCG	2	8	242592	242599	0 %	25 %	50 %	25 %	316931610
5733	NC_014834	GCTGC	2	10	242622	242631	0 %	20 %	40 %	40 %	316931610
5734	NC_014834	CGG	2	6	242652	242657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931610
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5737	NC_014834	GGT	2	6	242679	242684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931610
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5739	NC_014834	CGGC	2	8	242720	242727	0 %	0 %	50 %	50 %	316931610
5740	NC_014834	GCT	2	6	242742	242747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931610
5741	NC_014834	GCT	3	9	242751	242759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931610
5742	NC_014834	CGA	2	6	242760	242765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931610
5743	NC_014834	TCG	2	6	242786	242791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931610
5744	NC_014834	CG	3	6	242807	242812	0 %	0 %	50 %	50 %	316931610
5745	NC_014834	TGC	2	6	242861	242866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931610
5746	NC_014834	GGC	2	6	242916	242921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931610
5747	NC_014834	CGGCAG	2	12	242949	242960	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	316931610
5748	NC_014834	GCC	2	6	242964	242969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931610
5749	NC_014834	GCC	2	6	242998	243003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931610
5750	NC_014834	AGC	2	6	243014	243019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931610
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5752	NC_014834	GCCG	2	8	243124	243131	0 %	0 %	50 %	50 %	316931610
5753	NC_014834	CGC	2	6	243162	243167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931610
5754	NC_014834	GC	3	6	243227	243232	0 %	0 %	50 %	50 %	316931610
5755	NC_014834	GGC	2	6	243346	243351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931610
5756	NC_014834	ATC	2	6	243463	243468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931610
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5758	NC_014834	GGC	2	6	243668	243673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931611
5759	NC_014834	GGAGT	2	10	243712	243721	20 %	20 %	60 %	0 %	316931611
5760	NC_014834	GCCG	2	8	243724	243731	0 %	0 %	50 %	50 %	316931611
5761	NC_014834	CACC	2	8	243958	243965	25 %	0 %	0 %	75 %	316931611
5762	NC_014834	ACG	2	6	243975	243980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931611
5763	NC_014834	GCTC	2	8	244047	244054	0 %	25 %	25 %	50 %	316931611
5764	NC_014834	GGT	2	6	244066	244071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931611
5765	NC_014834	CCGG	2	8	244083	244090	0 %	0 %	50 %	50 %	316931611
5766	NC_014834	CGT	2	6	244104	244109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931611
5767	NC_014834	CG	3	6	244126	244131	0 %	0 %	50 %	50 %	316931611
5768	NC_014834	CAA	2	6	244144	244149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931611
5769	NC_014834	ACC	2	6	244181	244186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931611
5770	NC_014834	GCT	2	6	244204	244209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931611
5771	NC_014834	CGGCGT	2	12	244210	244221	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	316931611
5772	NC_014834	GGT	2	6	244228	244233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931611
5773	NC_014834	CGA	2	6	244237	244242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931611
5774	NC_014834	TGCGA	2	10	244253	244262	20 %	20 %	40 %	20 %	316931611
5775	NC_014834	TTC	3	9	244265	244273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931611
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5778	NC_014834	CAG	2	6	244441	244446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931611
5779	NC_014834	CG	4	8	244513	244520	0 %	0 %	50 %	50 %	316931611
5780	NC_014834	ACG	2	6	244521	244526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931611
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5782	NC_014834	CGA	2	6	244591	244596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931611
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5786	NC_014834	CGGC	2	8	244674	244681	0 %	0 %	50 %	50 %	316931611
5787	NC_014834	CTG	4	12	244778	244789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931611
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5794	NC_014834	TCG	2	6	245286	245291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931611
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5798	NC_014834	CGG	2	6	245434	245439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931611
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5802	NC_014834	GCT	2	6	245787	245792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931611
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5820	NC_014834	CCG	2	6	246741	246746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931612
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5824	NC_014834	CAT	2	6	246875	246880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931612
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5841	NC_014834	GCCG	2	8	247513	247520	0 %	0 %	50 %	50 %	316931613
5842	NC_014834	GC	3	6	247525	247530	0 %	0 %	50 %	50 %	316931613
5843	NC_014834	GCT	2	6	247552	247557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931613
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5845	NC_014834	GCT	2	6	247642	247647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931613
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5848	NC_014834	GCG	2	6	247659	247664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931613
5849	NC_014834	CCGGC	2	10	247705	247714	0 %	0 %	40 %	60 %	316931613
5850	NC_014834	GCG	2	6	247769	247774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931613
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5852	NC_014834	TGC	2	6	247833	247838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931613
5853	NC_014834	GC	3	6	247984	247989	0 %	0 %	50 %	50 %	316931613
5854	NC_014834	CGG	2	6	248017	248022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931613
5855	NC_014834	GGCC	2	8	248038	248045	0 %	0 %	50 %	50 %	316931613
5856	NC_014834	CAC	2	6	248065	248070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931613
5857	NC_014834	ACG	2	6	248229	248234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931613
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5859	NC_014834	TGC	2	6	248271	248276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931613
5860	NC_014834	GC	3	6	248307	248312	0 %	0 %	50 %	50 %	316931613
5861	NC_014834	GCG	2	6	248394	248399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931613
5862	NC_014834	GCC	3	9	248453	248461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931613
5863	NC_014834	GCT	2	6	248542	248547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931613
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5981	NC_014834	TGG	2	6	254089	254094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931619
5982	NC_014834	GCG	2	6	254103	254108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931619
5983	NC_014834	CTT	2	6	254129	254134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931619
5984	NC_014834	ATC	2	6	254157	254162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931619
5985	NC_014834	GGT	2	6	254192	254197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931619
5986	NC_014834	CGC	2	6	254210	254215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931619
5987	NC_014834	TGGC	2	8	254220	254227	0 %	25 %	50 %	25 %	316931619
5988	NC_014834	TGC	2	6	254245	254250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931619
5989	NC_014834	CGC	2	6	254266	254271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931619
5990	NC_014834	TGA	2	6	254278	254283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931619
5991	NC_014834	GCA	2	6	254284	254289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931619
5992	NC_014834	GGT	2	6	254300	254305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931619
5993	NC_014834	TGG	2	6	254326	254331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931619
5994	NC_014834	TCTG	2	8	254353	254360	0 %	50 %	25 %	25 %	316931619
5995	NC_014834	CCTCG	2	10	254435	254444	0 %	20 %	20 %	60 %	316931619
5996	NC_014834	GTG	3	9	254499	254507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931619
5997	NC_014834	TGC	2	6	254521	254526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931619
5998	NC_014834	ACCG	2	8	254580	254587	25 %	0 %	25 %	50 %	316931619
5999	NC_014834	AGC	3	9	254629	254637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931619
6000	NC_014834	TCG	2	6	254638	254643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931619

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